BioLiP

>protein
GRTLGEVWKERLNQMTKEEFTRYRKEAIIEVDRSAAKHARKEGNVTGGHPVSRGTAKLRWLVERRFLEPVGKVIDLGCGR
GGWCYYMATQKRVQEVRGYTKGGPGHEEPQLVQSYGWNIVTMKSGVDVFYRPSECCDTLLCDIGESSSSAEVEEHRTIRV
LEMVEDWLHRGPREFCVKVLCPYMPKVIEKMELLQRRYGGGLVRNPLSRNSTHEMYWVSRASGNVVHSVNMTSQVLLGRM
EKRTWKGPQYEEDVNLGSGTRA

The query sequence (length=262) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3lkz:A	262	262	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3lkz:B, 2oy0:A, 2oy0:B
2	2px5:A	265	262	0.8092	0.8000	0.8092	5.30e-160	2px2:A, 2px2:B, 2px4:A, 2px5:B, 2px8:A, 2px8:B, 2pxa:A, 2pxa:B, 2pxc:A
3	8b52:B	262	261	0.7977	0.7977	0.8008	6.66e-156	8b51:A, 8b51:B, 8b52:A
4	4k6m:A	888	262	0.7863	0.2320	0.7863	1.05e-147	4hdg:A, 4hdg:B, 4hdh:A, 4hdh:B, 4k6m:B, 4mtp:A, 4mtp:B
5	8bxk:A	265	261	0.7061	0.6981	0.7088	8.76e-142	8bxk:B, 8cqh:A, 8qdj:A
6	5ikm:A	259	261	0.6298	0.6371	0.6322	2.78e-115
7	6i7p:A	883	264	0.7023	0.2084	0.6970	8.39e-115	5goz:A, 5goz:B, 5goz:C, 5gp1:A, 5gp1:B, 5gp1:C, 6i7p:B, 6i7p:C, 6i7p:D, 6i7p:E, 6i7p:F, 5kqr:A, 5kqs:A, 5m2x:A, 5m2x:B, 5m2x:C, 5m2x:D, 5m2x:E, 5m2x:F, 5m2z:A, 5m2z:C, 5m2z:B, 5m2z:D, 5m2z:E, 5m2z:F, 5m5b:A, 5m5b:B, 5mrk:A, 5mrk:B, 5nju:A, 5nju:B, 5njv:A, 5njv:B, 5njv:C, 5njv:D, 8pem:A, 5tfr:A, 5tfr:B, 5tmh:A, 5tmh:B, 5u0b:A, 5u0b:B, 5u0c:A, 5u0c:B, 5u0c:C, 5u0c:D, 5u0c:E, 5u0c:F, 5u0c:G, 5u0c:H, 5ulp:A, 5ulp:B, 6ux2:B, 5vim:A, 5vim:B, 6wcz:B, 5wxb:A, 5wz1:A, 5wz1:B, 5wz1:C, 5wz1:D, 5wz1:E, 5wz1:F, 5wz1:G, 5wz1:H, 5wz2:A, 5wz2:B, 5wz2:C
8	8gzr:A	880	261	0.6374	0.1898	0.6398	9.32e-110	8bcr:A, 8bcr:B, 4c11:B, 5ccv:E, 4ctj:A, 4ctj:C, 4ctk:A, 4ctk:C, 5cuq:A, 5cuq:B, 5e9q:A, 5e9q:C, 5ec8:A, 5ec8:C, 5ehg:A, 5ehg:C, 5ehi:A, 5ehi:C, 5eif:A, 5eif:C, 5eiw:A, 5eiw:C, 5ekx:A, 5ekx:B, 3p8z:A, 3p8z:C, 3p97:A, 3p97:C, 4r8s:A, 4r8s:B, 3vws:A, 2xbm:B, 2xbm:A, 2xbm:C, 2xbm:D, 6xd1:A
9	8gzp:A	854	259	0.6336	0.1944	0.6409	3.71e-109	4c11:A, 5ccv:B, 5ccv:C, 5ccv:D, 5ccv:F, 5ccv:G, 5dto:A, 5f3t:A, 5f3z:A, 5f41:A, 8gzq:A, 4hhj:A, 5hmw:A, 5hmx:A, 5hmy:A, 5hmz:A, 5hn0:A, 5i3p:A, 5i3q:A, 5iq6:A, 6j00:A, 2j7u:A, 2j7w:A, 5jjr:A, 5jjs:A, 4v0q:A, 4v0r:A, 6xd0:A
10	6kr3:B	836	259	0.6336	0.1986	0.6409	1.68e-108	5k5m:A
11	6kr2:A	857	259	0.6336	0.1937	0.6409	1.81e-108	6izx:A, 6izy:A, 6kr2:B, 6kr3:A
