BioLiP

>protein
GSARRLYVGNIPFGITEEAMMDFFNAQMRLGGLTQAPGNPVLAVQINQKNFAFLEFRSVDETTQAMAFDGIIFQGQSLKI
RRP

The query sequence (length=83) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6xlv:A	203	82	0.9639	0.3941	0.9756	7.11e-52	5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
2	5x8p:v	190	84	0.2530	0.1105	0.2500	2.50e-04	5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
3	5x8p:v	190	18	0.1205	0.0526	0.5556	2.2	5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
4	2n7c:A	89	83	0.2651	0.2472	0.2651	8.38e-04
5	7s7b:C	79	87	0.3012	0.3165	0.2874	0.001	7s7b:G, 7s7c:C
6	2mgz:A	94	83	0.2892	0.2553	0.2892	0.004
7	6zj3:Sg	199	74	0.2410	0.1005	0.2703	0.007
8	2x1f:A	94	71	0.2410	0.2128	0.2817	0.007	2km8:B, 2x1a:A
9	5ifm:C	256	80	0.3133	0.1016	0.3250	0.009	5ifm:A
10	8esq:o	137	62	0.2410	0.1460	0.3226	0.021	8esr:o, 8etg:o, 8eth:o, 8eti:o, 8eup:o, 8euy:o, 8ev3:o
11	6hpj:B	84	82	0.2892	0.2857	0.2927	0.024
12	6fec:u	76	51	0.1928	0.2105	0.3137	0.057
13	3lqv:B	115	40	0.1807	0.1304	0.3750	0.063	2f9j:B, 3lqv:A, 7q4o:F, 8qo9:B6, 8qxd:B6, 8qzs:B6, 8r08:B6, 8r09:B6, 8r0a:B6, 8r0b:B6, 8rm5:B6
14	4a8x:A	88	77	0.2048	0.1932	0.2208	0.082
15	5en1:A	184	66	0.2289	0.1033	0.2879	0.11	8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
16	7uj1:B	270	80	0.3373	0.1037	0.3500	0.14	7pu5:B, 7pu5:D, 7pu5:H, 7pu5:J, 7pu5:L, 7sp0:B, 7uj1:A
17	4q8r:A	241	56	0.1807	0.0622	0.2679	0.33
18	2mkk:A	213	77	0.2410	0.0939	0.2597	0.34
19	9gpj:A	184	66	0.2289	0.1033	0.2879	0.72	6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
20	8by6:B	152	63	0.1928	0.1053	0.2540	0.76	7abg:A1, 6d0y:A, 1h2t:Z, 1h2u:X, 1h2u:Y, 1n52:B, 5oo6:B, 5oo6:E, 5oo6:H, 5oo6:K, 5oo6:N, 5oo6:Q, 5oo6:T, 5oo6:W, 5oob:D, 5oob:J, 5oob:B, 5oob:G, 8pmp:B, 8pnt:B, 8srr:B, 8suy:B
21	8i0v:4	161	61	0.2169	0.1118	0.2951	1.4
22	6n7p:A	186	81	0.2410	0.1075	0.2469	1.5	6n7r:A, 6n7x:A, 7oqc:B, 7oqe:B, 8w2o:A, 5zwn:Q
23	6g90:B	193	81	0.2410	0.1036	0.2469	1.7
24	5v1y:A	114	58	0.1928	0.1404	0.2759	2.0	6co4:A, 8ftq:A, 8ftq:B, 7kxi:A, 6oi4:A, 6oi4:B, 6uyi:A, 6uyj:A, 5v1y:B, 5v1z:B, 5v1z:A
25	7q33:A	93	84	0.2289	0.2043	0.2262	2.3	6pai:D, 6q0r:D, 6q0v:D, 6q0w:D, 6sj7:C, 6ud7:C, 6ue5:C
26	4bs2:A	174	80	0.2410	0.1149	0.2500	3.5	4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
27	6dg0:B	84	68	0.2169	0.2143	0.2647	4.1	6dg0:A
28	6zu5:LT0	160	30	0.1446	0.0750	0.4000	4.9
29	7dco:4	174	54	0.2169	0.1034	0.3333	7.1	6g90:R, 5gm6:e, 5nrl:R, 7oqb:R, 7oqe:R, 5zwm:4
30	7ccd:A	169	29	0.1084	0.0533	0.3103	7.1	7cc9:A, 7cc9:B, 7cc9:C, 7ccd:B, 7ccj:A, 7ccj:B
31	5gg6:B	295	32	0.1687	0.0475	0.4375	7.4	5gg6:A, 5gg7:A, 5gg7:B, 5gg8:A, 5gg9:A, 5gga:A, 5ggb:A, 5ggc:A, 5ggc:B, 5ggd:A, 5ggd:B, 6m65:A, 6m69:A, 6m6y:A, 6m72:A, 5xd1:A, 5xd2:A, 5xd3:A, 5xd4:A, 5xd5:B, 5xd5:A
32	2kg0:A	92	58	0.2169	0.1957	0.3103	7.6

[Back]