Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GSKVFVGRCTEDMTAEELQQFFCQYGEVVDVFIPKPFRAFAFVTFADDKVAQSLCGEDLIIKGISVHISNAE

The query sequence (length=72) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3d2w:A 72 72 1.0000 1.0000 1.0000 7.50e-49
2 4bs2:A 174 70 0.8472 0.3506 0.8714 1.87e-41 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
3 4bs2:A 174 55 0.1944 0.0805 0.2545 3.0 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
4 5x3z:A 96 58 0.2500 0.1875 0.3103 1.54e-05
5 2mb0:B 95 74 0.3611 0.2737 0.3514 2.62e-05
6 2i2y:A 150 74 0.3333 0.1600 0.3243 5.63e-05 9asq:H, 5bmg:A, 5bmg:B, 5bmg:H, 5bmg:D, 5bmg:E, 5bmg:F, 5bmg:G, 5bmh:A, 3v3x:C, 3v3x:D
7 9gpj:A 184 50 0.2917 0.1141 0.4200 1.48e-04 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
8 9gpj:A 184 49 0.2361 0.0924 0.3469 0.022 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
9 5ifm:C 256 51 0.2500 0.0703 0.3529 2.05e-04 5ifm:A
10 2rs2:A 84 61 0.3472 0.2976 0.4098 2.34e-04
11 2cjk:A 167 77 0.3194 0.1377 0.2987 3.61e-04 2km8:C
12 2cjk:A 167 48 0.2361 0.1018 0.3542 0.002 2km8:C
13 7uj1:B 270 50 0.2361 0.0630 0.3400 3.76e-04 7pu5:B, 7pu5:D, 7pu5:H, 7pu5:J, 7pu5:L, 7sp0:B, 7uj1:A
14 1wtb:A 79 58 0.2222 0.2025 0.2759 4.07e-04 1x0f:A
15 2n82:B 104 62 0.2639 0.1827 0.3065 4.39e-04 2err:A, 7vrl:B
16 2leb:A 101 52 0.2778 0.1980 0.3846 4.77e-04 2lec:A
17 6n7p:A 186 68 0.2639 0.1022 0.2794 7.90e-04 6n7r:A, 6n7x:A, 7oqc:B, 7oqe:B, 8w2o:A, 5zwn:Q
18 6g90:B 193 68 0.2639 0.0984 0.2794 8.13e-04
19 4a8x:A 88 64 0.2361 0.1932 0.2656 0.002
20 5en1:A 184 49 0.2222 0.0870 0.3265 0.005 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
21 5en1:A 184 76 0.3194 0.1250 0.3026 0.007 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
22 2mgz:B 105 74 0.2500 0.1714 0.2432 0.006 4ch1:A, 4cio:A, 2ru3:A
23 6hpj:B 84 60 0.2500 0.2143 0.3000 0.007
24 6jvx:A 87 76 0.2778 0.2299 0.2632 0.007 6jvy:A
25 7dco:4 174 57 0.2361 0.0977 0.2982 0.009 6g90:R, 5gm6:e, 5nrl:R, 7oqb:R, 7oqe:R, 5zwm:4
26 2xb2:D 89 75 0.3056 0.2472 0.2933 0.009 2xb2:Z
27 7s7b:C 79 50 0.2778 0.2532 0.4000 0.020 7s7b:G, 7s7c:C
28 1rk8:A 87 75 0.2778 0.2299 0.2667 0.024
29 7q4l:A 227 57 0.2222 0.0705 0.2807 0.037
30 2xs2:A 87 72 0.2778 0.2299 0.2778 0.052 2xs5:A, 2xs5:B, 2xs7:A
31 7zew:A 117 75 0.2917 0.1795 0.2800 0.067 7zex:A
32 2n7c:A 89 58 0.2083 0.1685 0.2586 0.076
33 5x8p:v 190 76 0.2222 0.0842 0.2105 0.12 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
34 5mqf:o 223 55 0.2500 0.0807 0.3273 0.13 6id1:y, 7w59:y, 7w5a:y, 7w5b:y
