Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GVLKLPIESIHRDKDQPRTYFDEEKLKELSESIKAQGVLQPILVRKDGDGYRIIAGERRWRASQAAGLKEVPAIVRDVTE
VQAFELALVENLQRADLNPIEEAEGYKRLVDEFKLTQEQVSVRVGKERSTVANALRLLALPTDVKGMVADGSLSMGHARA
LLGVPRLPELQNLAKQVADKKLSVRDTERLVQQ

The query sequence (length=193) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7bnr:B 196 192 0.9896 0.9745 0.9948 1.38e-136 7bnk:A, 7bnk:B, 7bnr:A, 7o0n:A, 7o0n:B
2 1vz0:B 192 189 0.5492 0.5521 0.5608 3.66e-63 1vz0:A, 1vz0:C, 1vz0:D
3 6sdk:A 199 178 0.4767 0.4623 0.5169 1.07e-61 6sdk:B, 6sdk:C, 6sdk:D
4 6t1f:C 195 191 0.4974 0.4923 0.5026 1.85e-51 7bm8:A, 7bm8:B, 6s6h:A, 6t1f:A, 6t1f:B, 6t1f:D
5 7ol9:B 203 190 0.4301 0.4089 0.4368 1.48e-50 7ol9:A, 6y93:A, 6y93:B
6 4umk:D 176 171 0.3938 0.4318 0.4444 4.48e-42 4umk:A
7 6s6h:B 140 110 0.2435 0.3357 0.4273 3.82e-19
8 8qa8:B 202 159 0.2642 0.2525 0.3208 4.26e-13 8qa8:A, 8qa8:C, 8qa8:D, 8qa8:E, 8qa8:F, 1r71:A, 1r71:B, 1r71:C, 1r71:D
9 5x0b:A 241 109 0.1710 0.1369 0.3028 5.69e-04 5x0e:A, 5x0f:A, 5x0g:A, 5x0j:A, 5x0k:A
10 5x51:M 1386 114 0.1606 0.0224 0.2719 0.006 5x4z:A, 5x51:A, 8yfr:A
11 7ena:PA 1475 100 0.1554 0.0203 0.3000 0.013 7b0y:A, 8b3d:A, 8b3f:A, 7enc:PA, 6gmh:A, 6gml:A, 8gxq:PA, 8gxs:PA, 7lbm:A, 5oik:A, 7oo3:A, 7oob:A, 7oop:A, 7opc:A, 7opd:A, 8p4a:A, 8p4b:A, 8p4c:A, 8p4d:A, 8p4e:A, 8p4f:A, 8s51:A, 8s52:A, 8s54:A, 8s55:A, 8uha:A, 8uhd:A, 8uis:A, 8w8e:A, 8w8f:A, 7ycx:1
12 8a3y:A 1426 94 0.1554 0.0210 0.3191 0.020 8oeu:A, 8oev:A, 8oew:A, 8of0:A, 7okx:A, 7oky:A, 7ol0:A, 7pks:A, 8rbx:A, 6ted:A, 8uhg:A, 8ui0:A, 7unc:A, 7und:A
13 5xon:A 1427 122 0.1606 0.0217 0.2541 0.17 6a5l:A, 6a5o:A, 6a5p:A, 6a5r:A, 6a5t:A, 6a5u:A, 8h0v:A, 8h0w:A, 8he5:A, 6inq:A, 6ir9:A, 6j4w:A, 6j4x:A, 6j4y:A, 6j4z:A, 6j50:A, 6j51:A, 8jh2:A, 8jh3:A, 8jh4:A, 7wbv:A, 7wbw:A, 7wbx:A, 5x4z:M, 5x50:A, 7xn7:A, 5xog:A, 7xse:A, 7xsx:A, 7xsz:A, 7xt7:A, 7xtd:A, 7xti:A, 8yfq:A
14 6o9l:A 1476 105 0.1554 0.0203 0.2857 0.26 8a40:A, 8bvw:A, 8byq:A, 8bz1:A, 7edx:o, 7eg7:o, 7eg8:o, 7eg9:o, 7ega:o, 7egb:o, 7egc:o, 6exv:A, 5flm:A, 5iy6:A, 5iy7:A, 5iy8:A, 5iy9:A, 5iya:A, 5iyb:A, 5iyc:A, 5iyd:A, 7nvr:A, 7nvs:A, 7nvt:A, 7nvu:A, 7nvy:A, 7nvz:A, 7nw0:A, 8s5n:A, 8wak:o, 8wal:o, 8wan:o, 8wao:o, 8wap:o, 8waq:o, 8war:o, 8was:o, 8wat:o, 8wau:o, 8wav:o, 8waw:o, 8wax:o, 8way:o, 8waz:o, 8wb0:o, 6xre:A, 7zwd:A, 7zx7:A, 7zx8:A
15 8tvs:A 1316 78 0.1192 0.0175 0.2949 0.59
16 1k83:A 1366 83 0.1192 0.0168 0.2771 0.60 1twa:A, 1twc:A, 1twg:A, 1twh:A
