Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GSASCLELALEGERLCKSGDCRAGVSFFEAAVQVGTEDLKTLSAIYSQLGNAYFYLHDYAKALEYHHHDLTLARTIGDQL
GEAKASGNLGNTLKVLGNFDEAIVCCQRHLDISRELNDKVGEARALYNLGNVYHAKGKSFGCPGPQFPEDVRNALQAAVD
LYEENLSLVTALGDRAAQGRAFGNLGNTHYLLGNFRDAVIAHEQRLLIAKEFGDKAAERRAYSNLGNAYIFLGEFETASE
YYKKTLLLARQLKDRAVEAQSCYSLGNTYTLLQDYEKAIDYHLKHLAIAQELKDRIGEGRACWSLGNAYTALGNHDQAMH
FAEKHLEI

The query sequence (length=328) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4wng:A 330 326 0.9665 0.9606 0.9724 0.0 7ep7:A, 4g2v:A, 3ro2:A, 3ro3:A, 4wnd:A, 4wne:A, 4wnf:A
2 4a1s:B 342 329 0.6860 0.6579 0.6839 9.97e-169
3 8chy:A 272 318 0.3323 0.4007 0.3428 8.55e-37 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
4 8chy:A 272 281 0.3079 0.3713 0.3594 7.50e-33 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
5 8chy:A 272 246 0.2683 0.3235 0.3577 2.45e-28 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
6 1na0:B 119 109 0.1220 0.3361 0.3670 1.43e-13 1na3:A, 1na3:B
7 1na0:B 119 89 0.1037 0.2857 0.3820 8.65e-09 1na3:A, 1na3:B
8 1na0:B 119 146 0.1311 0.3613 0.2945 1.56e-07 1na3:A, 1na3:B
9 1na0:B 119 70 0.0762 0.2101 0.3571 9.20e-07 1na3:A, 1na3:B
10 1na0:B 119 86 0.0823 0.2269 0.3140 8.21e-04 1na3:A, 1na3:B
11 3kd7:A 102 108 0.1189 0.3824 0.3611 1.51e-11 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
12 3kd7:A 102 101 0.0976 0.3137 0.3168 8.44e-07 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
13 3kd7:A 102 92 0.0945 0.3039 0.3370 8.60e-07 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
14 3kd7:A 102 70 0.0732 0.2353 0.3429 4.45e-05 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
15 3kd7:A 102 126 0.1189 0.3824 0.3095 8.30e-05 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
16 7t7t:A 466 257 0.1768 0.1245 0.2257 5.82e-08 7t7t:B
17 7t7t:A 466 237 0.1585 0.1116 0.2194 1.13e-07 7t7t:B
18 7t7t:A 466 101 0.0884 0.0622 0.2871 1.13e-05 7t7t:B
19 7t7t:A 466 188 0.1311 0.0923 0.2287 4.53e-05 7t7t:B
20 7t7t:A 466 324 0.2165 0.1524 0.2191 5.04e-05 7t7t:B
21 7t7t:A 466 92 0.0793 0.0558 0.2826 0.017 7t7t:B
22 7yeh:A 1020 267 0.2012 0.0647 0.2472 3.16e-05 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
23 7yeh:A 1020 291 0.2104 0.0676 0.2371 0.002 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
24 7yeh:A 1020 126 0.1098 0.0353 0.2857 0.013 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
