Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
HHHMVSTLKPLKIGKHTIKFPIFQGGMGVGISWDELAGNVAKEGALGVISAVGTGYYKNMRFVERIVAKKPFEALNFYSK
KALNEIFANARKICGNNPLGANILYAINDYGRVLRDSCEAGANIIITGAGLPTNMPEFAKDFSDVALIPIISSAKALKIL
CKRWSDRYKRIPDAFIVEGPLSGGHQGFKYEDCFKEEFRLENLVPKVVEASKEWGNIPIIAAGGIWDRKDIDTMLSLGAS
GVQMATRFLGTKECDAKVYADLLPTLKKEDILLIKSPVGYPARAINTGVIKRIEEGNAPKIACVSNCVAPCNRGEEAKKV
GYCIADGLGRSYLGNREEGLYFTGANGYRVDKIISVHELIKELTEG

The query sequence (length=366) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7e1q:A 366 366 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 7e1r:A, 7e1r:C, 7e1s:C, 7e1s:A
2 7l00:C 315 350 0.2623 0.3048 0.2743 2.07e-19 7l00:A, 7l00:B, 7l00:D
3 5gvh:A 311 351 0.2568 0.3023 0.2678 3.17e-16
4 2z6i:B 321 279 0.2240 0.2555 0.2939 7.82e-12 2z6i:A, 2z6j:A, 2z6j:B
5 5lsm:A 339 114 0.1011 0.1091 0.3246 7.46e-11 5lsm:B, 5lsm:C, 5lsm:D, 5lsm:E, 5lsm:F, 5lsm:G, 5lsm:H
6 4q4k:A 351 263 0.1913 0.1994 0.2662 1.14e-07 4q4k:B, 4qis:A, 4qis:B, 4qit:A, 4qit:B, 4qiu:A, 4qiu:B
7 3bw2:A 347 247 0.1776 0.1873 0.2632 1.86e-07 3bw3:A, 3bw4:A
8 4iql:A 313 260 0.1940 0.2268 0.2731 1.00e-06 4iql:B
9 6bka:A 374 171 0.1175 0.1150 0.2515 3.69e-06
10 6e2a:A 326 190 0.1393 0.1564 0.2684 6.37e-06 2gjl:A, 2gjn:A
11 4qq3:A 302 49 0.0546 0.0662 0.4082 0.017
12 1b3o:A 304 51 0.0574 0.0691 0.4118 0.041
13 4fo4:A 348 48 0.0546 0.0575 0.4167 0.042 4fo4:B, 4ix2:A, 4ix2:B, 4ix2:C, 4ix2:D, 4qne:A, 4qne:B, 4x3z:A, 4x3z:B
14 8fuz:A 390 51 0.0574 0.0538 0.4118 0.046 8foz:A, 8foz:B, 8foz:C, 8foz:D, 8foz:E, 8foz:F, 8foz:G, 8foz:H, 8fuz:B, 8fuz:C, 8fuz:D, 8fuz:E, 8fuz:F, 8fuz:G, 8fuz:H, 1jr1:B, 6u8e:A, 6u8e:B, 6u8e:C, 6u8e:D, 6u8e:E, 6u8e:F, 6u8e:G, 6u8e:H, 6u8s:A, 6u8s:B, 6u8s:C, 6u8s:D, 6u8s:E, 6u8s:F, 6u8s:G, 6u8s:H, 6ua5:A, 6ua5:B, 6ua5:C, 6ua5:D, 6ua5:E, 6ua5:F, 6ua5:G, 6ua5:H, 6udp:A, 6udp:B, 6udp:C, 6udp:D, 6udp:E, 6udp:F, 6udp:G, 6udp:H
15 4fxs:A 467 48 0.0546 0.0428 0.4167 0.046
