BioLiP

>protein
GYQMDIPKFKRLPRHIAIIPDGNRRWALARGLEKHEGYSSGIIPGLEVYDICVKIGIGEVTFFGFTQDNTKRPQIQRKAF
TDACIKSVQEIAKRDAEILVVGNTNSDIFPEELLEYTKRTKVGKGKIKINFLINYGWYWDLTYAYDDGKKMIENIASAEI
PRVDLLIRWGGRCRLSGMLPVQTVYSDIYVVDEMWPDFKPEHLFKALEFYQNQDITLGG

The query sequence (length=219) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7cav:B	222	222	1.0000	0.9865	0.9865	9.32e-163	7caq:A, 7caq:B, 7car:A, 7car:B, 7cas:B, 7cav:A, 7cav:C, 7cav:D, 7cav:E, 7cav:F, 7cav:G, 7cav:H, 7cc3:A, 7cc3:B, 7cc3:C, 7cc3:D, 7cc3:E, 7cc3:F, 7cc3:G, 7cc3:H
2	7vqb:A	207	207	0.8265	0.8744	0.8744	1.39e-137	7vq9:A, 7vq9:B, 7vqa:A, 7vqa:B, 7vqb:B, 7vqc:B, 7vqd:A, 7vqd:B
3	8kgb:C	245	229	0.3333	0.2980	0.3188	1.07e-30	8kgb:A, 8kgb:B, 8kgb:D, 8x35:A, 8x35:B, 8x36:A, 8x36:B, 8x37:A, 8x37:B
4	5hxq:C	227	219	0.3014	0.2907	0.3014	5.19e-27	5hxp:A, 5hxp:C, 5hxq:A, 5hxt:A, 5hxt:B
5	6szg:A	222	226	0.2785	0.2748	0.2699	3.05e-24	6szg:B, 6szh:B
6	1x07:A	231	224	0.2694	0.2554	0.2634	8.55e-24	5cqj:A, 2e98:A, 2e98:B, 2e99:A, 2e99:B, 2e9a:A, 2e9a:B, 2e9c:A, 2e9c:B, 2e9d:A, 2e9d:B, 4h2j:A, 4h2j:B, 4h2m:A, 4h2m:B, 4h2o:B, 4h2o:A, 4h38:A, 4h3a:A, 4h3a:B, 4h3c:A, 4h3c:B, 1jp3:A, 3sgt:B, 3sgv:B, 3sgv:A, 3sgx:A, 3sh0:B, 3sh0:A, 3th8:B, 1ueh:A, 1ueh:B, 1v7u:A, 3wyj:A, 1x06:A, 1x08:A, 1x09:A
7	4u82:A	236	231	0.2785	0.2585	0.2641	2.31e-22	4h8e:A, 3wyi:A
8	4q9o:A	240	237	0.3151	0.2875	0.2911	4.67e-22	5kh4:A, 5kh4:B, 5kh5:B, 4q9m:A, 4q9m:B, 4q9o:B
9	7jlr:A	237	232	0.2877	0.2658	0.2716	5.23e-20	7jlj:A, 7jlm:A, 7jlm:B
10	5zhe:B	200	215	0.2557	0.2800	0.2605	1.14e-19
11	7pay:A	329	238	0.2877	0.1915	0.2647	3.02e-17	7pax:A, 7pb0:A, 7pb1:A, 6w2l:A, 6z1n:A
12	6ime:A	285	230	0.2785	0.2140	0.2652	3.26e-17	6ime:B, 4onc:A, 4onc:B, 2vg2:A, 2vg2:C, 2vg2:B, 2vg2:D, 2vg3:A, 2vg3:C, 2vg3:B, 2vg3:D
13	2vg1:A	228	226	0.2648	0.2544	0.2566	1.28e-14	2vg0:A, 2vg0:B, 2vg1:B
14	5hc8:A	236	226	0.2511	0.2331	0.2434	1.82e-14	5hc7:A
15	3ugs:B	208	221	0.2283	0.2404	0.2262	7.18e-13	3ugs:A
16	5ygk:C	217	216	0.2283	0.2304	0.2315	2.34e-07	5gul:A, 5gul:B, 5gul:C, 5gul:D, 5ygk:A, 5ygk:B, 5ygk:H, 5ygk:D, 5ygk:E, 5ygk:F, 5ygk:G
17	5xk6:A	218	211	0.1963	0.1972	0.2038	2.90e-05	5xk6:B, 5xk6:C, 5xk6:D, 5xk7:A, 5xk7:B, 5xk7:C, 5xk7:D, 5xk8:A, 5xk8:B, 5xk8:C, 5xk8:D, 5xk9:A, 5xk9:B, 5xk9:C, 5xk9:D, 5xk9:E, 5xk9:F, 5xk9:G, 5xk9:H
18	2gsr:A	207	49	0.0868	0.0918	0.3878	0.11	2gsr:B
19	7rh5:c	158	66	0.0685	0.0949	0.2273	0.88	6adq:K, 6adq:W, 8ovc:W, 8ovc:b, 8ovd:b, 8ovd:W, 7rh5:W, 7rh6:c, 7rh7:W, 7rh7:c
20	8r3p:A	672	58	0.0685	0.0223	0.2586	1.8	8r3p:B, 8r3p:C, 8r3p:D
21	1bdm:B	327	30	0.0594	0.0398	0.4333	3.3	1bdm:A, 1bmd:A, 1bmd:B, 2cvq:A, 2cvq:B, 1wze:A, 1wze:B, 1wzi:A, 1wzi:B, 1y7t:A, 1y7t:B
22	3pxx:A	282	37	0.0639	0.0496	0.3784	3.4	3pxx:B, 3pxx:C, 3pxx:D, 3pxx:E, 3pxx:F
23	6agm:A	334	67	0.0913	0.0599	0.2985	3.9	6agm:B, 6agm:C, 6agm:D
24	8aaf:e	1527	40	0.0639	0.0092	0.3500	4.2	8agt:e, 8agu:e, 8agv:e, 8agw:e, 8agx:e, 8agz:e
25	3tho:B	366	64	0.0959	0.0574	0.3281	5.5	6asc:A, 6asc:B, 4nzv:A, 4nzv:B, 4o24:A, 4o24:B, 4o43:A, 4o43:B, 4o4k:A, 4o4k:B, 4o5g:A, 4o5g:B, 3thn:A, 6x1y:A, 6x1y:B, 6x1z:A, 6x1z:B
26	8j4z:J	541	74	0.0959	0.0388	0.2838	6.4	8j4z:H, 8j4z:A, 8j4z:K, 8j4z:C, 8j4z:F, 8j78:J, 8j78:F, 8j78:D, 8j7d:C, 8j7d:G, 8j7d:J, 8j7d:E, 8jaw:B, 8jaw:D, 8jaw:I, 8jaw:G, 8jaw:J, 8jaw:L, 8jxl:B, 8jxl:A, 8jxl:D, 8jxl:K, 8jxl:G, 8jxl:I, 8jxm:K, 8jxm:A, 8jxm:E, 8jxm:J, 8jxn:K, 8jxn:G, 8jxn:I, 8jxn:A, 8k2v:H, 8k2v:I, 8k2v:J, 8k2v:G, 8k2v:K, 8k2v:L
27	8jxm:C	520	74	0.0959	0.0404	0.2838	6.8	8j99:B, 8j99:D, 8j99:J, 8j99:G, 8j99:H, 8j99:L, 8jxm:H, 8jxn:D, 8jxn:B

[Back]