BioLiP

>protein
GSSGSSGLEEFKNSSKLVAAAEKERLDKHLGIPCNNCKQFPIEGKCYKCTECIEYHLCQECFDSYCHLSHTFTFREKRNQ
KWRSLEKRADEVSGPSSG

The query sequence (length=98) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2dip:A	98	98	1.0000	1.0000	1.0000	1.04e-69
2	4xi6:A	363	47	0.2245	0.0606	0.4681	5.02e-07	4xi7:A, 4xib:A
3	6ww3:A	60	45	0.1837	0.3000	0.4000	1.76e-06	6ww3:B
4	6ww4:B	56	45	0.1837	0.3214	0.4000	2.05e-06	6ww4:A
5	2fc7:A	82	101	0.3163	0.3780	0.3069	0.006	6e83:B, 6e86:B
6	7dde:A	525	52	0.1531	0.0286	0.2885	0.010	7dde:C, 7dde:E, 7dde:G, 7dde:I, 7dde:K, 7dde:M, 7dde:O, 7dde:Q, 7dde:S, 7dde:V, 7dde:X
7	6miu:A	57	43	0.1633	0.2807	0.3721	0.028	6khz:C, 6khz:D, 6miu:B, 6mj7:A, 7r1o:BBB, 7r1o:DDD, 7r1o:AAA, 7r1o:CCC, 5yp7:A, 5yp7:D, 5yp8:A, 5yp8:B, 5ypa:A, 5ypa:B, 5ypb:C, 5ypb:D, 5ype:C, 5ype:D, 5ypf:C, 5ypf:D, 5ypg:A, 5ypg:B, 5yph:A
8	2e5r:A	63	31	0.1224	0.1905	0.3871	0.042
9	5ypc:B	50	40	0.1531	0.3000	0.3750	0.12	6khz:A, 6khz:B, 5ypb:A, 5ypb:B, 5ypc:A, 5ypc:C, 5ypc:D, 5ype:A, 5ype:B, 5ypf:A, 5ypf:B, 5yph:B
10	2yre:A	100	101	0.3265	0.3200	0.3168	0.22
11	7dd9:A	1129	31	0.0918	0.0080	0.2903	0.61	7dd9:C, 7dd9:E, 7dd9:G, 6lz1:A, 6lz1:B, 6lz1:C, 6lz1:D
12	6h3u:A	246	69	0.1735	0.0691	0.2464	0.95	6h3t:A, 6h3t:B, 6h3u:B
13	9c4d:E	140	48	0.1429	0.1000	0.2917	1.1	9c4c:E, 9c4c:F, 9c4c:G, 9c4c:H, 9c4d:F, 9c4d:G, 9c4d:I, 9c4d:D, 9c4d:H, 9c4d:J, 9c4d:C, 2ev0:A, 2ev0:B, 2ev5:A, 2ev5:B, 2ev6:A, 2ev6:B, 2f5c:A, 2f5d:A, 2f5d:B, 2f5e:A, 2f5e:B, 2f5f:A, 2f5f:B, 4hv5:A, 4hv5:B, 4hv6:A, 4hv6:B, 4hx4:A, 4hx4:B, 1on1:A, 1on1:B, 1on2:A, 1on2:B, 3r60:A, 3r60:B, 3r61:A, 3r61:B
14	1wev:A	88	111	0.3163	0.3523	0.2793	1.1
15	6nwz:A	665	25	0.1020	0.0150	0.4000	1.6
16	2b7r:A	568	59	0.1735	0.0299	0.2881	3.9	2b7s:A, 1e39:A, 1jrx:A, 1jrx:B, 1jry:A, 1jry:B, 1jrz:A, 1jrz:B, 1kss:A, 1ksu:A, 1ksu:B, 1lj1:A, 1lj1:B, 1m64:A, 1m64:B, 1p2e:A, 1p2h:A, 1q9i:A, 1qjd:A, 1y0p:A
