BioLiP

>protein
HHGSMSNEQTFIAIKPDGVQRGLIGPIISRFENRGFKLVAMKLVSPPQSQLEQHYADLSDKPFFKGLVSYMLSGPICAMV
WEGRDVVKTGRTILGATNPLASAPGTIRGDFAIDVGRNVCHGSDSVENAKKEIALWFKPEELISWKSATFDWVYEKA

The query sequence (length=157) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6xpw:C	158	157	1.0000	0.9937	1.0000	2.05e-117	6xp7:A, 6xp7:B, 6xp7:C, 6xps:A, 6xps:B, 6xps:C, 6xpt:A, 6xpt:B, 6xpt:C, 6xpt:E, 6xpt:G, 6xpt:H, 6xpu:A, 6xpu:B, 6xpu:C, 6xpv:A, 6xpv:B, 6xpv:C, 6xpv:E, 6xpv:G, 6xpv:H, 6xpw:A, 6xpw:B, 6xpw:E, 6xpw:G, 6xpw:H
2	4fkx:A	153	153	0.6561	0.6732	0.6732	3.83e-77	4f4a:A, 4f4a:B, 4f4a:C, 4fkx:B, 4fkx:C, 4fky:A, 4fky:B, 4fky:C
3	7kpf:A	152	152	0.6624	0.6842	0.6842	3.78e-76	3bbb:B, 3bbb:C, 3bbb:E, 3bbb:F, 3bbf:A, 3bbf:B, 3bbf:C, 3bbf:D, 3bbf:E, 3bbf:F, 7kpf:B, 7kpf:C, 1nue:A, 1nue:B, 1nue:C, 1nue:D, 1nue:E, 1nue:F, 8pie:A, 8pie:B, 8pie:C, 8pie:D, 8pie:E, 8pie:F, 8pyw:A, 8pyw:B, 8pyw:C, 8pyw:D, 8pyw:E, 8pyw:F
4	3ngs:A	151	151	0.6242	0.6490	0.6490	3.13e-74	4kpc:A, 4kpc:B, 3ngs:C, 3ngt:A, 3ngt:B, 3ngt:C, 3ngt:D, 3ngt:E, 3ngt:F, 3ngt:G, 3ngt:H, 3ngt:I, 3ngt:J, 3ngt:K, 3ngt:M, 3ngt:N, 3ngu:A, 3ngu:B
5	5bxi:B	153	151	0.6242	0.6405	0.6490	4.59e-74	5bxi:A, 5bxi:C, 5bxi:I
6	8oov:B	157	152	0.6242	0.6242	0.6447	4.43e-72	1be4:A, 1be4:B, 1be4:C, 1bhn:A, 1bhn:B, 1bhn:C, 1bhn:D, 1bhn:E, 1bhn:F, 4eno:A, 4eno:B, 2hvd:A, 2hvd:B, 2hvd:C, 2hve:A, 2hve:B, 2hve:C, 8oov:A, 8oov:C, 1ucn:A, 1ucn:B, 1ucn:C, 5ui4:A, 5ui4:B, 5ui4:C, 5ui4:D, 5ui4:E, 5ui4:F, 7zl8:A, 7zl8:B, 7zl8:C, 7zl8:D, 7zl8:E, 7zl8:F, 7zl8:G, 7zl8:H, 7zl8:I, 7zl8:J, 7zl8:K, 7zl8:L, 7zlw:A, 7zlw:B, 7zlw:C, 7zlw:D, 7zlw:F, 7ztk:A, 7ztk:B, 7ztk:C, 7ztk:D, 7ztk:E, 7ztk:F
7	4uof:A	151	151	0.6178	0.6424	0.6424	8.09e-72	4uof:B, 4uof:C, 4uog:A, 4uog:B, 4uog:C, 4uoh:B, 4uoh:C
8	5u2i:B	151	151	0.5987	0.6225	0.6225	6.93e-71	5u2i:D
9	8qvz:C	155	154	0.5605	0.5677	0.5714	1.99e-68	8qvz:A, 8qvz:B, 8qvz:D, 8qvz:E, 8qvz:F, 8qw0:A, 8qw0:B, 8qw0:C, 8qw0:D, 8qw0:E, 8qw0:F, 8qw0:G, 8qw0:H, 8qw0:I, 8qw0:J, 8qw0:K, 8qw0:L, 8qw1:A, 8qw1:B, 8qw1:C, 8qw1:D, 8qw1:E, 8qw1:F, 8qw2:A, 8qw2:B, 8qw2:C, 8qw2:D, 8qw2:E, 8qw2:F, 8qw3:A, 8qw3:B, 8qw3:C, 8qw3:D, 8qw3:E, 8qw3:F, 1zs6:A, 1zs6:B, 1zs6:D
10	5kk8:A	149	148	0.5478	0.5772	0.5811	3.70e-62	5kk8:B
