Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GVFTREQLDEYQDCTFFTRKDIIRLYKRFYALNPHKVPTNMQGNRPAITTLTFEEVEKMPELKENPFKRRICEVFSEDGR
GNLSFDDFLDMFSVFSEMAPLQLKLKYAFRIYDYDGDELLGHDDLSKMIRSLTRDELSDVEVEFIIERIIEEADLDGDSS
INFAEFEHVVSRSPDFIRTFHIRI

The query sequence (length=184) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8tkp:B 187 184 1.0000 0.9840 1.0000 3.45e-135 8tkp:E, 7usw:C, 7usw:E, 7usx:C, 7usx:E, 7usy:C, 7usy:E
2 6wu5:B 183 182 0.4946 0.4973 0.5000 8.81e-61 6wu5:A, 6wu7:A, 6wu7:B, 6wud:A
3 2l4h:A 184 188 0.4511 0.4511 0.4415 1.24e-48 2l4i:A, 2lm5:A, 6ocx:D, 6ocx:C, 6ocx:A, 6ocx:B, 6od0:A, 6od0:B, 1xo5:A, 1xo5:B, 1y1a:A, 1y1a:B
4 5b8i:B 171 170 0.2717 0.2924 0.2941 1.70e-24
5 7u0t:A 190 157 0.2826 0.2737 0.3312 9.37e-24
6 4il1:A 529 158 0.2935 0.1021 0.3418 3.12e-23 1aui:A, 1aui:B, 9b9g:H, 9b9g:J, 5c1v:A, 5c1v:B, 4f0z:B, 4il1:B, 4il1:C, 4il1:D, 2jog:A, 3ll8:A, 3ll8:B, 3ll8:C, 3ll8:D, 1m63:A, 1m63:B, 1m63:E, 1m63:F, 1mf8:A, 1mf8:B, 6nuc:A, 6nuc:B, 6nuf:A, 6nuf:B, 6nuu:A, 6nuu:B, 4or9:B, 4ora:B, 4orb:A, 4orb:B, 4orc:B, 2p6b:A, 2p6b:C, 2p6b:B, 2p6b:D, 5sve:A, 5sve:B, 1tco:A, 1tco:B, 6uuq:A
7 6tz8:B 174 166 0.2554 0.2701 0.2831 3.46e-23 6tz8:E
8 2ct9:B 198 179 0.3152 0.2929 0.3240 4.00e-22 2ct9:A, 2e30:A
9 7u0u:A 195 160 0.2609 0.2462 0.3000 9.43e-22 6tz7:B
10 6tz6:E 146 118 0.2228 0.2808 0.3475 1.68e-19 6tz6:B
11 2bec:A 181 181 0.2772 0.2818 0.2818 7.50e-15
12 2l1w:A 149 108 0.1957 0.2416 0.3333 6.04e-11 2ksz:A, 2roa:A, 2rob:A
13 2l1w:A 149 71 0.1359 0.1678 0.3521 4.94e-04 2ksz:A, 2roa:A, 2rob:A
14 1uhn:A 189 124 0.1848 0.1799 0.2742 8.21e-11 2zfd:A
15 1v1f:A 188 123 0.1848 0.1809 0.2764 9.15e-11 2ehb:A, 1v1g:A
16 2f2p:A 169 129 0.2011 0.2189 0.2868 3.97e-10 2f2o:B, 2f2p:B
17 2f2p:A 169 67 0.1196 0.1302 0.3284 4.66e-04 2f2o:B, 2f2p:B
18 2n6a:A 162 129 0.2011 0.2284 0.2868 4.14e-10
19 2n6a:A 162 67 0.1196 0.1358 0.3284 3.24e-04
20 8aht:A 140 121 0.2174 0.2857 0.3306 6.59e-10 8aht:B
21 8aht:A 140 79 0.1304 0.1714 0.3038 5.06e-04 8aht:B
22 6xyr:A 348 126 0.2011 0.1063 0.2937 9.84e-10
23 6xyr:A 348 79 0.1304 0.0690 0.3038 3.51e-04
24 3o78:A 402 126 0.2011 0.0920 0.2937 1.48e-09 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
25 3o78:A 402 67 0.1196 0.0547 0.3284 3.52e-04 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
26 6hr1:A 406 126 0.2011 0.0911 0.2937 1.68e-09 6hr1:B
27 6hr1:A 406 69 0.1196 0.0542 0.3188 3.91e-04 6hr1:B
