BioLiP

>protein
GSNVNHLIKVTDQSITEGYDDSDGIIKAHDAENLIYDVTFEVDDKVKSGDTMTVNIDKNTVPSDLTDSFAIPKIKDNSGE
IIATGTYDNTNKQITYTFTDYVDKYENIKAHLKLTSYIDKSKVPNNNTKLDVEYKTALSSVNKTITVEYQKPNENRTANL
QSMFTNIDTKNHTVEQTIYINPLRYSAKETNVNISGNGDEGSTIIDDSTIIKVYKVGDNQNLPDSNRIYDYSEYEDVTND
DYAQLGNNNDVNINFGNIDSPYIIKVISKYDPNKDDYTTIQQTVTMQTTINEYTGEFRTASYDNTIAFSTSSGQGQGDLP

The query sequence (length=320) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1r17:A	321	320	1.0000	0.9969	1.0000	0.0	1r17:B
2	5cfa:B	328	327	0.5594	0.5457	0.5474	3.09e-100	5cf3:A, 5cfa:A
3	5wtb:C	323	325	0.5031	0.4985	0.4954	8.88e-90	5wtb:A, 5wtb:B, 5wtb:D
4	1n67:A	332	307	0.2844	0.2741	0.2964	9.05e-26	2vr3:A, 2vr3:B
5	8vdk:A	432	330	0.3187	0.2361	0.3091	7.60e-22
6	4jdz:B	445	316	0.3000	0.2157	0.3038	8.21e-19	4jdz:A, 4je0:A
7	3au0:A	339	278	0.2531	0.2389	0.2914	6.78e-17	3asw:A, 3at0:A, 4f1z:A, 4f20:A, 4f24:A, 4f27:A
8	4b60:A	299	265	0.1906	0.2040	0.2302	1.46e-08	4b60:B
9	6leb:A	315	245	0.2031	0.2063	0.2653	1.64e-04	6leb:B, 6lxs:A
10	5fjs:B	702	72	0.0719	0.0328	0.3194	0.24
11	5fjs:A	733	72	0.0719	0.0314	0.3194	0.25
12	7w2t:A	773	72	0.0719	0.0298	0.3194	0.27	5bvu:A, 5bx2:A, 5bx3:A, 5bx4:A, 5bx5:A, 7dks:A, 7dkt:A, 7dku:A, 7dkv:A, 7dkw:A, 7dkw:B, 7dkx:A, 7dky:A, 8i5o:A, 8i5p:A, 8i5p:B, 8i5q:A, 8i5q:B, 8i5r:A, 8i5s:A, 8i5t:A, 8i5u:A, 8jbo:A, 8jbo:B, 5ncx:A, 5npf:A, 5o0s:A, 5ost:A, 8r06:A, 7w2s:A, 7w2t:B, 7w2v:A, 7w2w:A, 7w2x:A
13	1hfe:L	396	59	0.0531	0.0429	0.2881	0.64	8bj7:A, 8bj8:A, 1e08:A, 1gx7:A, 1hfe:M, 6sg2:AAA
14	5dmp:A	169	82	0.0625	0.1183	0.2439	1.5
15	4g56:A	617	66	0.0594	0.0308	0.2879	1.5	4g56:C
16	7nmi:B	488	85	0.0625	0.0410	0.2353	2.9	1j55:A
17	7p70:A	407	85	0.0625	0.0491	0.2353	4.3	7pc4:A, 7qql:A
18	5n7d:A	423	85	0.0625	0.0473	0.2353	4.6	2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
19	7pc3:A	405	85	0.0625	0.0494	0.2353	4.8	2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
20	6t58:A	524	85	0.0625	0.0382	0.2353	5.2	3c1v:A, 3c1v:B, 3c1v:C, 3c1v:D, 4cfq:A, 4cfq:B, 4cfq:C, 4cfq:D, 4cfr:A, 3cga:A, 3cga:B, 7eq7:A, 4eto:B, 4hre:A, 4hre:C, 4hre:B, 4hre:D, 4hsz:A, 4hsz:B, 4hsz:C, 4hsz:D, 2hyu:A, 2hyv:A, 2hyw:A, 2hyw:B, 3ko0:A, 3ko0:C, 3ko0:B, 3ko0:D, 3ko0:J, 3ko0:I, 3ko0:E, 3ko0:H, 3ko0:K, 3ko0:S, 3ko0:L, 3ko0:N, 3ko0:M, 3ko0:P, 3ko0:O, 3ko0:R, 3ko0:T, 5lpu:A, 5lpu:B, 5lpu:C, 5lpu:D, 5lpx:A, 5lq0:A, 5lq0:B, 5lq2:A, 5lq2:B, 3m0w:I, 3m0w:A, 3m0w:E, 3m0w:H, 5n7g:B, 7psp:A, 7psp:B, 7psq:A, 7psq:C, 2q91:A, 2q91:B, 6t58:B, 4x9p:A, 1xjl:A, 1xjl:B, 7zvn:A, 7zvx:A, 7zvx:B, 3zwh:A
21	7p73:A	420	85	0.0625	0.0476	0.2353	5.2	8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
22	7pc5:A	405	85	0.0625	0.0494	0.2353	5.5
23	7qqn:C	414	85	0.0625	0.0483	0.2353	5.5	7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
24	7qqm:A	413	85	0.0625	0.0484	0.2353	5.7
25	7pcb:A	415	85	0.0625	0.0482	0.2353	6.3	7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
26	7ty0:D	485	49	0.0469	0.0309	0.3061	9.2	8ja5:A, 7txz:B, 2vwd:A, 2vwd:B, 8xc4:B

[Back]