BioLiP

>protein
GSSSGLPPGWEEKQDDRGRSYYVDHNSKTTTWSKPTMQD

The query sequence (length=39) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2n8t:A	39	39	1.0000	1.0000	1.0000	8.87e-24
2	7lp2:E	37	31	0.5128	0.5405	0.6452	3.59e-12	2lb2:A, 7lp2:A, 7lp2:C, 2lty:A
3	7lp3:A	37	32	0.5128	0.5405	0.6250	5.38e-12	7lp3:C
4	1i5h:W	50	34	0.4359	0.3400	0.5000	5.07e-09
5	2laj:A	40	35	0.4615	0.4500	0.5143	5.40e-09
6	5dws:C	40	33	0.4359	0.4250	0.5152	6.65e-09
7	5cq2:A	76	34	0.4359	0.2237	0.5000	1.19e-08	5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
8	5cq2:A	76	30	0.3846	0.1974	0.5000	3.97e-04	5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
9	2m3o:W	43	33	0.4103	0.3721	0.4848	1.98e-08	2kpz:A, 2kq0:A, 2mpt:A, 4n7h:A
10	2djy:A	42	35	0.4359	0.4048	0.4857	4.38e-08
11	2lb1:A	35	32	0.4103	0.4571	0.5000	7.30e-08	2ltx:A
12	4lcd:A	419	32	0.4359	0.0406	0.5312	1.67e-07	4lcd:B
13	2kxq:A	90	32	0.4103	0.1778	0.5000	2.17e-07	2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
14	2kxq:A	90	37	0.2821	0.1222	0.2973	0.058	2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
15	6jjy:A	128	30	0.4103	0.1250	0.5333	5.28e-07	6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
16	6jjy:A	128	36	0.4359	0.1328	0.4722	1.95e-05	6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
17	2jmf:A	43	30	0.3590	0.3256	0.4667	5.18e-06
18	6jjz:B	96	35	0.3846	0.1562	0.4286	5.98e-06	6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
19	6jjz:B	96	33	0.3333	0.1354	0.3939	0.008	6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
20	2ltv:A	36	32	0.3590	0.3889	0.4375	1.56e-05	2law:A
21	2ez5:W	46	35	0.3590	0.3043	0.4000	2.37e-05
22	2nc3:A	33	31	0.2821	0.3333	0.3548	3.09e-04	2nc4:A, 2nc5:A, 2nc6:A
23	8sg2:A	163	32	0.3333	0.0798	0.4062	4.13e-04	6dun:A, 6dun:B, 7efj:A, 7efx:A, 7ekv:A, 7f0m:A, 7f0m:C, 7f0m:B, 7f0m:D, 1f8a:B, 4gwv:A, 3i6c:A, 3i6c:B, 1i8g:B, 1i8h:B, 3ikd:A, 3ikd:B, 3ikg:A, 3ikg:B, 9inr:A, 9inr:B, 2itk:A, 3jyj:A, 3jyj:B, 3kab:A, 3kac:A, 3kac:B, 3kad:A, 3kaf:A, 3kag:A, 3kah:A, 3kai:A, 3kce:A, 2lb3:A, 2n1o:A, 1nmw:A, 3ntp:A, 6o33:A, 6o34:A, 3odk:A, 3oob:A, 1pin:A, 2q5a:A, 3tc5:A, 3tcz:A, 3tdb:A, 4tns:A, 4tyo:A, 4tyo:B, 5uy9:A, 6vaj:A, 3wh0:A, 2xp3:A, 2xp4:A, 2xp5:A, 2xp6:A, 2xp7:A, 2xp8:A, 2xp9:A, 2xpa:A, 2xpb:A
24	1jmq:A	46	30	0.3333	0.2826	0.4333	4.53e-04	1k5r:A, 1k9q:A, 1k9r:A, 2lax:A, 2lay:A, 2ltw:A
25	1eg4:A	260	37	0.2821	0.0423	0.2973	0.017
26	8pxx:A	99	26	0.2564	0.1010	0.3846	0.14	2dyf:A
27	8pxx:A	99	26	0.2821	0.1111	0.4231	0.17	2dyf:A
28	2jup:W	37	26	0.2308	0.2432	0.3462	1.3	2rly:W, 2rm0:W
29	7yfx:A	746	15	0.2051	0.0107	0.5333	1.8	7yfy:A, 7ygn:A
30	7air:A	885	26	0.2308	0.0102	0.3462	4.0	7aip:A, 7aip:B, 7aiq:A, 7aiq:B, 7air:B, 6kkr:A, 6kkr:B, 6kkt:A, 6kkt:B, 6kku:A, 6kku:B, 7tti:A, 7tti:B
31	7xx4:A	395	16	0.2308	0.0228	0.5625	8.1	2iyf:A, 2iyf:B, 4m83:A, 4m83:B, 7xx4:B
32	2ch6:A	343	27	0.2564	0.0292	0.3704	8.6	2ch6:B, 2ch6:C, 2ch6:D
33	3m34:A	632	13	0.1795	0.0111	0.5385	8.9	3m6l:A, 3m7i:A
34	5ujt:A	183	32	0.2564	0.0546	0.3125	8.9	4gg6:C, 4gg6:A, 1jk8:A, 5ks9:C, 5ks9:A, 5ksa:A, 5ksb:C, 5ksb:A, 5ksu:A, 5ksu:D, 5ksv:A, 2nna:A, 4ozf:A, 4ozg:C, 4ozg:A, 4ozh:C, 4ozh:A, 4ozi:C, 4ozi:A, 6px6:A, 6py2:A, 1s9v:A, 1s9v:D, 7sg0:A, 7sg1:A, 7sg1:F, 7sg2:A, 7sg2:F, 6u3m:A, 6u3m:C, 6u3n:A, 6u3o:E, 6u3o:C, 5ujt:G, 5ujt:D, 8vcx:A, 8vcy:A, 8vd2:A, 8vdd:A, 8vdu:A, 8vdu:D, 8vdu:G, 8vdu:J, 6xp6:A, 6xp6:D, 4z7u:C, 4z7u:A, 4z7v:C, 4z7v:A, 4z7w:C, 4z7w:A

[Back]