28 6u2m:A 464 126 0.2011 0.0797 0.2937 2.53e-09 8aht:C, 1ak8:A, 3b32:A, 7cqv:E, 5dsu:A, 2i08:A, 1j7o:A, 6jiu:C, 6jiu:F, 6jiu:I, 6jiu:L, 2kug:A, 6pjx:B, 2pq3:A, 4q57:A, 6u2m:C, 3uct:B, 3ucw:C, 3ucy:A
29 6u2m:A 464 69 0.1196 0.0474 0.3188 2.06e-04 8aht:C, 1ak8:A, 3b32:A, 7cqv:E, 5dsu:A, 2i08:A, 1j7o:A, 6jiu:C, 6jiu:F, 6jiu:I, 6jiu:L, 2kug:A, 6pjx:B, 2pq3:A, 4q57:A, 6u2m:C, 3uct:B, 3ucw:C, 3ucy:A
30 3u0k:A 397 126 0.2120 0.0982 0.3095 2.53e-09
31 3u0k:A 397 75 0.1359 0.0630 0.3333 3.07e-05
32 1ggz:A 144 115 0.1957 0.2500 0.3130 3.01e-09
33 1ggz:A 144 69 0.1087 0.1389 0.2899 0.008
34 6xw2:A 387 129 0.2228 0.1059 0.3178 3.14e-09
35 6xw2:A 387 69 0.1250 0.0594 0.3333 6.31e-04
36 1rfj:A 148 115 0.1957 0.2432 0.3130 3.40e-09 5a2h:A, 4aqr:A, 4aqr:B, 2ro9:A
37 1rfj:A 148 67 0.1196 0.1486 0.3284 1.36e-04 5a2h:A, 4aqr:A, 4aqr:B, 2ro9:A
38 1osa:A 148 111 0.1902 0.2365 0.3153 3.69e-09 1clm:A, 5e1k:A, 5e1n:A, 5e1p:A, 1exr:A, 2kxw:A, 2m5e:A
39 1osa:A 148 67 0.1196 0.1486 0.3284 3.94e-04 1clm:A, 5e1k:A, 5e1n:A, 5e1p:A, 1exr:A, 2kxw:A, 2m5e:A
40 8b6q:A 466 121 0.2011 0.0794 0.3058 6.78e-09 1a29:A, 1ahr:A, 8ahs:A, 8aht:D, 6ale:R, 4anj:B, 6b8m:B, 6b8m:D, 6b8m:F, 6b8m:H, 6b8n:B, 6b8n:D, 6b8n:F, 6b8n:H, 6b8p:B, 6b8p:D, 6b8p:F, 6b8p:H, 6b8q:B, 6b8q:D, 6b8q:H, 6b8q:F, 2bbm:A, 2bbn:A, 2bcx:A, 8bd2:A, 2be6:A, 2be6:B, 2be6:C, 7bf1:AAA, 7bf2:AAA, 2bkh:B, 2bki:B, 4bw8:A, 4bw8:B, 3bxk:A, 3bxk:C, 3bxl:A, 3bya:A, 4bya:A, 4byf:D, 1cdl:A, 1cdl:B, 1cdl:C, 1cdl:D, 1cdm:A, 1cff:A, 1ckk:A, 1cll:A, 3cln:A, 4cln:A, 1cm1:A, 1cm4:A, 6cnn:E, 6cnn:F, 6cnn:G, 6cnn:H, 6cno:E, 6cno:F, 6cno:G, 6cno:H, 2col:B, 7cqh:B, 7cqp:B, 7cqv:A, 1ctr:A, 6ctb:A, 6czq:R, 6dad:A, 6dad:B, 6dae:B, 6dae:A, 6daf:A, 6daf:B, 6dah:A, 6dah:B, 6dah:C, 6dah:D, 4dbp:C, 4dbq:B, 5dbr:A, 4dck:B, 8dgh:A, 8dgk:A, 4djc:A, 5dow:A, 5dow:C, 5dow:E, 5dow:G, 3dve:A, 3dvj:A, 3dvk:A, 3dvm:A, 6e2f:E, 6e2g:E, 6eeb:A, 4ehq:A, 3ewt:A, 3ewv:A, 2f2o:A, 2f3y:A, 2f3z:A, 6feg:B, 6feh:B, 8fny:B, 8fny:D, 2fot:A, 8fo6:B, 1fw4:A, 4g27:R, 4g28:R, 1g4y:R, 3g43:A, 3g43:B, 3g43:C, 3g43:D, 6gdk:A, 5ggm:A, 8gm4:B, 8gm5:B, 3gn4:B, 3gn4:D, 3gn4:F, 3gn4:H, 3gof:A, 3gof:B, 4gow:D, 3gp2:A, 6hcs:A, 6hcs:C, 6hcs:E, 6hcs:G, 4hex:A, 4hex:B, 2hf5:A, 5hit:A, 2hqw:A, 3hr4:B, 3hr4:D, 3hr4:F, 3hr4:H, 3if7:A, 3ifk:A, 3ifk:B, 1iq5:A, 1iwq:A, 5j03:B, 3j41:E, 3j41:F, 1j7p:A, 5j7j:A, 5j8h:A, 4j9y:R, 4j9z:R, 6jiy:C, 6jiy:F, 6jiy:I, 6jiy:L, 4jpz:C, 4jpz:I, 4jq0:C, 5jqa:A, 5jth:A, 6jv2:B, 6jv2:D, 6jv2:F, 6jv2:H, 2jzi:A, 2k0e:A, 2k0f:A, 2k0j:A, 6k4k:C, 6k4l:C, 6k4l:D, 6k4r:C, 6k4r:D, 2k61:A, 5k8q:A, 1k90:D, 1k90:E, 1k90:F, 1k93:D, 1k93:E, 1k93:F, 