BioLiP

>protein
GSIKVAVVVCLLRGQNVLLGRRRLGDSTFSLPSGHLEFGESFEECAARELKEETDLDIGKIELLTVTNNLFSQYVAVFMR
AVLADPRQEPQNIEPEFCDGWGWYEWDNLPKPLFWPLDNVVQDGFNPFP

The query sequence (length=129) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6ypf:A	129	129	1.0000	1.0000	1.0000	1.39e-93
2	5gp0:I	139	133	0.6744	0.6259	0.6541	1.04e-59	6dbz:A, 6dbz:B, 6fl4:A, 6fl4:B, 5gp0:E, 5gp0:F, 5gp0:A, 5wwd:A, 5wwd:B
3	7b66:A	161	121	0.3798	0.3043	0.4050	1.96e-24	7aom:A, 7aom:B, 7aop:A, 7b63:A, 7b63:B, 7b64:A, 7b65:A, 7b65:B, 7b66:B, 7b66:C, 7b66:D, 7b67:A, 7b67:B, 7b7v:A, 7b7v:B, 5bon:A, 5bon:B, 5bon:C, 5bon:D, 5bon:E, 5bon:F, 5bon:G, 5bon:H, 5lpg:A, 5lpg:B, 7nr6:A, 7nr6:B, 7r0d:AAA, 7r0d:BBB, 6t5j:A, 6t5j:B
4	4s2v:A	139	65	0.1783	0.1655	0.3538	2.28e-06
5	2gb5:A	265	110	0.2248	0.1094	0.2636	2.56e-06	7e44:A, 7e44:B, 7e44:E, 7e44:F, 2gb5:B, 5isy:A, 5isy:C, 5iw4:A, 5iw4:B, 5iw5:B, 5iw5:A, 1vk6:A
6	6vcr:A	161	65	0.1783	0.1429	0.3538	3.25e-06	6d1v:B, 4s2x:A, 4s2y:A, 7sp3:A, 6vck:B, 6vcl:B, 6vcm:B, 6vcn:A, 6vco:A, 6vcp:A, 6vcq:A
7	5mzg:A	155	123	0.2403	0.2000	0.2520	1.70e-04	6ehh:A, 6ehh:B, 6ehh:C, 6ehh:D, 5mze:A, 5mze:B, 5mze:C, 5mze:D, 5mzg:B
8	2b06:A	150	88	0.1938	0.1667	0.2841	1.70e-04
9	6aa3:A	162	126	0.2558	0.2037	0.2619	4.88e-04	8a07:A, 8a07:B, 8a0s:A, 8a0t:A, 8a0t:B, 8a34:A, 8a34:B, 8a3a:A, 6aa4:A, 6aa5:A, 5ans:A, 5ant:A, 5ant:B, 5ant:C, 5anu:A, 5anv:A, 5anw:A, 4c9w:A, 4c9x:A, 6eq2:A, 6eq3:A, 6eq4:A, 6eq5:A, 6eq6:A, 6eq7:A, 6f1x:A, 6f1x:B, 6f20:A, 6f20:B, 6f22:A, 6f22:B, 6f23:A, 6f23:B, 5fsi:A, 5fsk:A, 5fsl:A, 5fsm:A, 5fsn:A, 5fso:A, 5ghi:A, 5ghi:B, 5ghj:A, 5ghj:B, 5ghm:A, 5ghm:B, 5ghn:A, 5ghn:B, 5gho:B, 5ghq:A, 5ghq:B, 6gle:A, 6glg:A, 6glh:A, 6gli:A, 6glj:A, 6gll:A, 6gll:B, 6glm:A, 6gln:A, 6glp:A, 6glp:B, 6glq:A, 6glq:B, 6glr:A, 6glr:B, 6gls:A, 6gls:B, 6glu:A, 6glv:A, 8i18:A, 8i18:B, 8i19:A, 8i19:B, 8i1a:A, 8i1a:B, 8i1d:A, 8i1d:B, 8i1e:A, 8i1e:B, 