Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GSELPQMVQQLNSPDQQELQSALRKLQQIAMGGNEQIQAVIDAGALPALVQLLSSPNEQILASALGALANIASGGNEQIQ
AVIDAGALPALVQLLSSPNEQILQFALIALANIASGGNEQIQAVIDAGALPALVQLLSSPNEQILQEALWALSNIASGGN
EQIQAVIDAGALPALVQLLSSPNEQILQEALWALSNIASGGNEQIQAVIDAGALPALVQLLSSPNEQILQEALWALSNIA
SGGNEQKQAVKEAGALEKLEQLQSHENEKIQKEAQEALEKLQSHGSGGSGKRKRKAKITW

The query sequence (length=300) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6s9o:F 343 332 0.9333 0.8163 0.8434 2.02e-173 5aei:A, 5aei:B, 5aei:C, 5mfd:A, 5mfd:C, 5mfd:E, 5mfd:I, 5mfd:G, 5mfd:J, 5mfd:K, 5mfd:L, 5mfe:A, 5mfe:B, 5mfe:C, 5mfe:D, 5mff:A, 5mff:B, 5mff:C, 5mff:D, 5mfg:A, 5mfh:A, 5mfh:B, 5mfh:C, 5mfh:D, 5mfl:A, 5mfl:B, 5mfl:C, 5mfm:A, 5mfm:B, 5mfm:C, 5mfm:E, 5mfm:D, 5mfm:F, 5mfn:B, 5mfn:A, 5mfo:A, 5mfo:C, 5mfo:E, 6s9l:A, 6s9l:B, 6s9m:A, 6s9m:E, 6s9m:B, 6s9m:C, 6s9m:D, 6s9m:F, 6s9n:A, 6s9n:E, 6s9n:B, 6s9n:C, 6s9n:F, 6s9n:D, 6s9o:A, 6s9o:B, 6s9o:C, 6s9o:D, 6s9o:E
2 4plr:A 289 282 0.8633 0.8962 0.9184 4.07e-166 4plr:B, 4pls:A, 4pls:C, 4pls:D, 4pls:B, 4v3o:A, 4v3o:D, 4v3o:B, 4v3o:C, 4v3q:A, 4v3q:B, 4v3q:C, 4v3q:D
3 6sa8:A 665 275 0.8033 0.3624 0.8764 2.14e-146 7dne:B, 5mfg:C, 5mfg:D, 5mfg:B
4 6sa8:A 665 274 0.7933 0.3579 0.8686 4.68e-143 7dne:B, 5mfg:C, 5mfg:D, 5mfg:B
5 6sa8:A 665 256 0.7367 0.3323 0.8633 5.36e-132 7dne:B, 5mfg:C, 5mfg:D, 5mfg:B
6 6sa8:A 665 215 0.6000 0.2707 0.8372 7.47e-102 7dne:B, 5mfg:C, 5mfg:D, 5mfg:B
7 4db8:B 239 237 0.7167 0.8996 0.9072 1.50e-135
8 4db8:B 239 238 0.6767 0.8494 0.8529 4.17e-123
9 5mfo:F 201 196 0.5933 0.8856 0.9082 3.46e-110 5mfo:B, 5mfo:D
10 5mfo:F 201 199 0.5867 0.8756 0.8844 1.70e-105 5mfo:B, 5mfo:D
11 5mfo:F 201 196 0.5567 0.8308 0.8520 1.06e-98 5mfo:B, 5mfo:D
12 5mfi:B 240 240 0.4933 0.6167 0.6167 8.90e-90 4d49:A, 4d49:B, 4d49:E, 4d49:F, 5mfi:A, 5mfj:A, 5mfj:B, 5mfk:A
13 5mfi:B 240 238 0.4700 0.5875 0.5924 5.48e-85 4d49:A, 4d49:B, 4d49:E, 4d49:F, 5mfi:A, 5mfj:A, 5mfj:B, 5mfk:A
14 4bqk:A 424 248 0.3433 0.2429 0.4153 3.38e-51 4b8o:A, 4b8p:A, 4b8p:B, 4bpl:A, 4bqk:B, 2yns:A, 2yns:B
