Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GVTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDS

The query sequence (length=61) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6ipz:Z 63 61 0.9836 0.9524 0.9836 1.21e-39 1a0n:B, 1azg:B, 4eik:A, 1fyn:A, 8kdx:A, 3ua7:A, 3ua7:D, 3ua7:C, 4znx:A, 4znx:D, 4znx:B, 4znx:C
2 7a2w:A 61 60 0.9016 0.9016 0.9167 4.62e-37 7a2x:A, 7a2y:A, 7a2z:A
3 7ud6:A 265 56 0.8361 0.1925 0.9107 7.50e-31 3a7d:A, 2cl5:A, 2cl5:B, 5fhq:A, 5fhr:A, 5fhr:B, 6gy1:A, 1h1d:A, 3hvh:A, 3hvi:A, 3hvj:A, 3hvj:B, 3hvk:A, 1jr4:A, 5k01:A, 5k03:A, 5k05:A, 5k05:B, 5k09:A, 5k09:B, 5k09:C, 5k09:D, 5k09:E, 5k09:F, 5k09:G, 5k09:H, 5k09:I, 5k09:J, 5k09:K, 5k09:L, 5k09:M, 5k09:N, 5k09:O, 5k09:P, 5k09:Q, 5k09:R, 5k09:S, 5k09:T, 5k09:U, 5k09:V, 5k09:W, 5k09:X, 5k0b:A, 5k0b:B, 5k0b:C, 5k0b:D, 5k0b:E, 5k0b:F, 5k0b:G, 5k0b:H, 5k0c:A, 5k0c:B, 5k0e:A, 5k0f:A, 5k0f:B, 5k0g:A, 5k0l:A, 5k0l:B, 5k0l:C, 5k0l:D, 5k0n:A, 5k0n:B, 5k0n:C, 5k0n:D, 6lfe:A, 5lqa:A, 5lqc:A, 5lqj:B, 5lqj:C, 5lqj:D, 5lqk:A, 5lqn:A, 5lqr:A, 5lqu:A, 5lqu:B, 5lr6:A, 5lr6:B, 5lr6:C, 5lr6:D, 3nw9:A, 3nwb:A, 3nwe:A, 3oe4:A, 3oe5:A, 3ozr:A, 3ozs:A, 3ozt:A, 4p58:A, 5p8w:A, 5p8w:B, 5p8w:C, 5p8x:A, 5p8y:A, 5p8z:A, 5p90:A, 5p91:A, 5p92:A, 5p93:A, 5p94:A, 5p95:A, 5p96:A, 5p97:A, 5p98:A, 5p99:A, 5p9a:A, 5p9b:A, 5p9c:A, 5p9d:A, 5p9e:A, 5p9n:A, 5p9o:A, 5p9p:A, 5p9q:A, 5p9r:A, 5p9r:B, 5p9s:A, 5p9t:A, 5p9u:A, 5p9v:A, 5p9w:A, 5p9x:A, 5p9y:A, 5p9z:A, 5pa0:A, 5pa1:A, 5pa2:A, 5pa3:A, 5pa4:A, 5pa5:A, 5pa6:A, 5pa7:A, 5pa7:B, 4pyl:A, 4pyn:A, 4pyo:A, 4pyo:B, 4pyq:A, 4pyq:B, 3r6t:A, 3s68:A, 3u81:A, 1vid:A, 7xgi:A, 7xjb:A, 7xjb:B, 7xjb:C, 7xjb:D, 2zth:A, 2zvj:A
4 7uy0:A 448 59 0.8033 0.1094 0.8305 3.22e-30 7uy0:B, 7uy3:A
5 4hvw:A 61 56 0.7213 0.7213 0.7857 3.79e-29 6xx2:A, 6xx3:A