8i1f:A, 8i1f:B, 8i1g:A, 8i1i:A, 8i1i:B, 8i1j:A, 8i1j:B, 8i8s:A, 8i8s:B, 8i8t:A, 8i8t:B, 6ijy:A, 6ijy:B, 6ili:A, 6ili:B, 6imz:A, 6jvg:A, 6jvg:B, 6jvh:A, 6jvh:B, 6jvi:A, 6jvi:B, 6jvj:A, 6jvj:B, 6jvk:A, 6jvl:A, 6jvm:A, 6jvn:A, 6jvn:B, 6jvo:A, 6jvo:B, 6jvp:A, 6jvp:B, 6jvq:A, 6jvq:B, 6jvr:A, 6jvs:A, 6jvt:A, 6jvt:B, 7n03:A, 4n1t:A, 4n1u:A, 4n1u:B, 7n13:A, 7n13:B, 5ngr:A, 5ngr:B, 5ngs:A, 5ngs:B, 5ngt:A, 5nhy:A, 5nhy:B, 5otm:A, 5otm:B, 6qvo:A, 6qvo:B, 6qvo:C, 6qvo:D, 6us2:A, 6us3:A, 6us4:A, 3whw:A, 3whw:B, 5ws7:A, 5ws7:B, 3zr0:A, 3zr0:B
10	1su2:A	159	71	0.1938	0.1572	0.3521	0.001	1su2:B, 1sz3:A, 1sz3:B
11	6o3p:B	320	53	0.1318	0.0531	0.3208	0.002
12	5qoh:A	149	44	0.1473	0.1275	0.4318	0.002	5qoi:A, 5qoj:A, 5qok:A, 5qom:A, 5qon:A, 5qoo:A, 5qop:A, 5qoq:A, 5qor:A, 5qos:A, 5qot:A, 5qou:A, 5qov:A, 5qow:A, 5qox:A, 5qoy:A, 5qoz:A, 5qp0:A, 5qp1:A, 5qp2:A, 5qp3:A, 5qp4:A, 5qp5:A, 5qp6:A, 5qp7:A, 5qp8:A, 5qp9:A, 5qpa:A, 5qpb:A
13	1vc8:A	126	42	0.1705	0.1746	0.5238	0.003	1vc8:B, 1vc9:A, 1vc9:B
14	6scx:A	328	53	0.1318	0.0518	0.3208	0.004	6o3p:A, 6scx:B, 6scx:C
15	4nfw:F	153	55	0.1628	0.1373	0.3818	0.009	4nfw:A, 4nfw:B, 4nfw:C, 4nfw:D, 4nfw:E, 4nfw:G, 4nfw:H, 4nfw:J, 4nfw:K, 3shd:A, 3shd:B, 3shd:C, 3shd:D, 3shd:E, 3shd:F, 3shd:G, 3shd:H, 3shd:I, 3shd:J, 3shd:K, 3shd:L
16	1ppx:A	129	58	0.1395	0.1395	0.3103	0.013	3a6t:A, 3a6u:A, 3a6v:A, 3a6v:B, 1pun:A, 1puq:A, 1pus:A, 1tum:A, 7ww5:A, 7ww6:A, 7ww7:A, 7ww8:A, 7ww9:A, 7wwa:A, 7x9h:A, 7x9i:A, 7x9j:A, 7x9k:A, 7x9l:A, 7x9n:A, 7x9o:A
17	5otn:A	156	119	0.2326	0.1923	0.2521	0.015	5hzx:A, 5hzx:B
18	3cng:C	178	83	0.2016	0.1461	0.3133	0.019	3cng:A, 3cng:B, 3cng:D
19	6nci:B	197	76	0.1395	0.0914	0.2368	0.022	6nch:B
20	1k26:A	150	48	0.1318	0.1133	0.3542	0.033
21	3ffu:A	133	65	0.1783	0.1729	0.3538	0.034	3ef5:A, 3ef5:B, 3ffu:B
22	2o1c:A	147	56	0.1318	0.1156	0.3036	0.036	2o1c:B, 2o1c:C, 2o5w:A, 2o5w:C, 5u7e:A, 5u7f:A, 5u7h:A
