Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
HHHMLSKQLFLNRCKDVEEYQKAGHNPWPHKFNVSITVPEFIAKYSGLEKSQVSDDIVSVAGRVLSKRSSSSALMFIDLH
DSQTKLQIMLNKSAYENKEDFVSLTKMIYRGDICGFTGHPTRTKTGELSLIPISGMILSPCLHMLPSMHYGLGDQETRFR
KRYLDLIVNPESVKNFVLRTKVVKAVRKYLDDKGFLEVETPILNTIPGGATARPFITHHNQLDIQMYMRIAPELYLKELV
VGGINRVYEIGRLFRNEGIDQTHNPEFTTCEFYMAYADYNDIMKMTEELLGNMVKDITGGSTKLEIKKKMVLDFTAPFKR
ISYVHALEEKFGEKIPRPLDGPEALTFLKKQAIRFNAICAEPQTTARVMDKLFGDLIEVDLVQPTFVCDQPQLMSPLAKY
HRSEPELTERFELFILKREIANAYTELNNPIVQRSNFEQQAKDKALVDEVFLDAIEHAFPPTGGWGLGIDRLAMLLADVD
NIKEVILFPTMRPEDELEKKAREAKEDAMVAQEKA

The query sequence (length=515) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4up7:A 529 526 0.9981 0.9716 0.9772 0.0 4up9:A, 4upa:A
2 6chd:A 506 503 0.5126 0.5217 0.5249 0.0 3bju:A, 3bju:B, 3bju:C, 3bju:D, 6chd:B, 4dpg:A, 4dpg:B, 4dpg:C, 4dpg:D, 4dpg:E, 4dpg:F, 4dpg:G, 4dpg:H, 7ea9:A, 7ea9:B, 7ea9:C, 7ea9:D, 6ild:A, 6ild:B, 6ilh:A, 6ilh:B, 4ycu:A, 4ycu:B, 4ycw:A, 4ycw:B, 4ycw:E, 4ycw:F
3 5hgq:B 482 496 0.5184 0.5539 0.5383 0.0 5hgq:A, 5hgq:D, 5hgq:C
4 6bni:A 502 496 0.5068 0.5199 0.5262 0.0 6bni:B, 6c86:A, 6c86:B, 5eln:A, 5eln:B, 5eln:C, 5eln:D, 5elo:A, 5elo:B, 5elo:C, 5elo:D, 6hcw:A, 6hcw:B, 7zog:A, 7zog:B, 7zog:C, 7zog:D
5 7f6w:A 506 508 0.4893 0.4980 0.4961 3.40e-171
6 6agt:B 506 506 0.4505 0.4585 0.4585 2.33e-157 6agt:A, 6agt:C, 6agt:D, 7bt5:A, 7bt5:B, 6hcu:A, 6hcu:B, 6hcv:A, 6hcv:B, 8k9s:A, 8k9s:B, 8k9u:A, 8k9u:B, 8k9v:A, 8k9v:B, 8k9w:A, 8k9w:B, 8k9x:A, 8k9x:B, 6ka6:A, 6ka6:B, 6ka6:C, 6ka6:D, 6kab:A, 6kab:B, 6kab:C, 6kab:D, 6kbf:A, 6kbf:B, 6kcn:A, 6kcn:B, 6kcn:C, 6kcn:D, 6kct:A, 6kct:B, 6kct:C, 6kct:D, 6l3y:B, 6l3y:A, 6l4q:B, 6l4q:A, 6m0t:A, 6m0t:B, 6m0t:C, 6m0t:D, 4pg3:A, 4pg3:B, 4pg3:C, 4pg3:D, 4ycv:A, 4ycv:B, 4ycv:C, 4ycv:D, 5zh2:B, 5zh3:A, 5zh3:B, 5zh4:A, 5zh4:B, 5zh5:A, 5zh5:B
7 5zh2:A 464 489 0.4272 0.4741 0.4499 2.18e-146
