BioLiP

>protein
GRLRVVVLGSTGSIGTQALQVIADNPDRFEVVGLAAGGAHLDTLLRQRAQTGVTNIAVADEDIPYHGSDAATRLVEQTEA
DVVLNALVGALGLRPTLAALKTGARLALANKESLVAGGSLVLRAARPGQIVPVDSEHSALAQCLRGGTPDEVAKLVLTAS
GGPFRGWSAADLEHVTPEQAGAHPNTLNSASLVNKGLEVIETHLLFGIPYDRIDVVVHPQSIIHSMVTFIDGSTIAQASP
PDMKLPISLALGWPRRVSGAAAACDFHTASSWEFEPLDTDVFPAVELARQAGVAGGCMTAVYNAANEEAAAAFLAGRIGF
PAIVGIIADVLHAADQWAVEPATVDDVLDAQRWARERAQRAVSGM

The query sequence (length=365) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4aic:A	379	379	1.0000	0.9631	0.9631	0.0	4a03:A, 4a03:B, 4aic:B, 2c82:A, 2c82:B, 2jcv:A, 2jcv:B, 2jcx:A, 2jcx:B, 2jd0:A, 2jd1:A, 2jd1:B, 2jd2:A, 2jd2:B, 4ooe:A, 4ooe:B, 4ooe:C, 4ooe:D, 4oof:A, 4oof:B, 3ras:A, 3ras:B, 4rcv:A, 4rcv:B, 2y1c:A, 2y1c:B, 2y1d:B, 2y1e:A, 2y1e:B, 2y1f:A, 2y1f:B, 2y1g:A, 2y1g:B, 3zhx:A, 3zhx:B, 3zhy:A, 3zhy:B, 3zhz:A, 3zi0:A, 3zi0:B
2	2y1d:A	359	365	0.9836	1.0000	0.9836	0.0
3	7s04:A	396	395	0.4493	0.4141	0.4152	3.07e-89
4	1r0l:B	379	372	0.4192	0.4037	0.4113	5.46e-83	1r0l:A, 1r0l:C, 1r0l:D
5	8s65:B	411	403	0.4575	0.4063	0.4144	8.42e-79	8s65:A
6	6mh5:B	375	373	0.3753	0.3653	0.3673	1.21e-76	6mh5:A
7	3anl:A	400	395	0.4247	0.3875	0.3924	7.60e-72	3anl:B, 3anm:A, 3anm:B, 3ann:A, 3ann:B, 2egh:A, 2egh:B, 1jvs:A, 1jvs:B, 1ono:A, 1ono:B, 1onp:A, 1onp:B, 1q0h:A, 1q0l:A, 1q0q:A, 1q0q:B, 3r0i:A, 3r0i:B, 1t1r:A, 1t1r:B, 1t1s:A, 1t1s:B
8	5kqo:A	398	367	0.4055	0.3719	0.4033	6.37e-70	5kqo:B, 5krr:A, 5krr:B, 5ks1:A, 5ks1:B
9	4gae:A	416	402	0.3616	0.3173	0.3284	1.45e-69	3au8:A, 3au8:B, 3au9:A, 3au9:B, 3aua:A, 3aua:B, 4gae:B, 5jaz:A, 5jaz:B, 5jbi:A, 5jbi:B, 5jc1:A, 5jc1:B, 5jmp:A, 5jmp:B, 5jmw:A, 5jmw:B, 5jnl:A, 5jnl:B, 8jnv:A, 8jnv:B, 8jnw:A, 8jnw:B, 5jo0:A, 5jo0:B, 4kp7:A, 4kp7:B, 3wqq:A, 3wqq:B, 3wqr:A, 3wqr:B, 3wqs:B, 4y67:A, 4y67:B, 4y6p:A, 4y6p:B, 4y6r:A, 4y6r:B, 4y6s:A, 4y6s:B
10	3a06:B	373	372	0.3726	0.3646	0.3656	9.66e-65	3a06:A, 3a14:A, 3a14:B
11	5dul:B	390	391	0.3918	0.3667	0.3657	1.52e-64	5dul:A, 5dul:D, 3iie:A, 3iie:B
12	4zqg:A	408	384	0.3644	0.3260	0.3464	1.30e-62	4zqf:A, 4zqf:B, 4zqg:B, 4zqh:A, 4zqh:B
13	5dul:C	367	377	0.3644	0.3624	0.3528	3.48e-55
14	1ys4:A	348	154	0.1096	0.1149	0.2597	0.017	1ys4:B
15	8gjh:A	639	66	0.0575	0.0329	0.3182	0.26	8gjh:B, 8gjh:C, 8gjh:D, 8gjh:E, 8gjh:F
16	7p8p:B	147	73	0.0658	0.1633	0.3288	0.82	7p8p:D
17	1vef:A	387	101	0.0849	0.0801	0.3069	0.85	1vef:B, 1wkg:A, 1wkg:B, 1wkh:A, 1wkh:B
18	2vn8:A	358	87	0.0658	0.0670	0.2759	0.91	2vn8:B
19	2fit:A	130	68	0.0630	0.1769	0.3382	1.5	1fhi:A, 2fhi:A, 1fit:A, 3fit:A, 5fit:A, 6fit:A, 7p8p:A, 7p8p:C
20	1c7i:A	483	135	0.0959	0.0725	0.2593	3.6	1qe3:A
21	6tj5:A	131	41	0.0329	0.0916	0.2927	5.5
22	1uqw:A	487	149	0.0904	0.0678	0.2215	8.2	1uqw:B

[Back]