6 1y57:A 452 60 0.7541 0.1018 0.7667 1.75e-27 1a07:A, 1a07:B, 1a08:A, 1a08:B, 1a09:A, 1a09:B, 1a1a:A, 1a1a:B, 1a1b:A, 1a1b:B, 1a1c:A, 1a1c:B, 1a1e:A, 1a1e:B, 4agw:A, 4agw:B, 7ah3:A, 2bdf:A, 2bdf:B, 2bdj:A, 1bkm:A, 5bmm:A, 5bmm:B, 5d12:A, 7d57:A, 7d5o:A, 3d7t:B, 4dgg:A, 4dgg:B, 3dqw:A, 3dqw:B, 3dqw:C, 3dqw:D, 3dqx:A, 3dqx:B, 6e6e:A, 6e6e:B, 6e6e:C, 6e6e:D, 6e6e:E, 6e6e:F, 6e6e:G, 6e6e:H, 3el8:A, 3en4:A, 3en4:B, 3en5:B, 1f1w:A, 3f3t:A, 3f3u:A, 3f3u:B, 3f3v:A, 3f3v:B, 3f3w:A, 3f3w:B, 6f3f:A, 4f5a:A, 4f5b:A, 3f6x:A, 3f6x:B, 3f6x:C, 3f6x:D, 3g5d:A, 3g5d:B, 3g6g:A, 3g6g:B, 3g6h:B, 3geq:A, 3geq:B, 2h8h:A, 1hcs:B, 1hct:B, 4hvu:A, 4hvv:A, 6hve:A, 4hxj:A, 1is0:A, 1is0:B, 5j5s:A, 5j5s:B, 8jn8:A, 8jn9:A, 4k11:A, 8k79:A, 8k79:B, 5k9i:A, 5k9i:B, 1kc2:A, 1ksw:A, 6l8l:A, 6l8l:B, 6l8l:C, 6l8l:D, 4mcv:A, 4mcv:B, 4mxo:A, 4mxo:B, 4mxx:A, 4mxx:B, 4mxy:A, 4mxy:B, 4mxz:A, 4mxz:B, 7nes:A, 7ng7:A, 1nlo:C, 1nlp:C, 1nzl:B, 1nzv:B, 4o2p:A, 4o2p:B, 1o41:A, 1o42:A, 1o43:A, 1o44:A, 1o45:A, 1o46:A, 1o47:A, 1o48:A, 1o49:A, 1o4a:A, 1o4b:A, 1o4c:A, 1o4d:A, 1o4e:A, 1o4f:A, 1o4g:A, 1o4h:A, 1o4i:A, 1o4j:A, 1o4k:A, 1o4n:A, 1o4o:A, 1o4p:A, 1o4q:A, 1o4r:A, 5oav:A, 5oav:C, 5ob0:A, 5ob1:A, 5ob2:A, 5ob2:C, 3oez:A, 3oez:B, 2oiq:A, 7ote:A, 7ote:B, 1p13:B, 1p13:A, 1prl:C, 1prm:C, 3qlf:B, 3qlg:A, 3qlg:B, 4qt7:A, 1qwe:A, 1qwf:A, 1rlp:C, 1rlq:C, 4rtv:A, 4rtw:A, 4rtw:C, 4rty:A, 4rtz:A, 1sha:A, 1shb:A, 1shd:A, 1skj:A, 1sps:A, 1sps:B, 1sps:C, 2src:A, 3svv:A, 3svv:B, 5swh:A, 5swh:B, 5sys:A, 5sys:B, 5t0p:A, 5t0p:B, 5teh:A, 5teh:B, 3tz7:A, 3tz7:B, 3tz8:A, 3tz8:B, 3tz9:A, 3tz9:B, 3u4w:A, 3u51:A, 3u51:B, 4u5j:A, 4u5j:B, 3uqf:A, 3uqg:A, 3uqg:B, 7wf5:A, 7wf5:B, 6wiw:B, 8xn8:A, 5xp5:A, 5xp5:B, 5xp7:A, 5xp7:B, 4ybj:A, 4ybk:A, 1yom:A, 1yom:B
7 7pvx:A 60 60 0.7049 0.7167 0.7167 2.07e-26 7pvx:C
8 7pvt:C 56 56 0.6557 0.7143 0.7143 1.59e-25 7pvt:A
9 2oi3:A 86 58 0.5902 0.4186 0.6207 2.83e-19 2oj2:A
10 3vs7:B 427 58 0.5902 0.0843 0.6207 1.32e-17 4lud:B, 4lud:A, 4lue:B, 4lue:A, 3vs1:A
11 1qcf:A 450 58 0.5902 0.0800 0.6207 1.48e-17 1ad5:B, 1ad5:A, 2c0i:A, 2c0i:B, 2c0o:A, 2c0o:B, 2c0t:A, 2c0t:B, 5h09:A, 5h0b:A, 5h0e:A, 5h0g:A, 5h0h:A, 2hck:B, 2hck:A, 2hk5:A, 3vry:A, 3vry:B, 3vrz:A, 3vrz:B, 3vs0:A, 3vs0:B, 3vs1:B, 3vs2:A, 3vs2:B, 3vs3:A, 3vs3:B, 3vs4:B, 3vs4:A, 3vs5:A, 3vs5:B, 3vs6:A, 3vs6:B, 3vs7:A, 5zj6:A, 5zj6:B