8k9z:B, 8k9z:D, 8ka0:B, 8ka0:D, 8ka0:F, 8ka0:H, 8ka1:F, 2kdu:A, 7kl5:A, 2kne:A, 2kuh:A, 1l7z:A, 2l7l:A, 7l8v:A, 3l9i:C, 2lgf:A, 1lin:A, 2ll6:A, 2ll7:A, 2llo:A, 2llq:A, 2lqc:A, 2lqp:A, 1lvc:D, 1lvc:E, 1lvc:F, 2lv6:A, 2m0j:A, 2m0k:A, 4m1l:A, 2m3s:A, 2m55:A, 6m7h:A, 6mba:B, 6mc9:B, 2mes:A, 2mg5:A, 2mgu:A, 7mir:B, 7mis:B, 1mux:A, 6mud:A, 6mue:A, 1mxe:A, 1mxe:B, 2n27:A, 6n5w:C, 2n8j:A, 1niw:A, 1niw:C, 1niw:E, 1niw:G, 5nin:A, 5nin:B, 7nqc:A, 1nwd:A, 6o20:F, 2o5g:A, 6o5g:A, 2o60:A, 5oeo:A, 1ooj:A, 6os4:A, 4ovn:A, 4ovn:B, 4ovn:C, 4ovn:D, 4ovn:E, 3oxq:A, 3oxq:B, 3oxq:C, 3oxq:D, 6paw:D, 6paw:G, 6paw:H, 6paw:C, 4pjj:B, 1pk0:D, 1pk0:E, 1pk0:F, 6plm:C, 6plm:D, 7ppo:B, 7pqe:B, 1prw:A, 7psz:A, 7pu9:A, 4q5u:A, 1qiv:A, 1qiw:A, 1qiw:B, 4qnh:R, 1qs7:A, 1qs7:C, 1qtx:A, 2r28:A, 2r28:B, 4rjd:A, 4rjd:B, 2ro8:A, 1s26:D, 1s26:E, 1s26:F, 7shq:B, 8sik:B, 8sik:F, 8sik:H, 8sim:B, 8sim:D, 8sim:F, 8sim:H, 3sjq:A, 3sjq:B, 1sk6:D, 1sk6:E, 1sk6:F, 3sui:A, 1sw8:A, 1sy9:A, 5sy1:C, 5sy1:D, 6sz5:A, 5t0x:A, 7t2q:A, 7tci:B, 7tci:F, 7tci:D, 7tci:H, 7tcp:B, 7tcp:F, 7tcp:H, 7tcp:D, 5tp6:A, 7tzc:K, 7tzc:D, 7tzc:E, 7tzc:C, 6u39:A, 6u39:C, 6u39:E, 6u39:G, 6u39:I, 6u39:K, 6u39:M, 6u39:O, 6u39:Q, 6u39:S, 6u3a:A, 6u3a:B, 6u3b:A, 6u3d:A, 6u3d:B, 3uct:A, 3ucw:A, 3ucw:B, 3ucw:D, 4umo:C, 4umo:D, 1up5:A, 1up5:B, 4upu:A, 8uxl:I, 8uxl:J, 8uxl:L, 8uxl:K, 8uxm:I, 8uxm:J, 8uxm:L, 8uxm:K, 6uzz:B, 6uzz:D, 6uzz:F, 6uzz:H, 2v01:A, 2v02:A, 4v0c:C, 4v0c:D, 5v02:R, 5v03:R, 6v00:B, 6v00:E, 6v00:H, 6v00:K, 6v01:B, 6v01:E, 6v01:H, 6v01:K, 2vas:B, 2vay:A, 2vb6:B, 5vms:B, 1vrk:A, 7vuo:C, 7vvd:C, 7vvd:E, 7vvh:C, 8w41:B, 2w73:A, 2w73:B, 2w73:E, 2w73:F, 5wbx:R, 5wc5:R, 2wel:D, 1wrz:A, 5wsv:A, 5wsv:C, 1x02:A, 2x0g:B, 2x51:B, 1xa5:A, 1xfu:O, 1xfu:P, 1xfu:Q, 1xfu:R, 1xfu:S, 1xfu:T, 1xfv:O, 1xfv:P, 1xfv:Q, 1xfv:R, 1xfv:S, 1xfv:T, 1xfw:O, 1xfw:P, 1xfw:Q, 1xfw:R, 1xfw:S, 1xfw:T, 1xfx:O, 1xfx:P, 1xfx:Q, 1xfx:R, 1xfx:S, 1xfx:T, 1xfy:O, 1xfy:P, 1xfy:Q, 1xfy:R, 1xfy:S, 1xfy:T, 1xfz:O, 1xfz:P, 1xfz:Q, 1xfz:R, 1xfz:S, 1xfz:T, 6xxf:AAA, 6xxx:AAA, 6xy3:AAA, 1y0v:H, 1y0v:I, 1y0v:J, 1y0v:K, 1y0v:L, 1y0v:M, 2y4v:A, 6y4o:A, 6y4p:A, 1y6w:A, 6y94:A, 2ygg:B, 6yns:A, 6yns:C, 6yns:B, 6yns:K, 6yns:D, 6yns:E, 6yns:F, 6yns:G, 6yns:H, 6yns:I, 6yns:J, 6yns:L, 6ynu:A, 6ynu:C, 1yr5:A, 1yrt:B, 1yru:B, 6zbi:A, 4zlk:B, 1zot:B, 7zrp:A, 7zrp:C, 7zrq:A, 1zuz:A
