Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
HHHLANTSAHDFSYLKFVYNATDTSLEGSYDYIVIGGGTSGCPLAATLSEKYKVLLLERGTIATEYPNTLTADGFAYNLQ
QQDDGKTPVERFVSEDGIDNVRARILGGTTIINAGVYARANISFYSQTGIEWDLDLVNKTYEWVEDAIVVKPNNQSWQSV
IGEGFLEAGILPDNGFSLDHEAGTRLTGSTFDNNGTRHAADELLNKGDPNNLLVAVQASVEKILFSLSAIGVIYTDSDGN
SHQAFVRGNGEVIVSAGTIGTPQLLLLSGVGPESYLSSLNITVVQPNPYVGQFVYDNPRNFINILPPNPIEASVVTVLGI
RSDYYQVSASSLPFSTPPFSLFPTTSYPLPNSTFAHIVSQVPGPLSHGSVTLNSSSDVRIAPNIKFNYYSNSTDLANCVS
GMKKLGDLLRTKALEPYKARDVLGIDGFNYLGVPLPDDASFETFCLDNVASYWHYHGGSLVGKVLDDSFRVMGIKALRVV
DASTFPYEPNSHPQGFYLMLGRYVGLQILQERSI

The query sequence (length=514) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6jby:A 521 521 0.9942 0.9808 0.9808 0.0 7bwp:A, 7cgs:A, 5eb4:A, 5eb4:B, 5eb5:A, 5eb5:B, 8jm0:A, 8jm1:A, 8jm2:A, 8jm3:A, 8jm4:A, 8jm5:B, 8jm6:A, 8jm7:A, 8jm8:A, 6lqy:A, 6lr8:A
2 3red:A 521 519 0.7704 0.7601 0.7630 0.0 3red:B, 3red:C, 3red:D, 3red:E, 3red:F, 3red:G, 3red:H, 3red:I, 3red:J, 3red:K, 3red:L
3 3gdn:A 521 518 0.7646 0.7543 0.7587 0.0 3gdn:B, 3gdp:A, 3gdp:B, 1ju2:A, 1ju2:B
4 8bxl:B 590 604 0.2743 0.2390 0.2334 4.56e-22 8bxl:C, 8bxl:D, 8bxl:A, 8bxl:F, 8bxl:E
5 4udq:A 525 543 0.2685 0.2629 0.2541 7.66e-22 6f97:A, 6f97:B, 4udp:A, 4udp:B, 4udq:B, 4udr:A, 4udr:B
6 4h7u:A 577 565 0.2763 0.2461 0.2513 1.90e-21
7 5ncc:A 578 557 0.2743 0.2439 0.2531 1.99e-21 7av4:AAA, 5ncc:B, 5ncc:C, 5ncc:D, 5ncc:E, 5ncc:F, 7r33:A, 7r33:B, 7r34:A, 7r34:B, 7r35:A, 7r35:B, 7r36:A, 7r36:B, 6yru:AAA, 6yrv:AAA, 6yrx:AAA, 6yrz:AAA, 6ys1:AAA, 6ys2:AAA, 6zh7:A, 6zh7:B
8 3q9t:A 577 588 0.2802 0.2496 0.2449 1.98e-20 3q9t:B, 3q9t:C, 5zu2:A, 5zu2:B, 5zu2:C, 5zu3:A, 5zu3:B, 5zu3:C
9 8b7s:A 458 501 0.2432 0.2729 0.2495 4.49e-20
10 3fim:B 565 568 0.2685 0.2442 0.2430 1.86e-19 5oc1:A
11 4mjw:A 532 317 0.1595 0.1541 0.2587 2.39e-18 2jbv:A, 2jbv:B, 3ljp:A, 3ljp:B, 4mjw:B, 3nne:A, 3nne:B, 3nne:C, 3nne:D, 3nne:E, 3nne:F, 3nne:G, 3nne:H
