Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GSVNFVDLYVCMFCGRGNNEDKLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLPDVPKGDWRCPKCVAEE

The query sequence (length=59) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7klo:A 59 59 1.0000 1.0000 1.0000 2.23e-39 7klr:A
2 2mny:A 55 54 0.7797 0.8364 0.8519 1.16e-30 2mnz:A
3 2e6r:A 92 57 0.5932 0.3804 0.6140 2.32e-25
4 2miq:A 94 51 0.5763 0.3617 0.6667 1.67e-23
5 6fhq:A 58 56 0.4407 0.4483 0.4643 1.79e-14 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
6 5vab:A 54 45 0.4746 0.5185 0.6222 2.39e-14
7 6ryr:W 708 43 0.3729 0.0311 0.5116 3.14e-13 2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
8 4q6f:A 56 54 0.4068 0.4286 0.4444 6.09e-13 6fap:A, 6fap:B, 6fap:C, 6fap:D, 6fhu:A, 6fhu:B, 6fhu:D, 6fhu:C, 6fi0:A, 6fi0:B, 6fi0:C, 6fi0:D, 6fkp:A, 6fkp:D, 6fkp:C, 6fkp:B, 4q6f:B, 4q6f:C, 4q6f:D, 4qf2:A, 4qf2:B, 4qf2:C, 4qf2:D, 5t8r:D, 5t8r:A, 5t8r:B, 5t8r:C
9 1f62:A 51 45 0.3729 0.4314 0.4889 3.79e-12
10 5szb:A 115 50 0.3729 0.1913 0.4400 9.84e-12 5i3l:A, 5i3l:B, 2kwj:A, 2kwk:A, 2kwn:A, 2kwo:A, 5szc:A
11 9atn:A 98 46 0.3559 0.2143 0.4565 1.06e-11
12 9atn:A 98 33 0.2034 0.1224 0.3636 0.026
13 5b79:A 118 51 0.3559 0.1780 0.4118 5.08e-11 5vdc:A
14 2ysm:A 111 46 0.3559 0.1892 0.4565 1.94e-10
15 2ysm:A 111 32 0.1695 0.0901 0.3125 0.17
16 2puy:B 60 43 0.3559 0.3500 0.4884 1.15e-09 2puy:A
17 6guu:B 204 44 0.3729 0.1078 0.5000 1.74e-09 6guu:A
18 4gy5:A 215 47 0.3898 0.1070 0.4894 2.12e-09 3ask:A, 3ask:B, 3ask:D, 3asl:A, 3db3:A, 7fb7:B, 4gy5:B, 6iiw:A, 2lgg:A, 2lgk:A, 2lgl:A, 4qqd:A, 4qqd:B, 3shb:A, 3sou:A, 3sou:B, 3sow:A, 3sow:B, 3sox:A, 3sox:B, 3t6r:B, 3t6r:A, 8wms:A, 5xpi:A, 5yy9:A, 5yy9:B, 3zvy:A, 3zvy:B, 3zvz:B
19 6q3m:C 219 44 0.3729 0.1005 0.5000 2.14e-09 6q3m:A, 6q3m:B
20 2yql:A 56 43 0.3559 0.3750 0.4884 2.73e-09
21 1mm3:A 61 44 0.3559 0.3443 0.4773 7.09e-09
22 8hxx:N 375 45 0.3390 0.0533 0.4444 9.87e-09 8hxy:N, 8hy0:N, 8i3f:B, 8jho:N, 8tof:G, 8w9c:E, 8w9d:E, 8w9e:E, 8w9f:E
23 2ke1:A 66 35 0.2881 0.2576 0.4857 1.19e-08 2kft:A, 1xwh:A
