Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GRTTIAIDPVTRIEGHLKAEVVVENGKVVDARLSGGMYRGFETILRGRDPRDASQIVQRICGVCPTAHSTASVLALDEAF
GAKVPNNGRITRNLIFGANYLQSHILHFYHLSAQDFVQGPDTAPFVPRFPKSDLRLSKELNKAGVDQYIEALEVRRICHE
MVALFGGRMPHVQGQVVGGATEIPTKEKLVEYAARFKKVRDFVEQKYVPVVYTIGSKYKDMFKVGQGFKAALCVGAFPLD
NSGKKHLFMPGVYAKGKDMPFDPSKIKEYVKYSWFAEETTGLNYKEGKTIPAPDKAGAYSFVKAPRYDGLSLEVGPLARM
WVNNPELSPVGKKLLKDLFGISAKKFRDLGEEAAFSLMGRHVARAEETYYMLGAIEGWLKEIKAGEDTVVMPAVPASAEG
TGFTEAPRGSLLHYVKVKDSKIDNYQIVSASLWNCNPRDDMGQRGAVEEALIGIPVDDIQNPVNVARLIRAFDPULACAV
H

The query sequence (length=481) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6rtp:B 484 481 0.9938 0.9876 0.9938 0.0 5jsh:B, 5jsk:B, 5jsu:B, 5jsy:B, 5jt1:B, 6ru9:B, 6ruc:B, 2wpn:B, 6z7r:B, 6z7r:D, 6z8j:B, 6z8j:D, 6z8m:B, 6z8o:B, 6z8o:D, 6z9g:B, 6z9g:D, 6z9g:F, 6z9g:H, 6z9o:B, 6za1:B, 3ze6:B, 3ze7:B, 3ze8:B, 3ze9:B, 3zea:B
2 4kl8:L 489 490 0.6715 0.6605 0.6592 0.0 1cc1:L, 4kl8:M, 4kn9:L, 4kn9:M, 4ko1:L, 4ko1:M, 4ko2:L, 4ko2:M, 4ko3:L, 4ko3:M, 4ko4:L, 4ko4:M
3 1e3d:B 537 541 0.4158 0.3724 0.3697 1.08e-105 1e3d:D
4 1h2a:L 534 540 0.4179 0.3764 0.3722 3.71e-104 1h2r:L, 4u9h:L, 4u9i:L, 1ubh:L, 1ubj:L, 1ubk:L, 1ubl:L, 1ubm:L, 1ubo:L, 1ubr:L, 1ubt:L, 1ubu:L, 8w6x:L, 1wuh:L, 1wui:L, 1wuj:L, 1wuk:L, 1wul:L, 5xle:L, 5xlf:L, 5xlg:L, 5xlh:L, 5y4n:L
5 3cur:H 545 540 0.4054 0.3578 0.3611 1.43e-102 3cur:I, 3cur:J, 3cus:Q, 3cus:R, 3cus:S, 1frf:L, 3h3x:Q, 3h3x:R, 3h3x:S, 4ucq:Q, 4ucq:R, 4ucq:S, 4ucw:Q, 4ucw:R, 4ucw:S, 4ucx:Q, 4ucx:R, 4ucx:S, 4ud2:S, 4ud2:Q, 4ud2:R, 4ud6:Q, 4ud6:R, 4ud6:S, 4ue2:Q, 4ue2:R, 4ue2:S, 4ue6:R, 4ue6:Q, 4ue6:S, 4ueq:Q, 4ueq:R, 4ueq:S, 4ueq:T, 4ueq:U, 4ueq:V, 4uew:Q, 4uew:R, 4uew:S, 4upe:Q, 4upe:R, 4upe:S, 4upv:Q, 4upv:R, 4uql:Q, 4uql:R, 4uqp:Q, 4uqp:R, 4urh:Q, 4urh:S, 4urh:R, 1yqw:Q, 1yqw:R, 1yqw:S, 1yrq:H, 1yrq:I, 1yrq:J, 1yrq:K, 1yrq:M, 1yrq:N
6 1frv:B 530 543 0.3971 0.3604 0.3517 8.31e-99 1frv:D, 2frv:L, 2frv:B, 2frv:D, 2frv:F, 2frv:H, 2frv:J, 1yq9:H, 1yq9:I
7 3myr:D 561 566 0.4075 0.3494 0.3463 2.03e-97 3myr:B, 3myr:F, 3myr:H
8 6ehq:L 551 550 0.4054 0.3539 0.3545 5.42e-96 6ehq:M, 6ehs:L, 6ehs:M, 6en9:L, 6en9:M, 6g7m:L, 6g7m:M, 6gam:L, 6gam:M, 6gan:L, 6gan:M, 7nem:L, 7nem:M, 6syo:LLL, 6syo:MMM, 6syx:LLL, 6syx:MMM, 6szd:LLL, 6szd:MMM, 6szk:LLL, 6szk:MMM, 7vxq:A, 7vxq:C, 5xvb:L, 5xvb:M, 5xvc:L, 5xvc:M, 5xvd:L, 5xvd:M
