BioLiP

>protein
HGHMQTLIFLDLEATGLPSSRPEVTELCLLAVHRRALENTSISQGHPPPVPRPPRVVDKLSLCIAPGKACSPGASEITGL
SKAELEVQGRQRFDDNLAILLRAFLQRQPQPCCLVAHNGDRYDFPLLQTELARLSTPSPLDGTFCVDSIAALKALEQASS
KSYSLGSIYTRLYWQAPTDSHTAEGDVLTLLSICQWKPQALLQWVDEHARPFSTVKPMYG

The query sequence (length=220) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5yws:B	234	227	1.0000	0.9402	0.9692	2.49e-161	3b6o:A, 3b6o:B, 3b6o:C, 3b6o:D, 3b6p:A, 3b6p:B, 3b6p:C, 3b6p:D, 8hcc:A, 8hcc:B, 8hcc:C, 8hcc:D, 8hcd:B, 8hcd:C, 8hcd:D, 8hcd:E, 8hce:B, 8hcf:B, 8hcg:A, 8hch:A, 8hch:B, 8hch:C, 8hch:D, 2ioc:B, 2ioc:A, 3mxi:B, 3mxi:A, 3mxm:A, 3mxm:B, 2o4g:A, 2o4g:B, 2o4g:C, 2o4g:D, 2o4i:A, 2o4i:B, 2oa8:B, 2oa8:A, 3u3y:A, 3u3y:B, 3u6f:B, 3u6f:A, 7u8y:A, 7u8y:B, 4ynq:A, 4ynq:C, 4ynq:D, 4ynq:B, 5yws:A, 5ywt:B, 5ywt:A, 5ywu:A, 5ywu:B, 5ywv:A, 5ywv:B
2	8vl7:C	224	226	0.7727	0.7589	0.7522	1.49e-103	9ava:A, 9ava:B, 9ava:C, 9ava:D, 9ava:E, 9ava:F, 9ava:G, 9ava:H, 9ava:I, 9ava:J, 9ava:K, 9ava:L, 7tqq:A, 7tqq:B, 7tqq:E, 7tqq:F, 8vl7:A, 8vl7:B, 8vl7:D, 8vl7:E, 8vl7:F, 8vl7:G, 8vl7:H
3	6a47:A	224	217	0.4727	0.4643	0.4793	4.41e-59	6a46:A, 6a46:B, 6a47:B, 6a4b:B, 6a4b:A, 6a4b:C, 6a4b:D, 6a4b:E, 6a4b:F
4	3q2t:A	205	30	0.0545	0.0585	0.4000	0.72	3bho:A, 3mdg:A, 3mdi:A, 3p6y:A, 3p6y:B, 3p6y:E, 3p6y:I, 3p6y:M, 3p6y:N, 3p6y:F, 3q2t:B, 5r4p:A, 5r4p:B, 5r4q:A, 5r4q:B, 5r4r:A, 5r4r:B, 5r4s:A, 5r4s:B, 5r4t:A, 5r4t:B, 5r4u:A, 5r4u:B, 5r64:A, 5r64:B, 5r65:A, 5r65:B, 5r66:A, 5r66:B, 5r67:A, 5r67:B
5	4ail:C	750	37	0.0591	0.0173	0.3514	0.81	2jgu:A
6	3c9f:B	540	42	0.0682	0.0278	0.3571	2.6	3c9f:A
7	8dvv:A	3886	104	0.1364	0.0077	0.2885	3.2	8dvv:B, 8dvv:C, 8dvv:D
8	4flu:A	758	34	0.0500	0.0145	0.3235	4.8	4flt:A, 4flv:A, 4flw:A, 4flx:A, 4fly:A, 4flz:A, 4fm0:A, 4fm1:A, 4fm2:A
9	4k8x:A	759	37	0.0545	0.0158	0.3243	5.7	6is7:A, 6is7:B, 6isf:A, 6isf:B, 6isg:A, 6ish:A, 6isi:A, 4k8z:A, 5omf:A, 5omq:A, 5omv:A, 7om3:A, 7omb:A, 7omg:A, 6q4t:A, 7rsr:A, 7rss:A, 7rsu:A, 8t3x:A, 7tqw:A, 5vu6:A, 5vu7:A, 5vu9:A
10	3j9w:AC	210	138	0.1545	0.1619	0.2464	6.0	8buu:c, 8cdu:E, 8cec:H, 8ced:E, 8cee:E, 6ha1:c, 6ha8:c, 6htq:c, 5njt:C, 7o5b:C, 8qcq:c, 7qgu:h, 7qh4:g, 8qpp:C, 7qv1:c, 7qv2:c, 7qv3:c, 8r55:C
11	6jgz:B	3485	107	0.1273	0.0080	0.2617	7.5	6jg3:A, 6jg3:B, 6jg3:C, 6jg3:D, 6jgz:D, 6jgz:F, 6jgz:H, 6jh6:B, 6jh6:D, 6jh6:F, 6jh6:H, 6jhn:A, 6jhn:C, 6jhn:E, 6jhn:G, 6ji0:A, 6ji0:C, 6ji0:E, 6ji0:G, 6jrr:A, 6jrr:C, 6jrr:E, 6jrr:G
12	2x5d:D	380	74	0.0909	0.0526	0.2703	9.8	2x5d:A

[Back]