Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GTTENLYFQGSMSRITIERDGLTLVGDREEPFGEIYDMAILMHGFTANRNTPLLRQIADNLRDENVASVRFDFNGHGESD
GAFEDMTVCNEIADAQKILEYVRTDPHVRNIFLVGHAQGGVVASMLAGLYPDIVKKVVLLAPAAQLKDDALNGDTQGATY
NPEHIPAAIPFHGKKLGGFYLRTAQVLPIYEIAKHYTNPVSIIVGSNDQVVAPKYSKKYDEVYENSELHMVPDADHSFTG
QYKDSAVDLTAEFLKP

The query sequence (length=256) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7xri:A 256 256 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 7xri:B, 7xri:C, 7xri:D
2 3s2z:A 251 251 0.6914 0.7052 0.7052 1.25e-133 3pfb:A, 3pfb:B, 3pfc:A, 3qm1:A, 3s2z:B
3 7z2u:A 263 240 0.3398 0.3308 0.3625 9.97e-41 7z2u:B, 7z2v:A, 7z2v:B
4 2wtn:B 250 242 0.2930 0.3000 0.3099 2.18e-37 2wtn:A
5 8b9s:A 259 225 0.2930 0.2896 0.3333 1.09e-32 8b9s:B, 8b9s:C, 8b9s:E, 8b9s:F, 7q4h:A, 7q4h:B, 7q4j:A, 7q4j:B
6 3e0x:A 245 230 0.2109 0.2204 0.2348 3.92e-06 3e0x:B
7 8hgw:A 288 60 0.0938 0.0833 0.4000 2.04e-04 8hgw:B, 8hgw:C, 8hgw:D
8 2ocg:A 254 239 0.1992 0.2008 0.2134 4.83e-04 2oci:A, 2ock:A, 2ocl:A
9 5frd:A 256 146 0.1562 0.1562 0.2740 7.48e-04 5frd:B
10 7v8u:A 258 266 0.2461 0.2442 0.2368 0.001
11 5g5m:A 253 237 0.2344 0.2372 0.2532 0.002
12 7prm:A 295 129 0.1328 0.1153 0.2636 0.002 8aqf:A, 6ax1:A, 6ax1:B, 6bq0:A, 6bq0:B, 3hju:A, 3hju:B, 3jwe:A, 3jwe:B, 7l4t:A, 7l4u:A, 7l4u:B, 7l4w:A, 7l4w:B, 7l50:A, 7l50:B, 7l50:C, 7l50:D, 3pe6:A, 8ptc:A, 8ptq:A, 8ptr:A, 4uuq:A, 4uuq:B, 7zpg:A, 5zun:A
13 6qe2:A 257 73 0.0938 0.0934 0.3288 0.005 6qe2:B
14 7c4d:A 261 117 0.1172 0.1149 0.2564 0.009
15 2cjp:B 319 117 0.1094 0.0878 0.2393 0.010
16 4nvr:A 302 111 0.1367 0.1159 0.3153 0.024 4nvr:B, 4nvr:C, 4nvr:D
17 5h3h:B 269 106 0.0977 0.0929 0.2358 0.026 5h3h:A
18 4ke8:C 249 98 0.0938 0.0964 0.2449 0.036 4ke6:A, 4ke7:A, 4ke7:B, 4ke8:A, 4ke8:B, 4ke8:D, 4ke9:A, 4ke9:B, 4ke9:C, 4ke9:D
19 5z7x:A 270 110 0.0977 0.0926 0.2273 0.043
20 5cbk:A 271 112 0.0898 0.0849 0.2054 0.048 8dvc:A, 8dvc:B, 8dvc:C, 8dvc:D, 8dvc:E
21 7cof:A 320 48 0.0625 0.0500 0.3333 0.091 7cog:A, 7cog:B, 7cog:C, 7cog:D, 1hqd:A, 2lip:A, 3lip:A, 4lip:D, 4lip:E, 5lip:A, 2nw6:A, 1oil:A, 1oil:B, 1ys1:X, 1ys2:X
