Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
HKSEIAHRFKDLGEEHFKGLVLIAFSQYLQQCPFDEHVKLVNELTEFAKTCVADESHAGCEKSLHTLFGDELCKVASLRE
TYGDMADCCEKQEPERNECFLSHKDDSPDLPKLKPDPNTLCDEFKADEKKFWGKYLYEIARRHPYFYAPELLYYANKYNG
VFQECCQAEDKGACLLPKIETMREKVLASSARQRLRCASIQKFGERALKAWSVARLSQKFPKAEFVEVTKLVTDLTKVHK
ECCHGDLLECADDRADLAKYICDNQDTISSKLKECCDKPLLEKSHCIAEVEKDAIPENLPPLTADFAEDKDVCKNYQEAK
DAFLGSFLYEYSRRHPEYAVSVLLRLAKEYEATLECCADDPHACYSTVFDKLKHLVDEPQNLIKQNCDQFEKLGEYGFQN
ALIVRYTRKVPQVSTPTLVEVSRSLGKVGTRCCTKPESERMPCTEDYLSLILNRLCVLHEKTPVSEKVTKCCTESLVNRR
PCFSALTPDETYVPKAFDEKLFTFHADICTLPDTEKQIKKQTALVELLKHKPKATEEQLKTVMENFVAFVDKCCDKEACF
AVEGPKLVVSTQTALA

The query sequence (length=576) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6hn0:A 583 581 0.9219 0.9108 0.9139 0.0 6hn1:A, 4jk4:A, 4jk4:B, 8kfo:B, 4luf:A, 4luh:A, 4or0:A, 4or0:B, 5orf:A, 5orf:B, 5orf:C, 5orf:D, 5osw:A, 5otb:A, 5otb:B, 5otb:C, 5otb:D, 6qs9:A, 6qs9:B, 6rjv:A, 6rjv:B, 3v03:A, 3v03:B, 8wdd:A, 8wdd:B
2 8cks:A 585 582 0.7604 0.7487 0.7526 0.0 3a73:A, 3a73:B, 6a7p:A, 6a7p:B, 8a9q:A, 8a9q:B, 7aai:AAA, 3b9l:A, 3b9m:A, 1bke:A, 2bx8:A, 2bx8:B, 2bxa:A, 2bxa:B, 2bxb:A, 2bxb:B, 2bxc:A, 2bxc:B, 2bxd:A, 2bxd:B, 2bxe:A, 2bxe:B, 2bxf:A, 2bxf:B, 2bxg:A, 2bxg:B, 2bxh:A, 2bxh:B, 2bxi:A, 2bxk:A, 2bxl:A, 2bxm:A, 2bxn:A, 2bxo:A, 2bxp:A, 2bxq:A, 9csg:A, 3cx9:A, 7d6j:A, 7d6j:B, 7dl4:A, 1e7a:A, 1e7a:B, 1e7b:A, 1e7b:B, 1e7c:A, 4e99:A, 7eek:A, 7eek:B, 8ew4:A, 8ew7:A, 8ey5:A, 6ezq:A, 5gix:A, 5gix:B, 5giy:A, 1gni:A, 1gnj:A, 8h0o:A, 1h9z:A, 1ha2:A, 1hk1:A, 1hk2:A, 1hk3:A, 1hk4:A, 1hk5:A, 6hsc:B, 2i30:A, 5id7:A, 5id7:B, 5ifo:A, 5ijf:A, 8ism:A, 8itr:A, 8itt:A, 8itt:B, 4iw1:A, 4iw2:A, 8j8e:A, 8j8e:I, 3jqz:A, 7jwn:A, 8k1y:A, 6l4k:A, 4l8u:A, 4l9k:A, 4l9k:B, 4l9q:A, 4l9q:B, 4la0:A, 4la0:B, 4lb2:A, 4lb2:B, 4lb9:A, 3lu6:A, 3lu6:B, 3lu7:A, 3lu7:B, 3lu8:A, 3lu8:B, 6m5e:A, 6m5e:B, 6m5e:C, 1n5u:A, 1o9x:A, 7ov5:A, 7ov5:B, 7ov6:A, 