24 8ihn:M 357 45 0.3390 0.0560 0.4444 1.49e-08 8kd4:E
25 7xga:A 126 47 0.3729 0.1746 0.4681 2.51e-08 6vfo:A
26 8kd6:E 301 45 0.3390 0.0664 0.4444 2.75e-08 8kd2:E
27 7yi2:D 321 45 0.3390 0.0623 0.4444 2.78e-08 7yi0:D, 7yi3:D, 7yi4:D, 7yi5:D
28 2e6s:A 77 49 0.3559 0.2727 0.4286 1.51e-07
29 2l5u:A 61 58 0.3559 0.3443 0.3621 1.91e-07
30 6oie:B 111 51 0.3559 0.1892 0.4118 2.07e-07 6oie:A, 5u2j:B, 5u2j:A
31 4lk9:A 126 51 0.3559 0.1667 0.4118 3.53e-07 5b75:A, 5b76:A, 5b77:A, 5b78:A, 4ljn:A, 4lka:A, 4llb:A, 4llb:B, 2ln0:A, 6lsb:A, 3v43:A
32 7yi0:F 120 45 0.3390 0.1667 0.4444 8.69e-07
33 8w9c:F 156 45 0.3390 0.1282 0.4444 1.84e-06 8hxx:P, 8hy0:P, 8jho:P, 8w9d:F, 8w9e:F, 8w9f:F
34 4tvr:A 222 45 0.3390 0.0901 0.4444 6.44e-06
35 8bpb:C 126 49 0.3220 0.1508 0.3878 2.35e-05 8bpc:C
36 5hh7:A 192 45 0.3051 0.0938 0.4000 3.27e-05
37 8bpa:C 213 48 0.3220 0.0892 0.3958 4.79e-05 8c60:C
38 8bpa:C 213 39 0.2542 0.0704 0.3846 0.009 8c60:C
39 7ebk:A 183 43 0.3051 0.0984 0.4186 1.91e-04 7ebj:A
40 5b73:A 313 47 0.3220 0.0607 0.4043 2.41e-04 4cos:A, 7cwh:B, 5y1z:C, 5y1z:D
41 6ieu:A 170 43 0.2881 0.1000 0.3953 5.35e-04 6iet:A
42 2l43:A 80 49 0.2881 0.2125 0.3469 0.001 2ku3:A
43 3u5m:E 173 45 0.2881 0.0983 0.3778 0.002
44 3u5o:C 195 45 0.2881 0.0872 0.3778 0.002 8bd8:A, 8bd9:A, 8bdy:A, 5mr8:A, 3u5m:A, 3u5m:B, 3u5m:C, 3u5m:D, 3u5m:F, 3u5m:G, 3u5m:H, 3u5m:I, 3u5m:K, 3u5m:J, 3u5m:L, 3u5n:A, 3u5n:B, 3u5o:A, 3u5o:B, 3u5o:D, 3u5o:E, 3u5o:F, 3u5o:G, 3u5o:H, 3u5p:A, 3u5p:B, 3u5p:C, 3u5p:D, 3u5p:E, 3u5p:F, 3u5p:G, 3u5p:H, 7zdd:A
45 3o36:A 184 43 0.2542 0.0815 0.3488 0.002 7b9x:A, 5h1t:A, 5h1t:B, 5h1t:C, 5h1t:D, 5h1u:B, 5h1u:A, 5h1u:C, 5h1u:D, 5h1v:A, 5h1v:B, 3o33:A, 3o33:B, 3o33:C, 3o33:D, 3o34:A, 3o35:B, 3o35:A, 3o36:B, 3o37:A, 3o37:B, 3o37:C, 3o37:D, 4yab:A, 4yab:B, 4yad:A, 4yad:B, 4yat:A, 4yat:B, 4yax:A, 4yax:B, 4ybm:A, 4ybm:B, 4ybs:A, 4ybt:A, 4yc9:A, 4zql:A, 4zql:B
46 1fp0:A 88 46 0.2542 0.1705 0.3261 0.002
47 2k16:A 75 49 0.2542 0.2000 0.3061 0.002 5c13:A, 5c13:C, 5c13:E, 5c13:G, 2k17:A, 5wxg:A, 5wxh:C, 5wxh:A, 5xmy:A, 5xmy:C
