Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
HHANIDESKIKDTVDDLIQPLMQKNNIPGMSVAVTVNGKNYIYNYGLAAKQPQQPVTENTLFEVGSLSKTFAATLASYAQ
VSGKLSLDQSVSHYVPELRGSSFDHVSVLNVGTHTSGLQLFMPEDIKNTTQLMAYLKAWKPADAAGTHRVYSNIGTGLLG
MIAAKSLGVSYEDAIEKTLLPQLGMHHSYLKVPADQMENYAWGYNKKDEPVHVNMEILGNEAYGIKTTSSDLLRYVQANM
GQLKLAKMQQALTATHTGYFKSGEITQDLMWEQLPYPVSLPNLLTGNDMAMTKSVATPIVPPLPPQENVWINKTGSTNGF
GAYIAFVPAKKMGIVMLANKNYSIDQRVTVAYKILSSLEGNK

The query sequence (length=362) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6kby:A 362 362 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 6k9t:A, 6ka5:A, 6m5p:A, 6m5q:A
2 5f1f:A 361 352 0.4558 0.4571 0.4688 4.19e-115 5k1d:A, 5k1f:A, 3w8k:A, 4wbg:A, 1zkj:A, 5zyb:A
3 5cgw:A 362 356 0.4641 0.4641 0.4719 6.04e-114 5cgs:A, 5cgx:A, 5chj:A, 5chj:B, 5chm:A, 5chu:B, 5za2:A, 5za2:B
4 6fm7:A 356 354 0.4503 0.4579 0.4605 2.55e-109
5 3ws1:A 360 354 0.4392 0.4417 0.4492 9.34e-108 3wrz:A, 3wrz:B, 3ws0:A, 3ws0:B, 3ws0:C, 3ws1:B, 3ws1:C, 3ws2:A, 3ws2:B, 3ws2:C, 3ws5:B
6 6s1s:A 367 356 0.4392 0.4332 0.4466 1.67e-105 4hef:A, 6i30:A, 4nk3:A, 4ooy:A, 3s1y:A, 3s22:A, 8sdr:A, 8sds:A, 8sdt:A, 8sdv:A, 6uqs:A, 6uqt:A, 6uqu:A, 6ur3:A, 4wyy:A, 2wzx:A, 2wzz:A, 4wz4:A, 4x68:A, 4x68:B
7 1fr6:A 361 358 0.4061 0.4072 0.4106 1.83e-95 1fr6:B, 8jb8:A, 8jb8:B, 1rgy:A
8 8ttp:B 359 356 0.3895 0.3928 0.3961 4.23e-95 3bls:A, 3bls:B, 3bm6:A, 3bm6:B, 1c3b:A, 1c3b:B, 9c6p:A, 9c6p:B, 9c81:A, 9c81:B, 9c83:A, 9c83:B, 9c84:A, 9c84:B, 9c8j:A, 9c8j:B, 7cin:A, 7cin:B, 6dpt:A, 6dpt:B, 6dpx:A, 6dpx:B, 6dpy:A, 6dpy:B, 6dpz:A, 6dpz:B, 4e3i:A, 4e3i:B, 4e3j:A, 4e3j:B, 4e3k:A, 4e3k:B, 4e3l:A, 4e3l:B, 4e3m:A, 4e3m:B, 4e3n:A, 4e3n:B, 4e3o:A, 4e3o:B, 5f1g:A, 1fcm:A, 1fcm:B, 1fcn:A, 1fcn:B, 1fco:A, 1fco:B, 2ffy:A, 2ffy:B, 3fkv:A, 3fkv:B, 1fsw:A, 1fsw:B, 1fsy:A, 1fsy:B, 1ga9:A, 1ga9:B, 3gqz:A, 3gr2:A, 3grj:A, 3grj:B, 3gsg:A, 3gsg:B, 3gtc:A, 3gtc:B, 3gv9:A, 3gv9:B, 3gvb:A, 5gzw:A, 5gzw:B, 2hdq:A, 2hdq:B, 2hdr:A, 2hdr:B, 2hds:A, 2hds:B, 2hdu:A, 2hdu:B, 1i5q:A, 1i5q:B, 2i72:A, 2i72:B, 1iel:A, 1iel:B, 1iem:A, 1iem:B, 3iwo:A, 3iwo:B, 3ixb:B, 3ixb:A, 3ixg:B, 3ixh:B, 4jxg:B, 4jxg:A, 4jxs:B, 4jxv:A, 4jxv:B, 4jxw:A, 4jxw:B, 1kds:A, 1kds:B, 1kdw:A, 1kdw:B, 1ke0:A, 1ke0:B, 1ke3:A, 