BioLiP

>protein
HGVCWIYYPDGGSLVGEVNEDGEMTGEKIAYVYPDERTALYGKFIDGEMIEGKLATLMSTEEGRPHFELMPGNSVYHFDK
STSSCISTNALLPDPYESERVYVAESLISSAGEGLFSKVAVGPNTVMSFYNGVRITHQEVDSRDWALNGNTLSLDEETVI
DVPEPYNHVSKYCASLGHKANHSFTPNCIYDMFVHPRFGPIKCIRTLRAVEADEELTVAYGYDHSPGPEAPEWYQVELKA
FQATQQ

The query sequence (length=246) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1h3i:B	293	226	0.9187	0.7713	1.0000	1.02e-170	5ayf:A, 3cbm:A, 3cbo:A, 3cbp:A, 4e47:A, 4e47:B, 4e47:C, 4e47:D, 5eg2:A, 2f69:A, 4j7f:A, 4j7i:A, 4j83:A, 4j8o:A, 4jds:A, 4jds:B, 4jds:C, 4jds:D, 4jlg:A, 4jlg:B, 3m53:A, 3m54:A, 3m55:A, 3m56:A, 3m57:A, 3m58:A, 3m59:A, 3m5a:A, 1mt6:A, 1n6a:A, 1n6c:A, 1o9s:A, 1o9s:B, 3os5:A, 3vuz:A, 3vv0:A, 1xqh:A, 1xqh:E, 5ylt:A
2	7td5:F	447	206	0.2114	0.1163	0.2524	8.74e-06
3	7td5:A	497	206	0.2114	0.1046	0.2524	1.03e-05
4	7kso:A	395	201	0.2073	0.1291	0.2537	4.79e-05	7ksr:A, 7ktp:A
5	7at8:A	311	175	0.1870	0.1479	0.2629	3.58e-04
6	8t9g:C	536	122	0.1463	0.0672	0.2951	5.01e-04	8fyh:A, 8fyh:G
7	5ij7:B	469	122	0.1463	0.0768	0.2951	5.26e-04	6b3w:A, 6b3w:B, 6c23:K, 6c24:K, 5ij7:A, 5ij8:A, 5ij8:B, 4w2r:A, 4w2r:B
8	8tas:E	570	122	0.1463	0.0632	0.2951	5.57e-04	8tb9:E
9	6wkr:C	606	122	0.1463	0.0594	0.2951	5.92e-04	4mi0:A, 4mi5:A, 8t9g:I
10	5hyn:A	581	122	0.1463	0.0620	0.2951	6.02e-04	5hyn:F, 5hyn:K, 5hyn:Q, 5ls6:A, 5ls6:G, 5ls6:J, 5ls6:D
11	9c8u:A	475	122	0.1463	0.0758	0.2951	6.32e-04
12	5wg6:A	517	122	0.1463	0.0696	0.2951	8.90e-04	5wg6:C
13	7w6l:C	158	134	0.1504	0.2342	0.2761	0.032	5f59:A, 5f6k:C, 5f6k:E, 6kiw:K, 7w6l:E
14	7bre:B	163	116	0.1179	0.1779	0.2500	0.066	7bre:E
15	6nzo:S	233	138	0.1504	0.1588	0.2681	0.11	6px3:S
16	4au7:A	243	41	0.0691	0.0700	0.4146	0.47	4au7:B, 3rq4:A
17	5d6j:A	630	30	0.0488	0.0190	0.4000	2.5	5ey8:A, 5ey8:B, 5ey8:C, 5ey8:D, 5ey8:E, 5ey8:F, 5ey8:G, 5ey8:H, 5icr:A, 5icr:B, 5icr:C, 5icr:D