12 8bq3:A 60 54 0.4754 0.4833 0.5370 7.31e-17
13 1wa7:A 60 58 0.4918 0.5000 0.5172 2.21e-16
14 1lck:A 164 59 0.4918 0.1829 0.5085 2.90e-15 1bhf:A, 1cwd:L, 1cwe:A, 1cwe:C, 1fbz:A, 1fbz:B, 2iim:A, 1ijr:A, 1lcj:A, 1lkk:A, 1lkl:A, 1x27:A, 1x27:B, 1x27:C, 1x27:D, 1x27:E, 1x27:F
15 2w10:B 62 53 0.4098 0.4032 0.4717 1.95e-11 2d0n:A, 2d0n:C, 1h3h:A, 1oeb:B, 1oeb:A, 1uti:A, 2w10:A
16 8ssn:B 386 60 0.4590 0.0725 0.4667 8.57e-11
17 2fo0:A 466 60 0.4590 0.0601 0.4667 1.00e-10 1abo:A, 1abo:B, 1bbz:A, 1bbz:E, 1bbz:C, 1bbz:G, 6bl8:A, 6bl8:B, 7cc2:A, 7cc2:B, 3cs9:A, 3cs9:D, 3dk3:A, 3dk3:B, 3dk6:A, 3dk6:B, 3dk7:A, 3dk7:B, 7dt2:A, 7dt2:B, 2e2b:A, 2e2b:B, 3eg1:A, 3eg1:B, 2f4j:A, 1fpu:A, 1fpu:B, 2g1t:A, 2g1t:B, 2g1t:C, 2g1t:D, 2g2f:A, 2g2f:B, 2g2h:A, 2g2h:B, 2g2i:A, 2g2i:B, 2gqg:A, 2gqg:B, 8h7f:A, 8h7f:B, 8h7h:A, 8h7h:B, 6hd4:A, 6hd4:B, 6hd6:A, 6hd6:B, 2hiw:A, 2hiw:B, 3hmi:A, 5hu9:A, 2hyy:A, 2hyy:B, 2hyy:C, 2hyy:D, 2hz0:A, 2hz4:A, 2hz4:C, 2hz4:B, 2hzi:A, 2hzi:B, 2hzn:A, 1iep:A, 1iep:B, 3ik3:A, 3ik3:B, 4j9c:A, 4j9d:A, 4j9d:C, 4j9d:E, 4j9e:A, 4j9e:C, 4j9e:E, 4j9f:A, 4j9f:C, 4j9f:E, 4j9g:A, 4j9g:C, 4j9g:E, 4j9h:A, 4j9h:B, 4j9h:F, 4j9h:E, 4j9h:D, 4j9h:C, 4j9i:A, 4j9i:C, 4j9i:E, 3k5v:A, 3k5v:B, 3kf4:A, 3kf4:B, 3kfa:A, 3kfa:B, 1m52:A, 1m52:B, 3ms9:A, 3ms9:B, 3mss:A, 3mss:B, 3mss:C, 3mss:D, 7n9g:A, 7n9g:B, 6npe:A, 6npu:A, 6npv:A, 2o88:A, 2o88:B, 1opj:A, 1opj:B, 1opk:A, 1opl:A, 1opl:B, 3oxz:A, 3oy3:A, 3oy3:B, 3pyy:A, 2qoh:A, 2qoh:B, 3qri:A, 3qri:B, 3qrj:A, 3qrj:B, 3qrk:A, 4twp:A, 4twp:B, 3ue4:A, 3ue4:B, 2v7a:A, 2v7a:B, 7w7x:A, 7w7x:B, 7w7y:A, 7w7y:B, 4wa9:B, 4xey:A, 4xli:A, 4xli:B, 2xyn:A, 2xyn:B, 2xyn:C, 4yc8:A, 4yc8:B, 2z60:A, 4zog:A, 4zog:B
18 5mo4:A 429 60 0.4590 0.0653 0.4667 1.05e-10 3cs9:B, 3cs9:C, 2hz0:B, 6npe:B, 6npu:B, 6npv:B, 3pyy:B, 8ssn:A