15 4bqk:A 424 290 0.3733 0.2642 0.3862 1.22e-46 4b8o:A, 4b8p:A, 4b8p:B, 4bpl:A, 4bqk:B, 2yns:A, 2yns:B
16 6bvv:A 416 243 0.3267 0.2356 0.4033 1.53e-50 6bw9:A, 6bwa:A, 6bwb:A, 8fub:A, 8fzm:A, 8fzm:C, 8hkw:A, 8hkw:B, 7jjl:A, 7lf4:A, 7lf4:C, 7lfc:A, 7rfy:A, 7rg5:A, 5xzx:A
17 6bvv:A 416 289 0.3500 0.2524 0.3633 5.83e-42 6bw9:A, 6bwa:A, 6bwb:A, 8fub:A, 8fzm:A, 8fzm:C, 8hkw:A, 8hkw:B, 7jjl:A, 7lf4:A, 7lf4:C, 7lfc:A, 7rfy:A, 7rg5:A, 5xzx:A
18 8gai:C 434 245 0.3233 0.2235 0.3959 8.05e-49 5b56:A, 5b56:B, 4ba3:A, 3btr:C, 6bw0:E, 6bw1:E, 7cru:A, 7cru:C, 5ctt:A, 5d5k:C, 5e6q:B, 8ech:E, 1ejl:I, 1ejy:I, 5ekf:A, 5ekg:A, 8f2q:A, 5fc8:E, 8fk3:A, 8fua:A, 8fuc:B, 8fzk:C, 8g8q:A, 8g8r:A, 8g8s:A, 8gai:A, 5gxw:A, 5h43:A, 8he0:A, 8he3:A, 5hhg:E, 4htv:A, 5huw:C, 5huy:C, 1iq1:C, 6iu7:A, 6iua:A, 6iw8:C, 6iwa:C, 7jjm:B, 7jk7:B, 7jvo:A, 6k06:C, 5k9s:A, 5klr:B, 5klt:B, 3knd:A, 7l04:E, 3l3q:A, 7leq:E, 7let:E, 7leu:E, 7m60:A, 6mjl:B, 4mz5:E, 4mz6:E, 7n8j:A, 7n9h:C, 4oih:A, 3oqs:A, 6p6a:B, 6p6e:A, 1pjm:B, 1pjn:B, 1q1s:C, 1q1t:C, 3q5u:A, 8q8k:A, 8q8k:B, 8qxw:A, 8qxx:A, 7rfx:A, 7rfz:A, 7rg0:A, 7rg1:A, 7rg2:A, 7rg3:A, 7rg4:E, 7rg6:A, 3rz9:A, 3rzx:A, 8sg7:B, 8sud:A, 5svz:A, 8sv0:B, 7tmx:I, 7tmy:I, 3tpm:A, 8tuq:A, 8tur:A, 8tus:A, 8tut:A, 8tuu:A, 8tuv:A, 8u36:A, 4u54:A, 4u58:A, 4u5l:A, 4u5n:A, 4u5o:A, 4u5s:A, 4u5u:A, 4u5v:A, 5u5p:A, 5u5r:A, 3ukw:B, 3ukx:B, 3uky:B, 3ukz:B, 3ul0:B, 3ul1:B, 5umz:B, 7umi:E, 3uvu:A, 5v5o:C, 5v5p:C, 3ve6:A, 8vpr:A, 8vpu:A, 5w41:A, 5w4e:B, 5w4f:B, 5w4g:B, 6wba:A, 6wbb:I, 6wbc:A, 5wum:A, 5wun:A, 4wv6:A, 6wx7:A, 5x8n:A, 1y2a:C, 4yi0:C, 2ynr:A, 4zdu:A, 3zin:A, 3zio:A, 3zip:A, 3ziq:A, 3zir:A
19 8gai:C 434 298 0.3500 0.2419 0.3523 4.28e-43 5b56:A, 5b56:B, 4ba3:A, 3btr:C, 6bw0:E, 6bw1:E, 7cru:A, 7cru:C, 5ctt:A, 5d5k:C, 5e6q:B, 8ech:E, 1ejl:I, 1ejy:I, 5ekf:A, 5ekg:A, 8f2q:A, 5fc8:E, 8fk3:A, 8fua:A, 8fuc:B, 8fzk:C, 8g8q:A, 8g8r:A, 8g8s:A, 8gai:A, 5gxw:A, 5h43:A, 8he0:A, 8he3:A, 5hhg:E, 4htv:A, 5huw:C, 5huy:C, 1iq1:C, 6iu7:A, 6iua:A, 