Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GYYFHTENPFKDWPGAFEEGLKRLKEGDLPVTILFMEAAILQDPGDAEAWQFLGITQAENENEQAAIVALQRCLELQPNN
LKALMALAVSYTNTSHQQDACEALKNWIKQNPKYKYLDSSVLEGVKELYLEAAHQNGDMIDPDLQTGLGVLFHLSGEFNR
AIDAFNAALTVRPEDYSLWNRLGATLANGDRSEEAVEAYTRALEIQPGFIRSRYNLGISCINLGAYREAVSNFLTALSLQ
RKSGNIWAALRIALSLMDQPELFQAANLGDLDVLLRAFNLD

The query sequence (length=281) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4eqf:A 281 281 1.0000 1.0000 1.0000 0.0
2 1fch:A 302 294 0.6228 0.5795 0.5952 4.15e-122 1fch:B, 9gag:A
3 3cv0:A 300 290 0.3559 0.3333 0.3448 6.47e-46 3cvl:A, 3cvn:A, 3cvp:A, 3cvq:A
4 8chy:A 272 239 0.2349 0.2426 0.2762 1.83e-21 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
5 8chy:A 272 232 0.2278 0.2353 0.2759 3.54e-20 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
6 8chy:A 272 103 0.1174 0.1213 0.3204 1.34e-11 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
7 1na0:B 119 92 0.1068 0.2521 0.3261 2.49e-11 1na3:A, 1na3:B
8 1na0:B 119 93 0.1032 0.2437 0.3118 3.68e-07 1na3:A, 1na3:B
9 1na0:B 119 70 0.0783 0.1849 0.3143 7.57e-07 1na3:A, 1na3:B
10 1na0:B 119 76 0.0890 0.2101 0.3289 5.26e-06 1na3:A, 1na3:B
11 1na0:B 119 69 0.0890 0.2101 0.3623 6.91e-06 1na3:A, 1na3:B
12 1na0:B 119 127 0.1032 0.2437 0.2283 0.005 1na3:A, 1na3:B
13 7yeh:A 1020 232 0.2242 0.0618 0.2716 8.74e-11 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
14 7yeh:A 1020 273 0.2028 0.0559 0.2088 2.00e-06 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
15 7yeh:A 1020 202 0.1851 0.0510 0.2574 2.75e-06 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
16 3kd7:A 102 92 0.0961 0.2647 0.2935 1.21e-10 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
17 3kd7:A 102 83 0.1032 0.2843 0.3494 5.71e-08 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
18 3kd7:A 102 69 0.0747 0.2059 0.3043 2.33e-05 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
19 3kd7:A 102 71 0.0712 0.1961 0.2817 3.62e-05 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
20 3kd7:A 102 127 0.1139 0.3137 0.2520 2.83e-04 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
21 7y4i:A 822 228 0.2242 0.0766 0.2763 4.98e-10 8dti:A, 8dti:B
22 7y4i:A 822 173 0.1601 0.0547 0.2601 4.81e-06 8dti:A, 8dti:B