16 1nf7:A 454 51 0.0574 0.0463 0.4118 0.050 1jr1:A, 1nf7:B
17 1nfb:A 396 56 0.0574 0.0530 0.3750 0.051 1nfb:B
18 6uc2:A 453 51 0.0574 0.0464 0.4118 0.059 6i0m:B, 6i0o:A, 6uc2:B, 6uc2:C, 6uc2:D, 6uc2:E, 6uc2:F, 6uc2:G, 6uc2:H
19 8g8f:A 491 51 0.0574 0.0428 0.4118 0.062 8g8f:B, 8g8f:C, 8g8f:D, 8g8f:E, 8g8f:F, 8g8f:G, 8g8f:H, 8g9b:A, 8g9b:B, 8g9b:C, 8g9b:D, 8g9b:E, 8g9b:F, 8g9b:G, 8g9b:H, 6i0m:A, 6i0o:B, 6u8n:A, 6u8n:B, 6u8n:C, 6u8n:D, 6u8n:E, 6u8n:F, 6u8n:G, 6u8n:H, 6u8r:D, 6u8r:A, 6u8r:B, 6u8r:C, 6u8r:H, 6u8r:E, 6u8r:F, 6u8r:G, 6u9o:A, 6u9o:B, 6u9o:C, 6u9o:D, 6u9o:E, 6u9o:F, 6u9o:G, 6u9o:H, 6ua2:B, 6ua2:A, 6ua2:D, 6ua2:C, 6ua2:F, 6ua2:E, 6ua2:H, 6ua2:G, 6ua4:B, 6ua4:A, 6ua4:D, 6ua4:C, 6ua4:F, 6ua4:E, 6ua4:H, 6ua4:G, 6uaj:A, 6uaj:B, 6uaj:C, 6uaj:D, 6uaj:E, 6uaj:F, 6uaj:G, 6uaj:H, 6udo:A, 6udo:B, 6udo:C, 6udo:D, 6udo:E, 6udo:F, 6udo:G, 6udo:H, 6udq:A, 6udq:B, 6udq:C, 6udq:D, 6udq:E, 6udq:F, 6udq:G, 6udq:H
20 6mgr:C 369 56 0.0519 0.0515 0.3393 0.063 6mgr:A, 6mgr:B, 6mgr:D, 4mz1:A, 4mz1:B, 4mz1:C, 4mz8:A, 4mz8:B, 4mz8:C, 4mz8:D, 4r7j:A, 5uqf:A, 5uqf:B, 5uqf:C, 5uqg:A, 5uqg:B, 5uqg:H, 5uqg:C, 5uqg:G, 5uqg:D, 5uqg:E, 5uqg:F, 5uqh:A, 5uqh:B, 5uqh:C, 5uqh:D, 5uqh:E, 5uqh:F, 5uqh:G, 5uqh:H, 5urq:A, 5urq:D, 5urq:B, 5urq:C, 5urq:E, 5urq:H, 5urq:F, 5urq:G
21 8u7m:A 451 55 0.0601 0.0488 0.4000 0.065 8u7m:B, 8u7m:C, 8u7m:D, 8u7m:E, 8u7m:F, 8u7m:G, 8u7m:H
22 1b3o:B 410 50 0.0574 0.0512 0.4200 0.067
23 7pji:A 445 52 0.0519 0.0427 0.3654 0.069 4dqw:A, 4dqw:B, 6gk9:A, 6gk9:D, 7pji:B
24 7rfi:A 422 56 0.0574 0.0498 0.3750 0.081 7rfi:B, 7rfi:C, 7rfi:D, 7rfi:E, 7rfi:F, 7rfi:G, 7rfi:H, 7rgl:A, 7rgl:B, 7rgl:C, 7rgl:D, 7rgl:E, 7rgl:F, 7rgl:G, 7rgl:H
25 7rer:A 389 56 0.0574 0.0540 0.3750 0.083 7rer:D, 7rer:C, 7rer:B, 7rer:E, 7rer:H, 7rer:G, 7rer:F, 8u8y:A, 8u8y:B, 8u8y:C, 8u8y:D, 8u8y:E, 8u8y:F, 8u8y:G, 8u8y:H
26 7rgi:A 357 50 0.0574 0.0588 0.4200 0.089 7rgi:B, 7rgi:C, 7rgi:D, 7rgi:E, 7rgi:H, 7rgi:F, 7rgi:G