23	2r5w:B	345	61	0.1395	0.0522	0.2951	0.048	2qjt:B, 2qjt:A, 2r5w:A
24	3hhj:B	131	129	0.2946	0.2901	0.2946	0.051	3hhj:A
25	4hvy:A	135	92	0.2016	0.1926	0.2826	0.070
26	1v8m:A	159	57	0.1783	0.1447	0.4035	0.072	1v8l:A, 1v8r:A, 1v8s:A, 1v8t:A, 1v8v:A, 1v8y:A, 3x0k:A, 3x0l:A, 3x0m:A, 3x0n:A, 3x0o:A, 3x0p:A, 3x0q:A, 3x0r:A
27	1jkn:A	165	56	0.1240	0.0970	0.2857	0.095
28	2qjo:B	336	52	0.1395	0.0536	0.3462	0.095	2qjo:A, 2qjo:C
29	5zrk:A	129	86	0.1783	0.1783	0.2674	0.11	5zrg:A, 5zrh:A, 5zri:A, 5zrk:B, 5zrl:A, 5zrl:B, 5zro:A, 5zro:B
30	4mpo:B	148	74	0.2016	0.1757	0.3514	0.12	4mpo:A, 4mpo:C, 4mpo:D, 4mpo:E, 4mpo:F, 4mpo:G, 4mpo:H
31	1vhz:A	186	123	0.2403	0.1667	0.2520	0.14	1vhz:B
32	3r03:A	131	45	0.1550	0.1527	0.4444	0.19
33	7sez:A	210	66	0.1783	0.1095	0.3485	0.37	7sf0:A, 7t7h:A, 7t7h:B
34	5gg6:B	295	26	0.1085	0.0475	0.5385	0.46	5gg6:A, 5gg7:A, 5gg7:B, 5gg8:A, 5gg9:A, 5gga:A, 5ggb:A, 5ggc:A, 5ggc:B, 5ggd:A, 5ggd:B, 6m65:A, 6m69:A, 6m6y:A, 6m72:A, 5xd1:A, 5xd2:A, 5xd3:A, 5xd4:A, 5xd5:B, 5xd5:A
35	3i7v:A	134	86	0.1938	0.1866	0.2907	0.47	3i7v:B
36	4jzt:A	158	70	0.1628	0.1329	0.3000	0.50	4jzu:A, 4jzv:A, 4jzv:B
37	1mqw:A	200	89	0.2016	0.1300	0.2921	0.84	1mk1:A, 1mqe:A, 1mr2:A
38	9b21:A	205	32	0.0930	0.0585	0.3750	0.84	9b20:A, 9b20:B, 9b21:B, 9b22:A, 9b22:B
39	2yvm:A	182	43	0.1318	0.0934	0.3953	1.5	2yvo:A, 2yvp:A
40	2qkm:B	266	43	0.1163	0.0564	0.3488	1.6	5j3t:B, 5kq4:E, 5kq4:B, 5n2v:B, 5n2v:E, 2qkm:F
41	3bm4:A	197	56	0.1628	0.1066	0.3750	2.2	3ac9:A, 3ac9:B, 3aca:A, 3aca:B, 3bm4:B, 2dsc:A, 2dsc:B, 2dsd:A, 2dsd:B, 6gru:A, 6gru:B, 6gru:C, 6gru:D, 3l85:A, 3l85:B, 5nqr:A, 5nqr:B, 5nwh:A, 5nwh:B, 8ptt:A, 8ptt:B, 8ptt:C, 8ptt:D, 5qj4:A, 5qj4:B, 5qj4:C, 5qj4:D, 5qj5:A, 5qj5:B, 5qj5:C, 5qj5:D, 5qj6:A, 5qj6:B, 5qj6:C, 5qj6:D, 5qj7:A, 5qj7:B, 5qj7:C, 5qj7:D, 5qj8:A, 5qj8:B, 5qj8:C, 5qj9:A, 5qj9:B, 5qj9:C, 5qj9:D, 5qja:A, 5qja:B, 5qja:C, 5qja:D, 5qjb:A, 