48 2ro1:A 189 46 0.2542 0.0794 0.3261 0.005
49 8i02:F 235 45 0.2712 0.0681 0.3556 0.006
50 6u04:A 168 48 0.2712 0.0952 0.3333 0.024 5erc:A
51 8i02:G 284 36 0.2373 0.0493 0.3889 0.024 8ifg:P
52 8i02:G 284 46 0.2203 0.0458 0.2826 1.6 8ifg:P
53 2yt5:A 66 52 0.2881 0.2576 0.3269 0.026
54 4ptb:A 178 46 0.2712 0.0899 0.3478 0.036 5fb0:A, 5fb0:C, 5fb1:A, 6g5n:A, 6g5n:B, 6g5p:A, 6g5p:B, 4ptb:B, 5pwc:A, 5pwc:B, 5pwd:A, 5pwd:B, 5pwe:A, 5pwe:B, 5pwf:A, 5pwf:B, 5pwg:A, 5pwg:B, 5pwh:A, 5pwh:B, 5pwi:A, 5pwi:B, 5pwj:A, 5pwj:B, 5pwk:A, 5pwk:B, 5pwl:A, 5pwl:B, 5pwm:A, 5pwm:B, 5pwn:A, 5pwn:B, 5pwo:A, 5pwo:B, 5pwp:A, 5pwp:B, 5pwq:A, 5pwq:B, 5pwr:A, 5pwr:B, 5pws:A, 5pws:B, 5pwt:A, 5pwt:B, 5pwu:A, 5pwu:B, 5pwv:A, 5pwv:B, 5pww:A, 5pww:B, 5pwx:A, 5pwx:B, 5pwy:A, 5pwy:B, 5pwz:A, 5pwz:B, 5px0:A, 5px0:B, 5px1:A, 5px1:B, 5px2:A, 5px2:B, 5px3:A, 5px3:B, 5px4:A, 5px4:B, 5px5:A, 5px5:B, 5px6:A, 5px6:B, 5px7:A, 5px7:B, 5px8:A, 5px8:B, 5px9:A, 5px9:B, 5pxa:A, 5pxa:B, 5pxb:A, 5pxb:B, 5pxc:A, 5pxc:B, 5pxd:A, 5pxd:B, 5pxe:A, 5pxe:B, 5pxf:A, 5pxf:B, 5pxg:A, 5pxg:B, 5pxh:A, 5pxh:B, 5pxi:A, 5pxi:B, 5pxj:A, 5pxj:B, 5pxk:A, 5pxk:B, 5pxl:A, 5pxl:B, 5pxm:A, 5pxm:B, 5pxn:A, 5pxn:B, 5pxo:A, 5pxo:B, 5pxp:A, 5pxp:B, 5pxq:A, 5pxq:B, 5pxr:A, 5pxr:B, 5pxs:A, 5pxs:B, 5pxt:A, 5pxt:B, 5pxu:A, 5pxu:B, 5pxv:A, 5pxv:B, 5pxw:A, 5pxw:B, 5pxx:A, 5pxx:B, 5pxy:A, 5pxy:B, 5pxz:A, 5pxz:B, 5py0:A, 5py0:B, 5py1:A, 5py1:B, 5py2:A, 5py2:B, 5py3:A, 5py3:B, 5py4:A, 5py4:B, 5py5:A, 5py5:B, 5py6:A, 5py6:B, 5py7:A, 5py7:B, 5py8:A, 5py8:B, 5py9:A, 5py9:B, 5pya:A, 5pya:B, 5pyb:A, 5pyb:B, 5pyc:A, 5pyc:B, 5pyd:A, 5pyd:B, 5pye:A, 5pye:B, 5pyf:A, 5pyf:B, 5pyg:A, 5pyg:B, 5pyh:A, 5pyh:B, 5pyi:A, 5pyi:B, 5pyj:A, 5pyj:B, 5pyk:A, 5pyk:B, 5pyl:A, 5pyl:B, 5pym:A, 5pym:B, 5pyn:A, 5pyn:B, 5pyo:A, 5pyo:B, 5pyp:A, 5pyp:B, 5pyq:A, 5pyq:B, 5pyr:A, 5pyr:B, 5pys:A, 5pys:B, 5pyt:A, 5pyt:B, 5pyu:A, 5pyu:B, 5pyv:A, 5pyv:B, 5pyw:A, 5pyw:B, 5pyx:A, 5pyx:B, 5pyy:A, 5pyy:B, 5pyz:A, 5pyz:B, 5pz0:A, 5pz0:B, 5pz1:A, 5pz1:B, 5pz2:A, 5pz2:B, 5pz3:A, 5pz3:B, 5pz4:A, 5pz4:B, 5pz5:A, 5pz5:B, 5pz6:A, 5pz6:B, 5pz7:A, 5pz7:B, 5pz8:A, 5pz8:B, 5pz9:A, 5pz9:B, 5pza:A, 5pza:B, 5pzb:A, 5pzb:B, 5pzc:A, 5pzc:B, 5pzd:A, 5pzd:B, 5pze:A, 5pze:B, 5pzf:A, 5pzf:B, 5pzg:A, 5pzg:B, 5pzh:A, 5pzh:B, 5pzi:A, 5pzi:B, 5pzj:A, 5pzj:B