35 4lmz:A 176 56 0.2361 0.0966 0.3036 0.28 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
36 8idf:A 459 44 0.1944 0.0305 0.3182 0.29
37 2mkc:A 118 51 0.1528 0.0932 0.2157 0.42 2my3:A
38 7dco:X 128 51 0.1528 0.0859 0.2157 0.44 5gm6:V, 5zwm:X
39 1fnx:H 174 28 0.1111 0.0460 0.2857 0.45 1fxl:A, 1g2e:A
40 3pvz:A 372 25 0.1528 0.0296 0.4400 0.46 3pvz:C, 3pvz:D
41 7ohx:o 112 66 0.1944 0.1250 0.2121 0.48
42 8i0v:4 161 55 0.2222 0.0994 0.2909 0.52
43 6c0f:o 133 66 0.1944 0.1053 0.2121 0.60 7btb:o, 6cb1:o, 8e5t:o, 6elz:o, 6em1:o, 6em3:o, 6em4:o, 6em5:o, 3jct:o, 6m62:o, 7nac:o, 7ohp:o, 7ohq:o, 7ohr:o, 7ohs:o, 7ohv:o, 7ohw:o, 7r6q:o, 7r7a:o, 7u0h:o, 7uoo:o, 7uqb:o, 7uqz:o, 7v08:o, 8v83:o, 8v84:o, 8v87:o, 6ylx:o, 6yly:o, 5z3g:E
44 8xxm:3G 84 59 0.1944 0.1667 0.2373 0.63 5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
45 2l41:A 77 47 0.1806 0.1688 0.2766 0.65 2xnr:A
46 6xh2:A 93 43 0.1528 0.1183 0.2558 0.65 6cmn:A, 3k0j:D, 3k0j:C, 6xh0:A, 6xh1:A, 6xh3:A
47 5ja2:A 1238 23 0.1389 0.0081 0.4348 0.84 5ja1:A, 5t3d:A
48 7zlg:A 662 20 0.1528 0.0166 0.5500 1.4 7zli:A, 7zlj:A
49 8ch6:U 295 51 0.1806 0.0441 0.2549 1.4 7a5p:P, 8c6j:M, 6ff4:P, 6ff7:P, 9fmd:O, 8i0p:O, 8i0r:O, 8i0s:O, 8i0t:O, 8i0u:O, 8i0v:O, 8i0w:O, 6icz:O, 6id0:O, 6id1:O, 5mqf:P, 6qdv:M, 7qtt:U, 8ro2:O, 7w59:O, 7w5a:O, 7w5b:O, 5xjc:O, 5yzg:O, 5z56:O, 5z57:O, 6zym:P
50 8esq:o 137 54 0.1667 0.0876 0.2222 2.1 8esr:o, 8etg:o, 8eth:o, 8eti:o, 8eup:o, 8euy:o, 8ev3:o
51 7abi:P 237 51 0.1806 0.0549 0.2549 2.2 7aav:P, 7abg:P
52 7dkm:A 306 47 0.2222 0.0523 0.3404 2.5 7cvp:B, 6cwa:A, 6cwa:B, 7dkm:B, 7ewh:A, 7ewh:B, 2g76:A, 2g76:B, 5n53:B, 5n53:A, 5n6c:A, 5n6c:B, 5nzo:B, 5nzo:A, 5nzp:B, 5nzp:A, 5nzq:B, 5nzq:A, 5ofm:B, 5ofm:A, 5ofv:B, 5ofv:A, 5ofw:B, 5ofw:A, 6plf:A, 6plf:B, 6plg:A, 6plg:B, 6plg:C, 6plg:D, 6plg:E, 6plg:F, 6plg:G, 6plg:H, 6rih:A, 6rih:B, 6rj2:A, 6rj2:B, 6rj3:A, 6rj3:B, 6rj5:A, 6rj5:B, 6rj6:A, 6rj6:B, 7va1:B, 7va1:A, 7va1:C, 7va1:D
53 7cvp:A 254 47 0.2222 0.0630 0.3404 2.6
54 3hdi:A 414 45 0.1667 0.0290 0.2667 3.5 3hdi:B
55 7dvq:Y 140 51 0.1667 0.0857 0.2353 4.2 8i0p:Y, 8i0r:Y
56 8fru:L 202 45 0.1806 0.0644 0.2889 5.7 8br8:LM, 8brm:LM, 8bsi:LM, 8bsj:LM, 8btd:LM, 8btr:LM, 7pwg:L, 7pwo:L2
57 6qx9:1K 201 56 0.2083 0.0746 0.2679 5.8 7b0y:b, 4pjo:K, 4pjo:k, 4pjo:N, 4pjo:n, 8r08:1K, 7vpx:O
58 4ru5:C 602 20 0.1528 0.0183 0.5500 6.3 4ru5:A, 4ru5:B
59 1md9:A 536 43 0.1250 0.0168 0.2093 7.1 1mdb:A
60 4dzt:A 276 46 0.1944 0.0507 0.3043 9.7

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218