6iw8:C, 6iwa:C, 7jjm:B, 7jk7:B, 7jvo:A, 6k06:C, 5k9s:A, 5klr:B, 5klt:B, 3knd:A, 7l04:E, 3l3q:A, 7leq:E, 7let:E, 7leu:E, 7m60:A, 6mjl:B, 4mz5:E, 4mz6:E, 7n8j:A, 7n9h:C, 4oih:A, 3oqs:A, 6p6a:B, 6p6e:A, 1pjm:B, 1pjn:B, 1q1s:C, 1q1t:C, 3q5u:A, 8q8k:A, 8q8k:B, 8qxw:A, 8qxx:A, 7rfx:A, 7rfz:A, 7rg0:A, 7rg1:A, 7rg2:A, 7rg3:A, 7rg4:E, 7rg6:A, 3rz9:A, 3rzx:A, 8sg7:B, 8sud:A, 5svz:A, 8sv0:B, 7tmx:I, 7tmy:I, 3tpm:A, 8tuq:A, 8tur:A, 8tus:A, 8tut:A, 8tuu:A, 8tuv:A, 8u36:A, 4u54:A, 4u58:A, 4u5l:A, 4u5n:A, 4u5o:A, 4u5s:A, 4u5u:A, 4u5v:A, 5u5p:A, 5u5r:A, 3ukw:B, 3ukx:B, 3uky:B, 3ukz:B, 3ul0:B, 3ul1:B, 5umz:B, 7umi:E, 3uvu:A, 5v5o:C, 5v5p:C, 3ve6:A, 8vpr:A, 8vpu:A, 5w41:A, 5w4e:B, 5w4f:B, 5w4g:B, 6wba:A, 6wbb:I, 6wbc:A, 5wum:A, 5wun:A, 4wv6:A, 6wx7:A, 5x8n:A, 1y2a:C, 4yi0:C, 2ynr:A, 4zdu:A, 3zin:A, 3zio:A, 3zip:A, 3ziq:A, 3zir:A
20 8gai:C 434 129 0.1067 0.0737 0.2481 0.032 5b56:A, 5b56:B, 4ba3:A, 3btr:C, 6bw0:E, 6bw1:E, 7cru:A, 7cru:C, 5ctt:A, 5d5k:C, 5e6q:B, 8ech:E, 1ejl:I, 1ejy:I, 5ekf:A, 5ekg:A, 8f2q:A, 5fc8:E, 8fk3:A, 8fua:A, 8fuc:B, 8fzk:C, 8g8q:A, 8g8r:A, 8g8s:A, 8gai:A, 5gxw:A, 5h43:A, 8he0:A, 8he3:A, 5hhg:E, 4htv:A, 5huw:C, 5huy:C, 1iq1:C, 6iu7:A, 6iua:A, 6iw8:C, 6iwa:C, 7jjm:B, 7jk7:B, 7jvo:A, 6k06:C, 5k9s:A, 5klr:B, 5klt:B, 3knd:A, 7l04:E, 3l3q:A, 7leq:E, 7let:E, 7leu:E, 7m60:A, 6mjl:B, 4mz5:E, 4mz6:E, 7n8j:A, 7n9h:C, 4oih:A, 3oqs:A, 6p6a:B, 6p6e:A, 1pjm:B, 1pjn:B, 1q1s:C, 1q1t:C, 3q5u:A, 8q8k:A, 8q8k:B, 8qxw:A, 8qxx:A, 7rfx:A, 7rfz:A, 7rg0:A, 7rg1:A, 7rg2:A, 7rg3:A, 7rg4:E, 7rg6:A, 3rz9:A, 3rzx:A, 8sg7:B, 8sud:A, 5svz:A, 8sv0:B, 7tmx:I, 7tmy:I, 3tpm:A, 8tuq:A, 8tur:A, 8tus:A, 8tut:A, 8tuu:A, 8tuv:A, 8u36:A, 4u54:A, 4u58:A, 4u5l:A, 4u5n:A, 4u5o:A, 4u5s:A, 4u5u:A, 4u5v:A, 5u5p:A, 5u5r:A, 3ukw:B, 3ukx:B, 3uky:B, 3ukz:B, 3ul0:B, 3ul1:B, 5umz:B, 7umi:E, 3uvu:A, 5v5o:C, 5v5p:C, 3ve6:A, 8vpr:A, 8vpu:A, 5w41:A, 5w4e:B, 5w4f:B, 5w4g:B, 6wba:A, 6wbb:I, 6wbc:A, 5wum:A, 5wun:A, 4wv6:A, 6wx7:A, 5x8n:A, 1y2a:C, 4yi0:C, 2ynr:A, 4zdu:A, 3zin:A, 3zio:A, 3zip:A, 3ziq:A, 3zir:A