41 8b6q:A 466 69 0.1250 0.0494 0.3333 6.87e-05 1a29:A, 1ahr:A, 8ahs:A, 8aht:D, 6ale:R, 4anj:B, 6b8m:B, 6b8m:D, 6b8m:F, 6b8m:H, 6b8n:B, 6b8n:D, 6b8n:F, 6b8n:H, 6b8p:B, 6b8p:D, 6b8p:F, 6b8p:H, 6b8q:B, 6b8q:D, 6b8q:H, 6b8q:F, 2bbm:A, 2bbn:A, 2bcx:A, 8bd2:A, 2be6:A, 2be6:B, 2be6:C, 7bf1:AAA, 7bf2:AAA, 2bkh:B, 2bki:B, 4bw8:A, 4bw8:B, 3bxk:A, 3bxk:C, 3bxl:A, 3bya:A, 4bya:A, 4byf:D, 1cdl:A, 1cdl:B, 1cdl:C, 1cdl:D, 1cdm:A, 1cff:A, 1ckk:A, 1cll:A, 3cln:A, 4cln:A, 1cm1:A, 1cm4:A, 6cnn:E, 6cnn:F, 6cnn:G, 6cnn:H, 6cno:E, 6cno:F, 6cno:G, 6cno:H, 2col:B, 7cqh:B, 7cqp:B, 7cqv:A, 1ctr:A, 6ctb:A, 6czq:R, 6dad:A, 6dad:B, 6dae:B, 6dae:A, 6daf:A, 6daf:B, 6dah:A, 6dah:B, 6dah:C, 6dah:D, 4dbp:C, 4dbq:B, 5dbr:A, 4dck:B, 8dgh:A, 8dgk:A, 4djc:A, 5dow:A, 5dow:C, 5dow:E, 5dow:G, 3dve:A, 3dvj:A, 3dvk:A, 3dvm:A, 6e2f:E, 6e2g:E, 6eeb:A, 4ehq:A, 3ewt:A, 3ewv:A, 2f2o:A, 2f3y:A, 2f3z:A, 6feg:B, 6feh:B, 8fny:B, 8fny:D, 2fot:A, 8fo6:B, 1fw4:A, 4g27:R, 4g28:R, 1g4y:R, 3g43:A, 3g43:B, 3g43:C, 3g43:D, 6gdk:A, 5ggm:A, 8gm4:B, 8gm5:B, 3gn4:B, 3gn4:D, 3gn4:F, 3gn4:H, 3gof:A, 3gof:B, 4gow:D, 3gp2:A, 6hcs:A, 6hcs:C, 6hcs:E, 6hcs:G, 4hex:A, 4hex:B, 2hf5:A, 5hit:A, 2hqw:A, 3hr4:B, 3hr4:D, 3hr4:F, 3hr4:H, 3if7:A, 3ifk:A, 3ifk:B, 1iq5:A, 1iwq:A, 5j03:B, 3j41:E, 3j41:F, 1j7p:A, 5j7j:A, 5j8h:A, 4j9y:R, 4j9z:R, 6jiy:C, 6jiy:F, 6jiy:I, 6jiy:L, 4jpz:C, 4jpz:I, 4jq0:C, 5jqa:A, 5jth:A, 6jv2:B, 6jv2:D, 6jv2:F, 6jv2:H, 2jzi:A, 2k0e:A, 2k0f:A, 2k0j:A, 6k4k:C, 6k4l:C, 6k4l:D, 6k4r:C, 6k4r:D, 2k61:A, 5k8q:A, 1k90:D, 1k90:E, 1k90:F, 1k93:D, 1k93:E, 1k93:F, 8k9z:B, 8k9z:D, 8ka0:B, 8ka0:D, 8ka0:F, 8ka0:H, 8ka1:F, 2kdu:A, 7kl5:A, 2kne:A, 2kuh:A, 1l7z:A, 2l7l:A, 7l8v:A, 3l9i:C, 2lgf:A, 1lin:A, 2ll6:A, 2ll7:A, 2llo:A, 2llq:A, 2lqc:A, 2lqp:A, 1lvc:D, 1lvc:E, 1lvc:F, 2lv6:A, 2m0j:A, 2m0k:A, 4m1l:A, 2m3s:A, 2m55:A, 6m7h:A, 6mba:B, 6mc9:B, 2mes:A, 2mg5:A, 2mgu:A, 7mir:B, 7mis:B, 1mux:A, 6mud:A, 6mue:A, 1mxe:A, 1mxe:B, 2n27:A, 6n5w:C, 2n8j:A, 1niw:A, 1niw:C, 1niw:E, 1niw:G, 5nin:A, 5nin:B, 7nqc:A, 1nwd:A, 6o20:F, 2o5g:A, 6o5g:A, 2o60:A, 5oeo:A, 1ooj:A, 6os4:A, 4ovn:A, 4ovn:B, 4ovn:C, 4ovn:D, 4ovn:E, 3oxq:A, 3oxq:B, 3oxq:C, 3oxq:D, 6paw:D, 6paw:G, 6paw:H, 6paw:C, 4pjj:B, 1pk0:D, 1pk0:E, 1pk0:F, 6plm:C, 6plm:D, 7ppo:B, 7pqe:B, 1prw:A, 7psz:A, 7pu9:A, 4q5u:A, 1qiv:A, 1qiw:A, 1qiw:B, 4qnh:R, 1qs7:A, 1qs7:C, 1qtx:A, 2r28:A, 2r28:B, 4rjd:A, 4rjd:B, 2ro8:A, 1s26:D, 1s26:E, 1s26:F, 7shq:B, 8sik:B, 8sik:F, 8sik:H, 8sim:B, 8sim:D, 8sim:F, 8sim:H, 3sjq:A, 3sjq:B, 1sk6:D, 1sk6:E, 1sk6:F, 3sui:A, 1sw8:A, 1sy9:A, 5sy1:C, 5sy1:D, 6sz5:A, 5t0x:A, 7t2q:A, 7tci:B, 7tci:F, 7tci:D, 7tci:H, 7tcp:B, 7tcp:F, 7tcp:H, 7tcp:D, 5tp6:A, 7tzc:K, 7tzc:D, 7tzc:E, 7tzc:C, 6u39:A, 6u39:C, 6u39:E, 6u39:G, 