BioLiP

>protein
GSSMVTGGMASKWDQKGMDIAYEEAALGYKEGGVPIGGCLINNKDGSVLGRGHNMRFQKGSATLHGEISTLENCGRLEGK
VYKDTTLYTTLSPCDMCTGAIIMYGIPRCVVGENVNFKSKGEKYLQTRGHEVVVVDDERCKKIMKQFIDERPQDWFEDIG
E

The query sequence (length=161) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8i3p:B	166	155	0.9627	0.9337	1.0000	9.38e-116	8i3n:A, 8i3n:B, 8i3n:C, 8i3n:D, 8i3o:A, 8i3o:B, 8i3o:C, 8i3o:D, 8i3p:A, 2o3k:A, 2o3k:B, 1ox7:A, 1ox7:B, 1p6o:A, 1p6o:B, 1rb7:A, 1rb7:B, 1uaq:A, 1uaq:B, 8vlj:A, 8vlj:B, 8vlk:A, 8vlk:B, 8vlk:C, 8vlk:D, 8vll:A, 8vll:B, 8vlm:A, 8vlm:B, 8vlm:C, 8vlm:D, 1ysb:A, 1ysb:B, 1ysd:A, 1ysd:B
2	2b3j:C	152	98	0.2484	0.2632	0.4082	7.62e-16	2b3j:A, 2b3j:B, 2b3j:D
3	2nx8:A	168	96	0.2174	0.2083	0.3646	1.91e-15
4	7cph:B	156	149	0.2795	0.2885	0.3020	9.43e-14	7cph:A
5	1wwr:C	160	94	0.1801	0.1812	0.3085	2.80e-12	1wwr:A, 1wwr:B, 1wwr:D
6	1z3a:A	156	97	0.2360	0.2436	0.3918	7.09e-11	3ocq:A, 1z3a:B
7	7nz7:A	166	119	0.2360	0.2289	0.3193	1.56e-10	3dh1:A, 3dh1:B, 3dh1:C, 3dh1:D, 7nz8:A, 7nz9:A
8	7dc9:D	161	101	0.1988	0.1988	0.3168	1.13e-08	7dbf:A, 7dbf:D, 7dc9:A, 7dca:A, 7dca:D, 7dcb:A, 7dcb:D, 7dcw:A, 7dcw:D, 7dgc:A, 7dgc:D, 7dh1:A, 7dh1:D, 7dlc:A, 7dlc:D, 7dm5:A, 7dm5:D, 7dm6:A, 7dm6:D, 7dow:A, 7dow:D, 7dox:A, 7dox:D, 7doy:A, 7doy:D, 7dpk:A, 7dpk:D, 7dqn:A, 7dqn:D, 5jfy:A, 5jfy:B, 5jfy:C, 5jfy:D, 7w1q:A, 7w1q:D
9	8e2q:B	160	96	0.2236	0.2250	0.3750	1.17e-08	8e2p:A, 8e2p:B, 8e2p:C, 8e2p:D, 8e2q:A, 8e2q:C, 8e2q:D, 8e2r:A, 8e2r:B, 8e2s:A, 8e2s:B, 8e2s:C, 8e2s:D, 8e2s:E, 8e2s:F, 8e2s:G, 8e2s:H, 6vpc:F
10	2a8n:B	138	96	0.2050	0.2391	0.3438	6.28e-08	2a8n:A
11	6l2m:A	144	85	0.1429	0.1597	0.2706	5.28e-07	6l2l:A
12	1wkq:A	158	79	0.1615	0.1646	0.3291	5.91e-07	1tiy:A, 1tiy:B, 1wkq:B
13	2o7p:A	358	101	0.2112	0.0950	0.3366	2.76e-06	2o7p:B, 2obc:A
14	7bv5:A	234	102	0.1677	0.1154	0.2647	3.79e-06	7bv5:B
15	8aw3:2	177	107	0.1925	0.1751	0.2897	1.09e-05
16	2hxv:A	349	149	0.2484	0.1146	0.2685	3.29e-05
17	1vq2:A	173	120	0.2236	0.2081	0.3000	8.19e-05
18	2hvw:A	147	57	0.1180	0.1293	0.3333	0.002	5c2o:A, 5c2o:B, 2hvv:A, 2hvv:B, 2hvw:B, 2hvw:C
19	8wlv:A	158	100	0.1801	0.1835	0.2900	0.006	8wlv:B, 8wlv:C, 8wlv:D, 8wlw:A, 8wlw:C, 8wlw:B, 8wlw:D, 8wlx:A, 8wlx:B, 5xko:A, 5xko:B, 5xkp:A, 5xkp:B, 5xkp:C, 5xkp:D, 5xkq:A, 5xkq:B, 5xkq:C, 5xkq:D, 5xkr:A, 5xkr:B, 5xkr:C, 5xkr:D
20	8dqb:A	370	93	0.1925	0.0838	0.3333	0.038	8dq9:A, 8dq9:B, 8dqc:A, 8dqc:B
21	3zpc:A	357	84	0.1801	0.0812	0.3452	0.095	3zpc:B, 3zpg:A
22	4g3m:A	361	84	0.1366	0.0609	0.2619	0.21	2b3z:A, 2b3z:B, 2b3z:C, 2b3z:D, 2d5n:A, 2d5n:B, 2d5n:C, 2d5n:D, 3ex8:A, 3ex8:B, 3ex8:C, 3ex8:D, 4g3m:B, 4g3m:C, 4g3m:D
23	2g84:A	189	103	0.1615	0.1376	0.2524	0.29	7c3s:A, 7c3s:B, 7c3t:A, 7c3t:B, 7c3u:A, 7c3u:B, 2g84:B, 4hrq:A, 4hrq:B, 4hrw:A, 4hrw:B, 4lc5:A, 4lc5:B, 4lcn:A, 4lcn:B, 4lco:A, 4lco:B, 4lcp:A, 4lcp:B, 4ld2:A, 4ld2:B, 4ld4:A, 4ld4:B
24	5w3v:A	186	62	0.1118	0.0968	0.2903	0.47	5w3v:B, 5w3v:C, 5w3v:D
25	7nz8:B	284	82	0.1304	0.0739	0.2561	0.66	7nz7:B, 7nz9:B
26	7jil:S	128	52	0.1056	0.1328	0.3269	2.6
27	3p7i:A	300	56	0.0994	0.0533	0.2857	3.5
28	7coj:A	211	32	0.0559	0.0427	0.2812	4.0	7coi:A, 7coi:B, 7coi:C, 7coi:D, 7coj:B, 7coj:C, 7coj:D
29	7bv5:C	284	27	0.0683	0.0387	0.4074	4.9
30	7bv5:D	310	27	0.0683	0.0355	0.4074	5.1
31	7e40:D	345	48	0.1118	0.0522	0.3750	6.9	7e40:B
32	5mg5:L	396	23	0.0745	0.0303	0.5217	8.7	5mg5:C, 5mg5:O, 5mg5:R
33	8oxm:A	2748	32	0.0745	0.0044	0.3750	9.3	8oxm:B
34	7sic:A	2773	32	0.0745	0.0043	0.3750	9.3	8oxo:A, 8oxo:B, 8oxp:A, 8oxp:B, 7sic:B, 7sid:A, 7sid:C
35	7ni5:A	2791	32	0.0745	0.0043	0.3750	9.3	7ni4:A, 7ni4:B, 7ni5:B, 7ni6:A, 7ni6:B, 8oxq:A, 8oxq:B
36	8ajp:A	199	46	0.0807	0.0653	0.2826	9.5

[Back]