BioLiP

>protein
GTFYDVIEDYRHFDFAAYFAKVTDSDVRRILRQDRLSALDFLTLLSPQAEAYLEEMAQKAHRLTVQHFGRTMLLYTPLYL
ANYCVNQCVYCGFQLKNKLERKKLTLAEVEQEAQLIAATGLKHILILTGESRQHSPVSYIKDCVNILKKYFSSISIEIYP
LTQEEYAELIGAGVDGLTIYQEVYNEEVYAEMHPAGPKRNYRFRLEAPERACQAGMRTVNIGALLGLNDWRQEAFFTGLH
ADYLQRRFPDVEVSISPPRMRPHLGGFPPRVVVSDQNLVQYVLAFRLFMPRSGITLSTRENGRLRDAMVRLGVTKMSAGS
CTAVGGRSDQEAVGQFQISDERTVAEVAAMLYAQGYQPVYKDWQAL

The query sequence (length=366) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7pd1:B	367	366	1.0000	0.9973	1.0000	0.0	7pd1:A, 7pd2:A, 7pd2:B
2	4wcx:A	454	354	0.3224	0.2599	0.3333	1.72e-68	4wcx:C
3	4rtb:A	429	340	0.3224	0.2751	0.3471	3.12e-60
4	6htk:A	384	305	0.2350	0.2240	0.2820	1.47e-15	6htk:B, 6htm:A, 6htm:B, 6hto:A, 6hto:B, 4r33:A, 4r33:B, 4r34:A, 4r34:B
5	3t7v:A	337	346	0.2432	0.2641	0.2572	3.34e-15
6	7o1o:A	356	151	0.1038	0.1067	0.2517	1.13e-09	3ciw:A, 3cix:A, 5fep:A, 5fes:A, 5few:A, 5fex:A, 5fez:A, 5ff0:A, 5ff2:A, 5ff3:A, 5ff4:A, 3iix:A, 3iiz:A, 4jxc:A, 4jy8:A, 4jy9:A, 4jyd:A, 4jye:A, 4jyf:A, 7o1p:A, 7o1s:A, 7o1t:A, 7o25:A, 7o26:A, 8qmk:A, 8qml:A, 8qmm:A, 8qmn:A
7	6q2p:B	293	142	0.0984	0.1229	0.2535	0.008	6q2p:A, 6q2q:A, 6q2q:B, 5vsl:A, 5vsl:B, 5vsm:A, 5vsm:B
8	1r30:B	313	253	0.1639	0.1917	0.2372	0.28	1r30:A
9	6pey:B	290	139	0.1011	0.1276	0.2662	0.37	1b5t:A, 1b5t:B, 1b5t:C, 2fmn:A, 2fmn:B, 2fmn:C, 2fmo:A, 2fmo:B, 2fmo:C, 3fst:A, 3fst:C, 3fst:E, 3fsu:A, 3fsu:C, 3fsu:E, 6pey:A, 6pey:C, 1zp3:A, 1zp3:B, 1zp3:C, 1zp4:A, 1zp4:B, 1zp4:C, 1zpt:A, 1zpt:B, 1zpt:C, 1zrq:A, 1zrq:B, 1zrq:C
10	3fym:A	82	78	0.0601	0.2683	0.2821	0.85
11	5ijx:A	365	55	0.0464	0.0466	0.3091	0.95
12	7emf:P	766	45	0.0437	0.0209	0.3556	5.3	8gxq:p, 8gxs:p
13	6kih:A	400	102	0.0710	0.0650	0.2549	5.7	6kih:C, 6kih:D, 6kih:E, 6kih:F, 6kih:H, 6kih:I, 6kih:K, 6kih:L, 6kih:B, 6kih:G, 6kih:J
14	8aw7:A	309	69	0.0519	0.0615	0.2754	6.8	8at8:A, 8bbv:A, 9f0f:A, 9f0g:A, 8ofl:A, 8omm:A, 6sv3:A
15	1peu:A	692	44	0.0464	0.0246	0.3864	7.2	2bq1:E, 2bq1:F, 1peo:A, 1peq:A
16	4af0:A	395	92	0.0656	0.0608	0.2609	8.1	4af0:B
17	1eix:C	232	77	0.0574	0.0905	0.2727	8.4	1eix:A, 1eix:B, 1eix:D, 1jjk:A, 1jjk:B, 1jjk:C, 1jjk:D, 1jjk:E, 1jjk:F, 1jjk:G, 1jjk:H, 1jjk:I, 1jjk:J, 1jjk:K, 1jjk:L, 1jjk:M, 1jjk:N, 1jjk:O, 1jjk:P

[Back]