6u39:I, 6u39:K, 6u39:M, 6u39:O, 6u39:Q, 6u39:S, 6u3a:A, 6u3a:B, 6u3b:A, 6u3d:A, 6u3d:B, 3uct:A, 3ucw:A, 3ucw:B, 3ucw:D, 4umo:C, 4umo:D, 1up5:A, 1up5:B, 4upu:A, 8uxl:I, 8uxl:J, 8uxl:L, 8uxl:K, 8uxm:I, 8uxm:J, 8uxm:L, 8uxm:K, 6uzz:B, 6uzz:D, 6uzz:F, 6uzz:H, 2v01:A, 2v02:A, 4v0c:C, 4v0c:D, 5v02:R, 5v03:R, 6v00:B, 6v00:E, 6v00:H, 6v00:K, 6v01:B, 6v01:E, 6v01:H, 6v01:K, 2vas:B, 2vay:A, 2vb6:B, 5vms:B, 1vrk:A, 7vuo:C, 7vvd:C, 7vvd:E, 7vvh:C, 8w41:B, 2w73:A, 2w73:B, 2w73:E, 2w73:F, 5wbx:R, 5wc5:R, 2wel:D, 1wrz:A, 5wsv:A, 5wsv:C, 1x02:A, 2x0g:B, 2x51:B, 1xa5:A, 1xfu:O, 1xfu:P, 1xfu:Q, 1xfu:R, 1xfu:S, 1xfu:T, 1xfv:O, 1xfv:P, 1xfv:Q, 1xfv:R, 1xfv:S, 1xfv:T, 1xfw:O, 1xfw:P, 1xfw:Q, 1xfw:R, 1xfw:S, 1xfw:T, 1xfx:O, 1xfx:P, 1xfx:Q, 1xfx:R, 1xfx:S, 1xfx:T, 1xfy:O, 1xfy:P, 1xfy:Q, 1xfy:R, 1xfy:S, 1xfy:T, 1xfz:O, 1xfz:P, 1xfz:Q, 1xfz:R, 1xfz:S, 1xfz:T, 6xxf:AAA, 6xxx:AAA, 6xy3:AAA, 1y0v:H, 1y0v:I, 1y0v:J, 1y0v:K, 1y0v:L, 1y0v:M, 2y4v:A, 6y4o:A, 6y4p:A, 1y6w:A, 6y94:A, 2ygg:B, 6yns:A, 6yns:C, 6yns:B, 6yns:K, 6yns:D, 6yns:E, 6yns:F, 6yns:G, 6yns:H, 6yns:I, 6yns:J, 6yns:L, 6ynu:A, 6ynu:C, 1yr5:A, 1yrt:B, 1yru:B, 6zbi:A, 4zlk:B, 1zot:B, 7zrp:A, 7zrp:C, 7zrq:A, 1zuz:A
42 5ukg:A 393 126 0.2011 0.0941 0.2937 7.22e-09 5ukg:B
43 5ukg:A 393 69 0.1196 0.0560 0.3188 2.57e-04 5ukg:B
44 4i2y:A 381 121 0.2011 0.0971 0.3058 1.57e-08 4i2y:B
45 4i2y:A 381 69 0.1196 0.0577 0.3188 5.31e-04 4i2y:B
46 4i2y:A 381 98 0.1304 0.0630 0.2449 3.5 4i2y:B
47 2lcp:A 190 186 0.2283 0.2211 0.2258 8.20e-08 5aeq:A, 5aeq:B, 5aer:A, 5afp:B, 5afp:A, 8ahy:B, 8alh:B, 8alm:B, 1g8i:A, 1g8i:B, 4guk:A, 4guk:C, 4guk:B, 4guk:D, 4ov2:A, 4ov2:B, 4ov2:C, 4ov2:D, 6qi4:B, 6qi4:C, 4yru:A, 4yru:B, 4yru:C, 4yru:D
48 2lmt:A 148 117 0.1793 0.2230 0.2821 1.80e-07 2lmu:A, 2lmv:A
49 1bjf:A 181 185 0.2446 0.2486 0.2432 4.09e-07 1bjf:B
50 2jul:A 181 188 0.2283 0.2320 0.2234 6.91e-07 2e6w:A
51 7d3e:C 1380 152 0.2446 0.0326 0.2961 1.36e-06 7d3e:A, 7d3f:C, 7d3f:A
52 5aan:A 183 179 0.2174 0.2186 0.2235 2.15e-06 4by4:A, 4by4:B, 4by5:A, 4by5:B, 4by5:C, 4by5:D, 6epa:A, 5fyx:A, 5g08:A
53 8jp5:C 101 73 0.1413 0.2574 0.3562 2.96e-06 3a4u:B, 8jp4:C, 8jp4:D, 8jp4:G, 8jp4:H, 8jp5:D, 8jp5:G, 8jp5:H, 8jp6:C, 8jp6:D, 8jp6:G, 8jp6:H, 8jp7:C, 8jp7:D, 8jp7:G, 8jp7:H, 8jp8:C, 8jp8:D, 8jp8:G, 8jp8:H, 8jp9:C, 8jp9:D, 8jp9:G, 8jp9:H, 8jpg:C, 8jpg:G, 8jpg:D, 8jpg:H, 3lcp:C, 3lcp:D, 2vrg:A, 4ygb:B, 4ygb:D, 4ygc:B, 4ygc:D, 4ygd:B, 4ygd:F, 4ygd:H, 4yge:B, 4yge:D, 4yge:F
54 6dmw:E 113 90 0.1467 0.2389 0.3000 3.01e-06