27 7rgd:A 519 56 0.0574 0.0405 0.3750 0.095 7res:A, 7res:B, 7res:C, 7res:D, 7res:E, 7res:F, 7res:G, 7res:H, 7rfe:A, 7rfe:B, 7rfe:C, 7rfe:D, 7rfe:E, 7rfe:F, 7rfe:G, 7rfe:H, 7rfg:A, 7rfg:B, 7rfg:C, 7rfg:D, 7rfg:E, 7rfg:F, 7rfg:G, 7rfg:H, 7rgd:B, 7rgd:C, 7rgd:D, 7rgd:E, 7rgd:F, 7rgd:G, 7rgd:H, 7rgm:A, 7rgm:B, 7rgm:C, 7rgm:D, 7rgm:E, 7rgm:F, 7rgm:G, 7rgm:H, 7rgq:A, 7rgq:B, 7rgq:C, 7rgq:D, 7rgq:E, 7rgq:F, 7rgq:G, 7rgq:H, 8u7q:A, 8u7q:B, 8u7q:C, 8u7q:D, 8u7q:E, 8u7q:F, 8u7q:G, 8u7q:H, 8u7v:A, 8u7v:B, 8u7v:C, 8u7v:D, 8u7v:E, 8u7v:F, 8u7v:G, 8u7v:H, 8u8o:A, 8u8o:B, 8u8o:C, 8u8o:D, 8u8o:E, 8u8o:F, 8u8o:G, 8u8o:H
28 7rfh:H 451 55 0.0574 0.0466 0.3818 0.097 7rfh:A, 7rfh:B, 7rfh:C, 7rfh:D, 7rfh:E, 7rfh:F, 7rfh:G
29 1jcn:A 395 50 0.0574 0.0532 0.4200 0.12 1jcn:B
30 4qj1:D 346 38 0.0492 0.0520 0.4737 0.17 4ixh:A, 4ixh:D, 4ixh:B, 4ixh:C, 3khj:B, 3khj:C, 3khj:D, 3khj:H, 4qj1:A, 4qj1:B, 4qj1:C, 4rv8:A, 4rv8:D, 4rv8:B, 4rv8:C
31 3khj:A 302 38 0.0492 0.0596 0.4737 0.18 3khj:E, 3khj:F, 3khj:G
32 6b8s:B 336 63 0.0519 0.0565 0.3016 0.22 6b8s:A
33 4af0:A 395 53 0.0574 0.0532 0.3962 0.38 4af0:B
34 5ahm:A 354 60 0.0546 0.0565 0.3333 0.46 5ahm:B
35 6uy4:A 354 74 0.0738 0.0763 0.3649 0.64
36 5ahn:A 297 56 0.0546 0.0673 0.3571 0.76
37 3qdt:A 142 69 0.0519 0.1338 0.2754 0.82 3qdt:B, 3qdx:A, 3qdx:B, 3qdy:A, 3qdy:B
38 4z0g:B 390 100 0.0738 0.0692 0.2700 1.1 4xtd:A, 4xtd:B, 4xti:A, 4xti:B, 4z0g:A
39 1u9z:A 274 201 0.1448 0.1934 0.2637 1.3 1u9z:B, 1u9z:C, 1u9z:D
40 1y2u:A 142 75 0.0519 0.1338 0.2533 1.5 1y2u:B, 1y2v:A, 1y2v:B, 1y2w:A, 1y2w:B, 1y2x:A, 1y2x:B, 1y2x:C, 1y2x:D
41 4z87:A 498 56 0.0492 0.0361 0.3214 1.6 5tc3:A, 5tc3:B, 4z87:B, 4z87:C, 4z87:D
42 8qqv:A 356 49 0.0492 0.0506 0.3673 1.9 8qqv:B, 8qqv:D, 8qqv:C, 8qqv:E, 8qqv:F, 8qqv:G, 8qqv:H, 8qqx:A, 8qqx:B, 8qqx:C, 8qqx:D, 8qqx:E, 8qqx:F, 8qqx:G, 8qqx:H
43 4wy0:B 260 71 0.0574 0.0808 0.2958 1.9 4wy0:D, 4wy0:E, 4wy0:G, 4wy0:I, 4wy0:J, 4wy0:K, 1znn:A, 1znn:B, 1znn:C, 1znn:D, 1znn:E, 1znn:F
