BioLiP

>protein
GVCWIYYPDGGSLVGEVNEDGEMTGEKIAYVYPDERTALYGKFIDGEMIEGKLATLMSTEEGRPHFELMPGNSVYHFDKS
TSSCISTNALLPDPYESERVYVAESLISSAGEGLFSKVAVGPNTVMSFYNGVRITHQEVDSRDWALNGNTLSLDEETVID
VPEPYNHVSKYCASLGHKANHSFTPNCIYDMFVHPRFGPIKCIRTLRAVEADEELTVAYGYDHEAPEWYQVELKAFQAT

The query sequence (length=239) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1h3i:B	293	226	0.9372	0.7645	0.9912	5.30e-169	5ayf:A, 3cbm:A, 3cbo:A, 3cbp:A, 4e47:A, 4e47:B, 4e47:C, 4e47:D, 5eg2:A, 2f69:A, 4j7f:A, 4j7i:A, 4j83:A, 4j8o:A, 4jds:A, 4jds:B, 4jds:C, 4jds:D, 4jlg:A, 4jlg:B, 3m53:A, 3m54:A, 3m55:A, 3m56:A, 3m57:A, 3m58:A, 3m59:A, 3m5a:A, 1mt6:A, 1n6a:A, 1n6c:A, 1o9s:A, 1o9s:B, 3os5:A, 3vuz:A, 3vv0:A, 1xqh:A, 1xqh:E, 5ylt:A
2	7td5:F	447	205	0.2176	0.1163	0.2537	1.41e-05
3	7td5:A	497	205	0.2176	0.1046	0.2537	1.64e-05
4	7kso:A	395	201	0.2134	0.1291	0.2537	5.86e-05	7ksr:A, 7ktp:A
5	7at8:A	311	205	0.2050	0.1576	0.2390	5.26e-04
6	5ij7:B	469	121	0.1506	0.0768	0.2975	8.61e-04	6b3w:A, 6b3w:B, 6c23:K, 6c24:K, 5ij7:A, 5ij8:A, 5ij8:B, 4w2r:A, 4w2r:B
7	8t9g:C	536	121	0.1506	0.0672	0.2975	0.001	8fyh:A, 8fyh:G
8	6wkr:C	606	121	0.1506	0.0594	0.2975	0.001	4mi0:A, 4mi5:A, 8t9g:I
9	8tas:E	570	121	0.1506	0.0632	0.2975	0.001	8tb9:E
10	9c8u:A	475	121	0.1506	0.0758	0.2975	0.001
11	5hyn:A	581	121	0.1506	0.0620	0.2975	0.001	5hyn:F, 5hyn:K, 5hyn:Q, 5ls6:A, 5ls6:G, 5ls6:J, 5ls6:D
12	5wg6:A	517	119	0.1506	0.0696	0.3025	0.001	5wg6:C
13	7w6l:C	158	136	0.1590	0.2405	0.2794	0.014	5f59:A, 5f6k:C, 5f6k:E, 6kiw:K, 7w6l:E
14	7bre:B	163	121	0.1297	0.1902	0.2562	0.061	7bre:E
15	6nzo:S	233	138	0.1548	0.1588	0.2681	0.12	6px3:S
16	4au7:A	243	41	0.0711	0.0700	0.4146	0.44	4au7:B, 3rq4:A
17	2y2l:B	476	124	0.1004	0.0504	0.1935	2.4	2fff:B, 2jch:A, 2je5:A, 2je5:B, 2xd1:A, 2xd1:B, 2xd5:A, 2xd5:B, 2y2g:A, 2y2g:B, 2y2h:A, 2y2h:B, 2y2i:A, 2y2j:A, 2y2k:A, 2y2l:A, 2y2m:A, 2y2n:A, 2y2o:A, 2y2p:A, 2y2q:A, 2y2q:B, 7zui:AAA, 7zuj:AAA, 7zuk:AAA, 7zul:AAA
18	5d6j:A	630	30	0.0502	0.0190	0.4000	2.7	5ey8:A, 5ey8:B, 5ey8:C, 5ey8:D, 5ey8:E, 5ey8:F, 5ey8:G, 5ey8:H, 5icr:A, 5icr:B, 5icr:C, 5icr:D
19	5tfm:A	320	43	0.0586	0.0437	0.3256	4.5	5tfl:A, 5tfl:B
20	3ufx:B	378	76	0.0795	0.0503	0.2500	4.7	3ufx:E, 3ufx:G, 3ufx:I
21	4f3s:A	231	49	0.0711	0.0736	0.3469	4.7	4dz1:A
22	4y2h:B	352	96	0.0962	0.0653	0.2396	6.1	4c03:A, 4c03:B, 4c04:A, 4c05:A, 4c07:A, 4c08:A, 5e8r:A, 5e8r:B, 5egs:A, 5egs:B, 5egs:C, 5egs:D, 5fqn:A, 5fqo:A, 4hc4:A, 5hzm:A, 5lv4:A, 5lv5:A, 7nr4:A, 7nr4:B, 7nr4:C, 7nr4:D, 7nud:A, 7nud:B, 7nue:A, 7nue:B, 7p2r:A, 7p2r:B, 6p7i:A, 6p7i:B, 6p7i:C, 6p7i:D, 4qpp:B, 4qpp:C, 4qpp:A, 4qqk:A, 6sq3:A, 6sq3:B, 6sq4:A, 6sq4:B, 6sqi:A, 6sqk:B, 6sqk:A, 6w6d:A, 6wad:A, 5wcf:A, 4y2h:A, 4y30:A, 4y30:B
23	5diy:A	463	76	0.0795	0.0410	0.2500	6.3	5diy:B
24	4qts:C	186	54	0.0669	0.0860	0.2963	9.7	4qts:D

[Back]