BioLiP

>protein
GSFTPSGTTGTTKLTVTEKCQVRVGDLTVAKTRGQLTDAAPIGPVTVQALGCDARQVALKADTDNFEGKFFLISDNNRDK
LYVNIRPTDNSAWTTDNGVFYKNDVGSWGGIIGIYVDGQQTNTPPGNYTLTLTGGYWA

The query sequence (length=138) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2jkj:F	140	139	1.0000	0.9857	0.9928	5.02e-97	2jkj:A, 2jkj:B, 2jkj:C, 2jkj:D, 2jkj:E, 2jkl:A, 2jkl:B, 2jkl:C, 2jkl:D, 2jkl:F, 2jkl:E, 2jkn:A, 2jkn:B, 2jkn:C, 2jkn:D, 2jkn:E, 2jkn:F, 1usq:A, 1usq:B, 1usq:C, 1usq:D, 1usq:E, 1usq:F, 2w5p:A, 2w5p:B, 2w5p:C
2	3o6l:H	218	72	0.1594	0.1009	0.3056	0.17	3o6m:H
3	3fo9:H	218	79	0.1449	0.0917	0.2532	0.21	3bz4:B, 3bz4:D, 3bz4:F, 3bz4:H, 3c6s:B, 3c6s:D, 3c6s:F, 3c6s:H, 3fo9:B, 3ggw:B, 3ggw:D
4	8b8i:A	118	49	0.1087	0.1271	0.3061	0.22	8b8i:B, 8b8i:C, 8b8i:D, 8b8i:E, 8b8i:F, 8b8i:G, 8b8i:H
5	6vjt:H	223	39	0.1087	0.0673	0.3846	0.22
6	6nfn:J	219	66	0.1377	0.0868	0.2879	0.24	6nfn:H, 6nfn:N, 7uem:H, 7uem:D
7	7yue:A	225	48	0.1087	0.0667	0.3125	0.28	8h3c:D, 8h3c:B
8	7u0a:H	225	67	0.1449	0.0889	0.2985	0.33
9	6ct7:H	214	58	0.1304	0.0841	0.3103	0.42
10	8fcz:C	114	38	0.0942	0.1140	0.3421	0.44	8fd0:C, 8fd0:D, 8fd1:C
11	4wht:E	208	61	0.1087	0.0721	0.2459	0.45	4wht:A, 4wht:C, 4wht:G, 4wht:I, 4wht:K, 4wht:M, 4wht:O, 4wht:Q, 4wht:S, 4wht:U, 4wht:X, 4why:I, 4why:M, 4why:K, 4why:G
12	8cby:H	221	70	0.1304	0.0814	0.2571	0.48	8cbz:H, 8cc0:H, 8cc1:H
13	6x7w:A	222	75	0.1449	0.0901	0.2667	0.79	6x7w:H
14	7o33:H	215	61	0.1232	0.0791	0.2787	1.2
15	5dq9:H	222	78	0.1449	0.0901	0.2564	1.2	5dq9:A, 5dq9:C
16	7xld:B	125	52	0.1014	0.1120	0.2692	1.3	7xli:B
17	8fa7:H	230	44	0.1014	0.0609	0.3182	1.3	6axk:A, 8fa8:H, 8fan:A, 8fan:E, 8fat:C, 8fb5:A, 8fb5:C, 8fb5:E, 8fb5:G, 8fdd:A, 6ule:A, 7uym:H
18	8q6r:A	119	62	0.1159	0.1345	0.2581	1.5
19	8f9v:A	225	38	0.0942	0.0578	0.3421	1.6	8f9v:C, 8f9v:E, 8f9v:G, 8f9w:A, 8f9w:C, 8f9w:E, 8f9w:G
20	3ffd:A	210	73	0.1449	0.0952	0.2740	1.7
21	4onf:H	212	71	0.1449	0.0943	0.2817	1.8	4ong:H
22	4hih:B	203	38	0.0942	0.0640	0.3421	2.0	4hih:D, 4hii:B, 4hii:D, 4hij:B
23	7uny:C	127	49	0.1014	0.1102	0.2857	2.2	7uny:B
24	7tow:H	236	42	0.1014	0.0593	0.3333	2.2	7tow:A
25	6w00:H	224	51	0.1159	0.0714	0.3137	2.2	6wg2:H, 6wg2:I
26	4hix:H	219	39	0.0870	0.0548	0.3077	2.3	4ojf:H
27	4jg1:H	225	39	0.0870	0.0533	0.3077	2.4	3hr5:H, 3hr5:B, 3hr5:I, 3hr5:J, 4jfx:H, 4jfz:H, 4jg0:H, 5vzy:H
28	5dqd:H	222	78	0.1377	0.0856	0.2436	2.5