9 4c3o:A 583 572 0.3950 0.3259 0.3322 7.64e-94 4c3o:C, 4c3o:E
10 5a4f:L 581 569 0.3763 0.3115 0.3181 1.11e-82 5a4f:M, 5a4i:L, 5a4i:M, 5a4m:L, 5a4m:M, 5adu:L, 5adu:M, 6fpi:L, 6fpi:M, 6fpo:L, 6fpo:M, 6fpw:L, 6fpw:M, 6g7r:L, 6g7r:M, 6g94:L, 6g94:M, 6g94:J, 6g94:K, 6gal:L, 6gal:M, 4gd3:L, 4gd3:M, 4gd3:J, 4gd3:K, 5jrd:L, 5jrd:M, 5lmm:L, 5lmm:M, 5lry:L, 5lry:M, 6rp2:L, 6rp2:M, 4ue3:LLL, 4ue3:MMM, 3uqy:L, 3uqy:M, 3usc:L, 3usc:M, 3use:L, 3use:M
11 3ayx:A 595 585 0.3888 0.3143 0.3197 4.84e-82 3ayx:C, 3ayz:A, 3ayz:C, 5y34:A, 5y34:C
12 4iub:L 602 586 0.3867 0.3090 0.3174 8.04e-78 5d51:L, 4iuc:L, 4iud:L, 5mdj:L, 5mdk:L, 5mdl:L, 7odg:L, 7odh:L, 8pou:L, 8pov:L, 8pow:L, 8pox:L, 8poz:L, 3rgw:L, 4ttt:L
13 8dqv:A 513 526 0.3181 0.2982 0.2909 2.20e-61 8dqv:C, 7utd:A, 7utd:C, 7utd:E, 7utd:G, 7utd:I, 7utd:K, 7utd:M, 7utd:O, 7uur:C, 7uur:F, 7uus:A, 7uus:C, 7uus:E, 7uus:G, 7uus:I, 7uus:K, 7uus:M, 7uus:O
14 5aa5:G 561 558 0.3368 0.2888 0.2903 3.45e-47 5aa5:C, 5aa5:E, 5aa5:K, 5aa5:I, 5aa5:L
15 5odc:F 447 494 0.3077 0.3311 0.2996 7.48e-44 5odc:L, 5odh:F, 5odh:L, 5odi:F, 5odi:L, 5odq:F, 5odq:L, 5odr:F, 5odr:L
16 7t2r:D 447 504 0.2765 0.2975 0.2639 2.50e-39 7t2r:I, 7t30:D, 7t30:I
17 5xf9:D 455 488 0.2723 0.2879 0.2684 4.87e-35 5xf9:H, 5xfa:D, 5xfa:H
18 4ci0:A 385 490 0.2807 0.3506 0.2755 5.17e-32 4omf:A
19 6qgr:A 437 511 0.2640 0.2906 0.2485 6.61e-32 6qgt:A, 6qii:A
20 7z0s:E 532 95 0.0624 0.0564 0.3158 5.04e-07 7z0t:E
21 7z0s:E 532 133 0.0603 0.0545 0.2180 1.0 7z0t:E
22 6cfw:L 374 140 0.0790 0.1016 0.2714 4.02e-04
23 6cfw:L 374 139 0.0728 0.0936 0.2518 0.095
24 8e9h:D 407 270 0.1164 0.1376 0.2074 0.030 8e9g:D
25 6nmx:A 350 52 0.0353 0.0486 0.3269 1.3 6cgq:A, 6cgq:B, 6nmx:B, 6nmx:C, 6nmx:D
26 6i0d:4 384 72 0.0395 0.0495 0.2639 1.4 6i0d:E, 6i1p:E, 3i9v:4, 3iam:4, 3ias:4, 3ias:D, 3ias:M, 3ias:V, 3m9s:4, 3m9s:D, 6q8o:4, 6q8o:E, 6q8w:4, 6q8w:E, 6q8x:4, 6q8x:E, 2ybb:4
27 3ub9:B 165 78 0.0478 0.1394 0.2949 2.8 3ub6:A, 3ub6:B, 3ub8:B, 3ub8:A, 3ub9:A
