BioLiP

>protein
GRYSVKRYKTKRRTRDLDLIYNDLSTKESVQKLLNQPLDETKPGLGQHYCIHCAKYMETAIALKTHLKGKVHKRRVKELR
GVPYTQEVSDAAAGYNLNKFLNRVQEITQSVGPEKESNEALLKEHLDSTL

The query sequence (length=130) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8hfr:ox	143	130	1.0000	0.9091	1.0000	8.10e-95	6ft6:I, 3jct:I, 6m62:I, 6n8j:I, 6n8k:I, 6n8l:I, 7ug6:I, 7uoo:I, 7uqb:I, 7uqz:I, 7v08:I, 6ylg:I, 6ylh:I, 6yly:I, 7z34:I
2	8pv1:Cb	101	90	0.3231	0.4158	0.4667	1.23e-21	8pv2:Cb, 8pv3:Cb, 8pv4:Cb, 8pv5:Cb, 8pv6:Cb, 8pv7:Cb, 8pv8:Cb, 8pvk:Cb, 8pvl:Cb
3	8fld:NP	108	90	0.2692	0.3241	0.3889	2.92e-14	8fl2:NP, 8fl3:NP, 8fl4:NP, 8fl6:NP, 8fl7:NP, 8fl9:NP, 8fla:NP, 8flb:NP, 8flc:NP, 8fle:NP, 8flf:NP, 8idt:9, 8idy:9, 8ie3:9, 8ine:9, 8inf:9, 8ink:9, 8ipd:9, 8ipx:9, 8ipy:9, 8ir3:9, 6lss:9, 6lu8:9, 1zr9:A
4	6g90:T	462	38	0.0923	0.0260	0.3158	0.002	7dco:u, 4dgw:A, 5nrl:T, 5zwm:u
5	6jig:A	480	42	0.1077	0.0292	0.3333	0.44	6lk4:A
6	8j6g:A	621	47	0.1077	0.0225	0.2979	0.69	3amo:A, 3amo:B, 1av4:A, 1avl:A, 2bt3:A, 2cfd:A, 2cfd:B, 2cfg:A, 2cfg:B, 2cfk:A, 2cfl:A, 2cfw:A, 2cg0:A, 2cg1:A, 2cwt:A, 2cwt:B, 2cwu:A, 2cwu:B, 2cwv:A, 2cwv:B, 2d1w:A, 2d1w:B, 2e2t:A, 2e2u:A, 2e2u:B, 2e2v:A, 2e2v:B, 7f8k:A, 1iqx:A, 1iqx:B, 1iu7:A, 1iu7:B, 1ivu:A, 1ivu:B, 1ivv:A, 1ivv:B, 1ivw:A, 1ivw:B, 1ivx:A, 1ivx:B, 3kii:A, 3kii:B, 3kn4:A, 6l9c:X, 1rjo:A, 1sih:A, 1sii:A, 1ui7:A, 1ui7:B, 1ui8:A, 1ui8:B, 1w4n:A, 1w4n:B, 1w5z:A, 1w6c:A, 1w6g:A, 3wa2:X, 3wa3:A, 3wa3:B, 7wir:A, 7wir:B, 7wis:A, 7wis:B, 1wmn:A, 1wmn:B, 1wmp:A, 1wmp:B, 7wno:X, 7wnp:X, 3x3x:A, 3x3x:B, 3x3y:A, 3x3y:B, 3x3z:A, 3x3z:B, 3x40:A, 3x40:B, 3x41:A, 3x41:B, 3x42:A, 3x42:B, 7ynh:A, 7ynh:B, 2yx9:A, 2yx9:B, 2zl8:A, 2zl8:B, 5zou:A, 5zou:B, 5zow:A, 5zow:B, 5zox:A, 5zox:B, 5zoy:A, 5zoy:B, 5zoz:A, 5zoz:B, 5zp0:A, 5zp0:B, 5zp1:A, 5zp1:B, 5zp2:A, 5zp2:B, 5zp3:A, 