BioLiP

>protein
HGVCWIYYPDGGSLVGEVNEDGEMTGEKIAYVYPDERTALYGKFIDGEMIEGKLATLMSTEEGRPHFELMPGNSVYHFDK
STSSCISTNALLPDPYESERVYVAESLISSAGEGLFSKVAVGPNTVMSFYNGVRITHQEVDSRDWALNGNTLSLDEETVI
DVPEPYNHVSKYCASLGHKANHSFTPNCIYDMFVHPRFGPIKCIRTLRAVEADEELTVAYGYDGPEAPEWYQVELKAFQA
TQQKHH

The query sequence (length=246) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1h3i:B	293	223	0.9065	0.7611	1.0000	4.25e-168	5ayf:A, 3cbm:A, 3cbo:A, 3cbp:A, 4e47:A, 4e47:B, 4e47:C, 4e47:D, 5eg2:A, 2f69:A, 4j7f:A, 4j7i:A, 4j83:A, 4j8o:A, 4jds:A, 4jds:B, 4jds:C, 4jds:D, 4jlg:A, 4jlg:B, 3m53:A, 3m54:A, 3m55:A, 3m56:A, 3m57:A, 3m58:A, 3m59:A, 3m5a:A, 1mt6:A, 1n6a:A, 1n6c:A, 1o9s:A, 1o9s:B, 3os5:A, 3vuz:A, 3vv0:A, 1xqh:A, 1xqh:E, 5ylt:A
2	7td5:F	447	215	0.2276	0.1253	0.2605	1.40e-06
3	7td5:A	497	215	0.2195	0.1087	0.2512	1.95e-06
4	7at8:A	311	184	0.1951	0.1543	0.2609	5.00e-05
5	7kso:A	395	201	0.2073	0.1291	0.2537	5.29e-05	7ksr:A, 7ktp:A
6	8t9g:C	536	131	0.1545	0.0709	0.2901	9.96e-05	8fyh:A, 8fyh:G
7	8tas:E	570	131	0.1545	0.0667	0.2901	1.25e-04	8tb9:E
8	6wkr:C	606	131	0.1545	0.0627	0.2901	1.32e-04	4mi0:A, 4mi5:A, 8t9g:I
9	5hyn:A	581	131	0.1545	0.0654	0.2901	1.37e-04	5hyn:F, 5hyn:K, 5hyn:Q, 5ls6:A, 5ls6:G, 5ls6:J, 5ls6:D
10	5ij7:B	469	124	0.1504	0.0789	0.2984	3.35e-04	6b3w:A, 6b3w:B, 6c23:K, 6c24:K, 5ij7:A, 5ij8:A, 5ij8:B, 4w2r:A, 4w2r:B
11	9c8u:A	475	127	0.1504	0.0779	0.2913	3.88e-04
12	5wg6:A	517	119	0.1463	0.0696	0.3025	0.001	5wg6:C
13	7w6l:C	158	134	0.1504	0.2342	0.2761	0.035	5f59:A, 5f6k:C, 5f6k:E, 6kiw:K, 7w6l:E
14	7bre:B	163	116	0.1179	0.1779	0.2500	0.067	7bre:E
15	6nzo:S	233	137	0.1504	0.1588	0.2701	0.13	6px3:S
16	4au7:A	243	41	0.0691	0.0700	0.4146	0.48	4au7:B, 3rq4:A
17	5kod:D	566	73	0.0813	0.0353	0.2740	1.1
18	7vka:A	595	65	0.0691	0.0286	0.2615	2.6	5kod:A, 5kod:B, 5kod:C, 7vka:B
19	5d6j:A	630	30	0.0488	0.0190	0.4000	2.7	5ey8:A, 5ey8:B, 5ey8:C, 5ey8:D, 5ey8:E, 5ey8:F, 5ey8:G, 5ey8:H, 5icr:A, 5icr:B, 5icr:C, 5icr:D
20	2y2l:B	476	124	0.0976	0.0504	0.1935	3.4	2fff:B, 2jch:A, 2je5:A, 2je5:B, 2xd1:A, 2xd1:B, 2xd5:A, 2xd5:B, 2y2g:A, 2y2g:B, 2y2h:A, 2y2h:B, 2y2i:A, 2y2j:A, 2y2k:A, 2y2l:A, 2y2m:A, 2y2n:A, 2y2o:A, 2y2p:A, 2y2q:A, 2y2q:B, 7zui:AAA, 7zuj:AAA, 7zuk:AAA, 7zul:AAA
21	4f3s:A	231	49	0.0691	0.0736	0.3469	4.4	4dz1:A
22	3ufx:B	378	76	0.0772	0.0503	0.2500	4.7	3ufx:E, 3ufx:G, 3ufx:I
23	5tfm:A	320	43	0.0569	0.0437	0.3256	5.4	5tfl:A, 5tfl:B
24	8t9f:K	264	73	0.0976	0.0909	0.3288	6.4	4bup:A, 4bup:B, 5cpr:B, 8jhf:K, 8jhg:K, 3s8p:A, 3s8p:B, 5wbv:A, 5wbv:B, 7yrd:K, 7yrg:K
25	5wfd:B	774	126	0.1260	0.0401	0.2460	6.4	5wfc:B
26	7yrg:L	240	70	0.0935	0.0958	0.3286	6.7
27	5diy:A	463	76	0.0772	0.0410	0.2500	7.7	5diy:B

[Back]