Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GSARCAVCEGPGELCDLFFCTSCGHHYHGACLDTALTARKRAGWQCPECKVCQACRKPGNDSKMLVCETCDKGYHTFCLK
PPMEELPAHSWKCKACRV

The query sequence (length=98) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 9atn:A 98 98 1.0000 1.0000 1.0000 3.29e-69
2 2ysm:A 111 96 0.6837 0.6036 0.6979 2.14e-49
3 5b79:A 118 88 0.3776 0.3136 0.4205 2.03e-18 5vdc:A
4 5b79:A 118 45 0.1327 0.1102 0.2889 0.77 5vdc:A
5 5szb:A 115 84 0.3776 0.3217 0.4405 2.05e-18 5i3l:A, 5i3l:B, 2kwj:A, 2kwk:A, 2kwn:A, 2kwo:A, 5szc:A
6 4lk9:A 126 86 0.3776 0.2937 0.4302 4.81e-17 5b75:A, 5b76:A, 5b77:A, 5b78:A, 4ljn:A, 4lka:A, 4llb:A, 4llb:B, 2ln0:A, 6lsb:A, 3v43:A
7 6oie:B 111 86 0.3673 0.3243 0.4186 1.31e-16 6oie:A, 5u2j:B, 5u2j:A
8 1f62:A 51 46 0.2143 0.4118 0.4565 3.06e-12
9 1f62:A 51 48 0.2041 0.3922 0.4167 1.08e-05
10 7klo:A 59 46 0.2143 0.3559 0.4565 1.76e-11 7klr:A
11 7klo:A 59 33 0.1224 0.2034 0.3636 0.043 7klr:A
12 2e6r:A 92 52 0.2245 0.2391 0.4231 1.98e-11
13 2e6r:A 92 57 0.2143 0.2283 0.3684 1.09e-04
14 2mny:A 55 49 0.1939 0.3455 0.3878 3.09e-10 2mnz:A
15 2mny:A 55 45 0.1429 0.2545 0.3111 0.056 2mnz:A
16 2miq:A 94 86 0.3061 0.3191 0.3488 7.41e-10
17 2miq:A 94 42 0.1531 0.1596 0.3571 0.021
18 5vab:A 54 45 0.2041 0.3704 0.4444 2.43e-09
19 5vab:A 54 50 0.1735 0.3148 0.3400 0.005
20 6fhq:A 58 45 0.2143 0.3621 0.4667 2.49e-09 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
21 4q6f:A 56 45 0.2041 0.3571 0.4444 2.72e-09 6fap:A, 6fap:B, 6fap:C, 6fap:D, 6fhu:A, 6fhu:B, 6fhu:D, 6fhu:C, 6fi0:A, 6fi0:B, 6fi0:C, 6fi0:D, 6fkp:A, 6fkp:D, 6fkp:C, 6fkp:B, 4q6f:B, 4q6f:C, 4q6f:D, 4qf2:A, 4qf2:B, 4qf2:C, 4qf2:D, 5t8r:D, 5t8r:A, 5t8r:B, 5t8r:C
22 6ryr:W 708 45 0.1837 0.0254 0.4000 1.42e-08 2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
23 6ryr:W 708 62 0.2245 0.0311 0.3548 1.72e-04 2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
24 5hh7:A 192 59 0.2449 0.1250 0.4068 9.03e-08
25 8hxx:N 375 62 0.2347 0.0613 0.3710 1.71e-07 8hxy:N, 8hy0:N, 8i3f:B, 8jho:N, 8tof:G, 8w9c:E, 8w9d:E, 8w9e:E, 8w9f:E