19 8gmb:A 438 55 0.4262 0.0594 0.4727 1.50e-10 6aua:A, 6aub:A, 6bik:A, 6bke:A, 6bkh:A, 6bkw:A, 6bln:A, 5bpy:A, 5bpy:B, 5bq0:A, 6di0:A, 6di1:A, 6di3:A, 6di5:A, 6di9:A, 8dso:B, 8e2m:A, 6e4f:A, 8ejb:A, 6ep9:A, 5fbn:C, 5fbn:D, 5fbo:A, 8fd9:A, 8ff0:A, 8flg:A, 8flh:A, 8fll:A, 8fln:A, 8flv:A, 8gc7:A, 8gc8:A, 3gen:A, 6hrp:A, 6hrt:A, 6j6m:A, 5j87:A, 5j87:B, 5j87:C, 5j87:D, 5jrs:A, 5kup:A, 7kxl:A, 7kxm:A, 7kxn:A, 7kxo:A, 7kxp:A, 7kxq:A, 7l5o:A, 7l5p:A, 7l5p:B, 7lty:A, 7ltz:A, 6mny:A, 7n4q:A, 7n4r:A, 7n4s:A, 7n5o:A, 7n5r:A, 7n5x:A, 7n5y:A, 6n9p:A, 6nfh:A, 4nwm:A, 4nwm:B, 6nzm:A, 6nzm:D, 6o8i:A, 3ocs:A, 3oct:A, 6omu:A, 4ot5:A, 4ot6:A, 4otf:A, 4otq:A, 4otr:A, 5p9f:A, 5p9g:A, 5p9h:A, 5p9i:A, 5p9j:A, 5p9k:A, 5p9l:A, 5p9m:A, 3pix:A, 3piy:A, 7r60:A, 7r61:A, 4rfy:A, 4rfz:A, 4rg0:A, 4rx5:A, 6s90:A, 6s90:B, 8s9f:B, 8s9f:A, 5t18:A, 6tfp:A, 6tfp:B, 6tfp:C, 6tfp:D, 6tfp:E, 8tu3:A, 8tu4:A, 8tu5:A, 8u2d:A, 8u2e:A, 5u9d:A, 5vfi:A, 5vgo:A, 6vxq:A, 6w06:A, 6w07:A, 6w7o:A, 6w7o:B, 6w8i:C, 6w8i:A, 6w8i:B, 6x3n:A, 6x3o:A, 6x3o:B, 6x3p:A, 6xe4:A, 4y95:A, 4y95:B, 4y95:C, 4y95:D, 7yc9:A, 4yhf:A, 4yhf:B, 4z3v:A, 4zly:A, 4zlz:A, 5zz4:A, 5zz4:B, 5zz4:C, 5zz4:D, 5zz4:E, 5zz4:F
20 2jma:A 62 60 0.3279 0.3226 0.3333 1.45e-09 5ihk:A, 3thk:A, 3thk:B, 1u06:A
21 1zsg:A 65 55 0.3607 0.3385 0.4000 2.11e-09 2p4r:A, 5sxp:B, 5sxp:D, 5sxp:A, 5sxp:C
22 2ak5:B 64 53 0.3443 0.3281 0.3962 5.47e-09 2df6:A, 2df6:B
23 5qu2:A 56 54 0.3443 0.3750 0.3889 1.06e-08 5qu2:B
24 2drk:A 59 53 0.3279 0.3390 0.3774 1.11e-08 2drm:A, 2drm:B, 2drm:C, 2drm:D
25 2sem:B 59 60 0.3443 0.3559 0.3500 2.94e-08 1sem:A, 1sem:B, 2sem:A, 3sem:A, 3sem:B
26 8dgo:B 218 58 0.3115 0.0872 0.3276 3.82e-08 2aoa:A, 2aoa:B, 2aob:A, 2aob:B, 2aob:C, 2aob:D, 1aze:A, 1bm2:A, 1bmb:A, 3c7i:A, 5cdw:B, 5cdw:K, 5cdw:O, 5cdw:Y, 5cdw:d, 5cdw:Z, 5cdw:V, 5cdw:P, 5cdw:L, 5cdw:H, 5cdw:C, 5cdw:E, 5cdw:U, 5cdw:c, 5cdw:A, 5cdw:G, 1cj1:A, 1cj1:B, 1cj1:C, 1cj1:D, 1cj1:E, 1cj1:F, 1cj1:G, 1cj1:H, 1cj1:I, 1cj1:J, 1cj1:K, 1cj1:L, 1fyr:A, 1fyr:B, 1fyr:C, 1fyr:D, 1gbq:A, 2gbq:A, 3gbq:A, 4gbq:A, 2h5k:A, 2huw:A, 2huw:B, 3imd:A, 3imd:B, 3imj:A, 3imj:B, 3in7:A, 3in7:C, 3in8:A, 1io6:A, 1jyq:A, 1jyq:B, 1jyr:A, 3kfj:A, 7mph:A, 7mph:B, 7mph:C, 7mph:D, 7mph:E, 7mph:F, 3mxc:A, 3mxy:A, 3n7y:A, 3n7y:B, 3n7y:C, 3n84:A, 3n84:B, 3n84:C, 3n84:D, 3n84:E, 3n84:F, 3n8m:A, 3ov1:A, 3ove:A, 4p9v:A, 4p9z:A, 1qg1:E, 3s8l:A, 3s8n:A, 3s8o:A, 1tze:E, 2vwf:A, 2w0z:A, 3wa4:A, 6wm1:A, 6wm1:C, 6wo2:A, 6wo2:B, 1x0n:A, 1zfp:E