8 3a74:A 484 497 0.4078 0.4339 0.4225 1.25e-127 3a74:B, 3a74:C, 3a74:D, 3e9h:A, 3e9h:B, 3e9h:C, 3e9h:D, 3e9i:A, 3e9i:B, 3e9i:C, 3e9i:D
9 1e1t:A 485 451 0.3670 0.3897 0.4191 1.08e-114 1e1o:A, 1e22:A, 1e24:A, 1lyl:A, 1lyl:B, 1lyl:C, 5yzx:A, 5yzx:B, 5yzx:C
10 1bbu:A 486 484 0.3825 0.4053 0.4070 3.42e-113
11 6wbd:B 485 443 0.3515 0.3732 0.4086 4.16e-106 6wbd:A
12 4ex5:A 486 479 0.3709 0.3930 0.3987 2.40e-105 4ex5:B
13 6nrz:A 517 521 0.3786 0.3772 0.3743 1.11e-104 6nrz:B, 6ns0:A, 6ns0:B, 6o3f:A, 6o3f:B
14 6aqg:C 490 480 0.3553 0.3735 0.3812 4.36e-98 6aqg:A, 6aqg:B, 6aqg:D, 5vl1:A, 5vl1:B, 5vl1:C, 5vl1:D
15 6aqh:B 490 482 0.3398 0.3571 0.3631 4.15e-93 6aqh:A, 6aqh:C, 6aqh:D
16 7qh8:A 471 476 0.3456 0.3779 0.3739 1.55e-88 7qhn:A, 7qi8:A
17 3a5z:C 324 338 0.1864 0.2963 0.2840 5.22e-31 3a5y:B, 3a5y:C, 3a5y:D, 3a5z:A, 3a5z:E, 3a5z:G, 3g1z:A, 3g1z:B
18 3a5y:A 297 341 0.1786 0.3098 0.2698 7.42e-30
19 4o2d:B 515 498 0.2485 0.2485 0.2570 1.74e-25
20 1b8a:A 438 464 0.2408 0.2831 0.2672 1.29e-24 1b8a:B, 3nel:A, 3nem:A, 3nem:B
21 4wj3:M 589 262 0.1320 0.1154 0.2595 5.58e-21 4wj3:N, 4wj3:O, 4wj3:P, 4wj4:A
22 4wj3:M 589 98 0.0544 0.0475 0.2857 2.97e-07 4wj3:N, 4wj3:O, 4wj3:P, 4wj4:A
23 5w25:A 583 302 0.1573 0.1389 0.2682 1.27e-18 5w25:B
24 5w25:A 583 86 0.0563 0.0497 0.3372 6.41e-06 5w25:B
25 6sjc:B 581 312 0.1573 0.1394 0.2596 5.00e-18 7ap4:A, 7ap4:B, 1efw:A, 1efw:B, 1g51:A, 1g51:B, 6hhv:A, 6hhv:B, 6hhw:A, 6hhw:B, 6hhx:A, 6hhx:B, 6sjc:A
26 6sjc:B 581 85 0.0505 0.0448 0.3059 1.06e-04 7ap4:A, 7ap4:B, 1efw:A, 1efw:B, 1g51:A, 1g51:B, 6hhv:A, 6hhv:B, 6hhw:A, 6hhw:B, 6hhx:A, 6hhx:B, 6sjc:A
27 1c0a:A 585 254 0.1282 0.1128 0.2598 6.13e-18 1il2:A, 1il2:B
28 1c0a:A 585 105 0.0583 0.0513 0.2857 1.50e-06 1il2:A, 1il2:B
29 4o2d:A 580 288 0.1515 0.1345 0.2708 4.26e-17 4rmf:A
30 4o2d:A 580 86 0.0563 0.0500 0.3372 1.24e-06 4rmf:A
31 1asy:A 490 488 0.2136 0.2245 0.2254 5.45e-16 1asy:B, 1asz:A, 1asz:B
32 1x54:A 434 347 0.1728 0.2051 0.2565 4.77e-13 1x55:A