17 8tug:A 1367 78 0.1192 0.0168 0.2949 0.64 8tvp:A, 8tvq:A, 8tvv:A, 8tvw:A, 8tvx:A
18 8cen:A 1508 80 0.1140 0.0146 0.2750 0.79 4a3b:A, 4a3c:A, 4a3d:A, 4a3e:A, 4a3f:A, 4a3g:A, 4a3i:A, 4a3j:A, 4a3k:A, 4a3l:A, 4a3m:A, 4a93:A, 2b63:A, 2b8k:A, 4bbr:A, 4bbs:A, 4bxx:A, 4bxz:A, 4by1:A, 4by7:A, 5c3e:A, 5c44:A, 5c4a:A, 5c4x:A, 8ceo:A, 2e2h:A, 2e2i:A, 2e2j:A, 3fki:A, 5fmf:A, 5fyw:A, 5fz5:A, 3gtj:A, 3gtl:A, 3gtm:A, 3gto:A, 3gtp:A, 3gtq:A, 6gyk:A, 6gyl:A, 6gym:A, 3h3v:B, 3hou:A, 3hou:M, 3hov:A, 3how:A, 3hox:A, 3hoy:A, 3hoz:A, 1i3q:A, 3i4m:A, 3i4n:A, 1i50:A, 6i84:A, 5ip7:A, 5ip9:A, 3j0k:A, 2ja5:A, 2ja6:A, 2ja7:A, 2ja7:M, 2ja8:A, 8jch:A, 3k1f:A, 8k5p:A, 3k7a:A, 7kee:A, 7kef:A, 3m3y:A, 3m4o:A, 7mei:a, 7mei:A, 7mk9:A, 7mka:a, 7ml0:A, 7ml1:A, 7ml2:A, 7ml4:A, 7nkx:A, 7nky:A, 2nvq:A, 2nvt:A, 2nvx:A, 2nvy:A, 2nvz:A, 7o4i:A, 7o4j:A, 6o6c:A, 7o72:A, 7o73:A, 7o75:A, 5oqj:A, 5oqm:A, 5ot2:A, 3po2:A, 3po3:A, 3qt1:A, 2r7z:A, 1r9t:A, 2r92:A, 2r93:A, 7riq:A, 3rzd:A, 3rzo:A, 3s14:A, 3s15:A, 3s16:A, 3s17:A, 3s1m:A, 3s1n:A, 3s1q:A, 3s1r:A, 3s2d:A, 3s2h:A, 1sfo:A, 5sva:A, 1twf:A, 5u5q:A, 4v1m:A, 4v1n:A, 4v1o:A, 2vum:A, 1wcm:A, 4x67:A, 4x6a:A, 1y1v:A, 1y1w:A, 4y52:A, 1y77:A, 4y7n:A, 2yu9:A, 7zs9:A, 7zsa:A, 7zsb:A
19 8uxh:A 4004 31 0.0725 0.0035 0.4516 2.9 8uxh:B, 8uxh:C, 8uxh:D, 8uxi:A, 8uxi:B, 8uxi:C, 8uxi:D
20 8uxl:A 4232 31 0.0725 0.0033 0.4516 2.9 7u9q:A, 7u9q:D, 7u9q:B, 7u9q:C, 7u9r:A, 7u9r:D, 7u9r:B, 7u9r:C, 7u9t:A, 7u9t:D, 7u9t:B, 7u9t:C, 7u9x:A, 7u9x:B, 7u9x:C, 7u9x:D, 7u9z:A, 7u9z:B, 7u9z:C, 7u9z:D, 7ua1:A, 7ua1:B, 7ua1:C, 7ua1:D, 7ua5:A, 7ua5:B, 7ua5:C, 7ua5:D, 7ua9:A, 7ua9:B, 7ua9:C, 7ua9:D, 8uq2:A, 8uq2:B, 8uq2:C, 8uq2:D, 8uq3:A, 8uq3:B, 8uq3:C, 8uq3:D, 8uq4:A, 8uq4:B, 8uq4:C, 8uq4:D, 8uq5:A, 8uq5:B, 8uq5:C, 8uq5:D, 8uxc:A, 8uxc:B, 8uxc:C, 8uxc:D, 8uxe:A, 8uxe:B, 8uxe:C, 8uxe:D, 8uxf:A, 8uxf:B, 8uxf:C, 8uxf:D, 8uxg:A, 8uxg:B, 8uxg:C, 8uxg:D, 8uxl:B, 8uxl:C, 8uxl:D, 8uxm:A, 8uxm:B, 8uxm:C, 8uxm:D
21 7ua3:A 4443 31 0.0725 0.0032 0.4516 3.0 7ua3:B, 7ua3:C, 7ua3:D, 7ua4:A, 7ua4:B, 7ua4:C, 7ua4:D
22 3pjg:A 389 113 0.1451 0.0720 0.2478 3.9 3pln:A, 3plr:A
23 5loe:A 258 64 0.1192 0.0891 0.3594 4.2 2b18:A, 2gx5:C, 2hgv:A, 5loe:B, 5loe:C, 5loe:D
24 3i0p:A 361 40 0.0622 0.0332 0.3000 4.6
25 5da9:B 400 40 0.0725 0.0350 0.3500 5.3
26 5w8o:B 346 50 0.0933 0.0520 0.3600 5.9 5w8o:A
27 5da9:A 433 40 0.0725 0.0323 0.3500 6.1 5dac:A, 5dac:B
28 3h0g:M 1476 23 0.0570 0.0075 0.4783 7.7
29 7zr1:D 780 40 0.0725 0.0179 0.3500 8.9 7zr1:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218