Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GSELPQMVQQLNSPDQQELQSALRKLSQIASGGNEQIQAVIDAGALPALVQLLSSPNEQILQEALWALSNIASGGNEQIQ
AVIDAGALPALVQLLSSPNEQILQEALWALSNIASGGNEQIQAVIDAGALPALVQLLSSPNEQILQEALWALSNIASGGN
EQIQAVIDAGALPALVQLLSSPNEQILQEALWALSNIASGGNEQIQAVIDAGALPALVQLLSSPNEQILQEALWALSNIA
SGGNEQKQAVKEAGALEKLEQLQSHENEKIQKEAQEALEKLQS

The query sequence (length=283) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4plr:A 289 282 0.9399 0.9204 0.9433 5.44e-174 4plr:B, 4pls:A, 4pls:C, 4pls:D, 4pls:B, 4v3o:A, 4v3o:D, 4v3o:B, 4v3o:C, 4v3q:A, 4v3q:B, 4v3q:C, 4v3q:D
2 6s9o:F 343 325 0.9823 0.8105 0.8554 7.52e-172 5aei:A, 5aei:B, 5aei:C, 5mfd:A, 5mfd:C, 5mfd:E, 5mfd:I, 5mfd:G, 5mfd:J, 5mfd:K, 5mfd:L, 5mfe:A, 5mfe:B, 5mfe:C, 5mfe:D, 5mff:A, 5mff:B, 5mff:C, 5mff:D, 5mfg:A, 5mfh:A, 5mfh:B, 5mfh:C, 5mfh:D, 5mfl:A, 5mfl:B, 5mfl:C, 5mfm:A, 5mfm:B, 5mfm:C, 5mfm:E, 5mfm:D, 5mfm:F, 5mfn:B, 5mfn:A, 5mfo:A, 5mfo:C, 5mfo:E, 6s9l:A, 6s9l:B, 6s9m:A, 6s9m:E, 6s9m:B, 6s9m:C, 6s9m:D, 6s9m:F, 6s9n:A, 6s9n:E, 6s9n:B, 6s9n:C, 6s9n:F, 6s9n:D, 6s9o:A, 6s9o:B, 6s9o:C, 6s9o:D, 6s9o:E
3 6s9o:F 343 241 0.7244 0.5977 0.8506 2.82e-121 5aei:A, 5aei:B, 5aei:C, 5mfd:A, 5mfd:C, 5mfd:E, 5mfd:I, 5mfd:G, 5mfd:J, 5mfd:K, 5mfd:L, 5mfe:A, 5mfe:B, 5mfe:C, 5mfe:D, 5mff:A, 5mff:B, 5mff:C, 5mff:D, 5mfg:A, 5mfh:A, 5mfh:B, 5mfh:C, 5mfh:D, 5mfl:A, 5mfl:B, 5mfl:C, 5mfm:A, 5mfm:B, 5mfm:C, 5mfm:E, 5mfm:D, 5mfm:F, 5mfn:B, 5mfn:A, 5mfo:A, 5mfo:C, 5mfo:E, 6s9l:A, 6s9l:B, 6s9m:A, 6s9m:E, 6s9m:B, 6s9m:C, 6s9m:D, 6s9m:F, 6s9n:A, 6s9n:E, 6s9n:B, 6s9n:C, 6s9n:F, 6s9n:D, 6s9o:A, 6s9o:B, 6s9o:C, 6s9o:D, 6s9o:E
4 6sa8:A 665 275 0.8834 0.3759 0.9091 1.97e-155 7dne:B, 5mfg:C, 5mfg:D, 5mfg:B
5 6sa8:A 665 271 0.8657 0.3684 0.9041 4.55e-151 7dne:B, 5mfg:C, 5mfg:D, 5mfg:B
6 6sa8:A 665 256 0.8127 0.3459 0.8984 3.07e-141 7dne:B, 5mfg:C, 5mfg:D, 5mfg:B