23 7y4i:A 822 208 0.1637 0.0560 0.2212 3.14e-05 8dti:A, 8dti:B
24 7y4i:A 822 106 0.1068 0.0365 0.2830 0.001 8dti:A, 8dti:B
25 7y4i:A 822 188 0.1423 0.0487 0.2128 0.013 8dti:A, 8dti:B
26 7y4i:A 822 103 0.0996 0.0341 0.2718 0.015 8dti:A, 8dti:B
27 7y4i:A 822 122 0.0961 0.0328 0.2213 0.37 8dti:A, 8dti:B
28 5a01:A 681 139 0.1210 0.0499 0.2446 6.17e-06 5a01:B, 5a01:C
29 5lwv:A 711 113 0.0961 0.0380 0.2389 7.01e-06 5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
30 5lwv:A 711 118 0.1068 0.0422 0.2542 0.022 5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
31 1llu:A 341 103 0.1032 0.0850 0.2816 0.010 1llu:B, 1llu:C, 1llu:D, 1llu:E, 1llu:F, 1llu:G, 1llu:H
32 5lyn:B 133 51 0.0641 0.1353 0.3529 0.029 5lyn:A
33 6tm5:P 492 138 0.1174 0.0671 0.2391 0.047
34 6tm5:P 492 58 0.0569 0.0325 0.2759 2.1
35 3fp2:A 483 78 0.0747 0.0435 0.2692 0.19 3fp4:A, 3lca:A
36 3fp2:A 483 82 0.0712 0.0414 0.2439 1.3 3fp4:A, 3lca:A
37 2c2l:A 281 102 0.0890 0.0890 0.2451 0.20 2c2l:B, 2c2l:C, 2c2l:D, 6efk:B, 6efk:A, 8ehz:A, 8ehz:B, 8ei0:A, 8f14:A, 8f15:A, 8f15:B, 8f15:C, 8f16:A, 8f16:B, 8f17:A, 8f17:B, 8fyu:B, 8fyu:A, 8gck:B, 8gck:A, 6nsv:A, 6nsv:B, 3q47:B, 3q49:B, 3q4a:B, 8suv:A, 8suv:B, 8suv:C, 8suv:D, 7tb1:B, 7tb1:A
38 4j8f:A 551 126 0.1103 0.0563 0.2460 0.26 5aqw:A, 5aqx:A, 5aqy:A, 5aqz:A, 5ar0:A, 3atu:A, 3atv:A, 3ay9:A, 5bn8:A, 5bn9:A, 5bpl:A, 5bpm:A, 3d2f:B, 3d2f:D, 2e88:A, 2e8a:A, 7f4x:A, 7f4z:A, 7f50:A, 7fgm:A, 6fhk:A, 6fhk:B, 6g3r:A, 6g3s:A, 3gdq:A, 1hjo:A, 4io8:A, 3jxu:A, 7kw7:D, 5mkr:A, 5mks:A, 7q4r:A, 1s3x:A, 1xqs:C, 1xqs:D, 6zyi:A
39 8ffz:C 797 55 0.0498 0.0176 0.2545 0.29
40 8ffz:C 797 103 0.0783 0.0276 0.2136 0.58
41 5w5i:C 436 221 0.1601 0.1032 0.2036 0.44 5w5i:A
42 8dvs:A 682 58 0.0747 0.0308 0.3621 0.59 7bah:A, 7bah:B, 7bai:A, 7bai:B, 7bai:E, 8dvu:A, 5f9f:A, 5f9f:C, 5f9f:E, 5f9f:G, 5f9f:I, 5f9f:K, 7jl1:A, 6kyv:B, 6kyv:D, 6kyv:F, 6kyv:H, 6kyv:J, 6kyv:L, 3lrn:A, 3lrn:B, 3lrr:A, 3lrr:B, 7mk1:A, 7mk1:B, 3ncu:A, 3ncu:B, 3og8:A, 3og8:B, 2qfb:A, 2qfb:B, 2qfb:C, 2qfb:D, 2qfb:E, 2qfb:F, 2qfb:G, 2qfb:H, 2qfb:I, 2qfb:J, 7tny:A, 7tnz:A, 7to0:A, 7to2:A
43 2dvn:A 186 71 0.0676 0.1022 0.2676 0.87 2dvn:B, 2dvo:A, 2e5x:A, 2zti:A
44 5f9h:G 653 37 0.0569 0.0245 0.4324 0.88 5e3h:A, 5f98:A, 5f98:C, 5f98:E, 5f98:G, 5f98:I, 5f98:K, 5f9h:A, 5f9h:C, 5f9h:E, 5f9h:I, 5f9h:K, 6gpg:A, 7jl3:A, 7jl3:C, 7jl3:E