26 2yql:A 56 46 0.1939 0.3393 0.4130 3.30e-07
27 2yql:A 56 46 0.1735 0.3036 0.3696 6.69e-04
28 8ihn:M 357 48 0.1939 0.0532 0.3958 5.06e-07 8kd4:E
29 2puy:B 60 46 0.1939 0.3167 0.4130 6.73e-07 2puy:A
30 2puy:B 60 46 0.1735 0.2833 0.3696 3.15e-04 2puy:A
31 7yi2:D 321 48 0.1939 0.0592 0.3958 1.23e-06 7yi0:D, 7yi3:D, 7yi4:D, 7yi5:D
32 8kd6:E 301 48 0.1939 0.0631 0.3958 1.39e-06 8kd2:E
33 2ke1:A 66 45 0.1633 0.2424 0.3556 2.38e-06 2kft:A, 1xwh:A
34 2ke1:A 66 45 0.1735 0.2576 0.3778 0.39 2kft:A, 1xwh:A
35 2l5u:A 61 46 0.1735 0.2787 0.3696 7.45e-06
36 2l5u:A 61 46 0.1633 0.2623 0.3478 0.002
37 4gy5:A 215 70 0.2245 0.1023 0.3143 1.66e-05 3ask:A, 3ask:B, 3ask:D, 3asl:A, 3db3:A, 7fb7:B, 4gy5:B, 6iiw:A, 2lgg:A, 2lgk:A, 2lgl:A, 4qqd:A, 4qqd:B, 3shb:A, 3sou:A, 3sou:B, 3sow:A, 3sow:B, 3sox:A, 3sox:B, 3t6r:B, 3t6r:A, 8wms:A, 5xpi:A, 5yy9:A, 5yy9:B, 3zvy:A, 3zvy:B, 3zvz:B
38 4gy5:A 215 47 0.1531 0.0698 0.3191 0.82 3ask:A, 3ask:B, 3ask:D, 3asl:A, 3db3:A, 7fb7:B, 4gy5:B, 6iiw:A, 2lgg:A, 2lgk:A, 2lgl:A, 4qqd:A, 4qqd:B, 3shb:A, 3sou:A, 3sou:B, 3sow:A, 3sow:B, 3sox:A, 3sox:B, 3t6r:B, 3t6r:A, 8wms:A, 5xpi:A, 5yy9:A, 5yy9:B, 3zvy:A, 3zvy:B, 3zvz:B
39 2e6s:A 77 51 0.1735 0.2208 0.3333 1.90e-05
40 2e6s:A 77 51 0.1837 0.2338 0.3529 0.33
41 7xga:A 126 38 0.1633 0.1270 0.4211 2.33e-05 6vfo:A
42 1mm3:A 61 44 0.1633 0.2623 0.3636 3.86e-05
43 1mm3:A 61 45 0.1939 0.3115 0.4222 0.017
44 1fp0:A 88 48 0.1531 0.1705 0.3125 4.56e-05
45 1fp0:A 88 57 0.1837 0.2045 0.3158 1.5
46 8i02:G 284 46 0.2143 0.0739 0.4565 4.94e-05 8ifg:P
47 8i02:G 284 32 0.1327 0.0458 0.4062 0.097 8ifg:P
48 7yi0:F 120 50 0.1939 0.1583 0.3800 1.44e-04
49 8w9c:F 156 50 0.1939 0.1218 0.3800 2.23e-04 8hxx:P, 8hy0:P, 8jho:P, 8w9d:F, 8w9e:F, 8w9f:F
50 6q3m:C 219 47 0.1837 0.0822 0.3830 2.30e-04 6q3m:A, 6q3m:B
51 6q3m:C 219 62 0.2245 0.1005 0.3548 0.32 6q3m:A, 6q3m:B
52 2ro1:A 189 48 0.1531 0.0794 0.3125 3.80e-04
53 2ro1:A 189 47 0.1735 0.0899 0.3617 8.6
54 4tvr:A 222 49 0.1633 0.0721 0.3265 0.001
55 4tvr:A 222 46 0.1735 0.0766 0.3696 2.3
56 6guu:B 204 47 0.1735 0.0833 0.3617 0.001 6guu:A