17	5u7g:A	547	34	0.1327	0.0238	0.3824	5.0	4a9k:A, 4a9k:B, 6alc:B, 6axq:A, 6axq:B, 6axq:C, 6axq:D, 6ay3:A, 6ay3:B, 6ay5:A, 5cgp:A, 8cmz:A, 8cn0:A, 8cna:A, 8cnb:A, 8cnd:A, 2d82:A, 5dbm:A, 5dbm:B, 5dbm:C, 6dmk:A, 5eic:B, 5eng:A, 5ep7:A, 7evj:A, 6fqo:A, 6fqo:B, 6fqt:A, 6fqu:A, 6fr0:A, 6fr0:B, 6frf:A, 6frf:B, 6frf:C, 6frf:D, 8fup:A, 8fup:B, 8fv2:A, 8fv2:B, 8fv2:C, 8fv2:D, 8fvs:A, 8fvs:B, 8fxa:A, 8fxa:B, 8fxe:A, 8fxn:A, 8fxo:A, 8g6t:A, 8g6t:B, 8g6t:C, 8g6t:D, 8ga2:A, 8ga2:D, 8ga2:C, 8ga2:B, 5gh9:A, 5h85:A, 5i83:A, 5i86:A, 5i86:B, 5i89:A, 5j0d:A, 1jsp:B, 7juo:A, 7juo:B, 7juo:D, 7juo:C, 7juo:F, 7juo:E, 7juo:G, 7juo:H, 7kpy:A, 7kpy:B, 5ktu:A, 5ktu:B, 5ktw:A, 5ktw:B, 5ktw:C, 5ktx:A, 2l84:A, 2l85:A, 5lpj:A, 5lpl:A, 6lqx:B, 5mme:A, 5mme:B, 5mmg:A, 5mpk:A, 5mpk:B, 5mpn:A, 5mpz:A, 5mqe:A, 5mqe:B, 5mqg:A, 5mqg:B, 5mqk:A, 5mqk:B, 2n1a:B, 4n3w:A, 5nlk:A, 4nr4:A, 4nr4:B, 4nr5:A, 4nr6:A, 4nr7:A, 5nrw:A, 5nu3:A, 4nyv:A, 4nyv:B, 4nyv:C, 4nyv:D, 4nyw:A, 4nyx:A, 8og2:A, 5owk:A, 3p1c:A, 3p1d:A, 3p1f:A, 3p1f:B, 6qst:A, 6qst:B, 6qst:C, 6qst:D, 2rny:A, 6sqe:A, 6sqf:A, 6sqm:A, 6sqm:B, 6sqm:C, 3svh:A, 3svh:B, 6sxx:A, 6sxx:B, 5tb6:A, 1tot:A, 4tqn:A, 4ts8:A, 5u7g:B, 7uge:A, 7uge:B, 7ugl:A, 7ugl:B, 5w0e:A, 5w0f:A, 5w0i:A, 5w0l:A, 5w0l:B, 5w0q:A, 4whu:A, 7wx2:A, 7xh6:A, 7xh6:B, 7xhe:A, 7xhe:B, 7xi0:A, 7xi0:B, 7xm7:A, 7xm7:D, 7xm7:C, 7xne:A, 7xne:B, 7xng:A, 7xng:B, 5xxh:A, 6yij:A, 6yij:B, 6yij:C, 6yij:D, 6yij:E, 6yij:F, 6yij:G, 6yik:A, 6yik:C, 6yik:B, 6yil:A, 6yim:A, 4yk0:A, 4yk0:B, 4yk0:C, 4yk0:D
18	6gys:B	579	22	0.0918	0.0155	0.4091	6.0	6f07:B, 6gyp:B, 6gys:C, 6gys:J, 6gys:I, 6gyu:B, 7k7g:M, 8ow1:CE
19	6lmt:A	254	29	0.1020	0.0394	0.3448	9.1	6lmt:B, 6lmt:H, 6lmt:C, 6lmt:D, 6lmt:E, 6lmt:F, 6lmt:G
20	2d8r:A	99	38	0.1122	0.1111	0.2895	9.8

[Back]