5zp3:B, 5zp4:A, 5zp4:B, 5zp5:A, 5zp5:B, 5zp6:A, 5zp6:B, 5zp7:A, 5zp7:B, 5zp8:A, 5zp8:B, 5zp9:A, 5zp9:B, 5zpa:A, 5zpa:B, 5zpb:A, 5zpb:B, 5zpc:A, 5zpc:B, 5zpd:A, 5zpd:B, 5zpe:A, 5zpe:B, 5zpf:A, 5zpf:B, 5zpg:A, 5zpg:B, 5zph:A, 5zph:B, 5zpi:A, 5zpi:B, 5zpj:A, 5zpj:B, 5zpk:A, 5zpk:B, 5zpl:A, 5zpl:B, 5zpm:A, 5zpm:B, 5zpn:A, 5zpn:B, 5zpo:A, 5zpo:B, 5zpp:A, 5zpp:B, 5zpq:A, 5zpq:B, 5zpr:A, 5zpr:B, 5zps:A, 5zps:B, 5zpt:A, 5zpt:B
7	5gjo:A	385	57	0.1385	0.0468	0.3158	1.4	5gjn:A, 5gjo:B, 5gjp:A
8	1xcr:A	313	39	0.1000	0.0415	0.3333	1.7	1xcr:B
9	1eep:A	314	42	0.1231	0.0510	0.3810	2.3
10	2vrd:A	61	36	0.0923	0.1967	0.3333	2.4	4pjo:L, 4pjo:l, 4pjo:M, 4pjo:m, 6qx9:1C, 7vpx:N
11	8w2o:B	178	32	0.0923	0.0674	0.3750	4.1
12	6pjx:A	542	34	0.1154	0.0277	0.4412	4.3	4tnb:A, 4tnd:A, 8uap:A, 8uaq:A, 4wnk:A
13	8qzs:r	114	30	0.0769	0.0877	0.3333	4.7	7abf:N, 7abg:N, 7abi:N, 8h6k:4N, 5o9z:N, 8q7n:r, 8qpe:r
14	1g8x:A	1009	54	0.1231	0.0159	0.2963	5.5	1g8x:B
15	1sdd:A	268	75	0.1462	0.0709	0.2533	5.7
16	4qj1:D	346	42	0.0769	0.0289	0.2381	6.5	4ixh:A, 4ixh:D, 4ixh:B, 4ixh:C, 3khj:B, 3khj:C, 3khj:D, 3khj:H, 4qj1:A, 4qj1:B, 4qj1:C, 4rv8:A, 4rv8:D, 4rv8:B, 4rv8:C
17	3khj:A	302	42	0.0769	0.0331	0.2381	7.2	3khj:E, 3khj:F, 3khj:G
18	1jwy:A	1039	54	0.1231	0.0154	0.2963	7.6	4ae3:A, 2aka:A, 7b19:A, 7b1a:A, 3bz7:A, 3bz8:A, 3bz9:A, 1d0x:A, 1d0y:A, 1d0z:A, 1d1a:A, 1d1b:A, 1d1c:A, 1fmw:A, 2jhr:A, 2jj9:A, 1jx2:A, 1lvk:A, 3mjx:A, 3mkd:A, 1mma:A, 1mmd:A, 1mmg:A, 1mmn:A, 1mne:A, 3mnq:A, 3myh:X, 3myk:X, 3myl:X, 4pjk:A, 1vom:A, 1w9i:A, 1w9j:A, 1w9k:A, 1w9l:A, 2x9h:A, 2xel:A, 2xo8:A, 2y8i:X, 1yv3:A, 6z2s:A, 6z7t:A, 6z7t:B, 6z7u:A
19	1vei:A	175	33	0.1000	0.0743	0.3939	8.8	1uvh:A, 1uvh:B, 1uvh:C, 1uvh:D, 1veq:A, 1veq:J, 1veq:B, 1veq:C, 1veq:D, 1veq:E, 1veq:F, 1veq:L, 1veq:G, 1veq:H, 1veq:I, 1veq:K

[Back]