11	4cp5:A	151	140	0.5287	0.5497	0.5929	4.50e-62	1b4s:A, 1b4s:B, 1b4s:C, 1b99:A, 1b99:C, 1b99:D, 1b99:E, 2bef:A, 2bef:B, 2bef:C, 1bux:A, 1bux:B, 1bux:C, 4cp5:B, 4cp5:C, 4cp5:D, 4cp5:E, 4cp5:F, 1f3f:A, 1f3f:B, 1f3f:C, 1f6t:A, 1f6t:B, 1f6t:C, 3fkb:A, 3fkb:B, 3fkb:C, 3fkb:D, 3fkb:E, 3fkb:F, 1hiy:A, 1hiy:B, 1hiy:C, 1kdn:A, 1kdn:B, 1kdn:C, 1lwx:A, 1lwx:B, 1lwx:C, 1mn7:A, 1mn7:B, 1mn9:A, 1mn9:B, 1mn9:C, 1ndc:A, 1ndp:A, 1ndp:B, 1pae:X, 1s5z:A
12	7kpf:F	135	152	0.5924	0.6889	0.6118	4.69e-62
13	1s59:A	153	148	0.5159	0.5294	0.5473	2.66e-60	1s59:C
14	1wkk:A	137	136	0.4713	0.5401	0.5441	2.39e-53	1wkl:A, 1wkl:B
15	3q86:A	149	148	0.4777	0.5034	0.5068	3.26e-53	3q86:B, 3q89:B, 3q89:E, 3q8u:A, 3q8u:B, 3q8u:C, 3q8u:D, 3q8u:E, 3q8u:F, 3q8v:A, 3q8v:B, 3q8v:D, 3q8y:A, 3q8y:B, 3q8y:C, 3q8y:D, 3q8y:E, 3q8y:F, 3q8y:G, 3q8y:H
16	2az1:A	155	151	0.4713	0.4774	0.4901	3.49e-53	2az1:C, 2az1:D, 2az3:A, 2az3:B, 2az3:F, 2az3:C, 2az3:D, 2az3:E, 2az3:G, 2az3:H, 2az3:I
17	2dya:B	155	154	0.4841	0.4903	0.4935	4.78e-50	2dxd:A, 2dxd:B, 2dxe:A, 2dxf:A, 2dy9:A, 2dya:A
18	1nhk:R	144	138	0.4586	0.5000	0.5217	2.34e-47	1nhk:L, 1nlk:R, 1nlk:L
19	4s0m:D	143	138	0.4076	0.4476	0.4638	1.20e-40	5yol:E, 5yol:H
20	3ejm:A	134	134	0.3949	0.4627	0.4627	1.89e-40	3b6b:A, 3b6b:B, 3b6b:C, 3b6b:D, 3b6b:E, 3b6b:F, 2b8q:A, 2b8q:B, 2b8q:C, 2b8q:D, 2b8q:E, 2b8q:F, 3ddi:A, 3ddi:B, 3dkd:A, 3dkd:B, 3ee3:A, 3ee3:B, 3ee3:C, 3ee3:D, 3ee3:E, 3ee3:F, 3eic:A, 3eic:B, 3eic:C, 3eic:D, 3eic:E, 3eic:F, 3ejm:B, 3em1:A, 3em1:B, 3emt:A, 3emt:B, 3ena:A, 3ena:B, 3etm:A, 3etm:B, 3evm:A, 3evm:B, 3evo:A, 3evo:B, 3evw:A, 3evw:B, 3evw:C, 3evw:D, 3evw:E, 3evw:F, 3fbb:A, 3fbb:B, 3fbb:C, 3fbb:D, 3fbb:E, 3fbb:F, 3fbc:A, 3fbc:B, 3fbc:C, 3fbc:D, 3fbc:E, 3fbc:F, 3fbe:A, 3fbe:B, 3fbe:C, 3fbe:D, 3fbe:E, 3fbe:F, 3fbf:A, 3fbf:B, 3fbf:C, 3fbf:D, 3fbf:E, 3fbf:F, 3fc9:A, 3fc9:B, 3fc9:C, 3fc9:D, 3fc9:E, 3fc9:F, 3fcw:A, 3fcw:B, 3fcw:C, 3fcw:D, 3fcw:E, 3fcw:F, 3g2x:A, 3g2x:B, 3g2x:C, 3g2x:D, 3g2x:E, 3g2x:F, 3gp9:A, 3gp9:B, 3gp9:C, 3gp9:D, 3gp9:E, 3gp9:F, 3gpa:A, 3gpa:C, 3gpa:E, 3gpa:B, 3gpa:D, 3gpa:F
21	4ek2:A	142	137	0.4013	0.4437	0.4599	1.55e-39	4hr2:A, 4hr2:B
22	4dz6:A	168	160	0.3694	0.3452	0.3625	1.07e-29	4dz6:B, 4dz6:C, 4dz6:D, 4dz6:E, 4dz6:F
23	6fq3:A	390	80	0.1592	0.0641	0.3125	1.5	6fql:A
24	4wjw:B	673	71	0.1338	0.0312	0.2958	6.4
25	8ulg:A	827	53	0.0828	0.0157	0.2453	8.3	7jsn:A, 6mzb:A, 8ufi:A, 8ugb:A, 8ugs:A

[Back]