BioLiP

>protein
HGVCWIYYPDGGSLVGEVNEDGEMTGEKIAYVYPDERTALYGKFIDGEMIEGKLATLMSTEEGRPHFELMPGNSVYHFDK
STSSCISTNALLPDPYESERVYVAESLISSAGEGLFSKVAVGPNTVMSFANGVRITHQEVDSRDWALNGNTLSLDEETVI
DVPEPYNHVSKYCASLGHKANHSFTPNCIYDMFVHPRFGPIKCIRTLRAVEADEELTVAYGYDHSPPEAPEWYQVELKAF
QATQ

The query sequence (length=244) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1h3i:B	293	227	0.9262	0.7713	0.9956	7.65e-171	5ayf:A, 3cbm:A, 3cbo:A, 3cbp:A, 4e47:A, 4e47:B, 4e47:C, 4e47:D, 5eg2:A, 2f69:A, 4j7f:A, 4j7i:A, 4j83:A, 4j8o:A, 4jds:A, 4jds:B, 4jds:C, 4jds:D, 4jlg:A, 4jlg:B, 3m53:A, 3m54:A, 3m55:A, 3m56:A, 3m57:A, 3m58:A, 3m59:A, 3m5a:A, 1mt6:A, 1n6a:A, 1n6c:A, 1o9s:A, 1o9s:B, 3os5:A, 3vuz:A, 3vv0:A, 1xqh:A, 1xqh:E, 5ylt:A
2	7td5:F	447	206	0.2090	0.1141	0.2476	1.17e-04
3	7td5:A	497	206	0.2090	0.1026	0.2476	1.22e-04
4	7kso:A	395	201	0.2049	0.1266	0.2488	6.05e-04	7ksr:A, 7ktp:A
5	7at8:A	311	122	0.1434	0.1125	0.2869	0.004
6	8t9g:C	536	122	0.1434	0.0653	0.2869	0.006	8fyh:A, 8fyh:G
7	5ij7:B	469	122	0.1434	0.0746	0.2869	0.006	6b3w:A, 6b3w:B, 6c23:K, 6c24:K, 5ij7:A, 5ij8:A, 5ij8:B, 4w2r:A, 4w2r:B
8	5hyn:A	581	122	0.1434	0.0602	0.2869	0.006	5hyn:F, 5hyn:K, 5hyn:Q, 5ls6:A, 5ls6:G, 5ls6:J, 5ls6:D
9	9c8u:A	475	122	0.1434	0.0737	0.2869	0.007
10	6wkr:C	606	122	0.1434	0.0578	0.2869	0.007	4mi0:A, 4mi5:A, 8t9g:I
11	8tas:E	570	122	0.1434	0.0614	0.2869	0.007	8tb9:E
12	5wg6:A	517	122	0.1434	0.0677	0.2869	0.010	5wg6:C
13	7w6l:C	158	134	0.1475	0.2278	0.2687	0.42	5f59:A, 5f6k:C, 5f6k:E, 6kiw:K, 7w6l:E
14	4au7:A	243	41	0.0697	0.0700	0.4146	0.50	4au7:B, 3rq4:A
15	6nzo:S	233	54	0.0820	0.0858	0.3704	0.54	6px3:S
16	2y2l:B	476	124	0.0984	0.0504	0.1935	2.0	2fff:B, 2jch:A, 2je5:A, 2je5:B, 2xd1:A, 2xd1:B, 2xd5:A, 2xd5:B, 2y2g:A, 2y2g:B, 2y2h:A, 2y2h:B, 2y2i:A, 2y2j:A, 2y2k:A, 2y2l:A, 2y2m:A, 2y2n:A, 2y2o:A, 2y2p:A, 2y2q:A, 2y2q:B, 7zui:AAA, 7zuj:AAA, 7zuk:AAA, 7zul:AAA
17	6ven:N	218	135	0.1393	0.1560	0.2519	2.4
18	5d6j:A	630	30	0.0492	0.0190	0.4000	2.5	5ey8:A, 5ey8:B, 5ey8:C, 5ey8:D, 5ey8:E, 5ey8:F, 5ey8:G, 5ey8:H, 5icr:A, 5icr:B, 5icr:C, 5icr:D
19	5kis:A	1446	65	0.0656	0.0111	0.2462	3.1
20	5diy:A	463	84	0.0779	0.0410	0.2262	3.8	5diy:B
21	4f3s:A	231	49	0.0697	0.0736	0.3469	4.0	4dz1:A
22	5tfm:A	320	43	0.0574	0.0437	0.3256	5.1	5tfl:A, 5tfl:B
23	7ane:ae	584	30	0.0574	0.0240	0.4667	9.0
24	5kod:D	566	75	0.0779	0.0336	0.2533	9.1

[Back]