18	2y2l:B	476	124	0.0976	0.0504	0.1935	2.8	2fff:B, 2jch:A, 2je5:A, 2je5:B, 2xd1:A, 2xd1:B, 2xd5:A, 2xd5:B, 2y2g:A, 2y2g:B, 2y2h:A, 2y2h:B, 2y2i:A, 2y2j:A, 2y2k:A, 2y2l:A, 2y2m:A, 2y2n:A, 2y2o:A, 2y2p:A, 2y2q:A, 2y2q:B, 7zui:AAA, 7zuj:AAA, 7zuk:AAA, 7zul:AAA
19	4f3s:A	231	49	0.0691	0.0736	0.3469	3.9	4dz1:A
20	3ufx:B	378	76	0.0772	0.0503	0.2500	4.5	3ufx:E, 3ufx:G, 3ufx:I
21	5tfm:A	320	43	0.0569	0.0437	0.3256	5.3	5tfl:A, 5tfl:B
22	5diy:A	463	76	0.0772	0.0410	0.2500	6.7	5diy:B
23	4xpi:A	479	42	0.0569	0.0292	0.3333	9.0	2afh:A, 2afh:C, 2afi:A, 2afi:C, 2afi:I, 2afi:K, 6bbl:A, 6bbl:C, 8bts:A, 8bts:C, 8bts:H, 8bts:J, 5bvg:A, 5bvg:C, 5bvh:A, 5bvh:C, 6cdk:A, 6cdk:C, 8crs:A, 8crs:C, 5cx1:A, 5cx1:C, 5cx1:E, 5cx1:G, 5cx1:I, 5cx1:K, 5cx1:M, 5cx1:O, 8dbx:A, 8dbx:C, 8dby:A, 8dby:C, 8dfc:A, 8dfc:C, 8dfd:A, 8dfd:C, 8dpn:A, 8dpn:C, 8e3t:A, 8e3t:C, 8e3u:A, 8e3u:C, 8e3v:A, 8e3v:C, 8enl:A, 8enm:A, 8enm:C, 8enn:A, 8enn:C, 8eno:A, 1fp4:A, 1fp4:C, 1g20:A, 1g20:C, 1g21:A, 1g21:C, 7jrf:A, 7jrf:C, 3k1a:A, 3k1a:C, 1m1n:A, 1m1n:C, 1m1n:E, 1m1n:G, 1m1y:A, 1m1y:C, 1m1y:I, 1m1y:K, 1m34:A, 1m34:C, 1m34:I, 1m34:K, 7mci:A, 7mci:C, 2min:A, 2min:C, 3min:A, 3min:C, 1n2c:A, 1n2c:C, 4nd8:A, 4nd8:C, 6o7l:A, 6o7l:C, 6o7m:A, 6o7m:C, 6o7n:A, 6o7n:C, 6o7o:A, 6o7o:C, 6o7p:A, 6o7p:C, 6o7q:A, 6o7q:C, 6o7r:A, 6o7r:C, 6o7s:A, 6o7s:C, 6op1:A, 6op1:C, 6op2:A, 6op2:C, 6op3:A, 6op3:C, 6op4:A, 6op4:C, 8p8g:A, 8p8g:C, 4tku:A, 4tku:C, 4tkv:A, 4tkv:C, 3u7q:A, 3u7q:C, 6ug0:A, 6ug0:C, 7ut6:A, 7ut6:C, 7ut7:A, 7ut7:C, 7ut8:A, 7ut8:C, 7ut9:A, 7ut9:C, 7uta:A, 7uta:C, 5vq4:A, 5vq4:C, 6vxt:A, 6vxt:C, 4wna:A, 4wna:C, 4wza:A, 4wza:C, 4wzb:A, 4wzb:C, 4xpi:C
24	6tg9:A	949	133	0.1545	0.0400	0.2857	9.1	6tg9:E, 6tga:A, 6tga:E
25	8enl:C	382	42	0.0569	0.0366	0.3333	9.2
26	5wfd:B	774	132	0.1341	0.0426	0.2500	9.4	5wfc:B
27	8eno:C	407	42	0.0569	0.0344	0.3333	10.0	1l5h:A

[Back]