55 3ox5:A 153 96 0.1630 0.1961 0.3125 3.49e-06 2k7b:A, 2k7d:A, 2lan:A, 2lap:A, 3ox5:B, 3ox5:C, 3ox5:D, 3ox5:E, 3ox5:F, 3ox6:A, 3ox6:B, 3ox6:C, 3ox6:D, 3ox6:F
56 2lv7:A 100 80 0.1359 0.2500 0.3125 1.12e-05
57 3kf9:A 149 116 0.1685 0.2081 0.2672 1.21e-05 3kf9:C
58 3kf9:A 149 67 0.0924 0.1141 0.2537 6.1 3kf9:C
59 6k67:B 83 69 0.1196 0.2651 0.3188 1.75e-05 6k67:D
60 2kn2:A 92 63 0.1304 0.2609 0.3810 1.87e-05
61 5h7d:E 113 67 0.1196 0.1947 0.3284 2.48e-05 5h7d:F, 5h7d:G, 5h7d:H, 5h7d:K, 5h7d:L, 5h7d:O, 5h7d:P
62 5g4p:A 184 188 0.2228 0.2228 0.2181 3.23e-05 5g4p:E, 5g58:A, 5g58:E, 5m6c:A, 5m6c:E
63 5coc:A 124 67 0.1196 0.1774 0.3284 4.62e-05
64 8ebs:J 149 114 0.1630 0.2013 0.2632 7.41e-05 2a4j:A, 8ebt:J, 8ebv:J, 8ebw:J, 8ebx:J, 2ggm:A, 2ggm:B, 2k2i:A, 2obh:A, 2obh:B
65 6xu4:A 389 111 0.1630 0.0771 0.2703 8.14e-05 6xu4:B, 6xu4:E
66 6xu4:A 389 67 0.1141 0.0540 0.3134 0.014 6xu4:B, 6xu4:E
67 5d43:A 150 113 0.1739 0.2133 0.2832 8.68e-05 5d43:B
68 7ukh:I 181 184 0.2120 0.2155 0.2120 9.58e-05 7ukh:J, 7ukh:K, 7ukh:L
69 2lhi:A 176 134 0.1739 0.1818 0.2388 1.54e-04 1f55:A, 2lhh:A, 6oqq:B, 6oqq:D
70 2lhi:A 176 67 0.1250 0.1307 0.3433 0.004 1f55:A, 2lhh:A, 6oqq:B, 6oqq:D
71 4ygd:D 62 67 0.1359 0.4032 0.3731 1.82e-04 3wht:B, 3whu:B, 3wnx:B, 4ygc:F, 4ygc:H
72 3dd4:A 214 168 0.1902 0.1636 0.2083 2.15e-04
73 2kz2:A 93 68 0.1196 0.2366 0.3235 2.36e-04
74 1omr:A 201 134 0.1630 0.1493 0.2239 2.89e-04 2het:A, 2het:B, 2het:C, 2het:D, 2i94:A, 1jsa:A, 1la3:A, 4m2o:A, 4m2p:A, 4m2q:A, 4mlw:A, 1omv:A, 1rec:A, 4yi8:A, 4yi9:A
75 1fpw:A 190 123 0.1630 0.1579 0.2439 3.12e-04 2ju0:A
76 5x9a:B 198 123 0.1467 0.1364 0.2195 4.00e-04 5x9a:A, 5ypx:A, 5ypx:B
77 8u87:A 621 119 0.1522 0.0451 0.2353 7.78e-04 8u7y:A, 8u7y:B, 8u85:A, 8u85:C, 8u86:A, 8u86:C, 8u87:C
78 1qx7:M 115 116 0.1630 0.2609 0.2586 7.83e-04
79 7m2m:A 183 129 0.1685 0.1694 0.2403 0.001
80 8osi:A 400 111 0.1685 0.0775 0.2793 0.001
81 8osi:A 400 67 0.1250 0.0575 0.3433 0.005
82 6k4k:D 95 67 0.1141 0.2211 0.3134 0.002
83 1ncy:A 162 116 0.1793 0.2037 0.2845 0.002 1a2x:A, 1avs:A, 1avs:B, 1cta:A, 1cta:B, 1ctd:A, 1ctd:B, 1jc2:A, 1npq:A, 1smg:A, 1tnq:A, 4tnc:A, 5tnc:A, 1top:A, 2w49:0, 2w49:3, 2w49:6, 2w49:9, 1ytz:C, 1yv0:C
84 1ncy:A 162 67 0.1250 0.1420 0.3433 0.093 1a2x:A, 1avs:A, 1avs:B, 1cta:A, 1cta:B, 1ctd:A, 1ctd:B, 1jc2:A, 1npq:A, 1smg:A, 1tnq:A, 4tnc:A, 5tnc:A, 1top:A, 2w49:0, 2w49:3, 2w49:6, 2w49:9, 1ytz:C, 1yv0:C
85 3tz1:A 71 70 0.1304 0.3380 0.3429 0.003
86 4jwq:C 73 67 0.1141 0.2877 0.3134 0.005 4jwq:A