21 1un0:A 439 285 0.3533 0.2415 0.3719 1.55e-48 1bk6:A, 1bk6:B, 1ee4:A, 1ee4:B, 1ee5:A, 5h2w:A, 5h2w:C, 5h2x:A, 4pvz:B, 1un0:B, 4xzr:B
22 1un0:A 439 327 0.3967 0.2711 0.3639 4.17e-48 1bk6:A, 1bk6:B, 1ee4:A, 1ee4:B, 1ee5:A, 5h2w:A, 5h2w:C, 5h2x:A, 4pvz:B, 1un0:B, 4xzr:B
23 4rxh:B 421 277 0.3433 0.2447 0.3718 6.01e-47 5vqi:B
24 4rxh:B 421 327 0.3600 0.2565 0.3303 5.38e-43 5vqi:B
25 4rxh:B 421 326 0.3567 0.2542 0.3282 1.91e-40 5vqi:B
26 4b18:A 427 291 0.3433 0.2412 0.3540 8.95e-43 6wx9:A
27 4b18:A 427 304 0.3433 0.2412 0.3388 1.00e-38 6wx9:A
28 4b18:A 427 206 0.2133 0.1499 0.3107 1.07e-20 6wx9:A
29 6kbn:C 504 223 0.2433 0.1448 0.3274 6.03e-23 6kbm:A, 6kbn:A
30 6kbn:C 504 240 0.2367 0.1409 0.2958 1.45e-15 6kbm:A, 6kbn:A
31 6kbn:C 504 242 0.2400 0.1429 0.2975 4.86e-13 6kbm:A, 6kbn:A
32 1qz7:A 524 289 0.2733 0.1565 0.2837 1.09e-20 7afw:A, 7ar4:AAA, 4djs:A, 8ei9:A, 8eia:A, 8eib:A, 8eic:A, 2gl7:A, 2gl7:D, 1i7w:A, 1i7w:C, 1jpp:A, 1jpp:B, 1jpw:A, 1jpw:B, 1jpw:C, 3ouw:A, 8ru3:A, 8ru4:A, 8ru4:B, 3sl9:A, 3sl9:E, 3sl9:B, 3sl9:G, 1t08:A, 7uwi:A, 7uwo:A, 8y0p:A, 8y0p:B, 8z10:A
33 1qz7:A 524 248 0.2267 0.1298 0.2742 2.73e-16 7afw:A, 7ar4:AAA, 4djs:A, 8ei9:A, 8eia:A, 8eib:A, 8eic:A, 2gl7:A, 2gl7:D, 1i7w:A, 1i7w:C, 1jpp:A, 1jpp:B, 1jpw:A, 1jpw:B, 1jpw:C, 3ouw:A, 8ru3:A, 8ru4:A, 8ru4:B, 3sl9:A, 3sl9:E, 3sl9:B, 3sl9:G, 1t08:A, 7uwi:A, 7uwo:A, 8y0p:A, 8y0p:B, 8z10:A
34 1qz7:A 524 220 0.1900 0.1088 0.2591 8.81e-08 7afw:A, 7ar4:AAA, 4djs:A, 8ei9:A, 8eia:A, 8eib:A, 8eic:A, 2gl7:A, 2gl7:D, 1i7w:A, 1i7w:C, 1jpp:A, 1jpp:B, 1jpw:A, 1jpw:B, 1jpw:C, 3ouw:A, 8ru3:A, 8ru4:A, 8ru4:B, 3sl9:A, 3sl9:E, 3sl9:B, 3sl9:G, 1t08:A, 7uwi:A, 7uwo:A, 8y0p:A, 8y0p:B, 8z10:A
35 3l6x:A 434 312 0.2400 0.1659 0.2308 2.21e-08 3l6y:A, 3l6y:C, 3l6y:E
36 3l6x:A 434 49 0.0567 0.0392 0.3469 4.5 3l6y:A, 3l6y:C, 3l6y:E
37 5zhx:A 469 258 0.2133 0.1365 0.2481 2.78e-05 5zhx:B, 5zhx:C, 5zhx:D
38 5zhx:A 469 253 0.2133 0.1365 0.2530 0.003 5zhx:B, 5zhx:C, 5zhx:D
39 7dvq:K 188 103 0.0967 0.1543 0.2816 5.51e-04
