BioLiP

>protein
GPSFWLGNETLKVPLALFALNRQRLCERLRKNPAVQAGSIVVLQGGEETQRYCTDTGVLFRQESFFHWAFGVTEPGCYGV
IDVDTGKSTLFVPRLPASHATWMGKIHSKEHFKEKYAVDDVQYVDEIASVLTSQKPSVLLTLRGVNTDSGSVCREASFDG
ISKFEVNNTILHPEIVECRVFKTDMELEVLRYTNKIFSEAHREVMKAVKVGMKEYELESLFEHYCYSRGGMRHSSICGSG
ENSAVLHYGHAGAPNDRTIQNGDMCLFDMGGEYYCFASDITCSFPANGKFTADQKAVYEAVLRSSRAVMGAMKPGVWWPD
MHRLADRIHLEELAHMGILSGSVDAMVQAHLGAVFMPHGLGHFLGIDVHDVGGYPEGVERIDEPGLRSLRTARHLQPGMV
LTVEPGIYFIDHLLDEALADPARASFLNREVLQRFRGFGGVRIEEDVVVTDSGIELLTCVPRTVEEIEACMAGCDKAFTP
F

The query sequence (length=481) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5mc1:B	485	484	0.9958	0.9876	0.9897	0.0	6h2p:A, 6h2p:B, 6h2q:A, 6h2q:B, 5m4g:A, 5m4g:B, 5m4j:A, 5m4j:B, 5m4l:A, 5m4l:B, 5m4q:A, 5m4q:B, 5mby:A, 5mby:B, 5mbz:A, 5mbz:B, 5mc0:A, 5mc0:B, 5mc1:A, 5mc2:A, 5mc2:B, 5mc3:A, 5mc3:B, 5mc4:A, 5mc4:B, 5mc5:A, 5mc5:B, 2okn:A, 2okn:B, 6qsb:A, 6qsb:B, 6qsc:A, 6qsc:B, 6sre:A, 6sre:B, 6srf:A, 6srf:B, 6srg:B
2	6srg:A	455	478	0.9356	0.9890	0.9414	0.0
3	5wze:B	449	485	0.3326	0.3563	0.3299	1.34e-64	5wze:A, 5wze:C, 5wze:D
4	2bh3:A	440	478	0.3306	0.3614	0.3326	8.30e-59	1a16:A, 2bha:A, 2bhb:A, 2bhd:A, 2bn7:A, 2bws:A, 2bwt:A, 2bwv:A, 2bww:A, 2bwx:A, 2bwy:A, 1jaw:A, 1m35:A, 1m35:B, 1m35:C, 1m35:D, 1m35:E, 1m35:F, 1n51:A, 2v3x:A, 2v3y:A, 2v3z:A, 1w2m:A, 1w2m:B, 1w2m:C, 1w2m:D, 1w2m:E, 1w2m:F, 1w7v:A, 1w7v:B, 1w7v:C, 1w7v:D, 1wbq:A, 1wbq:B, 1wbq:C, 1wbq:D, 1wl6:A, 1wl9:A
5	4pv4:A	436	450	0.3015	0.3326	0.3222	9.88e-55	4pv4:B
6	3ig4:A	419	456	0.2661	0.3055	0.2807	1.12e-45	3ig4:B, 3ig4:C, 3ig4:D, 3ig4:E, 3ig4:F
7	5x49:A	441	464	0.2786	0.3039	0.2888	1.34e-45	5x49:B
8	4qr8:A	441	457	0.2827	0.3084	0.2976	5.61e-41	4qr8:B
9	3rva:A	445	456	0.2412	0.2607	0.2544	5.45e-39
10	6ah7:A	439	454	0.2412	0.2642	0.2555	1.10e-35	6ah7:B, 6ah7:C, 6ah7:D, 6ah8:A, 6ah8:B, 6ah8:C, 6ah8:D, 7e5c:A, 7e5c:B, 7e5c:C, 7e5c:D
11	4zwu:A	435	449	0.2328	0.2575	0.2494	4.70e-34	3l24:A, 3l7g:A, 4zwo:A, 4zwo:B, 4zwp:A, 4zwp:B, 4zwu:B
12	3l24:B	417	282	0.1663	0.1918	0.2837	1.21e-28	3l24:C, 3l7g:B, 3l7g:C
13	6a9t:A	417	457	0.2453	0.2830	0.2582	1.30e-24	6a9u:A, 6a9v:A
14	1pv9:A	337	400	0.2141	0.3056	0.2575	4.47e-24
15	5cnx:A	360	306	0.1767	0.2361	0.2778	7.07e-23	5cnx:B, 5cnx:C
16	3q6d:A	355	288	0.1642	0.2225	0.2743	2.15e-22	3q6d:B, 3q6d:C, 3q6d:D
17	5cdl:A	349	282	0.1788	0.2464	0.3050	1.08e-21	5cdv:A, 5giq:A
18	2zsg:A	356	296	0.1684	0.2275	0.2736	1.62e-21
19	1wy2:A	351	290	0.1622	0.2222	0.2690	3.81e-21	1wy2:B
20	1pv9:B	318	402	0.2017	0.3050	0.2413	3.18e-18