55 7duf:A 62 47 0.2712 0.2581 0.3404 0.13 7duf:B
56 7mju:A 184 53 0.3390 0.1087 0.3774 0.17 5dag:A, 5dah:B, 5dah:A
57 5wlf:A 60 51 0.2542 0.2500 0.2941 0.18 5wle:A
58 5xfr:A 309 52 0.2881 0.0550 0.3269 0.21 5xfr:B
59 1x4i:A 70 36 0.2373 0.2000 0.3889 0.23 7zmx:A, 7zmx:B
60 4gnd:C 107 45 0.3051 0.1682 0.4000 0.27 4gnd:A, 4gne:A, 4gnf:A, 4gng:A, 4gng:D
61 2lri:C 66 58 0.2712 0.2424 0.2759 0.37
62 6j2p:A 98 45 0.2881 0.1735 0.3778 0.50 6j2p:B, 6j2p:D, 6j2p:C
63 6ukj:A 350 40 0.2203 0.0371 0.3250 0.52
64 8ge0:A 188 58 0.3051 0.0957 0.3103 0.52 8gdx:A, 8ge0:B, 8ge0:C
65 6knb:B 1120 50 0.2542 0.0134 0.3000 0.53 6knc:B
66 6g8r:B 164 38 0.2203 0.0793 0.3421 0.57 2md7:B, 2md8:C
67 7mq8:NJ 827 12 0.1186 0.0085 0.5833 0.96 7mq8:NK, 7mq9:NJ, 7mq9:NK
68 5y20:A 52 42 0.2203 0.2500 0.3095 1.0
69 2mum:A 50 47 0.2881 0.3400 0.3617 1.1
70 1wee:A 72 36 0.1864 0.1528 0.3056 1.4
71 5z8l:A 204 32 0.1864 0.0539 0.3438 2.0 5z8n:A, 5z8n:B, 5z8n:C
72 2qic:A 51 17 0.1695 0.1961 0.5882 2.0
73 7pk0:A 284 25 0.1695 0.0352 0.4000 2.6
74 6asb:I 121 65 0.3051 0.1488 0.2769 3.3 6asb:C, 6asb:L
75 6ywv:n 186 9 0.1186 0.0376 0.7778 3.6
76 6i52:C 178 10 0.1186 0.0393 0.7000 3.9
77 6mk2:A 407 36 0.2542 0.0369 0.4167 4.4
78 1i3q:I 122 17 0.1356 0.0656 0.4706 4.9 4a3b:I, 4a3c:I, 4a3d:I, 4a3e:I, 4a3f:I, 4a3g:I, 4a3i:I, 4a3j:I, 4a3k:I, 4a3l:I, 4a3m:I, 4a93:I, 2b8k:I, 4bbr:I, 4bbs:I, 6blo:I, 6blp:I, 6bm2:I, 6bm4:I, 6bqf:I, 4bxx:I, 4bxz:I, 4by1:I, 4by7:I, 5c3e:I, 5c4a:I, 5c4j:I, 5c4x:I, 8cen:I, 8ceo:I, 3cqz:I, 2e2h:I, 2e2i:I, 2e2j:I, 3fki:I, 5fmf:I, 5fyw:I, 5fz5:I, 3gtg:I, 3gtj:I, 3gtk:I, 3gtl:I, 3gtm:I, 3gto:I, 3gtp:I, 3gtq:I, 6gyk:I, 6gyl:I, 6gym:I, 3h3v:J, 3hou:I, 3hou:U, 3hov:I, 3how:I, 3hox:I, 3hoy:I, 3hoz:I, 3i4m:I, 3i4n:I, 1i50:I, 1i6h:I, 6i84:I, 5ip7:I, 5ip9:I, 3j0k:I, 2ja5:I, 2ja6:I, 2ja7:I, 2ja7:U, 2ja8:I, 8jch:I, 