27 8dgo:B 218 52 0.3115 0.0872 0.3654 8.92e-07 2aoa:A, 2aoa:B, 2aob:A, 2aob:B, 2aob:C, 2aob:D, 1aze:A, 1bm2:A, 1bmb:A, 3c7i:A, 5cdw:B, 5cdw:K, 5cdw:O, 5cdw:Y, 5cdw:d, 5cdw:Z, 5cdw:V, 5cdw:P, 5cdw:L, 5cdw:H, 5cdw:C, 5cdw:E, 5cdw:U, 5cdw:c, 5cdw:A, 5cdw:G, 1cj1:A, 1cj1:B, 1cj1:C, 1cj1:D, 1cj1:E, 1cj1:F, 1cj1:G, 1cj1:H, 1cj1:I, 1cj1:J, 1cj1:K, 1cj1:L, 1fyr:A, 1fyr:B, 1fyr:C, 1fyr:D, 1gbq:A, 2gbq:A, 3gbq:A, 4gbq:A, 2h5k:A, 2huw:A, 2huw:B, 3imd:A, 3imd:B, 3imj:A, 3imj:B, 3in7:A, 3in7:C, 3in8:A, 1io6:A, 1jyq:A, 1jyq:B, 1jyr:A, 3kfj:A, 7mph:A, 7mph:B, 7mph:C, 7mph:D, 7mph:E, 7mph:F, 3mxc:A, 3mxy:A, 3n7y:A, 3n7y:B, 3n7y:C, 3n84:A, 3n84:B, 3n84:C, 3n84:D, 3n84:E, 3n84:F, 3n8m:A, 3ov1:A, 3ove:A, 4p9v:A, 4p9z:A, 1qg1:E, 3s8l:A, 3s8n:A, 3s8o:A, 1tze:E, 2vwf:A, 2w0z:A, 3wa4:A, 6wm1:A, 6wm1:C, 6wo2:A, 6wo2:B, 1x0n:A, 1zfp:E
28 1uj0:A 58 50 0.3279 0.3448 0.4000 5.08e-08
29 1gbr:A 74 52 0.3115 0.2568 0.3654 6.84e-08
30 6f55:A 67 53 0.3443 0.3134 0.3962 8.79e-08
31 6a9c:B 66 53 0.3607 0.3333 0.4151 3.08e-07
32 1b07:A 59 50 0.3279 0.3390 0.4000 3.68e-07 6atv:A, 1cka:A, 1ckb:A, 5ih2:A, 5ih2:B, 5l23:A, 5ul6:A
33 1ssh:A 60 53 0.3607 0.3667 0.4151 4.19e-07
34 4cc3:C 64 60 0.3279 0.3125 0.3333 5.44e-07 4cc2:A, 4cc2:C, 4cc3:A, 4cc3:E, 4cc3:G, 4cc7:A, 4cc7:C, 4cc7:K, 4cc7:E, 4cc7:G, 4cc7:I, 4cc7:M
35 2vkn:A 66 43 0.3443 0.3182 0.4884 5.50e-07
36 4f14:A 56 52 0.2951 0.3214 0.3462 8.37e-07
37 8t7c:A 1001 55 0.3443 0.0210 0.3818 1.22e-06
38 4e6r:A 58 56 0.3443 0.3621 0.3750 1.27e-06
39 2xmf:A 60 53 0.3115 0.3167 0.3585 1.79e-06
40 2o9v:A 67 51 0.2623 0.2388 0.3137 2.32e-06 4ln2:A
41 6b27:A 118 55 0.2623 0.1356 0.2909 2.91e-06 6b27:B, 6b27:C, 6b27:D, 6b27:E, 6b27:F
42 5ixf:A 68 50 0.2951 0.2647 0.3600 3.58e-06