33 3kfu:C 377 362 0.1650 0.2255 0.2348 2.08e-08 3kfu:A, 3kfu:D, 3kfu:B
34 8tc8:A 435 466 0.1942 0.2299 0.2146 8.17e-07 8h53:A, 8h53:B, 8h53:C, 8h53:D, 8tc8:B, 8tc8:C, 8tc8:D, 8tc9:A, 8tc9:B, 8tc9:C, 8tc9:D
35 2xgt:B 433 323 0.1359 0.1617 0.2167 5.76e-04 2xgt:A, 2xti:A, 2xti:B
36 3p8v:A 294 142 0.0680 0.1190 0.2465 0.003 3p8v:B, 3p8y:A, 3p8y:B, 3reu:A, 3reu:B, 3rex:A, 3rex:B, 3rl6:A, 3rl6:B
37 4cs3:A 270 105 0.0602 0.1148 0.2952 0.003 6aac:A, 6aad:A, 6aan:A, 6aao:A, 6aap:A, 6aaq:A, 6aaz:A, 6ab0:A, 6ab1:A, 6ab2:A, 6ab8:A, 6abk:A, 6abl:A, 6abm:A, 4bw9:A, 4bwa:A, 4ch3:A, 4ch4:A, 4ch5:A, 4ch6:A, 4cs4:A, 5k1p:A, 5k1x:A, 8ke1:A, 8ke2:A, 8ke3:A, 8ke4:A, 8ke5:A, 8ke6:A, 6ly3:A, 6ly6:A, 6ly7:A, 6lya:A, 6lyb:A, 4q6g:A, 2q7e:A, 2q7g:A, 2q7h:A, 3qtc:A, 7rsm:A, 7rsm:B, 7rsm:C, 7rsm:D, 4tqd:A, 4tqf:A, 3vqv:A, 3vqw:A, 3vqx:A, 3vqx:B, 3vqx:C, 3vqx:D, 3vqy:A, 2zce:A, 2zim:A, 2zin:A, 2zio:A, 4zib:A
38 3m4p:A 435 29 0.0291 0.0345 0.5172 0.006 3m4p:B, 3m4p:C, 3m4p:D
39 3m4p:A 435 154 0.0621 0.0736 0.2078 0.063 3m4p:B, 3m4p:C, 3m4p:D
40 7u0r:B 278 103 0.0621 0.1151 0.3107 0.034 8c49:A, 8c49:B, 8dqg:D, 8dqg:A, 8dqh:D, 8dqh:A, 8dqi:D, 8dqi:A, 8dqj:D, 7u0r:A
41 6yuf:D 1272 222 0.1010 0.0409 0.2342 0.18
42 2zni:A 279 120 0.0680 0.1254 0.2917 0.92 2zni:B
43 8dqj:A 251 91 0.0544 0.1116 0.3077 1.1
44 6yxy:BH 282 60 0.0388 0.0709 0.3333 2.1 7aoi:BH, 6hiv:BH, 6hix:BH
45 6vqv:E 285 43 0.0252 0.0456 0.3023 4.2
46 7by6:A 299 26 0.0233 0.0401 0.4615 4.3
47 7dpi:C 292 26 0.0233 0.0411 0.4615 4.8 7dpi:A
48 2du4:A 466 47 0.0330 0.0365 0.3617 5.0 2du3:B, 2du5:B, 2du6:B
49 2du3:A 534 47 0.0330 0.0318 0.3617 5.4 2du5:A, 2du6:A
50 5mgu:A 407 123 0.0563 0.0713 0.2358 5.6 3cmq:A, 3hfv:A, 5mgh:A, 5mgw:A, 8p8x:A, 3teg:A, 3tup:A
51 3l4g:C 508 30 0.0252 0.0256 0.4333 6.5 3l4g:A, 3l4g:E, 3l4g:G, 3l4g:I, 3l4g:K, 3l4g:M, 3l4g:O
