BioLiP

>protein
GQEVETSVTYYRLEEVAKRNSLKELWLVIHGRVYDVTRFLNEHPGGEEVLLEQAGVDASESFEDVGHSSDAREMLKQYYI
GDIHPSDLKP

The query sequence (length=90) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3ner:B	91	90	1.0000	0.9890	1.0000	4.45e-63	3ner:A
2	1awp:A	86	86	0.7667	0.8023	0.8023	3.84e-51	1awp:B, 1b5m:A, 1eue:A, 1eue:B, 4hil:A, 4hil:B, 1icc:C, 3mus:A
3	2i89:A	90	89	0.7444	0.7444	0.7528	7.00e-48	2i89:B, 2i89:C, 2i89:D, 1icc:A, 1icc:B, 1icc:D, 1lj0:A, 1lj0:B, 1lj0:C, 1lj0:D, 3mus:B
4	3ozz:B	82	81	0.6222	0.6829	0.6914	6.91e-40
5	2i96:A	108	87	0.5778	0.4815	0.5977	5.29e-36	4hin:A, 4hin:B, 4hin:C, 4hin:D, 2m33:A
6	1hko:A	104	87	0.5778	0.5000	0.5977	5.85e-36	1aqa:A, 1cyo:A, 1ehb:A, 1es1:A, 1f03:A, 1f04:A, 1i5u:A, 1ib7:A, 1j0q:A, 1jex:A, 1lqx:A, 1lr6:A, 1m20:A, 1m2i:A, 1m2m:A, 1m59:A, 1nx7:A, 1sh4:A, 1u9m:A, 1u9m:B, 1u9m:C, 1u9m:D, 1u9m:E, 1u9m:F, 1u9u:A, 3x32:A, 3x33:A, 3x34:A, 3x35:A
7	2ibj:A	86	76	0.5667	0.5930	0.6711	1.08e-34
8	1aw3:A	94	80	0.5556	0.5319	0.6250	4.46e-34	1axx:A, 2axx:A, 1b5a:A, 1b5b:A, 1bfx:A, 1blv:A, 1do9:A, 1mny:A
9	7bwh:A	88	79	0.3444	0.3523	0.3924	1.35e-14
10	1cxy:A	81	81	0.3111	0.3457	0.3457	3.53e-14
11	1x3x:A	82	77	0.3444	0.3780	0.4026	5.94e-13	1x3x:B
12	3lf5:A	87	78	0.3333	0.3448	0.3846	6.71e-13	3lf5:B
13	4b8n:B	90	71	0.3111	0.3111	0.3944	8.12e-13	4b8n:A, 4b8n:C, 4b8n:D
14	1kbi:A	504	49	0.2889	0.0516	0.5306	1.39e-11	1fcb:A, 1fcb:B, 1kbi:B, 1kbj:A, 1kbj:B, 3ks0:A, 3ks0:B, 1lco:A, 1lco:B, 1ldc:A, 1ltd:A, 1ltd:B, 2oz0:A, 2oz0:B, 1qcw:A, 1qcw:B, 1sze:A, 1sze:B, 1szf:A, 1szf:B, 1szg:A, 1szg:B
15	8tgb:A	108	75	0.2444	0.2037	0.2933	1.17e-09	8tgb:B
16	1mj4:A	79	78	0.2889	0.3291	0.3333	5.99e-08
17	1sox:A	463	81	0.3444	0.0670	0.3827	4.15e-06	2a9a:A, 2a9a:B, 2a9b:A, 2a9c:A, 2a9c:B, 2a9d:A, 2a9d:B, 3hbp:A, 3hbq:A, 1sox:B
18	6vz6:A	77	69	0.2222	0.2597	0.2899	0.063
19	2is6:A	654	23	0.1222	0.0168	0.4783	0.39	2is1:A, 2is1:B, 2is2:A, 2is2:B, 2is4:A, 2is6:B
20	2is4:B	632	23	0.1222	0.0174	0.4783	0.40
21	8ova:AC	208	54	0.1778	0.0769	0.2963	1.2	7ase:F, 5opt:f, 8ove:AC, 4v8m:AC
22	7sc6:A	349	18	0.1000	0.0258	0.5000	1.4	7scq:A, 7scq:B
23	2i0q:A	461	38	0.1444	0.0282	0.3421	3.7	1jb7:A, 1k8g:A, 1k8g:B, 1kix:A, 1otc:A, 1pa6:A, 1ph1:A, 1ph2:A, 1ph3:A, 1ph4:A, 1ph5:A, 1ph6:A, 1ph7:A, 1ph8:A, 1ph9:A, 1phj:A
24	5e0o:A	418	36	0.1333	0.0287	0.3333	4.0	4ofz:A
25	4yai:A	273	20	0.1000	0.0330	0.4500	6.6	4yag:A, 4yag:B, 4yai:B
26	4jz6:A	484	55	0.1889	0.0351	0.3091	6.7
27	4z71:B	163	65	0.1778	0.0982	0.2462	7.4	5kde:A, 5kdf:A, 1wcf:A, 4z70:A, 4z70:B, 4z70:C, 4z71:A, 4z71:C, 4z72:A, 4z73:A, 4z73:B, 4z73:C, 4z73:D, 4z73:F, 4z73:G, 4z73:E, 4z73:H, 4z73:I, 4z73:J, 4z73:K, 4z73:L, 4z74:A, 4z74:B, 4z74:C, 4z74:D, 4z74:F, 4z74:G, 4z74:E, 4z74:H, 4z74:I, 4z74:J, 4z74:K, 4z74:L
28	5jox:A	502	18	0.1222	0.0219	0.6111	7.8	5jox:B, 5joy:A, 5joy:B

[Back]