BioLiP

>protein
GSGAVKLSVSYRNGTLFIMVMHIKDLVTEDGADPNPYVKTYLLPDTHKTSKRKTKISRKTRNPTFNEMLVYSGYSKETLR
QRELQLSVLSAESLRENFFLGGITLPLKDFNLSKETVKWYQLTA

The query sequence (length=124) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6bty:B	128	122	0.9597	0.9297	0.9754	3.23e-87	2b3r:A, 2b3r:B, 6btz:A, 6btz:D, 6btz:B, 6btz:C, 6bu0:A, 6bu0:B, 6bu0:C
2	6ank:B	263	123	0.3468	0.1635	0.3496	3.51e-16	6anj:A, 6ank:A, 6lcy:A, 3n5a:A
3	6ank:B	263	109	0.2419	0.1141	0.2752	2.08e-04	6anj:A, 6ank:A, 6lcy:A, 3n5a:A
4	4lt7:A	128	126	0.3468	0.3359	0.3413	1.78e-15	2k3h:A, 4np9:A, 4ns0:A
5	4lcv:C	129	109	0.3145	0.3023	0.3578	1.31e-14
6	4ldc:A	149	120	0.3145	0.2617	0.3250	3.06e-13
7	5h4z:A	129	119	0.2823	0.2713	0.2941	4.61e-12	5h4y:A, 5h4z:B
8	5cch:E	280	120	0.2903	0.1286	0.3000	1.39e-10	1byn:A, 8c5h:S, 5ccg:E, 5ccg:F, 5ccg:K, 5cch:F, 5cci:E, 5cci:F, 3f05:A, 1k5w:A, 5kj7:E, 5kj7:F, 5kj7:K, 5kj8:E, 5kj8:F, 5kj8:K, 2lha:A, 6mti:1, 6mti:2, 6mti:3, 6mti:4, 6mti:5, 6mti:6, 1tjx:A, 7tx9:A, 7u4q:A, 1uov:A, 1uow:A, 4v11:A, 5vfe:A, 5vfe:B, 5vff:A, 5vfg:A, 5w5c:F, 2yoa:A, 2yoa:B
9	5cch:E	280	104	0.2258	0.1000	0.2692	0.32	1byn:A, 8c5h:S, 5ccg:E, 5ccg:F, 5ccg:K, 5cch:F, 5cci:E, 5cci:F, 3f05:A, 1k5w:A, 5kj7:E, 5kj7:F, 5kj7:K, 5kj8:E, 5kj8:F, 5kj8:K, 2lha:A, 6mti:1, 6mti:2, 6mti:3, 6mti:4, 6mti:5, 6mti:6, 1tjx:A, 7tx9:A, 7u4q:A, 1uov:A, 1uow:A, 4v11:A, 5vfe:A, 5vfe:B, 5vff:A, 5vfg:A, 5w5c:F, 2yoa:A, 2yoa:B
10	3hn8:A	279	107	0.3065	0.1362	0.3551	3.03e-10	1dqv:A, 3hn8:B, 3hn8:C
11	3hn8:A	279	67	0.1855	0.0824	0.3433	6.97e-07	1dqv:A, 3hn8:B, 3hn8:C
12	2cm6:A	149	135	0.3306	0.2752	0.3037	1.63e-09	2cm5:A, 2cm6:B, 5lo8:A, 5lo8:B, 5lob:A, 5lob:B, 5lob:C, 5low:A, 5low:B, 5low:C, 5low:H, 5low:I, 5low:J
13	6uwa:A	187	124	0.2903	0.1925	0.2903	3.72e-09	1dsy:A, 3gpe:A, 2nce:A, 3twy:A, 5w4s:A
14	3pfq:A	523	112	0.2903	0.0688	0.3214	1.28e-08	1a25:A, 1a25:B, 2i0e:A, 2i0e:B
15	2uzp:A	142	94	0.2339	0.2042	0.3085	4.09e-08	2uzp:B, 2uzp:C
16	1w15:A	132	105	0.2500	0.2348	0.2952	3.45e-06
17	4ihb:E	126	59	0.1371	0.1349	0.2881	0.017	7jof:A, 7jof:B, 7jof:C, 7jof:D
18	3b7y:A	144	78	0.1774	0.1528	0.2821	0.052
19	7atp:A	129	87	0.2339	0.2248	0.3333	0.32
20	5b2o:A	1455	55	0.1452	0.0124	0.3273	3.1	5b2p:A, 5b2q:A
21	3fi0:G	302	55	0.1613	0.0662	0.3636	5.8	3fhj:A, 3fhj:B, 3fhj:E, 3fhj:F, 3fi0:A, 3fi0:B, 3fi0:C, 3fi0:D, 3fi0:E, 3fi0:F, 3fi0:H, 3fi0:I, 3fi0:J, 3fi0:K, 3fi0:L, 3fi0:M, 3fi0:N, 3fi0:O, 3fi0:P, 3fi0:Q, 3fi0:R
22	3sxq:A	519	36	0.0806	0.0193	0.2778	8.0	3sxq:B, 3ttb:A, 3ttb:B
23	6l7i:G	660	47	0.1210	0.0227	0.3191	8.3
24	2d3t:C	390	31	0.0887	0.0282	0.3548	9.0	2d3t:D, 1wdk:C, 1wdk:D, 1wdl:C, 1wdl:D, 1wdm:C, 1wdm:D
25	4rhh:C	696	66	0.1290	0.0230	0.2424	9.5	4rhh:A, 4rhh:B, 4rhh:D

[Back]