22 5nqv:C 190 108 0.1367 0.1842 0.3241 0.11 5nqv:A, 5nqv:B, 5nqv:D
23 5yb5:B 318 106 0.0938 0.0755 0.2264 0.11
24 4lxh:A 276 115 0.1016 0.0942 0.2261 0.20 4lxi:A, 4lye:A
25 5alj:A 523 101 0.0977 0.0478 0.2475 0.32
26 4hai:A 548 101 0.0977 0.0456 0.2475 0.34 7a7g:A, 7a7g:B, 5ai0:A, 5ai4:A, 5ai5:A, 5ai6:A, 5ai8:A, 5ai9:A, 5aia:A, 5aib:A, 5aic:A, 5ak3:A, 5ak4:A, 5ak5:A, 5ak6:A, 5ake:A, 5akg:A, 5akh:A, 5aki:A, 5akj:A, 5akk:A, 5akl:A, 5akx:A, 5aky:A, 5akz:A, 5ald:A, 5ale:A, 5alf:A, 5alg:A, 5alh:A, 5ali:A, 5alk:A, 5all:A, 5alm:A, 5aln:A, 5alo:A, 5alp:A, 5alq:A, 5alr:A, 5als:A, 5alt:A, 5alu:A, 5alv:A, 5alw:A, 5alx:A, 5aly:A, 5alz:A, 5am0:A, 5am1:A, 5am2:A, 5am3:A, 5am4:A, 5am5:A, 3ans:A, 3ans:B, 3ant:A, 3ant:B, 6aum:A, 4c4x:A, 4c4x:B, 4c4y:A, 4c4z:A, 4c4z:B, 7eba:A, 7eba:B, 5fp0:A, 6fr2:A, 6hgv:A, 6hgw:A, 6hgx:A, 3i1y:A, 3i28:A, 6i5g:A, 6i5g:B, 4j03:A, 4jnc:A, 3koo:A, 5mwa:A, 4ocz:A, 4od0:A, 3otq:A, 7p4k:A, 7p4k:B, 3pdc:A, 3pdc:B, 8qmz:A, 8qmz:B, 8qmz:C, 8qmz:D, 8qn0:A, 8qn0:B, 8qvf:A, 8qvg:A, 8qvh:A, 8qvk:A, 8qvl:A, 8qwi:A, 8qzd:A, 1vj5:A, 3wk4:A, 3wk5:A, 3wk6:A, 3wk7:A, 3wk8:A, 3wk9:A, 3wka:A, 3wkb:A, 3wkc:A, 3wkd:A, 3wke:A, 4x6x:A, 4x6x:B, 4x6y:A, 4x6y:B, 4y2j:A, 4y2p:A, 4y2q:A, 4y2r:A, 4y2s:A, 4y2t:A, 4y2u:A, 4y2v:A, 4y2x:A, 4y2y:A, 6yl4:A, 1zd2:P, 1zd3:A, 1zd4:A, 1zd5:A
27 6n8e:A 1332 56 0.0625 0.0120 0.2857 0.34
28 2o7r:A 307 89 0.0859 0.0717 0.2472 0.41
29 6i8w:B 310 135 0.1289 0.1065 0.2444 0.41
30 7p0y:A 278 222 0.1914 0.1763 0.2207 0.66 7p0y:B
31 3stu:B 259 44 0.0547 0.0541 0.3182 0.84 3stv:A, 3stw:A, 3stw:B, 3stx:A, 3stx:B
32 8sbq:A 277 103 0.1055 0.0975 0.2621 0.84 8g49:A, 8sbq:B, 8t88:A, 8t88:B, 8tfw:A, 8tfw:B
33 2rau:A 350 50 0.0547 0.0400 0.2800 1.3
34 2og1:A 285 32 0.0508 0.0456 0.4062 1.3 2puh:A, 2puj:A, 2rht:A, 2rhw:A, 3v1m:A, 3v1n:A
35 1f7u:A 606 57 0.0547 0.0231 0.2456 1.3 1bs2:A, 1f7v:A
36 7k38:A 270 115 0.0898 0.0852 0.2000 2.0
37 6coc:A 260 46 0.0469 0.0462 0.2609 2.0 6coc:B, 6cod:A, 6cod:B, 6coe:A, 6coe:B, 6cog:A, 6cog:B, 6coh:A, 6coh:B, 6coi:A, 6coi:B
38 1jmc:A 238 74 0.0898 0.0966 0.3108 2.0
39 3gzj:A 254 171 0.1406 0.1417 0.2105 2.1 3gzj:B, 3gzj:C, 3gzj:D