7 6sa8:A 665 215 0.6678 0.2842 0.8791 3.59e-111 7dne:B, 5mfg:C, 5mfg:D, 5mfg:B
8 4db8:B 239 237 0.7703 0.9121 0.9198 2.95e-138
9 4db8:B 239 238 0.7491 0.8870 0.8908 2.52e-132
10 5mfo:F 201 199 0.6537 0.9204 0.9296 1.02e-114 5mfo:B, 5mfo:D
11 5mfo:F 201 196 0.6325 0.8905 0.9133 1.63e-110 5mfo:B, 5mfo:D
12 5mfo:F 201 196 0.6042 0.8507 0.8724 8.47e-103 5mfo:B, 5mfo:D
13 5mfi:B 240 235 0.5371 0.6333 0.6468 7.24e-97 4d49:A, 4d49:B, 4d49:E, 4d49:F, 5mfi:A, 5mfj:A, 5mfj:B, 5mfk:A
14 5mfi:B 240 238 0.5053 0.5958 0.6008 8.91e-88 4d49:A, 4d49:B, 4d49:E, 4d49:F, 5mfi:A, 5mfj:A, 5mfj:B, 5mfk:A
15 1un0:A 439 320 0.4311 0.2779 0.3812 9.78e-55 1bk6:A, 1bk6:B, 1ee4:A, 1ee4:B, 1ee5:A, 5h2w:A, 5h2w:C, 5h2x:A, 4pvz:B, 1un0:B, 4xzr:B
16 1un0:A 439 285 0.3852 0.2483 0.3825 3.97e-52 1bk6:A, 1bk6:B, 1ee4:A, 1ee4:B, 1ee5:A, 5h2w:A, 5h2w:C, 5h2x:A, 4pvz:B, 1un0:B, 4xzr:B
17 8gai:C 434 377 0.4240 0.2765 0.3183 1.27e-54 5b56:A, 5b56:B, 4ba3:A, 3btr:C, 6bw0:E, 6bw1:E, 7cru:A, 7cru:C, 5ctt:A, 5d5k:C, 5e6q:B, 8ech:E, 1ejl:I, 1ejy:I, 5ekf:A, 5ekg:A, 8f2q:A, 5fc8:E, 8fk3:A, 8fua:A, 8fuc:B, 8fzk:C, 8g8q:A, 8g8r:A, 8g8s:A, 8gai:A, 5gxw:A, 5h43:A, 8he0:A, 8he3:A, 5hhg:E, 4htv:A, 5huw:C, 5huy:C, 1iq1:C, 6iu7:A, 6iua:A, 6iw8:C, 6iwa:C, 7jjm:B, 7jk7:B, 7jvo:A, 6k06:C, 5k9s:A, 5klr:B, 5klt:B, 3knd:A, 7l04:E, 3l3q:A, 7leq:E, 7let:E, 7leu:E, 7m60:A, 6mjl:B, 4mz5:E, 4mz6:E, 7n8j:A, 7n9h:C, 4oih:A, 3oqs:A, 6p6a:B, 6p6e:A, 1pjm:B, 1pjn:B, 1q1s:C, 1q1t:C, 3q5u:A, 8q8k:A, 8q8k:B, 8qxw:A, 8qxx:A, 7rfx:A, 7rfz:A, 7rg0:A, 7rg1:A, 7rg2:A, 7rg3:A, 7rg4:E, 7rg6:A, 3rz9:A, 3rzx:A, 8sg7:B, 8sud:A, 5svz:A, 8sv0:B, 7tmx:I, 7tmy:I, 3tpm:A, 8tuq:A, 8tur:A, 8tus:A, 8tut:A, 8tuu:A, 8tuv:A, 8u36:A, 4u54:A, 4u58:A, 4u5l:A, 4u5n:A, 4u5o:A, 4u5s:A, 4u5u:A, 4u5v:A, 5u5p:A, 5u5r:A, 3ukw:B, 3ukx:B, 3uky:B, 3ukz:B, 3ul0:B, 3ul1:B, 5umz:B, 7umi:E, 3uvu:A, 5v5o:C, 5v5p:C, 3ve6:A, 8vpr:A, 8vpu:A, 5w41:A, 5w4e:B, 5w4f:B, 5w4g:B, 6wba:A, 6wbb:I, 6wbc:A, 5wum:A, 5wun:A, 4wv6:A, 6wx7:A, 5x8n:A, 1y2a:C, 4yi0:C, 2ynr:A, 4zdu:A, 3zin:A, 3zio:A, 3zip:A, 3ziq:A, 3zir:A
