BioLiP

>protein
GSRFTWRKECLAVMESYFNENQYPDEAKREEIANACNAVIQKPGKKLSDLERVTSLKVYNWFANRRKEIKRRANIEA

The query sequence (length=77) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4j19:A	77	77	1.0000	1.0000	1.0000	4.72e-53	4j19:B
2	2h8r:A	176	75	0.3377	0.1477	0.3467	1.97e-05	2h8r:B
3	8pi9:B	177	74	0.3247	0.1412	0.3378	5.32e-05	1ic8:A, 1ic8:B, 8pi7:A, 8pi7:B, 8pi8:A, 8pi8:B, 8pi9:A, 8pia:A, 8pia:B
4	2lkx:A	68	64	0.2727	0.3088	0.3281	7.50e-04
5	1fjl:A	65	70	0.2727	0.3231	0.3000	0.001	1fjl:B, 1fjl:C
6	3cmy:A	60	65	0.2727	0.3500	0.3231	0.007
7	8ejo:A	56	64	0.2468	0.3393	0.2969	0.084	8ejo:B, 8ejp:A, 8ejp:B
8	9b8u:B	66	35	0.1818	0.2121	0.4000	0.089	9b8u:A, 9b8u:C, 9b8u:D
9	1lfu:P	82	76	0.2987	0.2805	0.3026	0.13	1b72:B, 1b8i:B, 4cyc:B, 1puf:B, 2r5y:B, 2r5z:B, 4uus:B, 4uus:F, 5zjq:B, 5zjr:B, 5zjs:B, 5zjt:B
10	4egc:A	539	65	0.2338	0.0334	0.2769	0.14
11	3j7a:S	128	24	0.1429	0.0859	0.4583	0.25	3jbn:S, 3jbo:S, 3jbp:S, 6okk:S, 8tpu:SS
12	8osb:E	62	62	0.2208	0.2742	0.2742	0.26
13	1le8:A	53	55	0.1948	0.2830	0.2727	0.46	1akh:A, 1yrn:A
14	3a01:F	61	56	0.2078	0.2623	0.2857	0.51	3a01:B, 3lnq:A
15	1akh:B	78	74	0.3117	0.3077	0.3243	0.89	1apl:C, 1apl:D, 1k61:A, 1k61:B, 1k61:C, 1k61:D, 1le8:B, 1yrn:B
16	1ig7:A	58	61	0.2208	0.2931	0.2787	0.89
17	1mnm:C	77	74	0.3117	0.3117	0.3243	0.90	1mnm:D
18	3jys:A	479	33	0.1948	0.0313	0.4545	0.93
19	4rdu:D	62	61	0.2078	0.2581	0.2623	1.3	4rdu:A, 4xrs:I, 4xrs:G
20	4uus:A	67	58	0.1948	0.2239	0.2586	2.7	4uus:E
21	4xrm:B	64	25	0.1429	0.1719	0.4400	3.6	5bng:B, 5bng:A, 5eg0:A, 5ego:A, 8vts:B, 8vts:D, 8vtt:D, 4xrm:A, 4xrs:A, 4xrs:B
22	5flv:M	229	28	0.1429	0.0480	0.3929	4.2	5flv:A, 5flv:E, 5flv:I, 4s0h:A, 4s0h:B, 4s0h:E, 4s0h:F, 6wc2:N, 6wc2:M, 6wc2:O, 6wc5:I, 6wc5:N, 2x6u:A, 2x6v:A, 2x6v:B
23	9bh5:AS	148	26	0.1299	0.0676	0.3846	4.2	9cai:AS
24	7oho:AAA	605	32	0.1688	0.0215	0.4062	4.3	6qh5:A, 8t1o:A, 4uqi:A, 2vgl:A
25	7ao3:A	303	41	0.1558	0.0396	0.2927	4.6	7ao0:A, 7ao0:B, 7ao1:A, 7ao1:B, 7ao2:A, 7ao2:B, 7ao3:B, 7ao5:A, 7ao5:B, 6ggi:A, 6ggi:B, 6ggj:A, 6ggj:B, 6ggk:A, 6ggk:B, 6ggl:A, 6ggl:B, 5gue:A, 5gue:B, 5gue:C, 5gue:D, 8qws:A, 8qws:B
26	7d4i:RP	2084	23	0.1169	0.0043	0.3913	4.8	7d5t:RP
27	6m3d:C	108	32	0.1429	0.1019	0.3438	4.8	1du0:A, 1du0:B, 1hdd:C, 1hdd:D, 2hdd:A, 2hdd:B, 3hdd:A, 3hdd:B, 2hos:A, 2hos:B, 2hot:A, 2hot:B
28	6m3d:C	108	32	0.1429	0.1019	0.3438	4.8	1du0:A, 1du0:B, 1hdd:C, 1hdd:D, 2hdd:A, 2hdd:B, 3hdd:A, 3hdd:B, 2hos:A, 2hos:B, 2hot:A, 2hot:B
29	1nk2:P	77	28	0.1558	0.1558	0.4286	5.0	1nk3:P
30	3pfq:A	523	55	0.1818	0.0268	0.2545	5.2	1a25:A, 1a25:B, 2i0e:A, 2i0e:B
31	6lqs:RP	2180	23	0.1169	0.0041	0.3913	5.2	7d63:RP, 6lqp:RP, 6lqq:RP, 6lqr:RP, 6lqt:RP, 6lqu:RP, 6lqv:RP
32	4r2w:D	251	42	0.1429	0.0438	0.2619	6.2	7q2w:FFF, 4r2w:A, 4r2w:B, 4r2w:C, 4r2w:E, 4r2w:F, 4r2x:C, 4r2x:D, 4r2x:E, 4r2x:F, 4r2x:A, 4r2x:B, 4yjk:D, 4yjk:F, 4yjk:A
33	2me6:A	71	69	0.2727	0.2958	0.3043	6.3
34	3a01:A	78	61	0.2208	0.2179	0.2787	7.9	3a01:E
35	1b72:A	68	69	0.2987	0.3382	0.3333	8.3
36	5ere:A	540	12	0.1039	0.0148	0.6667	8.7
37	8w0o:A	259	33	0.1558	0.0463	0.3636	9.2	8w0n:A, 8w0n:B, 8w0o:B, 8w0o:C, 8w0o:D, 8w0o:E, 8w0o:H, 8w0o:F, 8w0o:G
38	6fqp:A	67	23	0.1169	0.1343	0.3913	10.0	6fqp:B, 6fqq:A, 6fqq:B, 6fqq:D, 6fqq:E

[Back]