1ke3:B, 4ken:B, 4kg2:B, 4kg2:A, 4kg5:B, 4kg5:A, 4kg5:C, 4kg5:D, 1kvl:A, 1kvl:B, 1kvm:B, 4kz3:A, 4kz3:B, 4kz4:B, 4kz5:A, 4kz5:B, 4kz6:B, 4kz7:A, 4kz7:B, 4kz8:A, 4kz8:B, 4kz9:A, 4kza:A, 4kza:B, 4kzb:A, 4kzb:B, 1l0g:A, 1l2s:A, 1l2s:B, 1ll5:A, 1ll5:B, 1ll9:B, 1llb:B, 4lv0:A, 4lv0:B, 4lv1:A, 4lv1:B, 4lv2:A, 4lv2:B, 4lv3:A, 4lv3:B, 1mxo:A, 1mxo:B, 1my8:A, 1my8:B, 1o07:A, 1o07:B, 3o86:A, 3o86:B, 3o87:A, 3o87:B, 3o88:A, 3o88:B, 4okp:B, 4old:A, 4old:B, 4olg:A, 4olg:B, 1pi4:A, 1pi4:B, 1pi5:A, 1pi5:B, 2pu2:A, 2pu2:B, 2pu4:A, 2pu4:B, 2r9w:A, 2r9w:B, 2r9x:A, 2r9x:B, 2rcx:A, 2rcx:B, 6t35:A, 6t5y:A, 6t7l:A, 6tbw:A, 6tpm:A, 8ttp:A, 6whf:A, 6whf:B, 6xfs:A, 6xfs:B, 6xfs:C, 6xfs:D, 1xgi:B, 1xgj:A, 1xgj:B, 6yen:A, 6yeo:A, 6yeo:B, 6yeo:C, 6yeo:D, 6ypd:A
9 8cup:B 360 358 0.3867 0.3889 0.3911 1.09e-88 8cup:A, 8cuq:B, 8cuq:A, 8fqm:A, 8fqm:B, 8fqm:C, 8fqm:D, 8fqn:A, 8fqo:B, 8fqo:A, 8fqp:B, 8fqp:A, 8fqq:A, 8fqq:B, 8fqr:B, 8fqs:B, 8fqu:B, 8fqu:A, 8fqw:B, 8fqw:A, 6pwl:A, 6pwl:B, 6pwl:C, 6pwl:D, 6pwm:A, 6pwm:B, 6pwm:C, 6pwm:D, 6tzf:A, 6tzf:B, 6tzf:C, 6tzf:D, 6tzg:A, 6tzg:B, 6tzg:C, 6tzg:D, 6tzh:A, 6tzh:B, 6tzh:C, 6tzh:D, 6tzi:A, 6tzi:B, 6tzi:C, 6tzi:D, 6tzj:A, 6tzj:B, 6tzj:C, 6tzj:D, 4u0x:B, 4u0x:A, 4u0x:C, 4u0x:D, 5w12:A, 5w12:B, 5w12:C, 5w12:D, 5w13:A, 5w13:B, 5w13:C, 5w13:D, 5w14:A, 5w14:B, 5w14:C, 5w14:D, 5wac:A, 5wac:B, 5wac:C, 5wac:D, 5wad:A, 5wad:B, 5wad:C, 5wad:D, 5wae:A, 5wae:B, 5wae:C, 5wae:D, 5waf:A, 5waf:B, 5waf:C, 5waf:D, 5wag:B, 5wag:A, 5wag:C, 5wag:D, 6wif:A, 6wif:B, 6wif:C, 6wif:D
10 6lc8:A 357 357 0.3702 0.3754 0.3754 2.87e-87 6lc9:A
11 3s4x:A 367 360 0.3674 0.3624 0.3694 3.82e-84 1bls:A, 1bls:B, 1ga0:A, 1onh:A, 1q2q:A, 2q9m:A, 2q9n:A, 1rgz:A, 1s6r:A, 7ti1:A, 5xhr:A, 4xux:A, 1y54:A
12 6lc8:B 318 357 0.3370 0.3836 0.3417 1.22e-71 6lc9:B
13 2qmi:F 447 363 0.2486 0.2013 0.2479 2.76e-15 2qmi:E, 2qmi:G, 2qmi:H
14 7v1y:A 394 304 0.2044 0.1878 0.2434 6.13e-12 7v1y:C, 7v1y:B, 7v1y:D
15 4e6x:C 305 342 0.2265 0.2689 0.2398 6.74e-12 4e6x:B
16 7mdf:A 453 345 0.2238 0.1788 0.2348 1.13e-11 4e6w:A, 4e6w:B, 4e6w:C, 7mdc:A
17 6kjj:A 361 152 0.1160 0.1163 0.2763 4.53e-11 6kjp:A, 6kjq:A, 6kjr:A