45 8qca:B 756 95 0.0747 0.0278 0.2211 0.91
46 8qca:B 756 42 0.0498 0.0185 0.3333 4.6
47 5mgx:G 266 71 0.0747 0.0789 0.2958 1.3 5mgx:F, 5mgx:E, 5mgx:H
48 6c0e:A 419 46 0.0641 0.0430 0.3913 1.7 6c0e:B
49 2mkd:A 60 14 0.0356 0.1667 0.7143 2.1 2mkn:A
50 1rqg:A 606 96 0.0854 0.0396 0.2500 2.2
51 3meq:A 341 56 0.0605 0.0499 0.3036 2.5 3meq:B, 3meq:C, 3meq:D
52 7kwd:A 473 55 0.0605 0.0359 0.3091 2.6 7kwd:B
53 1a6e:A 503 83 0.0996 0.0557 0.3373 3.1
54 3zd7:A 623 55 0.0676 0.0305 0.3455 3.1 8g7t:C
55 3uq3:A 258 104 0.0819 0.0891 0.2212 3.7 3upv:A
56 7wdo:A 445 94 0.1174 0.0742 0.3511 4.7 7wdn:A, 7wdp:A, 7wdr:A, 7wds:A, 7wdv:A
57 7qe7:K 531 119 0.1068 0.0565 0.2521 5.2 5a31:J, 5a31:K, 5g04:J, 5g04:K, 5g05:J, 5g05:K, 9gaw:Q, 9gaw:K, 3hym:B, 3hym:D, 3hym:F, 3hym:H, 3hym:J, 3hym:L, 5lcw:J, 5lcw:K, 8pkp:Q, 8pkp:K, 6q6g:Q, 6q6g:K, 6q6h:Q, 6q6h:K, 7qe7:Q, 8s4g:Q, 8s4g:K, 6tlj:J, 6tlj:K, 6tm5:J, 6tm5:K, 6tnt:J, 6tnt:K, 4ui9:J, 4ui9:K
58 7qe7:K 531 30 0.0391 0.0207 0.3667 8.8 5a31:J, 5a31:K, 5g04:J, 5g04:K, 5g05:J, 5g05:K, 9gaw:Q, 9gaw:K, 3hym:B, 3hym:D, 3hym:F, 3hym:H, 3hym:J, 3hym:L, 5lcw:J, 5lcw:K, 8pkp:Q, 8pkp:K, 6q6g:Q, 6q6g:K, 6q6h:Q, 6q6h:K, 7qe7:Q, 8s4g:Q, 8s4g:K, 6tlj:J, 6tlj:K, 6tm5:J, 6tm5:K, 6tnt:J, 6tnt:K, 4ui9:J, 4ui9:K
59 8g7t:A 647 21 0.0391 0.0170 0.5238 6.0 4ay2:A, 4bpb:A, 8dvr:A, 8g7u:A, 8g7u:C, 8g7v:A, 8g7v:C, 8scz:A, 8sd0:A, 7tnx:A, 7to1:A, 2ykg:A, 3zd6:A
60 3pz2:A 298 72 0.0747 0.0705 0.2917 6.3
61 6z42:A 336 103 0.1032 0.0863 0.2816 6.4 6z42:B, 6z42:C, 6z42:D
62 6i99:A 266 47 0.0427 0.0451 0.2553 7.5 6i99:B, 3sxr:A, 3sxr:B, 3sxs:A, 8x2a:A
63 1vb3:A 428 97 0.1032 0.0678 0.2990 8.3
64 7afl:V 99 34 0.0498 0.1414 0.4118 9.5 7bog:V, 7boh:V, 7nav:V
65 7pkq:s 87 28 0.0356 0.1149 0.3571 9.5
66 5wwr:A 461 94 0.0854 0.0521 0.2553 9.6 5wwr:B, 5wws:A, 5wws:B, 5wwt:A, 5wwt:B
67 3tbk:A 524 23 0.0356 0.0191 0.4348 9.7
68 3kpf:A 467 142 0.1174 0.0707 0.2324 9.8 1b37:A, 1b37:B, 1b37:C, 1b5q:A, 1b5q:B, 1b5q:C, 1h81:A, 1h81:B, 1h81:C, 1h82:A, 1h82:B, 1h82:C, 1h83:A, 1h83:B, 1h83:C, 1h84:A, 1h84:B, 1h84:C, 1h86:A, 1h86:B, 1h86:C, 3kpf:B, 3ku9:A, 3ku9:B, 3l1r:A, 3l1r:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218