21	1wn1:A	356	294	0.1642	0.2219	0.2687	6.64e-17	1wn1:B
22	4fkc:A	370	293	0.1559	0.2027	0.2560	1.58e-13	4rgz:A, 4rgz:N, 4rgz:1, 4rgz:e
23	4ege:A	371	282	0.1538	0.1995	0.2624	4.24e-11
24	7k3u:A	362	327	0.1767	0.2348	0.2599	5.66e-10	7k3u:B, 7k3u:C, 7k3u:D, 7k3u:E, 7k3u:F, 7k3u:G, 7k3u:H, 7k3u:I, 7k3u:J, 7n02:A, 7n02:B, 6xmr:A, 6xmr:B, 4zng:C, 4zng:B, 4zng:A
25	3iu7:A	284	288	0.1351	0.2289	0.2257	1.46e-07	4iec:A, 4if7:A, 3iu8:A, 3iu9:A, 4ook:A, 3pka:A, 3pkb:A, 3pkc:A, 3pkd:A, 3pke:A, 3ror:A, 1yj3:A, 5yoh:A, 5yoi:A, 5ypd:A, 5ypj:A, 5yxf:A
26	5jqk:A	631	192	0.1123	0.0856	0.2812	4.83e-05	5jqk:B, 5jr6:A
27	1qxw:A	249	293	0.1310	0.2530	0.2150	1.72e-04	1qxy:A, 1qxz:A
28	5jr6:B	545	192	0.1102	0.0972	0.2760	2.56e-04
29	3tav:A	264	161	0.0936	0.1705	0.2795	3.61e-04	3tav:B
30	5cde:A	398	328	0.1497	0.1809	0.2195	0.001	5cde:B, 5fcf:A, 5fcf:B, 5fch:A, 5fch:B, 4r60:A, 4r60:B
31	6yo9:A	398	322	0.1393	0.1683	0.2081	0.003	6twk:A, 6twk:B, 6yo9:B
32	3ctz:A	617	180	0.0977	0.0762	0.2611	0.005
33	5xev:A	409	126	0.0790	0.0929	0.3016	0.011
34	8khn:A	287	266	0.1185	0.1986	0.2143	0.022	8kho:A
35	8bqd:x	367	259	0.1123	0.1471	0.2085	0.039	8bqx:x
36	3s6b:A	345	224	0.0936	0.1304	0.2009	0.19
37	4s2r:P	615	266	0.1227	0.0959	0.2218	0.31	4s2r:Q, 4s2t:P, 4s2t:Q
38	2e2r:A	227	69	0.0374	0.0793	0.2609	0.54	6a6k:A, 6a6k:B, 6a6k:C, 2ewp:A, 2ewp:B, 2ewp:C, 2ewp:D, 2ewp:E, 2gp7:A, 2gpo:A, 2gpp:A, 2gpp:B, 2gpu:A, 2gpv:A, 2gpv:B, 2gpv:C, 2gpv:D, 2gpv:E, 2gpv:F, 6i61:A, 6i62:A, 6i63:A, 6i64:A, 6i65:A, 6i66:A, 6i67:A, 6k3n:A, 6knr:A, 6knr:B, 1kv6:A, 1kv6:B, 2p7a:A, 2p7g:A, 2p7z:A, 1s9p:A, 1s9p:B, 1s9p:C, 1s9p:D, 1s9q:A, 1s9q:B, 1tfc:A, 1tfc:B, 1vjb:A, 1vjb:B, 5yso:A, 5yso:B, 5yso:C, 2zas:A, 2zkc:A
39	4a6v:A	264	292	0.1435	0.2614	0.2363	1.2	4a6v:B, 4a6w:A, 2bb7:A, 1c21:A, 1c22:A, 1c23:A, 1c24:A, 1c27:A, 3d27:A, 2evc:A, 2evm:A, 2evo:A, 2evo:B, 2gg0:A, 2gg2:A, 2gg3:A, 2gg5:A, 2gg7:A, 2gg8:A, 2gg9:A, 2ggb:A, 2ggc:A, 2gtx:A, 2gtx:B, 2gu4:A, 2gu4:B, 2gu5:A, 2gu5:B, 2gu6:A, 2gu6:B, 2gu7:A, 2gu7:B, 1mat:A, 2mat:A, 3mat:A, 2p98:A, 2p99:A, 2p9a:A, 4pnc:A, 2q92:A, 2q93:A, 2q94:A, 2q95:A, 2q96:A, 1xnz:A, 1yvm:A, 4z7m:A, 4z7m:B
40	6ln4:A	218	69	0.0374	0.0826	0.2609	2.0	6lit:A, 6lit:B
41	3mx6:B	260	294	0.1185	0.2192	0.1939	2.4	3mr1:A, 3mr1:B, 3mr1:C, 3mr1:D, 3mx6:A
42	5ns8:A	440	46	0.0270	0.0295	0.2826	2.4	5ns8:B, 5ns8:C
43	3v1h:A	306	36	0.0270	0.0425	0.3611	2.7	4f2b:A, 4f2b:B, 4i90:A, 4i9j:A, 4i9t:A, 4rv3:A, 4s3g:A, 3v16:A
44	4fuk:A	329	311	0.1247	0.1824	0.1929	6.0	4fuk:B

[Back]