18 8gai:C 434 129 0.1201 0.0783 0.2636 0.005 5b56:A, 5b56:B, 4ba3:A, 3btr:C, 6bw0:E, 6bw1:E, 7cru:A, 7cru:C, 5ctt:A, 5d5k:C, 5e6q:B, 8ech:E, 1ejl:I, 1ejy:I, 5ekf:A, 5ekg:A, 8f2q:A, 5fc8:E, 8fk3:A, 8fua:A, 8fuc:B, 8fzk:C, 8g8q:A, 8g8r:A, 8g8s:A, 8gai:A, 5gxw:A, 5h43:A, 8he0:A, 8he3:A, 5hhg:E, 4htv:A, 5huw:C, 5huy:C, 1iq1:C, 6iu7:A, 6iua:A, 6iw8:C, 6iwa:C, 7jjm:B, 7jk7:B, 7jvo:A, 6k06:C, 5k9s:A, 5klr:B, 5klt:B, 3knd:A, 7l04:E, 3l3q:A, 7leq:E, 7let:E, 7leu:E, 7m60:A, 6mjl:B, 4mz5:E, 4mz6:E, 7n8j:A, 7n9h:C, 4oih:A, 3oqs:A, 6p6a:B, 6p6e:A, 1pjm:B, 1pjn:B, 1q1s:C, 1q1t:C, 3q5u:A, 8q8k:A, 8q8k:B, 8qxw:A, 8qxx:A, 7rfx:A, 7rfz:A, 7rg0:A, 7rg1:A, 7rg2:A, 7rg3:A, 7rg4:E, 7rg6:A, 3rz9:A, 3rzx:A, 8sg7:B, 8sud:A, 5svz:A, 8sv0:B, 7tmx:I, 7tmy:I, 3tpm:A, 8tuq:A, 8tur:A, 8tus:A, 8tut:A, 8tuu:A, 8tuv:A, 8u36:A, 4u54:A, 4u58:A, 4u5l:A, 4u5n:A, 4u5o:A, 4u5s:A, 4u5u:A, 4u5v:A, 5u5p:A, 5u5r:A, 3ukw:B, 3ukx:B, 3uky:B, 3ukz:B, 3ul0:B, 3ul1:B, 5umz:B, 7umi:E, 3uvu:A, 5v5o:C, 5v5p:C, 3ve6:A, 8vpr:A, 8vpu:A, 5w41:A, 5w4e:B, 5w4f:B, 5w4g:B, 6wba:A, 6wbb:I, 6wbc:A, 5wum:A, 5wun:A, 4wv6:A, 6wx7:A, 5x8n:A, 1y2a:C, 4yi0:C, 2ynr:A, 4zdu:A, 3zin:A, 3zio:A, 3zip:A, 3ziq:A, 3zir:A
19 4bqk:A 424 296 0.4099 0.2736 0.3919 1.78e-54 4b8o:A, 4b8p:A, 4b8p:B, 4bpl:A, 4bqk:B, 2yns:A, 2yns:B
20 4bqk:A 424 287 0.4028 0.2689 0.3972 1.46e-52 4b8o:A, 4b8p:A, 4b8p:B, 4bpl:A, 4bqk:B, 2yns:A, 2yns:B
21 6bvv:A 416 371 0.4311 0.2933 0.3288 7.10e-54 6bw9:A, 6bwa:A, 6bwb:A, 8fub:A, 8fzm:A, 8fzm:C, 8hkw:A, 8hkw:B, 7jjl:A, 7lf4:A, 7lf4:C, 7lfc:A, 7rfy:A, 7rg5:A, 5xzx:A
22 4rxh:B 421 277 0.3746 0.2518 0.3827 1.57e-50 5vqi:B
23 4rxh:B 421 279 0.3852 0.2589 0.3907 4.12e-50 5vqi:B
