BioLiP

>protein
GYKDNIRHGVCWIYYPDGGSLVGEVNEDGEMTGEKIAYVYPDERTALYGKFIDGEMIEGKLATLMSTEEGRPHFELMPGN
SVYHFDKSTSSCISTNALLPDPYESERVYVAESLISSAGEGLFSKVAVGPNTVMSFANGVRITHQEVDSRDWALNGNTLS
LDEETVIDVPEPYNHVSKYCASLGHKANHSFTPNCIYDMFVHPRFGPIKCIRTLRAVEADEELTVAYGYDHSPGPEAPEW
YQVELKAFQATQQ

The query sequence (length=253) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1h3i:B	293	232	0.9130	0.7884	0.9957	9.34e-175	5ayf:A, 3cbm:A, 3cbo:A, 3cbp:A, 4e47:A, 4e47:B, 4e47:C, 4e47:D, 5eg2:A, 2f69:A, 4j7f:A, 4j7i:A, 4j83:A, 4j8o:A, 4jds:A, 4jds:B, 4jds:C, 4jds:D, 4jlg:A, 4jlg:B, 3m53:A, 3m54:A, 3m55:A, 3m56:A, 3m57:A, 3m58:A, 3m59:A, 3m5a:A, 1mt6:A, 1n6a:A, 1n6c:A, 1o9s:A, 1o9s:B, 3os5:A, 3vuz:A, 3vv0:A, 1xqh:A, 1xqh:E, 5ylt:A
2	7td5:F	447	206	0.2016	0.1141	0.2476	1.48e-04
3	7td5:A	497	206	0.2016	0.1026	0.2476	1.68e-04
4	7kso:A	395	201	0.1976	0.1266	0.2488	7.57e-04	7ksr:A, 7ktp:A
5	7at8:A	311	122	0.1383	0.1125	0.2869	0.005
6	5ij7:B	469	122	0.1383	0.0746	0.2869	0.008	6b3w:A, 6b3w:B, 6c23:K, 6c24:K, 5ij7:A, 5ij8:A, 5ij8:B, 4w2r:A, 4w2r:B
7	8t9g:C	536	122	0.1383	0.0653	0.2869	0.008	8fyh:A, 8fyh:G
8	6wkr:C	606	122	0.1383	0.0578	0.2869	0.009	4mi0:A, 4mi5:A, 8t9g:I
9	8tas:E	570	122	0.1383	0.0614	0.2869	0.009	8tb9:E
10	5hyn:A	581	122	0.1383	0.0602	0.2869	0.009	5hyn:F, 5hyn:K, 5hyn:Q, 5ls6:A, 5ls6:G, 5ls6:J, 5ls6:D
11	9c8u:A	475	122	0.1383	0.0737	0.2869	0.010
12	5wg6:A	517	122	0.1383	0.0677	0.2869	0.013	5wg6:C
13	7w6l:C	158	134	0.1423	0.2278	0.2687	0.44	5f59:A, 5f6k:C, 5f6k:E, 6kiw:K, 7w6l:E
14	4au7:A	243	41	0.0672	0.0700	0.4146	0.52	4au7:B, 3rq4:A
15	6nzo:S	233	54	0.0791	0.0858	0.3704	0.60	6px3:S
16	2y2l:B	476	124	0.0949	0.0504	0.1935	2.1	2fff:B, 2jch:A, 2je5:A, 2je5:B, 2xd1:A, 2xd1:B, 2xd5:A, 2xd5:B, 2y2g:A, 2y2g:B, 2y2h:A, 2y2h:B, 2y2i:A, 2y2j:A, 2y2k:A, 2y2l:A, 2y2m:A, 2y2n:A, 2y2o:A, 2y2p:A, 2y2q:A, 2y2q:B, 7zui:AAA, 7zuj:AAA, 7zuk:AAA, 7zul:AAA
17	5d6j:A	630	33	0.0514	0.0206	0.3939	2.5	5ey8:A, 5ey8:B, 5ey8:C, 5ey8:D, 5ey8:E, 5ey8:F, 5ey8:G, 5ey8:H, 5icr:A, 5icr:B, 5icr:C, 5icr:D
18	5kis:A	1446	65	0.0632	0.0111	0.2462	3.1
19	5lhz:A	78	50	0.0514	0.1667	0.2600	3.3	5lhz:B, 5lhz:C
20	4f3s:A	231	49	0.0672	0.0736	0.3469	4.3	4dz1:A
21	5diy:A	463	84	0.0751	0.0410	0.2262	4.5	5diy:B
22	5tfm:A	320	43	0.0553	0.0437	0.3256	5.3	5tfl:A, 5tfl:B
23	8enl:C	382	42	0.0553	0.0366	0.3333	9.4
24	7ane:ae	584	30	0.0553	0.0240	0.4667	9.5
25	4xpi:A	479	42	0.0553	0.0292	0.3333	9.7	2afh:A, 2afh:C, 2afi:A, 2afi:C, 2afi:I, 2afi:K, 6bbl:A, 6bbl:C, 8bts:A, 8bts:C, 8bts:H, 8bts:J, 5bvg:A, 5bvg:C, 5bvh:A, 5bvh:C, 6cdk:A, 6cdk:C, 8crs:A, 8crs:C, 5cx1:A, 5cx1:C, 5cx1:E, 5cx1:G, 5cx1:I, 5cx1:K, 5cx1:M, 5cx1:O, 8dbx:A, 8dbx:C, 8dby:A, 8dby:C, 8dfc:A, 8dfc:C, 8dfd:A, 8dfd:C, 8dpn:A, 8dpn:C, 8e3t:A, 8e3t:C, 8e3u:A, 8e3u:C, 8e3v:A, 8e3v:C, 8enl:A, 8enm:A, 8enm:C, 8enn:A, 8enn:C, 8eno:A, 1fp4:A, 1fp4:C, 1g20:A, 1g20:C, 1g21:A, 1g21:C, 7jrf:A, 7jrf:C, 3k1a:A, 3k1a:C, 1m1n:A, 1m1n:C, 1m1n:E, 1m1n:G, 1m1y:A, 1m1y:C, 1m1y:I, 1m1y:K, 1m34:A, 1m34:C, 1m34:I, 1m34:K, 7mci:A, 7mci:C, 2min:A, 2min:C, 3min:A, 3min:C, 1n2c:A, 1n2c:C, 4nd8:A, 4nd8:C, 6o7l:A, 6o7l:C, 6o7m:A, 6o7m:C, 6o7n:A, 6o7n:C, 6o7o:A, 6o7o:C, 6o7p:A, 6o7p:C, 6o7q:A, 6o7q:C, 6o7r:A, 6o7r:C, 6o7s:A, 6o7s:C, 6op1:A, 6op1:C, 6op2:A, 6op2:C, 6op3:A, 6op3:C, 6op4:A, 6op4:C, 8p8g:A, 8p8g:C, 4tku:A, 4tku:C, 4tkv:A, 4tkv:C, 3u7q:A, 3u7q:C, 6ug0:A, 6ug0:C, 7ut6:A, 7ut6:C, 7ut7:A, 7ut7:C, 7ut8:A, 7ut8:C, 7ut9:A, 7ut9:C, 7uta:A, 7uta:C, 5vq4:A, 5vq4:C, 6vxt:A, 6vxt:C, 4wna:A, 4wna:C, 4wza:A, 4wza:C, 4wzb:A, 4wzb:C, 4xpi:C

[Back]