52 7elm:E 337 102 0.0524 0.0801 0.2647 6.6 6b44:D, 6b44:E, 6b44:F, 6b44:G, 6b44:H, 6b45:D, 6b45:E, 6b45:F, 6b45:G, 6b45:H, 6b46:D, 6b46:E, 6b46:F, 6b46:G, 6b46:H, 6b47:D, 6b47:E, 6b47:F, 6b47:G, 6b47:H, 6b48:D, 6b48:E, 6b48:F, 6b48:G, 6b48:H, 7ecv:D, 7ecv:E, 7ecv:F, 7ecv:G, 7ecv:H, 7ecw:D, 7ecw:E, 7ecw:F, 7ecw:G, 7ecw:H, 7elm:D, 7elm:F, 7elm:G, 7elm:H, 7elm:N, 7elm:O, 7elm:P, 7elm:Q, 7elm:R, 7eln:D, 7eln:E, 7eln:F, 7eln:G, 7eln:H, 7eln:N, 7eln:O, 7eln:P, 7eln:Q, 7eln:R, 7eqg:E, 7eqg:F, 7eqg:G, 7eqg:H, 7eqg:I, 7jzw:E, 7jzw:F, 7jzw:G, 7jzw:H, 7jzw:I, 7jzx:E, 7jzx:F, 7jzx:G, 7jzx:H, 7jzx:I, 7jzy:E, 7jzy:F, 7jzy:G, 7jzy:H, 7jzy:I, 7jzz:E, 7jzz:F, 7jzz:G, 7jzz:H, 7jzz:I, 6ne0:D, 6ne0:E, 6ne0:F, 6ne0:G, 6ne0:H, 7t3j:E, 7t3j:F, 7t3j:G, 7t3j:H, 7t3j:I, 7t3k:E, 7t3k:F, 7t3k:G, 7t3k:H, 7t3k:I, 7t3k:e, 7t3k:f, 7t3k:g, 7t3k:h, 7t3k:i, 7t3l:E, 7t3l:F, 7t3l:G, 7t3l:H, 7t3l:I, 7t3l:e, 7t3l:f, 7t3l:g, 7t3l:h, 7t3l:i, 7taw:E, 7taw:F, 7taw:G, 7taw:H, 7taw:I, 7taw:e, 7taw:f, 7taw:g, 7taw:h, 7taw:i, 7tax:E, 7tax:F, 7tax:G, 7tax:H, 7tax:I, 5uz9:D, 5uz9:E, 5uz9:F, 5uz9:G, 5uz9:H, 6vqv:F, 6vqv:G, 6vqv:H, 6vqv:I, 6vqv:J, 6vqw:E, 6vqw:F, 6vqw:G, 6vqw:H, 6vqw:I, 6vqx:E, 6vqx:F, 6vqx:G, 6vqx:H, 6vqx:I, 6w1x:D, 6w1x:E, 6w1x:F, 6w1x:G, 6w1x:H, 7we6:D, 7we6:E, 7we6:F, 7we6:G, 7we6:H, 7we6:N, 7we6:O, 7we6:P, 7we6:Q, 7we6:R, 6whi:D, 6whi:E, 6whi:F, 6whi:G, 6whi:H, 5xlo:B, 5xlo:C, 5xlo:D, 5xlo:E, 5xlo:F, 5xlp:D, 5xlp:E, 5xlp:F, 7yhs:D, 7yhs:F, 7yhs:G, 7yhs:H, 7yhs:I
53 7d2f:A 328 91 0.0466 0.0732 0.2637 7.3 7d2f:B
54 7q9f:A 1009 79 0.0388 0.0198 0.2532 8.4 7akd:C, 7l56:B, 7l56:C, 7l56:A, 7q9f:B
55 7tfa:B 441 54 0.0408 0.0476 0.3889 8.4 7tdp:A, 7tdp:C, 7tdp:B, 7tfa:L, 7tfa:Q, 7tfa:E, 7tfa:F, 7tfa:J, 7tfa:K, 7tfa:W, 7tfa:R, 7tfa:S, 7tfa:T, 7tfa:X, 7tfb:B, 7tfb:S, 7tfb:D, 7tfb:U, 7tfb:F, 7tfb:Y, 7tfb:J, 7tfb:K, 7tfb:Z, 7tfb:L, 7tfb:b, 7tfb:N, 7tfb:V, 7tfb:T, 7tfd:B, 7tfd:E, 7tfd:F, 7tfd:J, 7tfd:K, 7tfd:L, 7tfd:Q, 7tfd:R, 7tfd:S, 7tfd:T, 7tfd:W, 7tfd:X

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218