28 3t6p:A 330 61 0.0353 0.0515 0.2787 3.1 3d9t:A, 3d9t:B, 3d9u:A, 8dsf:A, 8dsf:B, 8dsf:C, 8dsf:D, 8dso:D, 4eb9:A, 4eb9:B, 4eb9:C, 4eb9:D, 6exw:A, 6exw:C, 6hpr:A, 4hy4:A, 4hy4:B, 4hy5:A, 4hy5:B, 4lge:A, 4lge:B, 4lgu:A, 4lgu:B, 5m6n:A, 5m6n:B, 4mti:A, 4mti:B, 3mup:A, 3mup:B, 3mup:C, 3mup:D, 4mu7:A, 4mu7:B, 3oz1:A, 3oz1:B, 3oz1:C, 3oz1:D, 1qbh:A, 7trm:A, 3uw4:A, 6w74:A, 6w7o:C, 6w7o:D, 6w8i:F, 6w8i:D, 6w8i:E
29 1k83:A 1366 63 0.0437 0.0154 0.3333 4.7 1twa:A, 1twc:A, 1twg:A, 1twh:A
30 8tug:A 1367 63 0.0437 0.0154 0.3333 4.7 8tvp:A, 8tvq:A, 8tvv:A, 8tvw:A, 8tvx:A
31 9ja1:A 1286 63 0.0437 0.0163 0.3333 4.7
32 8tvs:A 1316 63 0.0437 0.0160 0.3333 4.8
33 8u9x:A 1398 63 0.0437 0.0150 0.3333 5.0 6blo:A, 6blp:A, 6bm2:A, 6bm4:A, 6bqf:A, 1i6h:A, 7ked:A, 1nik:A, 1r5u:A, 1r9s:A, 7rim:A, 7rip:A, 7riw:A, 7rix:A, 7riy:A, 8u9r:A, 8ukq:A, 8ukr:A, 8uks:A, 8ukt:A, 8uku:A, 6upx:A, 6upy:A, 6upz:A, 6uq0:A, 6uq1:A, 6uq2:A, 6uq3:A, 5w4u:A, 5w51:A
34 3cqz:A 1349 63 0.0437 0.0156 0.3333 5.1
35 5vvs:A 1455 63 0.0437 0.0144 0.3333 5.1 5c4j:A, 3gtg:A, 3gtk:A, 8tvy:A, 5vvr:A
36 8cen:A 1508 63 0.0437 0.0139 0.3333 5.1 4a3b:A, 4a3c:A, 4a3d:A, 4a3e:A, 4a3f:A, 4a3g:A, 4a3i:A, 4a3j:A, 4a3k:A, 4a3l:A, 4a3m:A, 4a93:A, 2b63:A, 2b8k:A, 4bbr:A, 4bbs:A, 4bxx:A, 4bxz:A, 4by1:A, 4by7:A, 5c3e:A, 5c44:A, 5c4a:A, 5c4x:A, 8ceo:A, 2e2h:A, 2e2i:A, 2e2j:A, 3fki:A, 5fmf:A, 5fyw:A, 5fz5:A, 3gtj:A, 3gtl:A, 3gtm:A, 3gto:A, 3gtp:A, 3gtq:A, 6gyk:A, 6gyl:A, 6gym:A, 3h3v:B, 3hou:A, 3hou:M, 3hov:A, 3how:A, 3hox:A, 3hoy:A, 3hoz:A, 1i3q:A, 3i4m:A, 3i4n:A, 1i50:A, 6i84:A, 5ip7:A, 5ip9:A, 3j0k:A, 2ja5:A, 2ja6:A, 2ja7:A, 2ja7:M, 2ja8:A, 8jch:A, 3k1f:A, 8k5p:A, 3k7a:A, 7kee:A, 7kef:A, 3m3y:A, 3m4o:A, 7mei:a, 7mei:A, 7mk9:A, 7mka:a, 7ml0:A, 7ml1:A, 7ml2:A, 7ml4:A, 7nkx:A, 7nky:A, 2nvq:A, 2nvt:A, 2nvx:A, 2nvy:A, 2nvz:A, 7o4i:A, 7o4j:A, 6o6c:A, 7o72:A, 7o73:A, 7o75:A, 5oqj:A, 5oqm:A, 5ot2:A, 3po2:A, 3po3:A, 3qt1:A, 2r7z:A, 1r9t:A, 2r92:A, 2r93:A, 7riq:A, 3rzd:A, 3rzo:A, 3s14:A, 3s15:A, 3s16:A, 3s17:A, 3s1m:A, 3s1n:A, 3s1q:A, 3s1r:A, 3s2d:A, 3s2h:A, 1sfo:A, 5sva:A, 1twf:A, 5u5q:A, 4v1m:A, 4v1n:A, 4v1o:A, 2vum:A, 1wcm:A, 4x67:A, 4x6a:A, 1y1v:A, 1y1w:A, 4y52:A, 1y77:A, 4y7n:A, 2yu9:A, 7zs9:A, 7zsa:A, 7zsb:A
37 6b9v:A 254 39 0.0312 0.0591 0.3846 8.1 6b9v:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218