24 4rxh:B 421 108 0.1272 0.0855 0.3333 1.55e-07 5vqi:B
25 4b18:A 427 353 0.4028 0.2670 0.3229 1.46e-46 6wx9:A
26 4b18:A 427 369 0.4134 0.2740 0.3171 1.03e-40 6wx9:A
27 4b18:A 427 148 0.1696 0.1124 0.3243 5.88e-14 6wx9:A
28 1qz7:A 524 289 0.2933 0.1584 0.2872 8.30e-21 7afw:A, 7ar4:AAA, 4djs:A, 8ei9:A, 8eia:A, 8eib:A, 8eic:A, 2gl7:A, 2gl7:D, 1i7w:A, 1i7w:C, 1jpp:A, 1jpp:B, 1jpw:A, 1jpw:B, 1jpw:C, 3ouw:A, 8ru3:A, 8ru4:A, 8ru4:B, 3sl9:A, 3sl9:E, 3sl9:B, 3sl9:G, 1t08:A, 7uwi:A, 7uwo:A, 8y0p:A, 8y0p:B, 8z10:A
29 1qz7:A 524 219 0.1943 0.1050 0.2511 1.54e-08 7afw:A, 7ar4:AAA, 4djs:A, 8ei9:A, 8eia:A, 8eib:A, 8eic:A, 2gl7:A, 2gl7:D, 1i7w:A, 1i7w:C, 1jpp:A, 1jpp:B, 1jpw:A, 1jpw:B, 1jpw:C, 3ouw:A, 8ru3:A, 8ru4:A, 8ru4:B, 3sl9:A, 3sl9:E, 3sl9:B, 3sl9:G, 1t08:A, 7uwi:A, 7uwo:A, 8y0p:A, 8y0p:B, 8z10:A
30 6kbn:C 504 251 0.2544 0.1429 0.2869 5.19e-18 6kbm:A, 6kbn:A
31 6kbn:C 504 198 0.2226 0.1250 0.3182 9.64e-17 6kbm:A, 6kbn:A
32 6kbn:C 504 217 0.2403 0.1349 0.3134 6.63e-15 6kbm:A, 6kbn:A
33 3l6x:A 434 190 0.1661 0.1083 0.2474 6.91e-05 3l6y:A, 3l6y:C, 3l6y:E
34 3l6x:A 434 92 0.0813 0.0530 0.2500 2.2 3l6y:A, 3l6y:C, 3l6y:E
35 5zhx:A 469 258 0.2403 0.1450 0.2636 1.84e-04 5zhx:B, 5zhx:C, 5zhx:D
36 5zhx:A 469 252 0.2332 0.1407 0.2619 5.37e-04 5zhx:B, 5zhx:C, 5zhx:D
37 7dvq:K 188 105 0.0848 0.1277 0.2286 0.005
38 7dvq:K 188 66 0.0671 0.1011 0.2879 0.005
39 7dvq:K 188 66 0.0671 0.1011 0.2879 0.005
40 7dvq:K 188 39 0.0424 0.0638 0.3077 0.51
41 3lww:C 871 147 0.1343 0.0436 0.2585 0.018 1f59:A, 1f59:B, 1m5n:S, 1o6o:A, 1o6o:C, 1o6o:B, 1o6p:B, 1o6p:A, 1qgr:A
42 2q5d:B 845 148 0.1413 0.0473 0.2703 0.056
43 2q5d:B 845 118 0.1025 0.0343 0.2458 0.64
44 8tua:A 1329 42 0.0636 0.0135 0.4286 0.20 5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
45 5wbj:A 1058 197 0.1696 0.0454 0.2437 0.22 5wbk:A, 5wbl:A