12 6ze7:B 586 315 0.1595 0.1399 0.2603 4.26e-13 7aa2:A, 7aa2:B, 6ze2:A, 6ze2:B, 6ze3:A, 6ze4:A, 6ze4:B, 6ze5:A, 6ze5:B, 6ze6:A, 6ze6:B, 6ze7:A
13 6ze7:B 586 154 0.0681 0.0597 0.2273 6.9 7aa2:A, 7aa2:B, 6ze2:A, 6ze2:B, 6ze3:A, 6ze4:A, 6ze4:B, 6ze5:A, 6ze5:B, 6ze6:A, 6ze6:B, 6ze7:A
14 1gpe:B 587 586 0.2626 0.2300 0.2304 1.49e-12 1gpe:A
15 6h3o:F 650 310 0.1634 0.1292 0.2710 1.94e-12 6h3g:A, 6h3g:B, 6h3g:C, 6h3g:F, 6h3g:D, 6h3g:E, 6h3g:G, 6h3g:H, 6h3o:A, 6h3o:B, 6h3o:C, 6h3o:D, 6h3o:E, 6h3o:G, 6h3o:H, 8il5:A
16 6h3o:F 650 77 0.0467 0.0369 0.3117 0.63 6h3g:A, 6h3g:B, 6h3g:C, 6h3g:F, 6h3g:D, 6h3g:E, 6h3g:G, 6h3g:H, 6h3o:A, 6h3o:B, 6h3o:C, 6h3o:D, 6h3o:E, 6h3o:G, 6h3o:H, 8il5:A
17 3t37:A 509 505 0.2237 0.2259 0.2277 2.88e-12 4ha6:A
18 8il5:B 595 307 0.1634 0.1412 0.2736 3.54e-10
19 8il5:B 595 77 0.0467 0.0403 0.3117 0.66
20 6xut:A 589 336 0.1712 0.1494 0.2619 5.18e-09 6xuu:A, 6xuv:A
21 6xut:A 589 34 0.0311 0.0272 0.4706 0.062 6xuu:A, 6xuv:A
22 8il4:C 619 321 0.1654 0.1373 0.2648 5.76e-09 8il4:A, 8il4:B, 8il4:D
23 8il4:C 619 70 0.0389 0.0323 0.2857 0.43 8il4:A, 8il4:B, 8il4:D
24 6o9n:A 613 336 0.1537 0.1289 0.2351 2.22e-08 6o9n:B
25 6o9n:A 613 175 0.0934 0.0783 0.2743 0.006 6o9n:B
26 8orh:A 649 123 0.0817 0.0647 0.3415 4.05e-07 8orh:B, 8ors:A, 8ors:B, 7yx3:A, 7yx3:B, 4z24:A, 4z24:B, 4z25:A, 4z25:B, 4z25:C, 4z25:D, 4z25:E, 4z25:F, 4z25:G, 4z25:H, 4z25:I, 4z25:J, 4z25:K, 4z25:L, 4z26:A, 4z26:B, 4z26:C, 4z26:D, 4z26:E, 4z26:F, 4z26:G, 4z26:H
27 4ynt:A 570 309 0.1556 0.1404 0.2589 6.58e-07 7vkd:A, 7vkf:A, 7vzp:A, 7vzp:B, 7vzs:A, 7vzs:B, 4ynu:A
28 4ynt:A 570 110 0.0759 0.0684 0.3545 3.00e-06 7vkd:A, 7vkf:A, 7vzp:A, 7vzp:B, 7vzs:A, 7vzs:B, 4ynu:A
29 7yx4:A 650 124 0.0837 0.0662 0.3468 7.76e-07 7ptv:A, 7ptv:B, 7yx4:B, 7yx5:A
30 7yx4:A 650 32 0.0272 0.0215 0.4375 5.2 7ptv:A, 7ptv:B, 7yx4:B, 7yx5:A
