BioLiP

>protein
HHGSKKPINVAIFGSTGSIGTNALNIIRECNKIENVFNVKALYVNKSVNELYEQAREFLPEYLCIHDKSVYEELKELVKN
IKDYKPIILCGDEGMKEICSSNSIDKIVIGIDSFQGLYSTMYAIMNNKIVALANKESIVSAGFFLKKLLNIHKNAKIIPV
DSEHSAIFQCLDNNKVIKTKCLQDNFSKINNINKIFLCSSGGPFQNLTMDELKNVTSENALKHPKWKMGKKITIDSATMM
NKGLEVIETHFLFDVDYNDIEVIVHKECIIHSCVEFIDKSVISQMYYPDMQIPILYSLTWPDRIKTNLKPLDLAQVSTLT
FHKPSLEHFPCIKLAYQAGIKGNFYPTVLNASNEIANNLFLNNKIKYFDISSIISQVLESFNSQKVSENSEDLMKQILQI
HSWAKDKATDIYNKHN

The query sequence (length=416) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4gae:A	416	416	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3au8:A, 3au8:B, 3au9:A, 3au9:B, 3aua:A, 3aua:B, 4gae:B, 5jaz:A, 5jaz:B, 5jbi:A, 5jbi:B, 5jc1:A, 5jc1:B, 5jmp:A, 5jmp:B, 5jmw:A, 5jmw:B, 5jnl:A, 5jnl:B, 8jnv:A, 8jnv:B, 8jnw:A, 8jnw:B, 5jo0:A, 5jo0:B, 4kp7:A, 4kp7:B, 3wqq:A, 3wqq:B, 3wqr:A, 3wqr:B, 3wqs:B, 4y67:A, 4y67:B, 4y6p:A, 4y6p:B, 4y6r:A, 4y6r:B, 4y6s:A, 4y6s:B
2	8s65:B	411	416	0.3990	0.4039	0.3990	3.53e-101	8s65:A
3	7s04:A	396	375	0.3582	0.3763	0.3973	7.76e-91
4	4zqg:A	408	396	0.3726	0.3799	0.3914	3.13e-88	4zqf:A, 4zqf:B, 4zqg:B, 4zqh:A, 4zqh:B
5	6mh5:B	375	403	0.3798	0.4213	0.3921	7.93e-88	6mh5:A
6	3anl:A	400	381	0.3413	0.3550	0.3727	2.11e-86	3anl:B, 3anm:A, 3anm:B, 3ann:A, 3ann:B, 2egh:A, 2egh:B, 1jvs:A, 1jvs:B, 1ono:A, 1ono:B, 1onp:A, 1onp:B, 1q0h:A, 1q0l:A, 1q0q:A, 1q0q:B, 3r0i:A, 3r0i:B, 1t1r:A, 1t1r:B, 1t1s:A, 1t1s:B
7	5kqo:A	398	374	0.3413	0.3568	0.3797	4.16e-83	5kqo:B, 5krr:A, 5krr:B, 5ks1:A, 5ks1:B
8	1r0l:B	379	383	0.3317	0.3641	0.3603	6.99e-81	1r0l:A, 1r0l:C, 1r0l:D
9	5dul:B	390	409	0.3462	0.3692	0.3521	1.50e-77	5dul:A, 5dul:D, 3iie:A, 3iie:B
10	4aic:A	379	402	0.3221	0.3536	0.3333	3.62e-72	4a03:A, 4a03:B, 4aic:B, 2c82:A, 2c82:B, 2jcv:A, 2jcv:B, 2jcx:A, 2jcx:B, 2jd0:A, 2jd1:A, 2jd1:B, 2jd2:A, 2jd2:B, 4ooe:A, 4ooe:B, 4ooe:C, 4ooe:D, 4oof:A, 4oof:B, 3ras:A, 3ras:B, 4rcv:A, 4rcv:B, 2y1c:A, 2y1c:B, 2y1d:B, 2y1e:A, 2y1e:B, 2y1f:A, 2y1f:B, 2y1g:A, 2y1g:B, 3zhx:A, 3zhx:B, 3zhy:A, 3zhy:B, 3zhz:A, 3zi0:A, 3zi0:B
11	5dul:C	367	407	0.3245	0.3678	0.3317	2.81e-64
12	2y1d:A	359	401	0.3173	0.3677	0.3292	3.38e-62
13	3a06:B	373	404	0.3029	0.3378	0.3119	2.98e-60	3a06:A, 3a14:A, 3a14:B
14	8ssk:D	306	57	0.0481	0.0654	0.3509	0.24	8ssk:A, 8ssk:B, 8ssk:C
15	8xku:C	921	75	0.0601	0.0271	0.3333	0.97	8xkv:C
16	2r00:C	336	21	0.0264	0.0327	0.5238	2.1
17	3jsa:A	321	51	0.0481	0.0623	0.3922	2.7
18	2vn4:A	599	62	0.0337	0.0234	0.2258	3.4	2vn7:A
19	3szj:A	120	30	0.0288	0.1000	0.4000	7.1	3szj:B, 3t2w:A
20	2dm6:B	333	66	0.0481	0.0601	0.3030	8.6	2dm6:A, 1v3t:A, 1v3t:B, 1v3v:A, 1v3v:B
21	5kdr:A	301	30	0.0288	0.0399	0.4000	8.7

[Back]