BioLiP

>protein
GRYTTDDGYIFNASDIIEDTGDAYIVPHGDHYHYIPKNELSASELAAAEAFLSG

The query sequence (length=54) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2cs7:A	55	54	1.0000	0.9818	1.0000	1.24e-34	2cs7:B, 2cs7:C
2	6csl:A	71	43	0.3704	0.2817	0.4651	1.66e-09
3	3zfj:A	119	34	0.2407	0.1092	0.3824	0.12
4	4tqg:A	297	21	0.1852	0.0337	0.4762	0.37
5	8oh5:C	1172	35	0.2037	0.0094	0.3143	1.2	8oh5:F, 8oh5:I, 8oh5:L, 8oh9:C, 8oh9:F, 8oh9:I, 8oh9:L
6	1o4s:B	384	44	0.2778	0.0391	0.3409	2.1	1o4s:A
7	8q7x:A	1914	34	0.2222	0.0063	0.3529	5.3
8	8qp8:A	1918	34	0.2222	0.0063	0.3529	5.3
9	5z57:A	1978	34	0.2222	0.0061	0.3529	5.3
10	8i0p:A	2149	34	0.2222	0.0056	0.3529	5.3	8q7q:A, 8q7v:A, 8q7w:A
11	7abg:A	2174	34	0.2222	0.0055	0.3529	5.3	7abi:A, 8q91:A, 8rc0:A
12	8y6o:C	2227	34	0.2222	0.0054	0.3529	5.3	8h6e:5B, 8h6j:5B, 8qp9:A, 6qw6:5A, 6qx9:5A, 8qxd:A, 8r08:A
13	5z56:A	2232	34	0.2222	0.0054	0.3529	5.3	7aav:A, 7abf:A, 8ch6:a, 7dvq:A, 8i0s:A, 5z58:A
14	8h6k:5B	2253	34	0.2222	0.0053	0.3529	5.3	8h6l:5B, 8i0u:A, 8i0v:A, 8q7n:A, 8qo9:A, 8qpe:A, 7qtt:a, 8qzs:A
15	8c6j:A	2261	34	0.2222	0.0053	0.3529	5.3	6ah0:A, 6ahd:A, 8bc8:J, 6ff4:A, 6ff7:A, 9fmd:A, 8i0r:A, 8i0t:A, 8i0w:A, 6icz:A, 6id0:A, 6id1:A, 4jk9:A, 4jk9:B, 4jka:A, 4jka:B, 5mqf:A, 5o9z:A, 6qdv:A, 8qoz:A, 8qpa:A, 8qpb:A, 8qpk:A, 8r09:A, 8r0a:A, 8r0b:A, 8rm5:A, 8ro2:A, 7w59:A, 7w5a:A, 7w5b:A, 5xjc:A, 5yzg:A, 6zym:A
16	6tmf:S	111	24	0.1667	0.0811	0.3750	5.6
17	8ro0:A	2231	19	0.1667	0.0040	0.4737	7.1	8ro1:A
18	5yrp:A	224	20	0.1481	0.0357	0.4000	8.3	5yrp:B

[Back]