31 7yx4:A 650 48 0.0253 0.0200 0.2708 5.8 7ptv:A, 7ptv:B, 7yx4:B, 7yx5:A
32 1cf3:A 581 304 0.1420 0.1256 0.2401 2.78e-05 1gal:A, 8jpz:A, 8jpz:B, 5nit:A, 5niw:A, 3qvp:A, 3qvr:A
33 1cf3:A 581 51 0.0311 0.0275 0.3137 0.073 1gal:A, 8jpz:A, 8jpz:B, 5nit:A, 5niw:A, 3qvp:A, 3qvr:A
34 1kdg:B 546 298 0.1556 0.1465 0.2685 0.001 1kdg:A, 1naa:A, 1naa:B
35 1kdg:B 546 53 0.0331 0.0311 0.3208 0.18 1kdg:A, 1naa:A, 1naa:B
36 5kxj:A 481 52 0.0428 0.0457 0.4231 0.002
37 4qi7:A 805 289 0.1459 0.0932 0.2595 0.002 4qi7:B
38 4qi7:A 805 48 0.0331 0.0211 0.3542 0.033 4qi7:B
39 5hsa:A 662 313 0.1498 0.1163 0.2460 0.015 5hsa:B, 5hsa:C, 5hsa:D, 5hsa:E, 5hsa:F, 5hsa:G, 5hsa:H, 5i68:A
40 5hsa:A 662 61 0.0389 0.0302 0.3279 2.0 5hsa:B, 5hsa:C, 5hsa:D, 5hsa:E, 5hsa:F, 5hsa:G, 5hsa:H, 5i68:A
41 4qi6:A 800 71 0.0486 0.0312 0.3521 0.031 4qi3:A, 4qi3:B, 4qi4:A, 4qi5:A
42 4qi6:A 800 54 0.0370 0.0238 0.3519 0.76 4qi3:A, 4qi3:B, 4qi4:A, 4qi5:A
43 7d9f:A 591 60 0.0350 0.0305 0.3000 0.27 7d9f:B, 7d9g:A, 7d9g:B, 7d9h:A, 7d9h:B, 7d9i:A, 7d9i:B, 7d9j:A, 7d9j:B
44 7cyx:A 363 52 0.0389 0.0551 0.3846 0.27 7cyx:B
45 3kpr:D 201 103 0.0506 0.1294 0.2524 0.47 5d2n:C, 5d2n:D, 3kpr:I, 4z7v:E, 4z7v:G
46 6mgj:A 747 118 0.0642 0.0442 0.2797 0.78 6mgj:B, 6mgj:C, 6mgj:D, 6mgj:E, 6mgj:F, 6mgj:G, 6mgj:H, 6mgk:A, 6mgk:B, 6mgk:C, 6mgk:D, 6mgl:A
47 8wpe:A 1006 79 0.0389 0.0199 0.2532 0.88 8hg1:A, 8hpa:A, 8j86:A, 8j8f:A, 8j8g:A, 8k8s:A, 8k8u:A, 5n2g:A, 8wpf:A, 8wpk:A, 8wpp:A
48 7dve:A 498 78 0.0467 0.0482 0.3077 0.90
49 3b3r:A 503 58 0.0389 0.0398 0.3448 1.0 1b4v:A, 3b6d:A, 1b8s:A, 1cbo:A, 1cc2:A, 3cnj:A, 2gew:A, 3gyi:A, 3gyj:A, 1ijh:A, 5kwf:A, 1mxt:A, 1n1p:A, 1n4u:A, 1n4v:A, 1n4w:A, 4rek:A, 4u2l:A, 4u2s:A, 4u2t:A, 4xwr:A, 4xxg:A
50 3e1t:A 437 31 0.0311 0.0366 0.5161 1.2
51 4j9v:A 456 82 0.0467 0.0526 0.2927 1.2 4j9u:H, 4j9u:G, 4j9u:E, 4j9u:F, 4j9v:B, 6v4k:E, 6v4k:F, 6v4k:G, 6v4k:H, 6v4l:C, 6v4l:D