43 2d1x:C 66 51 0.3115 0.2879 0.3725 4.98e-06 2d1x:A, 2d1x:B, 2d1x:D, 5nv1:A, 7pll:A, 3ulr:B
44 2rol:A 64 50 0.2787 0.2656 0.3400 1.08e-05
45 6pbc:A 1070 55 0.3443 0.0196 0.3818 1.12e-05
46 7z3j:A 1119 55 0.3443 0.0188 0.3818 1.21e-05 2fci:A, 4k45:A, 7nxe:A, 2pld:A, 2ple:A, 5tq1:A, 5tqs:A, 5tqs:B, 5tqs:D, 5tqs:C, 1ywo:A
47 1jeg:A 60 55 0.3115 0.3167 0.3455 1.29e-05
48 2bz8:B 57 54 0.2623 0.2807 0.2963 1.37e-05 2bz8:A
49 3uat:A 276 62 0.3770 0.0833 0.3710 1.96e-05
50 2rpn:A 59 51 0.2951 0.3051 0.3529 2.23e-05
51 1n5z:A 71 56 0.3279 0.2817 0.3571 5.30e-05 1n5z:B, 2v1r:B, 2v1r:A
52 1wlp:B 138 57 0.2459 0.1087 0.2632 1.14e-04 1ov3:A, 1ov3:B, 7yxw:A
53 1wlp:B 138 52 0.2787 0.1232 0.3269 0.012 1ov3:A, 1ov3:B, 7yxw:A
54 5xhz:A 60 48 0.2295 0.2333 0.2917 2.74e-04 5xhz:B
55 2rqw:A 105 56 0.2623 0.1524 0.2857 3.40e-04
56 4z88:D 70 67 0.3279 0.2857 0.2985 5.97e-04 4z88:A, 4z88:B, 4z88:C, 4z88:E, 4z88:F, 4z88:G, 4z88:H, 4z88:I, 4z88:J, 4z88:K, 4z88:L, 4z89:A, 4z89:C, 4z89:B, 4z89:D, 4z89:J, 4z89:I, 4z89:E, 4z89:F, 4z89:G, 4z89:H
57 2kym:A 120 56 0.2787 0.1417 0.3036 0.001
58 5ypr:A 267 53 0.2951 0.0674 0.3396 0.001 7f7g:A, 7f7g:B, 7f7i:A, 7f7i:D, 7f7i:B, 7f7i:C, 7f7i:E, 7f7i:F, 5gnv:A, 1jxm:A, 3wp0:A, 3wp1:B, 5ypo:B, 5ypo:A
59 7oj9:A 67 52 0.2951 0.2687 0.3462 0.002
60 4iim:A 57 55 0.2459 0.2632 0.2727 0.004 4iim:B
61 3tvt:A 255 53 0.2951 0.0706 0.3396 0.004
62 1w70:A 60 50 0.2459 0.2500 0.3000 0.005 1w70:B
63 2fpd:C 62 53 0.2459 0.2419 0.2830 0.007 7nyl:AAA
64 3i5r:A 81 67 0.3443 0.2593 0.3134 0.008
65 4wci:C 63 55 0.2459 0.2381 0.2727 0.015 2j6f:A, 2j6o:A, 2j7i:A, 2j7i:B, 4wci:A, 4wci:E
66 2lcs:A 67 52 0.2459 0.2239 0.2885 0.016
67 4x1v:A 59 54 0.2459 0.2542 0.2778 0.018 3u23:A
68 4lnp:A 61 50 0.2295 0.2295 0.2800 0.026
69 8hlo:A 67 32 0.1639 0.1493 0.3125 0.11 2rqu:A
70 6pi7:A 192 39 0.2295 0.0729 0.3590 0.15
71 8dgq:A 272 43 0.2623 0.0588 0.3721 0.18 8dgq:B, 6pxc:A, 6way:A
72 3gue:A 468 16 0.1639 0.0214 0.6250 0.20 3gue:B
73 1zuk:A 65 55 0.2459 0.2308 0.2727 0.30 1zuk:B