57 6guu:B 204 45 0.1735 0.0833 0.3778 0.81 6guu:A
58 2k16:A 75 71 0.2245 0.2933 0.3099 0.007 5c13:A, 5c13:C, 5c13:E, 5c13:G, 2k17:A, 5wxg:A, 5wxh:C, 5wxh:A, 5xmy:A, 5xmy:C
59 2k16:A 75 45 0.1224 0.1600 0.2667 0.81 5c13:A, 5c13:C, 5c13:E, 5c13:G, 2k17:A, 5wxg:A, 5wxh:C, 5wxh:A, 5xmy:A, 5xmy:C
60 8bpb:C 126 45 0.1429 0.1111 0.3111 0.025 8bpc:C
61 8bpb:C 126 44 0.1429 0.1111 0.3182 2.3 8bpc:C
62 8bpa:C 213 44 0.1429 0.0657 0.3182 0.027 8c60:C
63 8bpa:C 213 49 0.1735 0.0798 0.3469 0.31 8c60:C
64 8bpa:C 213 44 0.1429 0.0657 0.3182 1.9 8c60:C
65 2yt5:A 66 51 0.1531 0.2273 0.2941 0.031
66 3o36:A 184 49 0.1837 0.0978 0.3673 0.045 7b9x:A, 5h1t:A, 5h1t:B, 5h1t:C, 5h1t:D, 5h1u:B, 5h1u:A, 5h1u:C, 5h1u:D, 5h1v:A, 5h1v:B, 3o33:A, 3o33:B, 3o33:C, 3o33:D, 3o34:A, 3o35:B, 3o35:A, 3o36:B, 3o37:A, 3o37:B, 3o37:C, 3o37:D, 4yab:A, 4yab:B, 4yad:A, 4yad:B, 4yat:A, 4yat:B, 4yax:A, 4yax:B, 4ybm:A, 4ybm:B, 4ybs:A, 4ybt:A, 4yc9:A, 4zql:A, 4zql:B
67 2qh1:B 185 53 0.1531 0.0811 0.2830 0.055 1pvm:A, 1pvm:B, 2qh1:A
68 3u5m:E 173 49 0.1837 0.1040 0.3673 0.069
69 7ebk:A 183 38 0.1429 0.0765 0.3684 0.082 7ebj:A
70 3u5o:C 195 49 0.1837 0.0923 0.3673 0.084 8bd8:A, 8bd9:A, 8bdy:A, 5mr8:A, 3u5m:A, 3u5m:B, 3u5m:C, 3u5m:D, 3u5m:F, 3u5m:G, 3u5m:H, 3u5m:I, 3u5m:K, 3u5m:J, 3u5m:L, 3u5n:A, 3u5n:B, 3u5o:A, 3u5o:B, 3u5o:D, 3u5o:E, 3u5o:F, 3u5o:G, 3u5o:H, 3u5p:A, 3u5p:B, 3u5p:C, 3u5p:D, 3u5p:E, 3u5p:F, 3u5p:G, 3u5p:H, 7zdd:A
71 8i02:F 235 49 0.1837 0.0766 0.3673 0.12
72 5zbu:A 74 46 0.1837 0.2432 0.3913 0.13 5zbu:D, 5zc4:A, 5zc4:D
73 6ieu:A 170 38 0.1327 0.0765 0.3421 0.23 6iet:A
74 2lri:C 66 49 0.1837 0.2727 0.3673 0.32
75 4ptb:A 178 49 0.1531 0.0843 0.3061 0.44 5fb0:A, 5fb0:C, 5fb1:A, 6g5n:A, 6g5n:B, 6g5p:A, 6g5p:B, 4ptb:B, 5pwc:A, 5pwc:B, 5pwd:A, 5pwd:B, 5pwe:A, 5pwe:B, 5pwf:A, 5pwf:B, 5pwg:A, 5pwg:B, 5pwh:A, 5pwh:B, 5pwi:A, 5pwi:B, 5pwj:A, 5pwj:B, 5pwk:A, 5pwk:B, 5pwl:A, 5pwl:B, 5pwm:A, 5pwm:B, 5pwn:A, 5pwn:B, 5pwo:A, 5pwo:B, 5pwp:A, 5pwp:B, 5pwq:A, 5pwq:B, 5pwr:A, 5pwr:B, 5pws:A, 5pws:B, 5pwt:A, 5pwt:B, 5pwu:A, 5pwu:B, 5pwv:A, 5pwv:B, 