52 8t0q:C 517 41 0.0370 0.0368 0.4634 1.3 8t0q:D, 8t0v:D
53 5fg3:A 598 135 0.0681 0.0585 0.2593 2.0 5yt0:A
54 8e0e:A 322 106 0.0486 0.0776 0.2358 2.0 1t0j:B, 1t3l:A, 5v2q:A
55 3rug:E 198 93 0.0447 0.1162 0.2473 2.0 3rug:G
56 5mh4:A 303 42 0.0331 0.0561 0.4048 3.2 5mip:A, 5miq:A, 5mir:A, 5mis:A, 5mit:A, 5mjk:A, 5mjk:B, 5mjk:C, 5mjk:D
57 4x9m:A 384 32 0.0272 0.0365 0.4375 3.3 4x9n:A
58 8wbu:A 391 94 0.0486 0.0639 0.2660 4.0 7d5g:A, 8wbv:A
59 1o5w:C 512 30 0.0331 0.0332 0.5667 4.0 1o5w:A, 1o5w:B, 1o5w:D
60 1ijt:A 128 89 0.0389 0.1562 0.2247 4.1
61 3ng7:X 427 32 0.0350 0.0422 0.5625 4.2 3k7m:X, 3k7q:X, 3k7t:A, 3k7t:B, 3ngc:X, 3nh3:X, 3nho:X, 3nk0:X, 3nk1:X, 3nk2:X, 3nn0:X, 3nn6:X
62 6vmx:D 203 115 0.0584 0.1478 0.2609 4.8 6cql:D, 6cqn:D, 6cqq:D, 6cqq:I, 6cqr:D, 6cqr:I, 5d2l:I, 5d2l:K, 5d2l:O, 5d2l:E, 3gsn:A, 5isz:D, 6vmx:I
63 8jej:A 540 70 0.0370 0.0352 0.2714 6.1 8jek:A, 8k6j:A, 8k6k:A, 7w2j:A, 7w2j:D, 7wsq:A, 7wsq:D, 8xcm:A, 8xcn:A
64 7n4k:D 199 81 0.0409 0.1055 0.2593 6.9 6l9l:C, 6l9l:G, 7n5c:D, 7n5p:D, 3pqy:D, 3pqy:I, 3pqy:N, 3pqy:S
65 6p2n:A 748 28 0.0292 0.0201 0.5357 7.0
66 4qrr:D 203 107 0.0564 0.1429 0.2710 7.0 6bj3:D, 6bj8:D, 4wo4:C, 5xot:D
67 5k0a:D 322 39 0.0311 0.0497 0.4103 7.3 5jri:A, 5jri:B, 5k0a:A, 5k0a:B, 5k0a:C
68 6qw6:63 85 61 0.0389 0.2353 0.3279 7.7 6ah0:r, 6qx9:63, 8qxd:63, 8r08:63, 8r09:63, 8r0a:63, 8r0b:63, 8rm5:63
69 7qfd:A 458 54 0.0389 0.0437 0.3704 8.2 7qva:A
70 7qf8:A 494 54 0.0389 0.0405 0.3704 8.6
71 5w1v:I 202 94 0.0467 0.1188 0.2553 9.9 5e6i:F, 5e6i:P, 5w1v:D, 5w1v:N, 5w1v:S, 5w1w:D, 5w1w:I, 5w1w:N, 5w1w:S
72 7fje:m 246 87 0.0370 0.0772 0.2184 9.9 5c07:D, 5c07:I, 5c08:D, 5c08:I, 5c09:D, 5c09:I, 5c0a:D, 5c0a:I, 5c0b:D, 5c0b:I, 5c0c:I, 5c0c:D, 5hyj:D, 5hyj:I, 6u07:A, 3uts:D, 3uts:I, 3utt:D, 3utt:I, 6vqo:D, 6vqo:H

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218