3k1f:I, 8k5p:I, 3k7a:I, 1k83:I, 7ked:I, 7kee:I, 7kef:I, 3m3y:I, 3m4o:I, 7mei:i, 7mei:I, 7mk9:I, 7mka:i, 7ml0:I, 7ml1:I, 7ml2:I, 7ml4:I, 1nik:I, 7nkx:I, 7nky:I, 2nvq:I, 2nvt:I, 2nvx:I, 2nvy:I, 2nvz:I, 7o4i:I, 7o4j:I, 6o6c:G, 7o72:I, 7o73:I, 7o75:I, 5oqj:I, 5oqm:I, 5ot2:I, 3po2:I, 3po3:I, 1r5u:I, 1r9s:I, 1r9t:I, 2r92:I, 7rim:I, 7rip:I, 7riq:I, 7riw:I, 7rix:I, 7riy:I, 3rzd:I, 3rzo:I, 3s14:I, 3s15:I, 3s16:I, 3s17:I, 3s1m:I, 3s1n:I, 3s1q:I, 3s1r:I, 3s2d:I, 3s2h:I, 1sfo:I, 5sva:I, 8tug:I, 8tvp:I, 8tvq:I, 8tvs:I, 8tvv:I, 8tvw:I, 8tvx:I, 8tvy:I, 1twa:I, 1twc:I, 1twf:I, 1twg:I, 1twh:I, 5u5q:I, 8u9r:I, 8u9x:I, 8ukq:I, 8ukr:I, 8uks:I, 8ukt:I, 8uku:I, 6upx:I, 6upy:I, 6upz:I, 6uq0:I, 6uq1:I, 6uq2:I, 6uq3:I, 4v1m:I, 4v1n:I, 4v1o:I, 2vum:I, 5vvr:I, 5vvs:I, 5w4u:I, 5w51:I, 1wcm:I, 4x67:I, 4x6a:I, 1y1v:I, 1y1w:I, 4y52:I, 1y77:I, 4y7n:I, 2yu9:I, 7zs9:I, 7zsa:I, 7zsb:I
79 4bvp:A 365 55 0.3051 0.0493 0.3273 5.1 3aaq:A, 3aar:A, 4br7:A, 4bra:A, 4bra:B, 4brc:A, 4brc:B, 4brd:A, 4brd:B, 4bre:A, 4bre:B, 4brf:A, 4brf:B, 4brg:A, 4brg:B, 4brh:A, 4brh:B, 4bri:A, 4bri:B, 4brk:A, 4brk:B, 4brl:A, 4brl:B, 4brn:A, 4brn:B, 4brq:A, 4brq:B, 4bvo:A, 4bvp:B
80 4o64:A 116 62 0.3051 0.1552 0.2903 5.7 4o64:B, 4o64:C
81 1wes:A 71 55 0.3051 0.2535 0.3273 6.4 2g6q:A
82 7odf:A 703 24 0.1525 0.0128 0.3750 6.6
83 1lbg:A 357 24 0.1864 0.0308 0.4583 6.6 2bjc:A, 2bjc:B, 1cjg:A, 1cjg:B, 1efa:A, 1efa:B, 1efa:C, 1jwl:B, 1jwl:A, 1jwl:C, 2kei:A, 2kei:B, 2kej:A, 2kej:B, 2kek:A, 2kek:B, 1l1m:A, 1l1m:B, 1lbg:D, 1lbh:A, 1lbh:B, 1lbh:C, 1lbh:D, 1lcc:A, 1lcd:A, 1osl:A, 1osl:B, 2p9h:A, 2p9h:B, 2paf:A, 2paf:B, 2pe5:A, 2pe5:B, 2pe5:C, 4rzt:A, 4rzt:B, 4rzt:C, 4rzt:D, 1tlf:A, 1tlf:B, 1tlf:C, 1tlf:D
84 6ojt:B 481 13 0.1356 0.0166 0.6154 6.6 6ojr:A, 6ojt:A, 6ojw:B, 6ojw:A
85 3v0r:A 130 28 0.1695 0.0769 0.3571 7.0
86 6y2x:A 231 27 0.1356 0.0346 0.2963 7.9 6ir0:A, 6y22:A, 6y3j:A
87 8pm4:A 604 27 0.1864 0.0182 0.4074 8.4
88 3cwq:A 206 30 0.2034 0.0583 0.4000 8.9 3cwq:B
89 5zba:A 360 36 0.2034 0.0333 0.3333 9.6

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218