BioLiP

>protein
GSRRIFSGVQPTSDSLHLGNALGAVAQWVGLQDDHDAFFCVVDLHAITIPQDPEALRRRTLITAAQYLALGIDPGRATIF
VQSQVPAHTQLAWVLGCFTGFGQASRMTQFKATTVGLFTYPVLQAADVLAYDTELVPVGEDQRQHLELARDVAQRFNSRF
PGTLVVPDVLIPKMTAKIYDLQDPTSKMSKSAGTDAGLINLLDDPALSAKKIRSAVTDSERDIRYDPDVKPGVSNLLNIQ
SAVTGTDIDVLVDGYAGHGYGDLKKDTAEAVVEFVNPIQARVDELTADPAELEAVLAAGAQRAHDVASKTVQRVYDRLGF
LL

The query sequence (length=322) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7elt:A	330	330	0.9969	0.9727	0.9727	0.0	7ens:A, 7ent:A, 7ev2:A, 7ev3:A
2	7cms:A	328	325	0.5031	0.4939	0.4985	8.85e-110	7cki:A, 7cms:B, 5dk4:A, 7eer:A, 7eer:B, 7eer:C, 7eer:D, 1i6k:A, 1i6l:A, 1i6m:A, 1m83:A, 1mau:A, 1maw:A, 1maw:B, 1maw:C, 1maw:D, 1maw:E, 1maw:F, 1mb2:A, 1mb2:B, 1mb2:C, 1mb2:D, 1mb2:E, 1mb2:F, 2ov4:A
3	8i1w:B	333	327	0.5093	0.4925	0.5015	3.41e-108	8i1y:A, 8i1y:B, 8i1z:A, 8i1z:B, 8i27:A, 8i27:B, 8i2a:B, 8i2a:A, 8i2c:A, 8i2c:B, 8i2j:A, 8i2j:B, 8i2l:B, 8i2l:A, 8i2m:A, 8i2m:B, 8i4i:A, 8i4i:B, 5v0i:A, 5v0i:B
4	6dfu:A	332	327	0.5031	0.4880	0.4954	5.15e-107	6dfu:B
5	3sz3:A	341	331	0.4814	0.4545	0.4683	9.92e-97
6	3fi0:G	302	318	0.4720	0.5033	0.4780	1.62e-96	3fhj:A, 3fhj:B, 3fhj:E, 3fhj:F, 3fi0:A, 3fi0:B, 3fi0:C, 3fi0:D, 3fi0:E, 3fi0:F, 3fi0:H, 3fi0:I, 3fi0:J, 3fi0:K, 3fi0:L, 3fi0:M, 3fi0:N, 3fi0:O, 3fi0:P, 3fi0:Q, 3fi0:R
7	5ekd:A	327	328	0.4379	0.4312	0.4299	5.69e-89	5ekd:B
8	3fhj:D	286	318	0.4410	0.4965	0.4465	8.72e-85	3fhj:C
9	2yy5:B	346	344	0.3789	0.3526	0.3547	4.87e-66	2yy5:A, 2yy5:C, 2yy5:D
10	3tzl:B	320	327	0.3354	0.3375	0.3303	7.56e-55	3tzl:A
11	5tew:A	333	328	0.3323	0.3213	0.3262	1.45e-46
12	2g36:A	322	331	0.3354	0.3354	0.3263	2.41e-44
13	6ncr:A	342	340	0.3261	0.3070	0.3088	3.61e-41	6ncr:B
14	2a4m:C	331	329	0.3292	0.3202	0.3222	4.64e-31	1yi8:C, 1yia:B, 1yid:B
15	3kt8:D	410	343	0.2764	0.2171	0.2595	6.86e-08	3kt0:A, 3kt3:A, 3kt3:B, 3kt3:C, 3kt3:D, 3kt6:A, 3kt6:B, 3kt6:C, 3kt6:D, 3kt8:A, 3kt8:B, 3kt8:C
16	3a04:A	367	225	0.1832	0.1608	0.2622	1.67e-06	3a05:A
17	2cyb:A	319	226	0.1863	0.1881	0.2655	7.03e-04	2cyb:B
18	3jxe:B	363	147	0.1149	0.1019	0.2517	0.004	3jxe:A
19	2cyc:A	371	206	0.1646	0.1429	0.2573	0.006	2cyc:B
20	3p0j:A	657	194	0.1460	0.0715	0.2423	0.010	3p0h:B, 3p0i:B, 3p0j:B
21	4j75:A	374	237	0.1739	0.1497	0.2363	0.010	4j75:B, 4jfa:A, 4jfa:B, 4jfa:D
22	4jfa:C	348	240	0.1677	0.1552	0.2250	0.016
23	5usf:A	682	199	0.1491	0.0704	0.2412	0.028	3p0h:A, 3p0i:A, 3p0j:C, 3p0j:D, 5usf:B
24	6bqz:A	215	178	0.1335	0.2000	0.2416	0.033	6bqz:B
25	3hv0:A	352	200	0.1366	0.1250	0.2200	0.21	3hv0:B
26	3tze:A	360	206	0.1398	0.1250	0.2184	0.21	3tze:B
27	7sc6:A	349	110	0.0932	0.0860	0.2727	0.24	7scq:A, 7scq:B
28	2ox4:C	397	95	0.0870	0.0705	0.2947	0.24	2ox4:A, 2ox4:B, 2ox4:D, 2ox4:E, 2ox4:F, 2ox4:G, 2ox4:H
29	7ror:B	362	34	0.0373	0.0331	0.3529	1.2	7ror:A, 7ros:A, 7ros:B, 7rot:A, 7rot:B, 3vgj:A, 3vgj:B
30	6gmo:A	439	41	0.0497	0.0364	0.3902	1.8	6gmo:B, 2gwc:A, 2gwc:B, 2gwc:C, 2gwc:D, 2gwc:E, 2gwc:F, 2gwc:G, 2gwc:H, 2gwd:A
31	1out:A	142	56	0.0590	0.1338	0.3393	4.8	1ouu:A, 1ouu:C
32	3tqo:A	387	114	0.0839	0.0698	0.2368	6.8
33	4fbg:A	399	27	0.0404	0.0326	0.4815	7.4	4fbg:E, 4fbg:G, 4fbg:H, 4fbg:I, 4fbg:K, 4fbg:M, 4fbg:P
34	6sl2:A	619	80	0.0839	0.0436	0.3375	9.3	5nl7:A, 6sl3:A

[Back]