5pww:A, 5pww:B, 5pwx:A, 5pwx:B, 5pwy:A, 5pwy:B, 5pwz:A, 5pwz:B, 5px0:A, 5px0:B, 5px1:A, 5px1:B, 5px2:A, 5px2:B, 5px3:A, 5px3:B, 5px4:A, 5px4:B, 5px5:A, 5px5:B, 5px6:A, 5px6:B, 5px7:A, 5px7:B, 5px8:A, 5px8:B, 5px9:A, 5px9:B, 5pxa:A, 5pxa:B, 5pxb:A, 5pxb:B, 5pxc:A, 5pxc:B, 5pxd:A, 5pxd:B, 5pxe:A, 5pxe:B, 5pxf:A, 5pxf:B, 5pxg:A, 5pxg:B, 5pxh:A, 5pxh:B, 5pxi:A, 5pxi:B, 5pxj:A, 5pxj:B, 5pxk:A, 5pxk:B, 5pxl:A, 5pxl:B, 5pxm:A, 5pxm:B, 5pxn:A, 5pxn:B, 5pxo:A, 5pxo:B, 5pxp:A, 5pxp:B, 5pxq:A, 5pxq:B, 5pxr:A, 5pxr:B, 5pxs:A, 5pxs:B, 5pxt:A, 5pxt:B, 5pxu:A, 5pxu:B, 5pxv:A, 5pxv:B, 5pxw:A, 5pxw:B, 5pxx:A, 5pxx:B, 5pxy:A, 5pxy:B, 5pxz:A, 5pxz:B, 5py0:A, 5py0:B, 5py1:A, 5py1:B, 5py2:A, 5py2:B, 5py3:A, 5py3:B, 5py4:A, 5py4:B, 5py5:A, 5py5:B, 5py6:A, 5py6:B, 5py7:A, 5py7:B, 5py8:A, 5py8:B, 5py9:A, 5py9:B, 5pya:A, 5pya:B, 5pyb:A, 5pyb:B, 5pyc:A, 5pyc:B, 5pyd:A, 5pyd:B, 5pye:A, 5pye:B, 5pyf:A, 5pyf:B, 5pyg:A, 5pyg:B, 5pyh:A, 5pyh:B, 5pyi:A, 5pyi:B, 5pyj:A, 5pyj:B, 5pyk:A, 5pyk:B, 5pyl:A, 5pyl:B, 5pym:A, 5pym:B, 5pyn:A, 5pyn:B, 5pyo:A, 5pyo:B, 5pyp:A, 5pyp:B, 5pyq:A, 5pyq:B, 5pyr:A, 5pyr:B, 5pys:A, 5pys:B, 5pyt:A, 5pyt:B, 5pyu:A, 5pyu:B, 5pyv:A, 5pyv:B, 5pyw:A, 5pyw:B, 5pyx:A, 5pyx:B, 5pyy:A, 5pyy:B, 5pyz:A, 5pyz:B, 5pz0:A, 5pz0:B, 5pz1:A, 5pz1:B, 5pz2:A, 5pz2:B, 5pz3:A, 5pz3:B, 5pz4:A, 5pz4:B, 5pz5:A, 5pz5:B, 5pz6:A, 5pz6:B, 5pz7:A, 5pz7:B, 5pz8:A, 5pz8:B, 5pz9:A, 5pz9:B, 5pza:A, 5pza:B, 5pzb:A, 5pzb:B, 5pzc:A, 5pzc:B, 5pzd:A, 5pzd:B, 5pze:A, 5pze:B, 5pzf:A, 5pzf:B, 5pzg:A, 5pzg:B, 5pzh:A, 5pzh:B, 5pzi:A, 5pzi:B, 5pzj:A, 5pzj:B
76 6knb:B 1120 74 0.2347 0.0205 0.3108 0.52 6knc:B
77 6g8r:B 164 47 0.1633 0.0976 0.3404 0.77 2md7:B, 2md8:C
78 6g8r:B 164 66 0.2041 0.1220 0.3030 8.4 2md7:B, 2md8:C
79 8aaf:e 1527 54 0.1633 0.0105 0.2963 0.88 8agt:e, 8agu:e, 8agv:e, 8agw:e, 8agx:e, 8agz:e
80 6y2x:A 231 33 0.1224 0.0519 0.3636 1.4 6ir0:A, 6y22:A, 6y3j:A
81 7mex:A 1737 39 0.1122 0.0063 0.2821 1.4 6kgi:B, 7mey:A, 3nih:A, 3nii:A, 3nij:A, 3nik:B, 3nik:D, 3nik:A, 3nik:F, 3nil:D, 3nil:A, 3nil:B, 3nil:F, 3nim:B, 3nim:F, 3nim:A, 3nim:D, 3nin:A, 3nin:B, 3nis:A, 3nis:B, 3nis:D, 3nis:F, 3nit:A