7ov6:B, 7qfe:A, 6qio:A, 6qip:A, 6r7s:A, 8rco:A, 8rco:B, 8rgk:A, 8rgk:B, 8rgl:A, 8rgl:B, 3tdl:A, 3uiv:H, 5ujb:A, 5ujb:B, 8vac:A, 8vae:A, 2vdb:A, 5vnw:B, 7vr9:A, 7vr9:B, 2vue:A, 2vue:B, 2vuf:A, 2vuf:B, 7wkz:A, 7wkz:B, 7wlf:A, 7woj:A, 7wok:A, 7wok:B, 6wuw:A, 6wuw:B, 7wz9:A, 5x52:A, 5x52:B, 7x7x:A, 7x7x:B, 2xsi:A, 2xvq:A, 2xvq:B, 2xvu:A, 2xvu:B, 2xvv:A, 2xvw:A, 6xv0:A, 2xw0:A, 2xw0:B, 2xw1:A, 2xw1:B, 7y2d:A, 5yb1:A, 5yb1:B, 2ydf:A, 2ydf:B, 6yg9:A, 5yoq:A, 5yoq:B, 1ysx:A, 8yxa:A, 8yxa:B, 8yxb:A, 8yxb:B, 5z0b:A, 5z0b:B, 5z0b:C, 7z57:A, 4z69:A, 4z69:I
3 6ci6:A 581 581 0.7448 0.7384 0.7384 0.0 5dby:A, 5dqf:A, 5id9:A, 5iih:A, 5iiu:A, 5iix:A, 5ij5:A, 5ije:A, 4j2v:A, 7mbl:A, 6mdq:A, 6oci:A, 6ocj:A, 4ot2:A, 7q4x:A, 6u4r:A, 6u4x:A, 6u5a:A, 5v0v:A, 6xk0:A, 4zbq:A, 4zbr:A
4 8bsg:A 584 582 0.7222 0.7123 0.7148 0.0 6ock:A, 6ocl:A, 4po0:A
5 8x1n:A 591 581 0.4028 0.3926 0.3993 3.62e-154
6 5okl:B 558 559 0.3299 0.3405 0.3399 9.26e-114
7 5okl:B 558 385 0.1476 0.1523 0.2208 1.60e-12
8 5okl:B 558 189 0.0799 0.0824 0.2434 2.76e-04
9 6rq7:B 479 529 0.2899 0.3486 0.3157 2.12e-89
10 6rq7:B 479 384 0.1493 0.1795 0.2240 6.19e-10
11 6rq7:B 479 103 0.0503 0.0605 0.2816 0.009
12 1j78:B 447 443 0.1701 0.2192 0.2212 3.02e-27 1j7e:A, 1j7e:B
13 1j78:B 447 380 0.1545 0.1991 0.2342 5.98e-15 1j7e:A, 1j7e:B
14 3q9o:A 605 78 0.0278 0.0264 0.2051 1.0 3ess:A, 3ki0:A, 3ki1:A, 3ki2:A, 3ki3:A, 3ki4:A, 3ki5:A, 3ki6:A, 3ki7:A, 3ny6:A, 2q6m:A
15 3ubt:Y 328 148 0.0590 0.1037 0.2297 1.6 1dct:A, 1dct:B, 3ubt:B, 3ubt:A
16 8f72:B 595 49 0.0295 0.0286 0.3469 1.8 8f5m:A, 8f5m:B, 8f72:A
17 3pvc:A 635 47 0.0260 0.0236 0.3191 3.0 3sgl:A
18 3t8i:A 306 29 0.0226 0.0425 0.4483 4.2 3t8i:B, 3t8i:C, 3t8i:D
19 2h1n:A 566 181 0.0747 0.0760 0.2376 5.6 2h1j:A, 2h1j:B, 2h1n:B
20 2xb3:A 155 55 0.0312 0.1161 0.3273 6.6
21 6ohr:F 526 55 0.0295 0.0323 0.3091 8.3

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218