87 1tn4:A 157 114 0.1848 0.2166 0.2982 0.005 1tcf:A, 2tn4:A
88 1tn4:A 157 67 0.1250 0.1465 0.3433 0.20 1tcf:A, 2tn4:A
89 3qrx:A 145 106 0.1630 0.2069 0.2830 0.006 1oqp:A
90 3qrx:A 145 63 0.0978 0.1241 0.2857 3.2 1oqp:A
91 2r2i:A 184 111 0.1413 0.1413 0.2342 0.007
92 8c0t:A 281 67 0.1196 0.0783 0.3284 0.012
93 2doq:B 149 110 0.1902 0.2349 0.3182 0.013 2doq:A, 2doq:C, 4mbe:D, 4mbe:A
94 1s1e:A 181 127 0.1304 0.1326 0.1890 0.016 2i2r:E, 2i2r:F, 2i2r:G, 2i2r:H, 2i2r:M, 2i2r:N, 2i2r:O, 2i2r:P, 2nz0:A, 2nz0:C, 1s6c:A
95 2lvj:A 77 70 0.1033 0.2468 0.2714 0.016 1k9u:A, 1k9u:B, 2lvk:A, 5otj:D, 5otj:C
96 6gez:B 532 67 0.1196 0.0414 0.3284 0.019 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
97 5joj:A 97 84 0.1304 0.2474 0.2857 0.036
98 2m28:A 72 68 0.1141 0.2917 0.3088 0.037
99 1jba:A 189 110 0.1413 0.1376 0.2364 0.040
100 3o4y:A 172 92 0.1413 0.1512 0.2826 0.050
101 2ggz:A 165 145 0.1467 0.1636 0.1862 0.055 2ggz:B
102 5e37:A 313 71 0.0924 0.0543 0.2394 0.069 5e37:C
103 5e37:A 313 97 0.1304 0.0767 0.2474 7.4 5e37:C
104 7vus:B 68 63 0.1033 0.2794 0.3016 0.074 7vur:A, 7vur:B, 7vus:A, 7vus:C, 7vus:D, 7vut:A, 7vut:B, 7vuu:A, 7vuu:B, 7vuu:C, 7vuu:D
105 1la0:A 161 130 0.1793 0.2050 0.2538 0.079 1aj4:A, 1ap4:A, 2ctn:A, 3ctn:A, 1dtl:A, 1fi5:A, 8fmm:A, 8fmm:D, 8fmn:A, 8fmn:D, 8fmo:A, 8fmo:D, 8fmp:A, 8fmp:D, 8fmq:A, 8fmq:D, 8fmr:A, 8fmr:D, 8fms:A, 8fms:D, 8fmt:A, 8fmt:D, 4gje:A, 1ih0:A, 1j1d:A, 1j1d:D, 1j1e:A, 1j1e:D, 2jxl:A, 2kdh:A, 2kfx:T, 2kgb:C, 6klt:A, 6klu:A, 2krd:C, 2l1r:A, 2l98:A, 1lxf:C, 2mkp:C, 2mle:C, 2mlf:C, 1mxl:C, 2mzp:C, 2n79:C, 1ozs:A, 1r2u:A, 1r6p:A, 3rv5:A, 3rv5:B, 3rv5:C, 3rv5:D, 1sbj:A, 1scv:A, 3sd6:A, 3swb:A, 7uti:U, 7uti:Z, 8uzx:C, 8uzy:C, 8v01:C, 8v0i:C, 8v0k:C, 1wrk:A, 1wrk:B, 1wrl:A, 1wrl:B, 1wrl:C, 1wrl:D, 1wrl:E, 1wrl:F, 4y99:A
106 7kaa:A 152 65 0.1250 0.1513 0.3538 0.085
107 1s3p:A 109 85 0.1359 0.2294 0.2941 0.096 1xvj:A, 1xvj:B
108 4qox:A 462 99 0.1304 0.0519 0.2424 0.10
109 5mwc:D 275 89 0.1250 0.0836 0.2584 0.12
110 2bl0:B 145 59 0.0978 0.1241 0.3051 0.28
111 4mvf:A 408 64 0.0924 0.0417 0.2656 0.29 3pm8:A, 3pm8:B
112 6lb7:A 304 88 0.1413 0.0855 0.2955 0.35 4nsd:A, 4nsd:B
113 3ox6:E 118 27 0.0707 0.1102 0.4815 0.46
114 2pas:A 109 71 0.1087 0.1835 0.2817 0.82 3pat:A, 1pva:A, 1pva:B
115 3k21:A 178 95 0.1304 0.1348 0.2526 0.90
116 2opo:C 85 61 0.1087 0.2353 0.3279 1.0 2opo:A, 2opo:B, 2opo:D
117 2opo:C 85 68 0.1033 0.2235 0.2794 7.5 2opo:A, 2opo:B, 2opo:D
118 5x11:E 181 48 0.0924 0.0939 0.3542 1.1 5x11:A, 5x11:B, 5x11:D, 5x11:C, 5x11:F, 5x11:H, 5x14:A