82 7odf:A 703 33 0.1020 0.0142 0.3030 1.4
83 8uxh:A 4004 54 0.1633 0.0040 0.2963 1.5 8uxh:B, 8uxh:C, 8uxh:D, 8uxi:A, 8uxi:B, 8uxi:C, 8uxi:D
84 8uxl:A 4232 54 0.1633 0.0038 0.2963 1.5 7u9q:A, 7u9q:D, 7u9q:B, 7u9q:C, 7u9r:A, 7u9r:D, 7u9r:B, 7u9r:C, 7u9t:A, 7u9t:D, 7u9t:B, 7u9t:C, 7u9x:A, 7u9x:B, 7u9x:C, 7u9x:D, 7u9z:A, 7u9z:B, 7u9z:C, 7u9z:D, 7ua1:A, 7ua1:B, 7ua1:C, 7ua1:D, 7ua5:A, 7ua5:B, 7ua5:C, 7ua5:D, 7ua9:A, 7ua9:B, 7ua9:C, 7ua9:D, 8uq2:A, 8uq2:B, 8uq2:C, 8uq2:D, 8uq3:A, 8uq3:B, 8uq3:C, 8uq3:D, 8uq4:A, 8uq4:B, 8uq4:C, 8uq4:D, 8uq5:A, 8uq5:B, 8uq5:C, 8uq5:D, 8uxc:A, 8uxc:B, 8uxc:C, 8uxc:D, 8uxe:A, 8uxe:B, 8uxe:C, 8uxe:D, 8uxf:A, 8uxf:B, 8uxf:C, 8uxf:D, 8uxg:A, 8uxg:B, 8uxg:C, 8uxg:D, 8uxl:B, 8uxl:C, 8uxl:D, 8uxm:A, 8uxm:B, 8uxm:C, 8uxm:D
85 7ua3:A 4443 54 0.1633 0.0036 0.2963 1.5 7ua3:B, 7ua3:C, 7ua3:D, 7ua4:A, 7ua4:B, 7ua4:C, 7ua4:D
86 5xfr:A 309 36 0.1122 0.0356 0.3056 1.8 5xfr:B
87 5b73:A 313 69 0.2245 0.0703 0.3188 1.9 4cos:A, 7cwh:B, 5y1z:C, 5y1z:D
88 8i3x:A 60 28 0.1122 0.1833 0.3929 2.2 8i3x:B
89 5eya:G 86 52 0.1429 0.1628 0.2692 2.8 5eya:F, 5fer:A, 5fer:D
90 5wlf:A 60 48 0.1429 0.2333 0.2917 2.9 5wle:A
91 4v3k:C 75 46 0.1531 0.2000 0.3261 3.2 7ojx:A, 4v3k:F, 4v3l:C
92 7duf:A 62 47 0.1531 0.2419 0.3191 3.3 7duf:B
93 5y20:A 52 38 0.1224 0.2308 0.3158 4.4
94 1wem:A 76 25 0.0918 0.1184 0.3600 5.1 4l7x:A, 2m3h:A
95 7bvw:A 79 46 0.1531 0.1899 0.3261 5.7 7bvw:B
96 1x4j:A 75 47 0.1531 0.2000 0.3191 6.3
97 2kiz:A 69 57 0.1531 0.2174 0.2632 7.1 5lg0:A, 5lg7:A, 7p2k:A
98 5dka:A 96 30 0.1224 0.1250 0.4000 7.2 5dka:B, 8gbq:B, 8gcb:B
99 2reg:A 290 24 0.1122 0.0379 0.4583 7.4 2reg:B, 2rin:A, 2rin:B
100 7zj3:A 86 48 0.1633 0.1860 0.3333 8.3 8a38:A, 8a38:B, 8a38:C, 8ams:C, 8ams:D, 7zj3:D, 7zj3:G, 7zj3:J
101 6rxn:A 45 42 0.1224 0.2667 0.2857 8.4
102 7dge:A 784 44 0.1122 0.0140 0.2500 8.7 1ewk:A, 1ewk:B, 1isr:A, 1iss:A, 1iss:B, 3ks9:A, 3ks9:B
103 6j2p:A 98 31 0.1020 0.1020 0.3226 9.1 6j2p:B, 6j2p:D, 6j2p:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218