BioLiP

>protein
HHHHHSQDPRACLKCKYLTNDEICPICHSPTSENWIGLLIVINPEKSEIAKKAGIDIKGKYALSVKE

The query sequence (length=67) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4zn3:B	67	67	1.0000	1.0000	1.0000	2.97e-45	3lpe:B, 3lpe:D, 3lpe:F, 3lpe:H, 4zn1:B
2	1ryq:A	64	67	0.4776	0.5000	0.4776	2.69e-16	8oki:I, 8p2i:I, 3p8b:A, 3p8b:C, 3qqc:E
3	9bct:I	65	64	0.3881	0.4000	0.4062	2.21e-08
4	5z2v:B	197	50	0.2090	0.0711	0.2800	0.11	5z2v:A
5	5zvq:A	194	52	0.2388	0.0825	0.3077	0.18	8ab0:F, 8ab0:E, 8bpr:E, 8bpr:F
6	7mex:A	1737	29	0.1642	0.0063	0.3793	0.22	6kgi:B, 7mey:A, 3nih:A, 3nii:A, 3nij:A, 3nik:B, 3nik:D, 3nik:A, 3nik:F, 3nil:D, 3nil:A, 3nil:B, 3nil:F, 3nim:B, 3nim:F, 3nim:A, 3nim:D, 3nin:A, 3nin:B, 3nis:A, 3nis:B, 3nis:D, 3nis:F, 3nit:A
7	2exu:A	192	74	0.3433	0.1198	0.3108	0.60
8	1n7u:A	554	40	0.2090	0.0253	0.3500	1.1
9	5ai2:A	54	20	0.1493	0.1852	0.5000	1.9	5ai3:A, 4ar3:A, 4ar4:A, 4ar5:A, 4ar6:A, 9bkl:A, 9bkp:A, 9bkt:A, 1bq8:A, 1bq9:A, 1brf:A, 1caa:A, 1cad:A, 1iu5:A, 1iu6:A, 4k9f:A, 3kyu:A, 3kyv:A, 3kyw:A, 3kyx:A, 3kyy:A, 5nw3:A, 5ome:A, 3ryg:A, 3rz6:A, 3rzt:A, 3ss2:A, 1vcx:A, 1zrp:A
10	8atu:A	2837	36	0.1940	0.0046	0.3611	2.9	8atu:B, 8atx:A, 8atx:B, 8auk:A, 8auk:B, 8auw:B
11	5bv9:A	701	17	0.1194	0.0114	0.4706	3.0	5cvy:A, 5vma:A
12	8auw:A	2900	36	0.1940	0.0045	0.3611	3.1
13	5y9e:E	420	29	0.1791	0.0286	0.4138	3.4	5y9e:A, 5y9e:B, 5y9e:C, 5y9e:D
14	7kw6:A	697	16	0.1045	0.0100	0.4375	4.2
15	2pve:A	52	18	0.1343	0.1731	0.5000	5.1	2pve:B, 2pve:C
16	8ab0:D	157	17	0.1194	0.0510	0.4706	5.3	8bpr:D
17	2aus:D	53	22	0.1493	0.1887	0.4545	6.5	2aus:B, 2ey4:E, 2ey4:F, 3hax:C, 3hay:C, 3hjw:B, 2hvy:C, 3lwo:B, 3lwp:B, 3lwq:B, 3lwr:B, 3lwv:B, 2rfk:B
18	8fgw:A	1081	25	0.1343	0.0083	0.3600	6.9
19	6z2w:E	2325	34	0.2090	0.0060	0.4118	7.7	6z2w:F, 6z2x:E, 6z2x:F, 6z3a:F, 6z3a:E
20	7xzh:B	730	26	0.1642	0.0151	0.4231	7.7	7m19:C, 7xzh:A, 7xzh:C, 7xzh:D, 7xzh:E, 7xzh:F
21	6hip:A	104	38	0.1791	0.1154	0.3158	7.8	6hip:B, 5lso:A, 5lso:B, 2peh:A, 2peh:B
22	5c1z:A	384	27	0.1343	0.0234	0.3333	8.2	4bm9:A, 5c1z:B, 5c23:A, 5c23:B, 5c9v:A, 6glc:A, 6hue:A, 6hue:B, 4i1f:A, 4i1h:A, 8ik6:C, 8ikm:A, 8ikt:A, 8ikv:C, 8ikv:A, 8jwv:A, 5n2w:A, 5n38:A, 8wzn:A, 8wzo:A
23	2ff0:A	102	20	0.1343	0.0882	0.4500	8.3	2a66:A, 5l0m:A, 8pki:K
24	6knb:B	1120	24	0.1045	0.0063	0.2917	9.5	6knc:B

[Back]