40 7dvq:K 188 105 0.0800 0.1277 0.2286 0.005
41 7dvq:K 188 78 0.0600 0.0957 0.2308 0.041
42 3lww:C 871 147 0.1267 0.0436 0.2585 0.021 1f59:A, 1f59:B, 1m5n:S, 1o6o:A, 1o6o:C, 1o6o:B, 1o6p:B, 1o6p:A, 1qgr:A
43 5wbj:A 1058 198 0.1667 0.0473 0.2525 0.055 5wbk:A, 5wbl:A
44 2q5d:B 845 148 0.1333 0.0473 0.2703 0.062
45 7t3p:A 2066 173 0.1567 0.0227 0.2717 0.50 7t3p:B, 7t3p:C, 7t3p:D
46 7t3p:A 2066 179 0.1567 0.0227 0.2626 0.57 7t3p:B, 7t3p:C, 7t3p:D
47 7t3p:A 2066 179 0.1533 0.0223 0.2570 9.5 7t3p:B, 7t3p:C, 7t3p:D
48 6dr0:C 2193 180 0.1433 0.0196 0.2389 1.0 6dqj:A, 6dqj:B, 6dqj:C, 6dqj:D, 6dqn:A, 6dqn:B, 6dqn:C, 6dqn:D, 6dqs:A, 6dqs:B, 6dqs:C, 6dqs:D, 6dqv:A, 6dqv:B, 6dqv:C, 6dqv:D, 6dqz:A, 6dqz:B, 6dqz:D, 6dqz:C, 6dr0:A, 6dr0:B, 6dr0:D, 6dr2:A, 6dr2:B, 6dr2:C, 6dr2:D, 6dra:A, 6dra:B, 6dra:C, 6dra:D, 6drc:A, 6drc:B, 6drc:C, 6drc:D
49 7t3u:A 2020 173 0.1433 0.0213 0.2486 1.0 7t3u:D
50 7t3u:A 2020 190 0.1467 0.0218 0.2316 2.5 7t3u:D
51 8tkf:A 2272 232 0.1733 0.0229 0.2241 1.0 8tkf:D, 8tkf:B, 8tkf:C
52 8tkd:A 2249 233 0.1700 0.0227 0.2189 1.4 8tkd:B, 8tkd:C, 8tkd:D, 8tke:A, 8tke:B, 8tke:C, 8tke:D, 8tkg:A, 8tkg:B, 8tkg:C, 8tkg:D, 8tl9:A, 8tl9:B, 8tla:A, 8tla:B
53 1l9m:B 681 97 0.0867 0.0382 0.2680 1.7 1l9m:A, 1l9n:A, 1l9n:B, 1nud:A, 1nud:B, 1nuf:A, 1nug:A, 1nug:B, 8oxv:A, 8oxw:A, 8oxx:A
54 8tl9:D 2034 182 0.1433 0.0211 0.2363 1.9 8tla:D
55 3v7p:A 409 98 0.1067 0.0782 0.3265 2.4 4m51:A
56 8tua:A 1329 73 0.0900 0.0203 0.3699 2.9 5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
57 5owu:A 860 260 0.1967 0.0686 0.2269 3.3
58 2a14:A 257 94 0.0733 0.0856 0.2340 3.5
59 7t3q:A 2103 174 0.1400 0.0200 0.2414 4.7 7t3q:B, 7t3q:C, 7t3q:D, 7t3u:B
60 7t3q:A 2103 198 0.1600 0.0228 0.2424 5.0 7t3q:B, 7t3q:C, 7t3q:D, 7t3u:B
61 2iuk:A 835 67 0.0600 0.0216 0.2687 6.3 2iuk:B
62 7t3r:A 2130 176 0.1400 0.0197 0.2386 6.9 7t3r:B, 7t3r:C, 7t3r:D, 7t3t:A, 7t3t:B, 7t3t:C, 7t3t:D
63 5yzg:s 374 109 0.0900 0.0722 0.2477 7.3

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218