BioLiP

>protein
GSQALPPGPMQTLIFFDMEATGLPFSQPKVTELCLLAVHRCALESPPPTVPPPPRVVDKLSLCVAPGKACSPAASEITGL
STAVLAAHGRQCFDDNLANLLLAFLRRQPQPWCLVAHNGDRYDFPLLQAELAMLGLTSALDGAFCVDSITALKALERKSY
SLGSIYTRLYGQSPPDSHTAEGDVLALLSICQWRPQALLRWVDAHARPFGTIRPMY

The query sequence (length=216) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8vl7:C	224	223	0.9722	0.9375	0.9417	9.64e-150	9ava:A, 9ava:B, 9ava:C, 9ava:D, 9ava:E, 9ava:F, 9ava:G, 9ava:H, 9ava:I, 9ava:J, 9ava:K, 9ava:L, 7tqq:A, 7tqq:B, 7tqq:E, 7tqq:F, 8vl7:A, 8vl7:B, 8vl7:D, 8vl7:E, 8vl7:F, 8vl7:G, 8vl7:H
2	5yws:B	234	232	0.7917	0.7308	0.7371	3.65e-109	3b6o:A, 3b6o:B, 3b6o:C, 3b6o:D, 3b6p:A, 3b6p:B, 3b6p:C, 3b6p:D, 8hcc:A, 8hcc:B, 8hcc:C, 8hcc:D, 8hcd:B, 8hcd:C, 8hcd:D, 8hcd:E, 8hce:B, 8hcf:B, 8hcg:A, 8hch:A, 8hch:B, 8hch:C, 8hch:D, 2ioc:B, 2ioc:A, 3mxi:B, 3mxi:A, 3mxm:A, 3mxm:B, 2o4g:A, 2o4g:B, 2o4g:C, 2o4g:D, 2o4i:A, 2o4i:B, 2oa8:B, 2oa8:A, 3u3y:A, 3u3y:B, 3u6f:B, 3u6f:A, 7u8y:A, 7u8y:B, 4ynq:A, 4ynq:C, 4ynq:D, 4ynq:B, 5yws:A, 5ywt:B, 5ywt:A, 5ywu:A, 5ywu:B, 5ywv:A, 5ywv:B
3	6a47:A	224	214	0.4491	0.4330	0.4533	2.31e-52	6a46:A, 6a46:B, 6a47:B, 6a4b:B, 6a4b:A, 6a4b:C, 6a4b:D, 6a4b:E, 6a4b:F
4	4ail:C	750	73	0.1157	0.0333	0.3425	0.039	2jgu:A
5	9b8t:A	1146	48	0.0741	0.0140	0.3333	0.091	9b8s:A, 9f6d:A, 9f6e:A, 9f6f:A, 9f6i:A, 9f6j:A, 9f6k:A, 9f6l:A
6	2gwn:A	451	100	0.1435	0.0687	0.3100	0.10
7	4k8x:A	759	44	0.0787	0.0224	0.3864	0.89	6is7:A, 6is7:B, 6isf:A, 6isf:B, 6isg:A, 6ish:A, 6isi:A, 4k8z:A, 5omf:A, 5omq:A, 5omv:A, 7om3:A, 7omb:A, 7omg:A, 6q4t:A, 7rsr:A, 7rss:A, 7rsu:A, 8t3x:A, 7tqw:A, 5vu6:A, 5vu7:A, 5vu9:A
8	6wya:A	756	101	0.1204	0.0344	0.2574	0.97	6wyb:A
9	1d5a:A	733	101	0.1204	0.0355	0.2574	1.5
10	6sty:A	198	66	0.0787	0.0859	0.2576	1.5	6j7y:B, 6j7z:B, 6j80:B, 6n6i:A, 6n6i:B, 6n6j:A, 6n6j:B, 6n6k:A, 6n6k:B, 6rcl:A, 6rcn:A, 6sty:B, 6sty:E
11	3re3:B	144	63	0.0972	0.1458	0.3333	3.7
12	5why:A	418	26	0.0602	0.0311	0.5000	3.9
13	4pbp:B	210	42	0.0787	0.0810	0.4048	5.0	4pbp:A, 4pbp:C
14	1uqw:A	487	114	0.1435	0.0637	0.2719	5.9	1uqw:B
15	1i7l:A	309	29	0.0602	0.0421	0.4483	6.2	1i7l:B
16	7vqm:A	584	44	0.0741	0.0274	0.3636	6.3	7vqm:B, 7vqm:C, 7vqm:D
17	8yts:A	83	27	0.0556	0.1446	0.4444	8.1	8yts:B

[Back]