BioLiP

>protein
GSHMASSRQKYAEEELEQVREALRKAEKELESHSSWYAPEALQKWLQLTHEVEVQYYNIKKQNAEKQLLVAKEGAEKIKK
KR

The query sequence (length=82) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2mak:A	82	82	1.0000	1.0000	1.0000	3.06e-53	2mak:C
2	2bog:X	280	54	0.1951	0.0571	0.2963	0.35	2bod:X, 2bof:X
3	1qzw:A	432	46	0.1707	0.0324	0.3043	1.1	3kl4:A, 5l3s:A, 5l3s:C, 5l3s:E, 5l3s:G, 5l3v:A, 5l3v:B, 1qzw:C, 1qzw:E, 1qzw:G, 3zn8:M
4	1cm8:A	329	34	0.1341	0.0334	0.3235	1.2	1cm8:B
5	7nnl:B	682	40	0.1585	0.0191	0.3250	2.8	2a00:A, 2a29:A, 7bgy:B, 7bh1:B, 7bh2:B, 6hra:B, 6hrb:B, 7lc3:B, 7lc6:B, 5mrw:B, 5mrw:F, 5mrw:J, 7nnp:B, 7zrd:B, 7zre:B, 7zrg:B, 7zrh:B, 7zri:B, 7zrj:B, 7zrk:B, 7zrl:B, 7zrm:B
6	9iuk:A	1335	50	0.2195	0.0135	0.3600	3.0	9iul:A, 9ium:A
7	4yji:A	490	35	0.1463	0.0245	0.3429	3.4
8	4gox:A	275	63	0.1829	0.0545	0.2381	5.2
9	8sy6:J	1269	37	0.1463	0.0095	0.3243	7.8
10	5r7x:B	344	59	0.2317	0.0552	0.3220	8.3	4c8d:A, 5r7x:A, 5raa:A, 5raa:B, 5rab:A, 5rab:B, 5rac:A, 5rac:B, 5rad:A, 5rad:B, 5rae:A, 5rae:B, 5raf:A, 5raf:B, 5rag:A, 5rag:B, 5rah:A, 5rah:B, 5rai:A, 5rai:B, 5raj:A, 5raj:B, 5rak:A, 5rak:B, 5ral:A, 5ral:B, 5ram:A, 5ram:B, 5ran:A, 5ran:B, 5rao:A, 5rao:B, 5rap:A, 5rap:B, 5raq:A, 5raq:B, 5rar:A, 5rar:B, 5ras:A, 5ras:B, 5rau:A, 5rau:B, 5rav:A, 5rav:B, 5raw:A, 5raw:B, 5rax:A, 5rax:B, 5ray:A, 5ray:B, 5raz:A, 5raz:B, 5rb0:A, 5rb0:B, 5rb1:A, 5rb1:B, 5rb2:A, 5rb2:B, 5rb3:A, 5rb3:B, 5rb4:A, 5rb4:B, 5rb5:A, 5rb5:B, 5rb6:A, 5rb6:B, 5rb7:A, 5rb7:B, 6rbj:A, 6rbj:B, 6ydv:AAA, 6ydv:BBB
11	7dxi:A	371	44	0.1341	0.0296	0.2500	9.3	7dxi:B
12	8umc:A	322	40	0.1220	0.0311	0.2500	9.3	8umc:C

[Back]