BioLiP

>protein
GRIGEVKRVTKETNVSVKINLDGTGVADSSSGIPFLDHMLDQLASHGLFDVHVRATGDVHIDDHHTNEDIALAIGTALLK
ALGERKGINRFGDFTAPLDEALIHVSLDLSGRPYLGYNLEIPTQRVGTYDTQLVEHFFQSLVNTSGMTLHIRQLAGENSH
HIIEATFKAFARALRQATETDPR

The query sequence (length=183) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5el9:A	199	182	0.9508	0.8744	0.9560	3.49e-128	5ekw:A, 5elw:A, 6ezj:A, 6ezj:Q, 6ezj:B, 6ezj:N, 6ezj:C, 6ezj:W, 6ezj:D, 6ezj:H, 6ezj:E, 6ezj:R, 6ezj:F, 6ezj:G, 6ezj:V, 6ezj:L, 6ezj:I, 6ezj:S, 6ezj:J, 6ezj:K, 6ezj:U, 6ezj:X, 6ezj:M, 6ezj:P, 6ezj:O, 6ezj:T, 2f1d:B, 2f1d:A, 2f1d:G, 2f1d:C, 2f1d:D, 2f1d:E, 2f1d:F, 2f1d:H, 2f1d:J, 2f1d:I, 2f1d:O, 2f1d:K, 2f1d:L, 2f1d:M, 2f1d:N, 2f1d:P, 4mu0:A, 4mu1:A, 4mu3:A, 4mu4:A, 4qnj:A, 4qnk:A, 4qnk:B, 4qnk:C, 4qnk:D, 4qnk:E, 4qnk:F, 4qnk:G, 4qnk:H
2	8qaw:A	185	182	0.8907	0.8811	0.8956	1.03e-120	7oj5:A, 7oj5:B, 7oj5:C, 7oj5:D, 7oj5:E, 7oj5:F, 7oj5:G, 7oj5:H, 7oj5:I, 7oj5:J, 7oj5:K, 7oj5:L, 7oj5:M, 7oj5:N, 7oj5:O, 7oj5:P, 7oj5:Q, 7oj5:R, 7oj5:S, 7oj5:T, 7oj5:V, 7oj5:W, 7oj5:X, 7oj5:Y, 8qav:A, 8qav:S, 8qav:W, 8qav:B, 8qav:N, 8qav:R, 8qav:C, 8qav:Q, 8qav:V, 8qav:D, 8qav:H, 8qav:X, 8qav:E, 8qav:O, 8qav:Y, 8qav:F, 8qav:P, 8qav:G, 8qav:J, 8qav:M, 8qav:T, 8qav:I, 8qav:K, 8qav:L, 8qaw:B, 8qaw:C, 8qaw:D, 8qaw:E, 8qaw:F, 8qaw:G, 8qaw:H, 8qax:A, 8qax:B, 8qax:C, 8qax:D, 8qax:E, 8qax:F, 8qay:A, 8qay:B, 8qay:C, 8qay:D, 8qay:E, 8qay:F, 8qay:G, 8qay:H
3	6fwh:A	196	180	0.4536	0.4235	0.4611	4.07e-59	6fwh:C, 6fwh:F, 6fwh:B, 6fwh:K, 6fwh:G, 6fwh:L, 6fwh:E, 6fwh:D, 6fwh:H, 6fwh:J, 6fwh:I
4	4gqu:A	191	179	0.4918	0.4712	0.5028	2.19e-55	7ddv:A, 7dnq:A, 7fcy:A, 6khh:A, 4lom:A, 4lpf:A, 5xds:A, 6yjh:A, 5zqn:A
5	1rhy:B	180	181	0.4590	0.4667	0.4641	8.69e-48
6	6ezm:U	212	195	0.4317	0.3726	0.4051	2.78e-46	6ezm:D, 6ezm:S, 6ezm:L, 6ezm:R, 6ezm:A, 6ezm:Q, 6ezm:V, 6ezm:O, 6ezm:B, 6ezm:N, 6ezm:F, 6ezm:T, 6ezm:C, 6ezm:X, 6ezm:E, 6ezm:H, 6ezm:P, 6ezm:J, 6ezm:G, 6ezm:I, 6ezm:W, 6ezm:K, 6ezm:M
7	2ae8:B	172	163	0.3661	0.3895	0.4110	1.12e-39	2ae8:A, 2ae8:C, 2ae8:D, 2ae8:E, 2ae8:F
8	5dnl:A	176	178	0.3716	0.3864	0.3820	1.14e-31	5dnl:C, 5dnl:B, 5dnx:A, 5dnx:C, 5dnx:B
9	1cb8:A	674	70	0.1311	0.0356	0.3429	0.28	1hm2:A, 1hm3:A, 1hmu:A, 1hmw:A
10	5ftw:A	255	32	0.0820	0.0588	0.4688	0.90
11	3pe7:A	376	34	0.0765	0.0372	0.4118	1.4
12	7lxd:A	1190	65	0.0929	0.0143	0.2615	2.1	6v8p:A
13	7s0t:A	1231	65	0.0929	0.0138	0.2615	2.1
14	8tlq:A	1283	65	0.0929	0.0133	0.2615	2.1	8tlt:A, 6v93:A
15	8vc5:A	488	45	0.0710	0.0266	0.2889	2.9	8vc5:B
16	8xvg:L	3485	55	0.0820	0.0043	0.2727	3.1	8xvv:L
17	6ici:A	585	64	0.1093	0.0342	0.3125	4.8
18	6hiv:Cv	1059	38	0.0820	0.0142	0.3947	7.3	6hiw:Cv, 6hiy:Cv, 7pub:Cv
19	8t5j:A	154	26	0.0710	0.0844	0.5000	9.6

[Back]