5qjb:B, 5qjb:C, 5qjb:D, 5qjc:A, 5qjc:B, 5qjc:C, 5qjc:D, 5qjd:A, 5qjd:B, 5qjd:C, 5qjd:D, 5qje:A, 5qje:B, 5qje:C, 5qje:D, 5qjf:A, 5qjf:B, 5qjf:C, 5qjf:D, 5qjg:A, 5qjg:B, 5qjg:C, 5qjg:D, 5qjh:A, 5qjh:B, 5qjh:C, 5qji:A, 5qji:B, 5qji:C, 5qji:D, 5qjj:A, 5qjj:B, 5qjj:C, 5qjj:D, 5qjk:A, 5qjk:B, 5qjk:C, 5qjk:D, 5qjl:A, 5qjl:B, 5qjl:C, 5qjl:D, 5qjm:A, 5qjm:B, 5qjm:C, 5qjm:D, 5qjn:A, 5qjn:B, 5qjn:C, 5qjo:A, 5qjo:B, 5qjo:C, 5qjo:D, 5qjp:A, 5qjp:B, 5qjp:C, 5qjp:D, 5qjq:A, 5qjq:B, 5qjq:C, 5qjq:D, 5qjr:A, 5qjr:B, 5qjr:C, 5qjr:D, 5qjs:A, 5qjs:B, 5qjs:C, 5qjs:D, 5qjt:A, 5qjt:B, 5qjt:C, 5qjt:D, 5qju:A, 5qju:B, 5qju:C, 5qju:D, 5qjv:A, 5qjv:B, 5qjv:C, 5qjv:D, 5qjw:A, 5qjw:B, 5qjw:C, 5qjw:D, 5qjx:A, 5qjx:B, 5qjx:C, 5qjx:D, 5qjy:A, 5qjy:B, 5qjy:C, 5qjy:D, 5qjz:A, 5qjz:B, 5qjz:C, 5qjz:D, 5qk0:A, 5qk0:B, 5qk0:C, 5qk0:D, 5qk1:A, 5qk1:B, 5qk1:C, 5qk1:D, 5qk2:A, 5qk2:B, 5qk2:C, 5qk2:D, 5qk3:A, 5qk3:B, 5qk3:C, 5qk3:D, 5qk4:A, 5qk4:B, 5qk4:C, 5qk4:D, 5qk5:A, 5qk5:B, 5qk5:C, 5qk5:D, 5qk6:A, 5qk6:B, 5qk6:C, 5qk6:D, 5qk7:A, 5qk7:B, 5qk7:C, 5qk7:D, 5qk8:A, 5qk8:B, 5qk8:C, 5qk8:D, 5qk9:A, 5qk9:B, 5qk9:C, 5qk9:D, 5qka:A, 5qka:B, 5qka:C, 5qka:D, 5qkb:A, 5qkb:B, 5qkb:C, 5qkb:D, 5qtl:A, 5qtl:B, 5qtl:C, 5qtl:D, 5qtm:A, 5qtm:B, 5qtm:C, 5qtm:D, 5qtn:A, 5qtn:B, 5qtn:C, 5qtn:D, 5qto:A, 5qto:B, 5qto:C, 5qto:D, 5qtp:A, 5qtp:B, 5qtp:C, 5qtp:D, 5qtq:A, 5qtq:B, 5qtq:C, 5qtq:D, 5qtr:A, 5qtr:B, 5qtr:C, 5qtr:D, 5qts:A, 5qts:B, 5qts:C, 5qts:D, 8rdz:A, 8rdz:C, 8rdz:B, 8rdz:D, 8riy:AAA, 8riy:BBB
42	1xsc:A	153	40	0.1008	0.0850	0.3250	2.9	4ick:B, 4ijx:A, 4ijx:B
43	2oap:2	503	63	0.1395	0.0358	0.2857	3.7	2oap:1, 2oaq:2
44	8sr8:A	1353	76	0.1783	0.0170	0.3026	4.9	8sr8:B, 8sr8:C, 8sr8:D, 8sr9:A, 8sr9:B, 8sr9:C, 8sr9:D, 8sra:A, 8sra:B, 8sra:C, 8sra:D, 8srb:A, 8srb:B, 8srb:C, 8srb:D
45	8vig:A	436	64	0.1550	0.0459	0.3125	7.0
46	6am0:A	260	41	0.1008	0.0500	0.3171	9.5	6am0:E, 5lop:A

[Back]