119 1rro:A 108 80 0.1359 0.2315 0.3125 1.1 1omd:A
120 5w7d:A 528 52 0.0924 0.0322 0.3269 1.9 5w7e:A, 5w7e:B, 5w7f:A, 5w7f:B
121 5b7x:A 156 57 0.1033 0.1218 0.3333 2.3
122 1s6i:A 182 128 0.1576 0.1593 0.2266 2.8
123 1h4b:A 84 61 0.1033 0.2262 0.3115 2.8
124 4y5q:A 449 67 0.1087 0.0445 0.2985 2.9 9d8s:A, 3igo:A, 3mwu:A, 3ncg:A, 2wei:A
125 3q5i:A 470 65 0.1087 0.0426 0.3077 3.2
126 6tda:S 783 56 0.0815 0.0192 0.2679 3.3
127 6tj7:A 134 78 0.1033 0.1418 0.2436 3.9
128 6tj7:A 134 34 0.0598 0.0821 0.3235 4.9
129 3h4s:E 96 30 0.0652 0.1250 0.4000 4.6
130 2lc5:A 85 46 0.0761 0.1647 0.3043 4.9
131 6i5b:A 484 63 0.0761 0.0289 0.2222 5.3 6i5b:B
132 1gxd:A 624 117 0.1359 0.0401 0.2137 5.6 1ck7:A, 1eak:A, 1eak:B, 1eak:D, 1eak:C, 1gen:A, 1gxd:B, 1rtg:A
133 8yjx:B 490 114 0.1304 0.0490 0.2105 5.8
134 4n5x:A 155 86 0.1196 0.1419 0.2558 6.6 4zcu:A, 4zcu:B, 4zcu:C, 4zcv:A, 4zcv:B, 4zcv:C, 4zcv:D
135 7jgi:A 125 49 0.0924 0.1360 0.3469 6.8 6mv3:A, 7uh9:A, 7uha:A, 5w88:A, 5wcl:A
136 4ysm:A 475 67 0.0924 0.0358 0.2537 6.9 3ma6:A, 3ma6:B, 4ysj:A, 4ysj:B, 4ysm:B, 4yuq:A, 4yuq:B, 4yzb:A, 4yzb:B
137 8d9m:A 258 27 0.0489 0.0349 0.3333 7.2 7lq5:A, 7lq5:B, 7lq5:C
138 5dvr:A 386 67 0.0924 0.0440 0.2537 7.2
139 3seq:D 650 137 0.1957 0.0554 0.2628 7.8 3dla:B, 3seq:C, 3sez:D, 3sez:C, 3syt:D, 3szg:B
140 8c6o:A 195 55 0.0761 0.0718 0.2545 7.8 8a9s:A, 8a9s:B, 8c6o:B, 1el4:A, 2f8p:A, 1jf2:A, 4mrx:A, 4mry:A, 4n1f:A, 4n1g:A, 4n1g:B, 7o3u:A, 1qv0:A, 1qv1:A, 1s36:A, 1sl7:A, 1sl9:A
141 2n7l:C 140 49 0.0924 0.1214 0.3469 7.8 7sc2:A, 7sc3:A
142 4ieb:A 472 67 0.0924 0.0360 0.2537 8.3 6bfa:A, 3hx4:A, 3i7b:A, 3i7c:A, 4ifg:A, 4ihp:A, 4jbv:A, 5jms:A, 5jn2:A, 3ku2:A, 4m84:A, 4mx9:A, 4mxa:A, 3n51:A, 3nyv:A, 4ona:A, 3sx9:A, 3sxf:A, 3t3u:A, 3t3v:A, 4tzr:A, 3upx:A, 3upz:A, 3v51:A, 3v5p:A, 3v5t:A, 5w80:A, 5w8r:A, 5w91:A, 5w9e:A, 5w9r:A, 4wg3:A, 4wg4:A, 4wg5:A, 4yga:A, 4yga:C, 4yga:E, 4yga:G, 4yjn:A
143 1hqv:A 178 46 0.0815 0.0843 0.3261 8.8 3aaj:A, 3aaj:B, 3aak:A, 5gqq:C, 5gqq:D, 5jjg:A, 3wxa:A, 3wxa:B, 2zn8:A, 2zn9:A, 2zn9:B, 2zne:A, 2zne:B, 2zrs:A, 2zrs:B, 2zrs:C, 2zrs:D, 2zrs:E, 2zrs:F, 2zrs:G, 2zrs:H, 2zrt:A, 2zrt:B, 2zrt:C, 2zrt:D, 2zrt:E, 2zrt:F, 2zrt:G, 2zrt:H
144 7qun:A 694 54 0.0652 0.0173 0.2222 8.9 7qun:B, 7qun:C, 7qun:D
145 8sli:A 894 80 0.1250 0.0257 0.2875 9.3 8sli:D, 8sli:C, 8sli:B
146 3khe:B 191 69 0.1087 0.1047 0.2899 9.4 3khe:A
147 6iih:A 446 27 0.0543 0.0224 0.3704 9.6 6iih:B, 6lb7:B, 6xqo:J

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218