44 8u7j:L 267 71 0.0519 0.0712 0.2676 1.9 8u7j:K, 8u7j:I, 8u9e:B
45 5mcp:E 387 51 0.0492 0.0465 0.3529 2.0 5mcp:G
46 8qqp:A 464 49 0.0492 0.0388 0.3673 2.1 8q65:A, 8q65:E, 8qqp:B, 8qqp:C, 8qqp:D, 8qqp:E, 8qqp:F, 8qqp:G, 8qqp:H, 8qqq:A, 8qqq:B, 8qqq:C, 8qqq:D, 8qqq:E, 8qqq:F, 8qqq:G, 8qqq:H, 8qqr:A, 8qqr:B, 8qqr:C, 8qqr:D, 8qqr:E, 8qqr:F, 8qqr:G, 8qqr:H, 8qqt:A, 8qqt:B, 8qqt:C, 8qqt:D, 8qqt:E, 8qqt:F, 8qqt:G, 8qqt:H
47 5mcp:C 446 50 0.0492 0.0404 0.3600 2.1 5mcp:A, 5mcp:B, 5mcp:D, 6rpu:A
48 1eep:A 314 38 0.0464 0.0541 0.4474 2.2
49 2iss:B 285 80 0.0601 0.0772 0.2750 2.5 2iss:A, 2iss:C
50 1p0k:B 309 44 0.0437 0.0518 0.3636 2.7 1p0k:A, 1p0n:A, 1p0n:B
51 2cu0:A 358 54 0.0519 0.0531 0.3519 2.9 2cu0:B
52 4axs:A 291 72 0.0546 0.0687 0.2778 3.5
53 7ykd:A 282 104 0.0765 0.0993 0.2692 4.0 8sg1:R
54 4v61:BD 227 35 0.0355 0.0573 0.3714 4.8
55 1ep3:A 311 64 0.0519 0.0611 0.2969 4.8 1ep1:A, 1ep2:A, 5ksw:A, 5ksw:C, 5ue9:A, 5ue9:C
56 9c4m:A 335 49 0.0464 0.0507 0.3469 5.3 9c4m:B, 9c4m:C, 9c4m:D, 9c4m:E, 9c4m:F, 9c4m:G, 9c4m:H
57 1zfj:A 476 44 0.0464 0.0357 0.3864 5.4
58 5vp5:A 411 57 0.0410 0.0365 0.2632 5.6
59 3bxo:A 236 83 0.0492 0.0763 0.2169 5.8 3bxo:B
60 3nz1:A 249 55 0.0464 0.0683 0.3091 6.3 4a29:A, 4a2s:A, 1a53:A, 8foq:A, 1igs:A, 4iww:A, 4iww:B, 1juk:A, 5k7j:A, 5k7j:B, 1lbf:A, 1lbl:A, 6nw4:A, 4ou1:A, 3ud6:A, 3uxd:A, 3uxd:B
61 8cuy:A 1016 131 0.0902 0.0325 0.2519 7.0
62 4zqr:C 358 39 0.0383 0.0391 0.3590 7.0 6d4q:A, 6d4r:A, 6d4s:A, 6d4t:A, 6d4u:A, 6d4v:A, 6d4w:A, 5j5r:A, 5k4x:A, 5k4z:A, 6mjy:A, 5ou1:A, 5ou2:A, 5ou3:A, 5upu:A, 5upv:A, 4zqm:A, 4zqn:A, 4zqo:A, 4zqp:A, 4zqr:A, 4zqr:B, 4zqr:D
63 5cli:A 160 52 0.0410 0.0938 0.2885 7.0 5clj:A, 2fwi:A, 2fwj:A, 2fwp:A, 4z7j:A, 4z7j:B
64 2a1y:A 301 36 0.0383 0.0465 0.3889 7.3
65 4ori:A 355 72 0.0628 0.0648 0.3194 7.4 1uum:A, 1uum:B, 1uuo:A
66 2ki7:B 97 44 0.0410 0.1546 0.3409 7.5 2k3r:A
67 3wgy:B 324 53 0.0437 0.0494 0.3019 9.3 3wgq:A, 3wgz:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218