BioLiP

>protein
GSMEQGFLPKGWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPA

The query sequence (length=43) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2m3o:W	43	43	1.0000	1.0000	1.0000	6.98e-28	2kpz:A, 2kq0:A, 2mpt:A, 4n7h:A
2	2laj:A	40	39	0.7442	0.8000	0.8205	4.12e-19
3	4lcd:A	419	32	0.4884	0.0501	0.6562	1.53e-10	4lcd:B
4	2jmf:A	43	40	0.4884	0.4884	0.5250	2.36e-10
5	2djy:A	42	40	0.4651	0.4762	0.5000	2.67e-10
6	1i5h:W	50	39	0.5116	0.4400	0.5641	7.91e-10
7	5dws:C	40	33	0.4651	0.5000	0.6061	1.49e-09
8	2ez5:W	46	38	0.5116	0.4783	0.5789	1.52e-09
9	2kxq:A	90	37	0.4651	0.2222	0.5405	1.72e-09	2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
10	2kxq:A	90	32	0.3023	0.1444	0.4062	0.001	2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
11	2lb1:A	35	34	0.4651	0.5714	0.5882	2.34e-09	2ltx:A
12	5cq2:A	76	33	0.4651	0.2632	0.6061	4.65e-09	5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
13	5cq2:A	76	31	0.4186	0.2368	0.5806	2.76e-08	5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
14	6jjz:B	96	32	0.4419	0.1979	0.5938	6.67e-09	6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
15	6jjz:B	96	33	0.2791	0.1250	0.3636	0.22	6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
16	2n8t:A	39	33	0.3721	0.4103	0.4848	2.18e-08
17	6jjy:A	128	33	0.4419	0.1484	0.5758	2.21e-07	6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
18	6jjy:A	128	31	0.3488	0.1172	0.4839	4.24e-06	6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
19	2ltv:A	36	34	0.3953	0.4722	0.5000	5.84e-07	2law:A
20	7lp2:E	37	30	0.3488	0.4054	0.5000	1.37e-06	2lb2:A, 7lp2:A, 7lp2:C, 2lty:A
21	1jmq:A	46	31	0.3488	0.3261	0.4839	2.60e-06	1k5r:A, 1k9q:A, 1k9r:A, 2lax:A, 2lay:A, 2ltw:A
22	1eg4:A	260	28	0.2791	0.0462	0.4286	3.16e-05
23	7lp3:A	37	32	0.3256	0.3784	0.4375	1.47e-04	7lp3:C
24	8pxx:A	99	33	0.3256	0.1414	0.4242	0.003	2dyf:A
25	8pxx:A	99	27	0.1628	0.0707	0.2593	1.3	2dyf:A
26	2nc3:A	33	30	0.2791	0.3636	0.4000	0.010	2nc4:A, 2nc5:A, 2nc6:A
27	8sg2:A	163	31	0.3023	0.0798	0.4194	0.015	6dun:A, 6dun:B, 7efj:A, 7efx:A, 7ekv:A, 7f0m:A, 7f0m:C, 7f0m:B, 7f0m:D, 1f8a:B, 4gwv:A, 3i6c:A, 3i6c:B, 1i8g:B, 1i8h:B, 3ikd:A, 3ikd:B, 3ikg:A, 3ikg:B, 9inr:A, 9inr:B, 2itk:A, 3jyj:A, 3jyj:B, 3kab:A, 3kac:A, 3kac:B, 3kad:A, 3kaf:A, 3kag:A, 3kah:A, 3kai:A, 3kce:A, 2lb3:A, 2n1o:A, 1nmw:A, 3ntp:A, 6o33:A, 6o34:A, 3odk:A, 3oob:A, 1pin:A, 2q5a:A, 3tc5:A, 3tcz:A, 3tdb:A, 4tns:A, 4tyo:A, 4tyo:B, 5uy9:A, 6vaj:A, 3wh0:A, 2xp3:A, 2xp4:A, 2xp5:A, 2xp6:A, 2xp7:A, 2xp8:A, 2xp9:A, 2xpa:A, 2xpb:A
28	7olc:SE	261	34	0.2558	0.0421	0.3235	0.47	7old:SE, 8oo0:SE, 5oql:m, 7r81:F2, 6rxu:Cb, 6rxv:Cb, 6rxx:Cb, 6rxz:Cb, 7z3n:SE, 7z3o:SE
29	4bts:AW	259	25	0.1860	0.0309	0.3200	0.65	4bts:BW, 4bts:CW, 4bts:DW, 5jpq:p, 4v5o:AW, 4v5o:BW
30	7kuy:E	338	10	0.1628	0.0207	0.7000	2.5	5bkf:E
31	4gr5:C	457	36	0.3023	0.0284	0.3611	3.5	4gr5:A, 4gr5:B, 4gr5:D
32	8tl6:B	353	12	0.1395	0.0170	0.5000	3.6
33	6r6u:A	458	41	0.2558	0.0240	0.2683	3.9	6r6u:B
34	2jup:W	37	27	0.1628	0.1892	0.2593	4.2	2rly:W, 2rm0:W
35	7jmr:A	224	35	0.3721	0.0714	0.4571	4.5	7jmv:A
36	7s05:B	437	30	0.2791	0.0275	0.4000	4.7	7s05:A
37	3ejw:A	315	28	0.2093	0.0286	0.3214	6.7	3ejw:B
38	6xyw:Bw	337	32	0.2558	0.0326	0.3438	9.6
39	8fe1:E	346	9	0.1395	0.0173	0.6667	9.9	5bkg:E, 8dn5:E, 7l31:E, 7mly:E, 7tu9:E

[Back]