25 7yeh:A 1020 173 0.1189 0.0382 0.2254 0.42 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
26 6mfv:A 641 163 0.1250 0.0640 0.2515 1.36e-04 6mfv:B, 6mfv:C, 6mfv:D
27 6mfv:A 641 127 0.0976 0.0499 0.2520 0.004 6mfv:B, 6mfv:C, 6mfv:D
28 6mfv:A 641 154 0.1006 0.0515 0.2143 0.40 6mfv:B, 6mfv:C, 6mfv:D
29 6mfv:A 641 89 0.0579 0.0296 0.2135 7.3 6mfv:B, 6mfv:C, 6mfv:D
30 3uq3:A 258 60 0.0671 0.0853 0.3667 0.001 3upv:A
31 3uq3:A 258 55 0.0579 0.0736 0.3455 2.3 3upv:A
32 3uq3:A 258 27 0.0335 0.0426 0.4074 6.4 3upv:A
33 7y4i:A 822 197 0.1646 0.0657 0.2741 0.002 8dti:A, 8dti:B
34 7y4i:A 822 258 0.1982 0.0791 0.2519 0.008 8dti:A, 8dti:B
35 5lwv:A 711 195 0.1402 0.0647 0.2359 0.003 5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
36 5lwv:A 711 173 0.1189 0.0549 0.2254 0.45 5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
37 1elr:A 128 61 0.0549 0.1406 0.2951 0.031 3esk:A, 3fwv:A, 3fwv:B
38 1elr:A 128 111 0.0793 0.2031 0.2342 5.0 3esk:A, 3fwv:A, 3fwv:B
39 8gl8:I 624 82 0.0640 0.0337 0.2561 0.50
40 8h4q:N 488 83 0.0762 0.0512 0.3012 0.84 8h4h:N, 8h4h:A, 8h4q:A
41 4gpk:J 347 79 0.0701 0.0663 0.2911 2.4 4gpk:A, 4gpk:B, 4gpk:C, 4gpk:D, 4gpk:E, 4gpk:F, 4gpk:G, 4gpk:H, 4gpk:I, 4gpk:K, 4gpk:L
42 3juc:A 149 28 0.0366 0.0805 0.4286 3.3
43 3muo:A 684 39 0.0579 0.0278 0.4872 3.9 3iuq:A, 3iur:A, 3ivm:A
44 6lxn:A 110 32 0.0396 0.1182 0.4062 4.6 6lxn:B
45 5ze8:A 385 95 0.0762 0.0649 0.2632 4.9
46 5a01:A 681 100 0.0732 0.0352 0.2400 5.5 5a01:B, 5a01:C
47 5a01:A 681 104 0.0793 0.0382 0.2500 6.3 5a01:B, 5a01:C
48 7qe7:K 531 88 0.0671 0.0414 0.2500 5.7 5a31:J, 5a31:K, 5g04:J, 5g04:K, 5g05:J, 5g05:K, 9gaw:Q, 9gaw:K, 3hym:B, 3hym:D, 3hym:F, 3hym:H, 3hym:J, 3hym:L, 5lcw:J, 5lcw:K, 8pkp:Q, 8pkp:K, 6q6g:Q, 6q6g:K, 6q6h:Q, 6q6h:K, 7qe7:Q, 8s4g:Q, 8s4g:K, 6tlj:J, 6tlj:K, 6tm5:J, 6tm5:K, 6tnt:J, 6tnt:K, 4ui9:J, 4ui9:K
49 4i9e:A 383 163 0.1250 0.1070 0.2515 6.3 4i9c:A, 4i9e:B, 3ulq:A
50 4oyz:A 469 52 0.0457 0.0320 0.2885 6.7 8b75:A, 4clk:A, 4cll:A, 4clp:A, 4cls:A, 4clt:A, 4clu:A, 4clw:A, 4cly:A, 4clz:A, 4cm0:A, 4cm2:A, 8cnh:A, 8co7:A, 8coj:A, 8cot:A, 5d0r:A, 5iv3:A, 5iv4:A, 7ovd:A, 4oya:A, 4oyb:A, 4oyi:A, 4oym:A, 4oyo:A, 4oyp:A, 4oyx:A, 4oz2:A, 4oz3:A, 4ust:A, 4usu:A, 4usv:A, 4usw:A
51 1gmw:A 138 28 0.0335 0.0797 0.3929 7.2 1gmw:B, 1gmw:C, 1gmw:D
52 3wd7:A 401 76 0.0610 0.0499 0.2632 9.3 7cct:A, 6l7j:A, 3wd7:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218