46 8tkd:A 2249 227 0.1943 0.0245 0.2423 0.50 8tkd:B, 8tkd:C, 8tkd:D, 8tke:A, 8tke:B, 8tke:C, 8tke:D, 8tkg:A, 8tkg:B, 8tkg:C, 8tkg:D, 8tl9:A, 8tl9:B, 8tla:A, 8tla:B
47 8tkf:A 2272 232 0.1802 0.0224 0.2198 0.57 8tkf:D, 8tkf:B, 8tkf:C
48 7t3p:A 2066 179 0.1625 0.0223 0.2570 0.66 7t3p:B, 7t3p:C, 7t3p:D
49 7t3p:A 2066 179 0.1590 0.0218 0.2514 0.76 7t3p:B, 7t3p:C, 7t3p:D
50 7t3p:A 2066 179 0.1590 0.0218 0.2514 4.8 7t3p:B, 7t3p:C, 7t3p:D
51 6dr0:C 2193 180 0.1449 0.0187 0.2278 0.71 6dqj:A, 6dqj:B, 6dqj:C, 6dqj:D, 6dqn:A, 6dqn:B, 6dqn:C, 6dqn:D, 6dqs:A, 6dqs:B, 6dqs:C, 6dqs:D, 6dqv:A, 6dqv:B, 6dqv:C, 6dqv:D, 6dqz:A, 6dqz:B, 6dqz:D, 6dqz:C, 6dr0:A, 6dr0:B, 6dr0:D, 6dr2:A, 6dr2:B, 6dr2:C, 6dr2:D, 6dra:A, 6dra:B, 6dra:C, 6dra:D, 6drc:A, 6drc:B, 6drc:C, 6drc:D
52 7t3u:A 2020 173 0.1484 0.0208 0.2428 0.80 7t3u:D
53 7t3u:A 2020 190 0.1555 0.0218 0.2316 3.4 7t3u:D
54 8tl9:D 2034 182 0.1449 0.0202 0.2253 1.5 8tla:D
55 3v7p:A 409 98 0.1131 0.0782 0.3265 1.9 4m51:A
56 7t3r:A 2130 170 0.1555 0.0207 0.2588 3.1 7t3r:B, 7t3r:C, 7t3r:D, 7t3t:A, 7t3t:B, 7t3t:C, 7t3t:D
57 8tk8:A 2268 235 0.1837 0.0229 0.2213 3.3 8tk8:B, 8tk8:C, 8tk8:D, 8tkh:A, 8tkh:B, 8tkh:C, 8tkh:D, 8tki:A, 8tki:B, 8tki:C, 8tki:D, 8tl9:C, 8tla:C
58 7t3q:A 2103 174 0.1413 0.0190 0.2299 3.5 7t3q:B, 7t3q:C, 7t3q:D, 7t3u:B
59 6xu2:A 1091 98 0.0742 0.0192 0.2143 5.3 6xte:A
60 5m5w:B 1183 92 0.0777 0.0186 0.2391 5.7 4c2m:B, 4c2m:Q, 4c3h:B, 4c3i:B, 4c3j:B, 5g5l:B, 6h67:B, 6h68:B, 6hko:B, 6hlq:B, 6hlr:B, 5m3f:B, 5m3m:B, 5m5x:B, 5m5y:B, 5m64:B, 5n5y:B, 5n5z:B, 5n60:B, 5n61:B, 5oa1:B, 6rqh:B, 6rql:B, 6rqt:B, 6rrd:B, 6rui:B, 6ruo:B, 6rwe:B, 6tps:B, 5w5y:B, 5w64:B, 5w65:B, 5w66:B, 4ym7:AB, 4ym7:BB, 4ym7:CB, 4ym7:DB, 4ym7:EB, 4ym7:FB
61 5owu:A 860 261 0.2049 0.0674 0.2222 6.3
62 1l5j:A 862 149 0.1343 0.0441 0.2550 8.6 1l5j:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218