40 5dnu:A 267 43 0.0391 0.0375 0.2326 2.5
41 5cw2:C 319 135 0.1406 0.1129 0.2667 2.5 5cw2:A, 5cw2:B, 5cw2:D
42 6ke6:5C 535 68 0.0820 0.0393 0.3088 2.6 7ajt:UG, 7aju:UG, 7d4i:5C, 7d5s:5C, 7d5t:5C, 7d63:5C, 6lqp:5C, 6lqq:5C, 6lqr:5C, 6lqs:5C, 6lqt:5C, 6lqu:5C, 6lqv:5C, 6nd4:W, 7suk:LW, 5wlc:LW, 6zqa:UG, 6zqb:UG, 6zqc:UG, 6zqd:UG
43 3lss:A 438 62 0.0586 0.0342 0.2419 2.7
44 7qun:A 694 160 0.1328 0.0490 0.2125 2.8 7qun:B, 7qun:C, 7qun:D
45 7dmb:A 358 60 0.0703 0.0503 0.3000 3.1 7dmb:B
46 7snu:A 270 76 0.0742 0.0704 0.2500 3.2 7c8l:A, 5z7y:A, 5z89:A, 5z95:A
47 1tah:B 318 48 0.0508 0.0409 0.2708 3.2 1cvl:A, 2es4:A, 2es4:B, 1qge:E, 1tah:A, 1tah:C, 1tah:D
48 3ad7:A 963 58 0.0703 0.0187 0.3103 3.2 3ad8:A, 3ad9:A, 3ada:A, 1vrq:A, 1x31:A
49 7ktr:A 3042 101 0.1055 0.0089 0.2673 3.2
50 4jym:A 267 121 0.0977 0.0936 0.2066 3.3 4jym:B
51 3b12:A 294 104 0.1328 0.1156 0.3269 3.3 3b12:B, 1y37:A, 1y37:B
52 8ags:AAA 298 28 0.0430 0.0369 0.3929 3.4 8agm:AAA, 8agm:BBB, 8agm:CCC, 8agm:DDD, 8agn:AAA, 8agn:BBB, 8agn:CCC, 8agn:DDD, 8agp:AAA, 8agp:BBB, 8ags:BBB, 5ng7:B
53 4r83:A 474 25 0.0352 0.0190 0.3600 3.4 4r83:B, 4r83:C, 4r83:D, 4r84:A, 4r84:B, 4r84:C, 4r84:D, 4r9v:A
54 4rot:A 268 80 0.1055 0.1007 0.3375 3.4
55 4hs9:A 287 51 0.0586 0.0523 0.2941 3.5 4gw3:A, 4gxn:A, 6jd9:A
56 5ngy:A 1265 214 0.1914 0.0387 0.2290 4.4 6htv:A, 5lfc:A, 5lfc:B, 5ngy:B, 5o8l:A
57 1q7t:A 310 12 0.0430 0.0355 0.9167 4.6 4ewl:A, 4ewl:B, 1q74:A, 1q74:B, 1q74:C, 1q74:D, 1q7t:B
58 3lss:B 468 86 0.0781 0.0427 0.2326 5.7 6rlt:A, 6rlt:B, 6rlu:A, 6rlu:B, 6rlv:A, 6rlv:B
59 1iun:B 276 61 0.0703 0.0652 0.2951 6.3 2d0d:A, 1iuo:A, 1iup:A, 1uk7:A, 1uk8:A, 1uk9:A, 1uka:A
60 6kxh:B 294 75 0.0781 0.0680 0.2667 6.9 7clz:A, 7clz:C, 7clz:D, 6kxh:A, 6kxh:C, 6kxh:D
61 2c0c:A 353 90 0.0977 0.0708 0.2778 7.0 2c0c:B, 2wek:A, 2wek:B, 2x1h:A, 2x1h:B, 2x7h:A, 2x7h:B, 7zej:A, 7zej:B
62 2qm3:A 338 47 0.0625 0.0473 0.3404 7.9
63 4o1k:A 211 39 0.0547 0.0664 0.3590 9.3
64 3wwo:B 257 45 0.0430 0.0428 0.2444 9.5 3wwo:A
65 8xvg:L 3485 48 0.0625 0.0046 0.3333 9.8 8xvv:L

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218