12	8t13:B	877	259	0.6336	0.1893	0.6409	1.86e-108	3evg:A, 1l9k:A, 2p1d:A, 2p3l:A, 2p3o:A, 2p3q:A, 2p40:A, 2p41:A, 1r6a:A, 8t12:B, 7xd8:A, 7xd8:D, 7xd8:G, 7xd8:J, 7xd8:M, 7xd8:P, 7xd9:A, 7xd9:D, 7xd9:G, 7xd9:J, 7xd9:M, 7xd9:P, 5zqk:A, 5zqk:B
13	5ccv:A	849	259	0.6298	0.1943	0.6371	2.92e-108	6h80:A, 6h9r:A, 6izz:A
14	5ccv:H	767	259	0.6145	0.2099	0.6216	1.15e-101
15	3eld:A	277	260	0.5649	0.5343	0.5692	3.78e-98	3elu:A, 3elw:A, 3ely:A, 3emb:A, 3emd:A
16	2oxt:A	265	262	0.5267	0.5208	0.5267	3.05e-97	2oxt:B, 2oxt:C, 2oxt:D
17	6qsn:B	884	261	0.5763	0.1708	0.5785	2.06e-90	3eva:A, 3evb:A, 3evc:A, 3evd:A, 3eve:A, 3evf:A, 6qsn:A
18	7wnj:A	262	262	0.4962	0.4962	0.4962	5.21e-88
19	3gcz:A	259	260	0.5000	0.5058	0.5038	1.42e-86
20	2wa2:B	259	261	0.4962	0.5019	0.4981	1.58e-86
21	7d6m:A	260	260	0.4885	0.4923	0.4923	1.71e-86	7d6m:B, 7fjt:A, 7v1b:A, 7v1c:A, 7v1d:A, 7v1e:A, 7v1f:A, 7v1g:A, 7v1h:A, 7v1i:A, 7v1j:A
22	2wa2:A	223	240	0.4466	0.5247	0.4875	1.66e-74
23	8gy9:A	249	222	0.2328	0.2450	0.2748	6.84e-10	8gy9:B, 8gya:A, 8gya:B, 8gyb:A, 8gyb:B, 8gyb:C, 8gyb:D
24	6bqc:A	348	45	0.0725	0.0546	0.4222	0.003
25	5wp4:A	485	49	0.0725	0.0392	0.3878	0.025
26	5wp5:A	463	49	0.0687	0.0389	0.3673	0.10	5wp5:B
27	4iv8:A	245	22	0.0458	0.0490	0.5455	1.0	4iv8:B
28	1eiz:A	180	26	0.0420	0.0611	0.4231	1.6	1ej0:A
29	1ve3:B	226	23	0.0344	0.0398	0.3913	3.5	1ve3:A
30	6ecx:A	283	41	0.0496	0.0459	0.3171	4.2	6ect:A
31	5imt:A	460	63	0.0611	0.0348	0.2540	5.2
32	6p3o:A	341	38	0.0496	0.0381	0.3421	6.7	6p3m:A, 6p3n:A
33	6tvk:AAA	660	37	0.0458	0.0182	0.3243	8.2
34	6qz4:A	568	62	0.0611	0.0282	0.2581	8.3	8ekg:A, 8ekg:B, 8ekg:C, 8ekg:E, 8ekg:D, 8ekg:F, 6jtt:A, 6jtt:B, 6jtt:C, 6jtu:A, 6jtu:B, 6jtu:C, 6qg9:A, 6qg9:B, 6qg9:C, 6qg9:D, 6qg9:E, 6qg9:F, 6qg9:G, 6qg9:H, 6qg9:I, 6qg9:J, 6qga:A, 6qga:B, 6qga:C, 6qga:D, 6qga:E, 6qga:F, 6qgb:A, 6qgb:B, 6qgb:C, 6qgb:D, 6qgb:E, 6qgb:F, 6qz1:A, 6qz2:A, 6qz2:B, 6qz2:C, 6qz2:D, 6qz2:E, 6qz2:F, 6qz2:G, 6qz2:H, 6qz2:I, 6qz2:J, 6qz3:A, 6qz4:B
35	7du5:B	118	94	0.0802	0.1780	0.2234	8.5	7du5:A, 5hjz:A, 5hjz:B
36	7lxi:A	279	28	0.0420	0.0394	0.3929	9.5	7mcj:A, 7mcj:B
37	2bh2:A	418	33	0.0496	0.0311	0.3939	9.7	2bh2:B, 1uwv:A

[Back]