29	6umh:H	232	44	0.0870	0.0517	0.2727	2.5	6co3:H, 6d01:A, 6d01:C, 6d01:E, 6d01:G, 6d0x:A, 8ekf:HHH, 8fas:A, 8fat:A, 8fg0:C, 8fg0:A, 6o23:A, 6o25:A, 6o25:E, 6o25:I, 6o26:A, 7rqq:H, 7ssc:H, 6umh:h, 6w05:H
30	2or9:I	228	82	0.1449	0.0877	0.2439	2.6	2or9:H, 6pxr:H
31	6o24:A	230	74	0.1522	0.0913	0.2838	2.6	6bqb:H, 6o23:C, 7rqr:A, 7rqr:H, 6ulf:A, 6vln:H
32	7kqk:A	222	38	0.0870	0.0541	0.3158	2.7	7kqk:H, 6nfn:R
33	6ncp:C	229	42	0.0797	0.0480	0.2619	2.8
34	7x9e:A	211	38	0.0797	0.0521	0.2895	2.8	7x9e:C
35	1qkz:H	219	38	0.0870	0.0548	0.3158	3.2
36	1qgc:A	220	75	0.1522	0.0955	0.2800	3.3
37	7byv:A	428	55	0.1304	0.0421	0.3273	3.4	7bys:A, 7bys:B, 7byt:A, 7byx:A, 7byx:B, 7byx:C, 7byx:D
38	6azm:D	225	38	0.0870	0.0533	0.3158	3.7	6azm:B, 8b9v:H, 5csz:H, 5csz:A, 5fgb:C, 5fgb:E, 3gjf:H, 3gjf:M, 3hae:H, 3hae:I, 3hae:O, 3hae:T, 5ifj:A, 5ifj:D, 5ifj:G, 5ifj:J, 5ig7:A, 5ig7:D, 5ig7:G, 5ig7:J, 6jjp:A, 6jjp:D, 3kdm:H, 3kdm:B, 7sjs:H, 3so3:C, 4xxd:B, 4xxd:E
39	8dao:C	126	55	0.1159	0.1270	0.2909	3.8	8dao:A
40	7jvd:H	214	72	0.1449	0.0935	0.2778	3.8
41	4pex:B	551	52	0.1087	0.0272	0.2885	4.2	4pey:A, 4pez:A, 4pf0:A, 4pf0:B, 4tyv:B, 4tz1:A, 4tz3:A, 4tz5:A, 4tz5:B
42	7ut3:H	217	67	0.1232	0.0783	0.2537	4.3
43	8ek5:E	227	38	0.0870	0.0529	0.3158	4.4	7tn9:M, 7tn9:Q, 7tn9:O
44	5t33:H	223	47	0.1014	0.0628	0.2979	4.5
45	6uoe:H	225	38	0.0870	0.0533	0.3158	4.8
46	4rav:A	118	42	0.0942	0.1102	0.3095	4.9	4rav:C
47	8fdc:A	218	42	0.0942	0.0596	0.3095	4.9
48	3cfb:H	213	70	0.1449	0.0939	0.2857	5.1	3cfb:B, 1fl3:H, 1fl3:A, 1ub5:H, 1ub5:A
49	7cu5:A	230	38	0.0870	0.0522	0.3158	5.7	7cu5:B
50	6obg:C	116	53	0.0870	0.1034	0.2264	5.8	6obg:D
51	8fa9:H	226	38	0.0870	0.0531	0.3158	5.8
52	2uzi:H	114	41	0.0797	0.0965	0.2683	5.9	2vh5:H
53	2h1p:H	220	75	0.1449	0.0909	0.2667	6.1	5mhe:H, 5mhg:H, 5t6p:D, 5t6p:B, 5t78:B, 5t78:D
54	2dqu:H	222	74	0.1449	0.0901	0.2703	6.7	2dqt:H, 3ls4:H, 4p3c:H, 4p3d:A, 4p3d:H, 4qxu:H
55	6axl:A	218	42	0.0942	0.0596	0.3095	6.8	6axl:D
56	7bep:A	228	38	0.0870	0.0526	0.3158	7.6	7bep:D, 8fjb:E
57	6xun:C	221	41	0.0942	0.0588	0.3171	7.9	6xun:H, 6xun:A
58	7c94:B	223	77	0.1522	0.0942	0.2727	7.9	6a9k:H, 6a9k:B, 7c94:E
59	7dc7:A	222	52	0.1014	0.0631	0.2692	8.3	7dc8:B, 7dc8:E, 7rpu:A
60	7deo:A	241	38	0.0870	0.0498	0.3158	9.0	7deo:C
61	7t76:H	136	42	0.0942	0.0956	0.3095	9.4
62	7t1w:H2	217	70	0.1449	0.0922	0.2857	9.6	7t1w:H, 7t1w:H3, 7t1w:H4, 7t1w:H5, 7t1x:H, 7t1x:H2, 7t1x:H3, 7t1x:H4, 7t1x:H5

[Back]