Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GTSKLKYVLQDARFFLIKSNNHENVSLAKAKGVWSTLPVNEKKLNLAFRSARSVILIFSVRESGKFQGFARLSSESHHGG
SPIHWVLGGVFKIDWICRRELPFTKSAHLTNPWNEHKPVKIGRDGQEIELECGTQLCLLFPPDESIDLYQVIHKM

The query sequence (length=155) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7po6:B 166 164 1.0000 0.9337 0.9451 4.82e-112 8k2e:B, 8k2e:A, 7l4x:B, 7l4y:B, 2mtv:A, 7p87:A, 7p87:B, 7p88:A, 7p88:B, 7p8a:A, 7p8a:B, 7p8b:A, 7p8b:B, 7p8f:A, 7p8f:B, 7pj7:A, 7pj7:B, 7pj8:A, 7pj8:B, 7pj9:A, 7pj9:B, 7pja:A, 7pja:B, 7pjb:A, 7pjb:B, 7pjp:A, 7pjp:B, 7pjq:A, 7pjq:B, 7po6:A, 7po6:C, 8q2q:A, 8q2q:B, 8q2r:A, 8q2r:B, 8q2s:A, 8q2s:B, 8q2t:A, 8q2t:B, 8q2u:A, 8q2u:B, 8q2v:A, 8q2v:B, 8q2w:A, 8q2w:B, 8q2x:A, 8q2x:B, 8q2y:A, 8q2y:B, 8q31:A, 8q31:B, 8q32:A, 8q32:B, 8q33:A, 8q33:B, 8q35:A, 8q35:B, 8q37:A, 8q37:B, 8q38:A, 8q38:B, 8q39:A, 8q39:B, 8q3a:A, 8q3a:B, 8q3g:A, 8q3g:B, 8q4m:A, 8q4m:B, 8q4n:A, 8q4n:B, 8q4p:A, 8q4p:B, 8q4q:A, 8q4q:B, 8q4r:A, 8q4r:B, 8q4t:A, 8q4t:B, 8q4u:A, 8q4u:B, 8q4v:A, 8q4v:B, 8q4w:A, 8q4w:B, 4r3i:A, 6rt4:A, 6rt4:B, 6rt5:C, 6rt5:B, 6rt6:C, 6rt6:B, 6rt7:C, 6rt7:B, 6syz:A, 6syz:B, 6sz1:A, 6sz1:B, 6sz2:B, 6sz3:B, 6sz7:A, 6sz7:B, 6sz8:B, 6szl:B, 6szn:B, 6szr:B, 6szt:A, 6szt:B, 6szx:A, 6szx:B, 6szy:B, 6t01:A, 6t01:B, 6t02:A, 6t02:B, 6t03:A, 6t03:B, 6t04:B, 6t05:B, 6t05:A, 6t06:B, 6t07:B, 6t08:A, 6t08:B, 6t09:A, 6t09:B, 6t0a:A, 6t0a:B, 6t0c:A, 6t0c:B, 6t0d:A, 6t0d:B, 6t0o:A, 6t0o:B, 6t0x:A, 6t0x:B, 6t0z:A, 6t0z:B, 6t10:A, 6t10:B, 6t11:B, 6t12:A, 6t12:B, 6we9:A, 6we9:C, 6wea:A, 6wea:C, 6wea:B, 6wea:D, 6yke:B, 6yki:B, 6ykj:A, 6ykj:B, 6ykz:A, 6ykz:B, 6yl0:A, 6yl0:B, 6yl8:A, 6yl8:B, 6yl9:B, 6ym2:A, 6ym2:B, 6ym8:A, 6ym8:B, 6yni:B, 6ynj:A, 6ynj:B, 6ynk:A, 6ynk:B, 6ynl:B, 6ynm:B, 6ynn:A, 6ynn:B, 6yno:B, 6ynp:A, 6ynp:B, 6yoq:A, 6yoq:B, 6zcm:A, 6zcm:B, 6zcn:A, 6zcn:B, 6zd5:A, 6zd5:B, 6zd7:B, 6zd7:A, 6zda:A, 6zda:B
2 5zuu:D 147 136 0.3871 0.4082 0.4412 1.61e-30
3 5zuu:C 174 146 0.4000 0.3563 0.4247 1.64e-29 5zuu:A, 5zuu:B
4 7nh2:A 150 141 0.3419 0.3533 0.3759 4.26e-26 7njc:A
5 4rcm:A 164 152 0.2903 0.2744 0.2961 4.56e-16 4rcm:B
6 7qkn:B 193 137 0.2839 0.2280 0.3212 1.06e-15 7pcu:A, 7pcu:B, 7qkn:A, 7ql7:A, 7ql7:B, 4rcj:A
7 7z8w:B 154 134 0.2645 0.2662 0.3060 2.11e-14 7a1v:A, 7bik:B, 7r5f:B, 7r5l:A, 7r5w:A, 7r5w:B, 4rdn:A, 4rdn:B, 7ywb:A, 7ywb:B, 7yx6:A, 7yx6:B, 7yxe:A, 7yxe:B, 7z26:A, 7z26:B, 7z4u:A, 7z4u:B, 7z54:A, 7z54:B, 7z5m:A, 7z5m:B, 7z7b:A, 7z7b:B, 7z7f:A, 7z8p:A, 7z8p:B, 7z8w:A, 7z8x:A, 7z92:A, 7z92:B, 7z93:A, 7z93:B, 7zg4:A, 7zg4:B