18 2dns:A 362 175 0.1409 0.1409 0.2914 3.03e-10 2dns:B, 2dns:C, 2dns:D, 2dns:E, 2efu:A, 2efu:B, 2efu:C, 2efu:D, 2efx:A, 2efx:B, 2efx:C, 2efx:D, 2efx:E
19 2efu:E 342 194 0.1492 0.1579 0.2784 7.00e-09 2efu:F, 2efx:F
20 1cef:A 347 268 0.2017 0.2104 0.2724 1.24e-08 1ceg:A, 1hvb:A, 1ikg:A, 1iki:A, 1mpl:A, 1pw1:A, 1pw8:A, 1pwc:A, 1pwd:A, 1pwg:A, 1scw:A, 1sde:A, 1yqs:A
21 3wwx:A 340 204 0.1602 0.1706 0.2843 1.81e-08
22 4ivk:A 404 105 0.0912 0.0817 0.3143 3.30e-07
23 1ci9:A 377 123 0.0912 0.0875 0.2683 4.00e-07 1ci9:B
24 6ksv:A 427 190 0.1492 0.1265 0.2842 5.17e-07 6ksv:B
25 8rlk:A 385 203 0.1547 0.1455 0.2759 5.27e-07 8rlk:B, 8rlk:C, 8rlk:D
26 5tgf:D 332 181 0.1160 0.1265 0.2320 5.51e-06
27 7pp8:A 402 298 0.1906 0.1716 0.2315 9.10e-06 7pp8:B, 7pp8:C, 7pp8:D, 7pp8:E, 7pp8:F, 7pp8:G, 7pp8:H, 7pu6:A, 7pu6:B, 7pu6:C, 7pu6:D, 7pu6:E, 7pu6:F, 7pu6:G, 7pu6:H
28 3a65:A 384 191 0.1215 0.1146 0.2304 0.002 3a66:A, 2dcf:A, 3vwp:A, 3vwq:A, 3vwr:A, 2zm7:A, 2zm8:A, 2zm9:A, 2zma:A
29 8aji:A 348 162 0.1133 0.1178 0.2531 0.039 8aji:B, 8aji:C, 8aji:D, 8akh:A, 8akh:B
30 3hlf:A 425 249 0.1354 0.1153 0.1968 2.4 3hld:A, 3hle:A, 3hlg:A
31 1xdp:A 687 114 0.0801 0.0422 0.2544 4.3 1xdp:B
32 1u7c:A 383 63 0.0552 0.0522 0.3175 5.2 6b21:A, 4nh2:C, 4nh2:D, 4nh2:E, 4nh2:B, 1u7g:A
33 5xe0:A 457 49 0.0470 0.0372 0.3469 5.2 5zit:A
34 8a1r:A 593 41 0.0414 0.0253 0.3659 6.6 8a1r:B, 7b02:A, 6fmu:A, 6fmz:A, 6fp4:A, 6ftc:A, 3h4k:A, 4la1:A, 4la1:B, 7npx:A, 7npx:B, 8pdd:A, 8pdd:B, 8pl0:A, 8pl0:B, 8pl1:A, 8pl1:B, 8pl2:A, 8pl2:B, 8pl3:A, 8pl3:B, 8pl4:A, 8pl4:B, 8pl5:A, 8pl5:B, 8pl6:A, 8pl7:A, 8pl7:B, 8pl8:A, 8pl9:A, 8pl9:B, 8pla:A, 8pla:B, 8plb:A, 8plb:B, 8plc:A, 8plc:B, 8pld:A, 8pld:B, 8ple:A, 8ple:B, 8plf:A, 8plf:B, 8plg:A, 8plh:A, 8pli:A, 8pli:B, 8plj:A, 8plj:B, 8plk:A, 8plk:B, 8pll:A, 8plm:A, 8pln:A, 8plo:A, 8plo:B, 8plp:A, 8plp:B, 8plq:A, 8plq:B, 8plr:A, 8plr:B, 8pls:A, 8pls:B, 8plt:A, 8plt:B, 8plu:A, 8plu:B, 8plv:A, 8plv:B, 8plw:A, 8plw:B, 8plx:A, 8plx:B, 8ply:A, 8ply:B, 6rtj:A, 6rtm:A, 6rto:A, 2v6o:A, 2x8c:A, 2x8c:B, 2x8g:A, 2x8h:A, 2x99:A, 6zlb:A, 6zlp:A, 6zp3:A, 6zst:A
35 6am0:F 178 104 0.0691 0.1404 0.2404 8.5 6am0:B
36 6kjd:B 400 92 0.0691 0.0625 0.2717 8.9 6kjd:A, 6kje:B, 6kje:A, 6kjf:B, 6kjf:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218