74 4wsi:A 372 22 0.1311 0.0215 0.3636 0.41 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
75 3tsz:A 341 52 0.2787 0.0499 0.3269 0.65 3shw:A
76 7zmk:A 221 34 0.2131 0.0588 0.3824 0.74 8un7:A, 8un7:D, 8un7:B, 8un7:E, 8un7:C, 8un7:F, 8un7:G, 8un7:H, 7zmk:D, 7zmk:I, 7zmk:L, 7zmk:O, 7zmk:R, 7zmk:U, 7zmk:X
77 4m28:A 483 19 0.1639 0.0207 0.5263 0.97 4m2a:A, 4m2b:A, 5nzg:A, 5nzi:A, 5nzj:A, 5nzk:A, 5nzl:A, 5nzm:A, 2oeg:A
78 6fzm:A 190 21 0.1803 0.0579 0.5238 1.7 4f1l:A, 4f1l:B, 4f1l:C, 4f1l:D, 4f1q:A, 4f1q:B, 6fym:A, 6fym:B, 6fym:C, 6fym:D, 6fzm:B, 6g0w:A, 6g0w:B, 3goy:A, 3goy:B, 3goy:C, 3goy:D, 7l9y:A, 7l9y:B, 7l9y:C, 7l9y:D, 7lun:A, 7lun:B, 7lun:C, 7lun:D, 7lun:E, 7lun:F, 7lun:G, 7lun:H, 5lxp:A, 5lxp:B, 5lyh:A, 5lyh:B, 5nqe:A, 5nqe:B, 4py4:B, 3se2:A, 3se2:B, 3se2:C, 3se2:D, 3smi:A, 3smi:B, 3smj:A, 3smj:B, 5v7t:A, 5v7w:A, 5v7w:B, 6we2:A, 6we2:B, 6we3:A, 6we3:B, 6we4:A, 6we4:B
79 2a0i:A 293 56 0.1967 0.0410 0.2143 2.1
80 4py4:A 169 21 0.1803 0.0651 0.5238 2.3 7r3l:A, 7r3l:B
81 5n8o:A 1432 52 0.1967 0.0084 0.2308 2.4 4l0j:A, 1p4d:A, 1p4d:B, 1p4d:C, 2q7t:A, 2q7t:B, 2q7u:A
82 8b80:A 474 34 0.1803 0.0232 0.3235 3.3 8b81:A, 8b81:B, 5okb:B, 5okb:C, 5okb:D, 5oke:C, 5oke:D, 5oke:A, 5oke:B, 5okg:C, 5okg:D, 5okg:A, 5okg:B, 5okk:A, 5okk:B, 5okq:A, 5okq:B, 5okr:A, 5okr:B, 5oks:A, 5oks:B, 4zen:A, 4zen:B, 4zep:A, 4zep:B, 4zfm:D, 4zfm:A, 4zfm:B, 4zfm:C
83 8jhe:A 508 26 0.1475 0.0177 0.3462 6.4 8jhe:B, 8jhe:C, 8jhe:D
84 6vld:B 469 48 0.1803 0.0235 0.2292 8.2 6tkv:A, 6tkv:B, 6vld:A, 6vlg:A, 6vlg:B, 6vlg:C, 6vlg:D, 6x5h:A, 6x5h:B, 6x5h:C, 6x5r:B, 6x5r:A, 6x5s:A, 6x5s:B, 6x5t:A, 6x5t:B, 6x5t:C, 6x5t:D, 6x5t:E, 6x5t:F, 6x5t:G, 6x5t:H, 6x5u:E, 6x5u:B, 6x5u:D, 6x5u:F, 6x5u:A, 6x5u:G, 6x5u:C, 6x5u:H
85 5ixb:A 105 67 0.2787 0.1619 0.2537 8.4 5ixb:B
86 6ci7:A 365 21 0.1639 0.0274 0.4762 8.8 6ci7:B, 6ci7:C, 6ci7:D, 6ci7:E, 6ci7:F, 6cib:A, 6cib:B, 6cib:C, 6cib:D, 6cib:E, 6cib:F
87 6p2o:A 727 39 0.2131 0.0179 0.3333 8.9 6p2o:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218