8 4u8t:A 157 139 0.2903 0.2866 0.3237 3.36e-14 4u8t:D, 4u8t:F, 4u8t:B, 4u8t:C, 4u8t:E
9 6zot:B 180 134 0.2581 0.2222 0.2985 7.80e-14 6zot:A
10 6fpx:A 177 133 0.2258 0.1977 0.2632 8.63e-06 5dno:A, 5eim:A, 5eim:B, 6fpq:A, 6fpx:C, 6fpx:E
11 2cyb:A 319 64 0.1161 0.0564 0.2812 0.25 2cyb:B
12 5b8h:A 256 38 0.0839 0.0508 0.3421 4.2 5b8h:B
13 3r4q:A 138 21 0.0710 0.0797 0.5238 4.6
14 2vn8:A 358 31 0.0710 0.0307 0.3548 4.9 2vn8:B
15 4ecw:A 432 91 0.1548 0.0556 0.2637 7.1 9chw:A, 9ci9:A, 9cih:A, 9ciq:A, 9cj9:A, 6d0m:A, 6d0z:A, 5dg7:A, 5dg8:A, 5dg9:A, 5dga:A, 5dgb:A, 4dl2:A, 4dl3:A, 4dl4:A, 4dl5:A, 4dl6:A, 4dl7:A, 5dlf:A, 5dlg:A, 5dqg:A, 5dqh:A, 5dqi:A, 8e85:A, 8e86:A, 8e87:A, 8e88:A, 8e89:A, 8e8a:A, 8e8b:A, 8e8c:A, 8e8d:A, 8e8e:A, 8e8f:A, 8e8g:A, 8e8h:A, 8e8j:A, 8e8k:A, 4ecq:A, 4ecr:A, 4ecs:A, 4ect:A, 4ecu:A, 4ecv:A, 4ecx:A, 4ecy:A, 4ecz:A, 4ed0:A, 4ed1:A, 4ed2:A, 4ed3:A, 4ed6:A, 4ed7:A, 4ed8:A, 4eey:A, 8eve:A, 8evf:A, 5ewe:A, 5ewf:A, 5ewg:A, 5f9l:A, 5f9n:A, 8fn3:A, 8fog:A, 8g8h:A, 8g8j:A, 8gbf:A, 8gkr:A, 8gml:A, 4j9k:A, 4j9l:A, 4j9m:A, 4j9n:A, 4j9o:A, 4j9p:A, 4j9q:A, 4j9r:A, 4j9s:A, 3jaa:A, 5jum:A, 5kfa:A, 5kfb:A, 5kfc:A, 5kfd:A, 5kfe:A, 5kff:A, 5kfg:A, 5kfh:A, 5kfi:A, 5kfj:A, 5kfk:A, 5kfl:A, 5kfm:A, 5kfn:A, 5kfo:A, 5kfp:A, 5kfq:A, 5kfr:A, 5kfs:A, 5kft:A, 5kfu:A, 5kfv:A, 5kfw:A, 5kfx:A, 5kfy:A, 5kfz:A, 5kg0:A, 5kg1:A, 5kg2:A, 5kg3:A, 5kg4:A, 5kg5:A, 5kg6:A, 5kg7:A, 5l1i:A, 5l1j:A, 5l1k:A, 5l1l:A, 7l69:A, 5l9x:A, 7lcd:A, 6m7o:A, 6m7p:A, 6m7t:A, 6m7u:A, 6m7v:A, 7m7l:A, 7m7m:A, 7m7n:A, 7m7o:A, 7m7p:A, 7m7q:A, 7m7r:A, 7m7s:A, 7m7t:A, 7m7u:A, 7m7y:A, 7m7z:A, 7m80:A, 7m81:A, 7m82:A, 7m83:A, 7m84:A, 7m85:A, 7m86:A, 7m87:A, 7m88:A, 7m89:A, 7m8a:A, 7m8b:A, 7m8c:A, 7m8d:A, 6mp3:A, 6mq8:A, 3mr2:A, 3mr3:A, 3mr5:A, 3mr6:A, 6mxo:A, 4o3n:A, 4o3o:A, 4o3p:A, 4o3q:A, 4o3r:A, 4o3s:A, 6pl7:A, 6pl8:A, 6plc:A, 6pz3:A, 6q02:A, 4q8e:A, 4q8f:A, 4rnm:A, 4rnn:A, 4rno:A, 4ru9:A, 3si8:A, 8ski:A, 3tq1:A, 7u72:A, 7u73:A, 7u74:A, 7u75:A, 7u76:A, 7u77:A, 7u78:A, 7u79:A, 7u7a:A, 7u7b:A, 7u7c:A, 7u7d:A, 7u7e:A, 7u7f:A, 7u7g:A, 7u7i:A, 7u7j:A, 7u7k:A, 7u7l:A, 7u7r:A, 7u7s:A, 7u7t:A, 7u7u:A, 7u7v:A, 7u7w:A, 7u7x:A, 7u7y:A, 7u7z:A, 7u80:A, 7u81:A, 7u82:A, 7u83:A, 7u84:A, 6ui2:A, 8ujt:A, 8ujv:A, 8ujx:A, 8uk4:A, 6uqi:A, 6v5k:A, 8v7a:A, 8v7b:A, 8v7c:A, 8v7d:A, 8v7e:A, 8v7f:A, 8v7g:A, 8v7h:A, 8v7i:A, 8v7j:A, 8v7k:A, 6w5x:A, 6wk6:A, 4yp3:A, 4yqw:A, 4yr0:A, 4yr2:A, 4yr3:A
16 1txg:A 335 40 0.0968 0.0448 0.3750 7.5 1txg:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218