Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GPSFPEPKVVRSQGGLLSLKLSATPTPLAIAGQRATLLTYGGSFPGPTLRVRPRDTVRLTLENRLPEPTNLHWHGLPISP
KVDDPFLEIPPGESWTYEFTVPKELAGTFWYHPHLHGRVAPQLFAGLLGALVVESSLDAIPELREAEEHLLVLKDLALQG
GRPAPHTPMDWMNGKEGDLVLVNGALRPTLVAQKATLRLRLLNASNARYYRLALQDHPLYLIAADGGFLEEPLEVSELLL
APGERAEVLVRLRKEGRFLLQALPYDRGAMGMMDMGGMAHAMPQGPSRPETLLYLIAPKNPKPLPLPKALSPFPTLPAPV
VTRRLVLTEDMMAARFFINGQVFDHRRVDLKGQAQTVEVWEVENQGDMDHPFHLHVHPFQVLSVGGRPFPYRAWKDVVNL
KAGEVARLLVPLREKGRTVFHCHIVEHEDRGMMGVLEVG

The query sequence (length=439) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6w2k:A 440 439 1.0000 0.9977 1.0000 0.0 5afa:A, 5g3b:A, 5g3c:A, 5g3d:A, 5g3e:A, 5g3f:A, 5g3g:A, 5g3h:A, 5jrr:A, 5jx9:A, 5k0d:A, 5k15:A, 5k3k:A, 5k5k:A, 5k7a:A, 5k84:A, 6q29:A, 6tyr:A, 6w2k:B, 6w9x:A, 6wcg:A, 6wch:A, 6wcl:A, 6wcm:A, 6wcn:A, 6wcp:A, 2xu9:A, 2yae:A, 2yaf:A, 2yah:A, 2yam:A, 2yao:A, 2yap:A, 2yaq:A, 2yar:A
2 3zx1:A 471 435 0.3485 0.3248 0.3517 2.36e-88
3 7f19:A 444 453 0.3462 0.3423 0.3355 1.63e-59 2yxv:A, 2yxv:B, 2yxw:A, 2yxw:B
4 3aw5:A 438 420 0.3462 0.3470 0.3619 2.80e-59 6k3d:A, 8p4g:A, 8p4g:B
5 6evg:A 444 415 0.3212 0.3176 0.3398 2.56e-58
6 5b7e:A 477 473 0.3508 0.3229 0.3256 9.69e-58 5b7f:A, 5b7m:A, 5b7m:B, 5b7m:C, 4ef3:A, 2fqd:A, 2fqe:A, 2fqf:A, 2fqg:A, 6im7:A, 1kv7:A, 1n68:A, 3nsc:A, 3nsd:A, 3nsy:A, 3nt0:A, 3pau:A, 3pav:A, 1pf3:A, 3qqx:A, 5ys1:A, 5ys5:A
7 6xiz:A 477 453 0.3052 0.2809 0.2958 4.11e-55 6xiz:B, 6z0j:A, 6z0k:A
8 3od3:A 488 497 0.3485 0.3135 0.3078 5.04e-54 4e9q:A, 4e9r:A, 4e9s:A, 4e9t:A, 7f0v:A, 7f0v:B, 4hak:A, 4hal:A, 4ner:A, 3uaa:A, 3uab:A, 3uac:A, 3uad:A, 3uae:A
9 9f1t:A 477 452 0.3189 0.2935 0.3097 4.10e-51 9f1t:B, 9f3z:B, 9f3z:A
10 6ttd:A 457 451 0.3212 0.3085 0.3126 1.36e-46 6syy:A, 6ttd:B
11 6xj0:A 508 419 0.2893 0.2500 0.3031 3.24e-44
12 6vow:A 409 440 0.3075 0.3301 0.3068 6.21e-37
13 7z5p:A 505 479 0.3030 0.2634 0.2777 5.56e-36 7z5p:B
14 6vox:A 407 429 0.2779 0.2998 0.2844 5.06e-31
15 4ako:A 506 480 0.2802 0.2431 0.2562 9.66e-31 4a66:A, 4a67:A, 4a68:A, 4akp:A, 4akq:A, 2bhf:A, 1gsk:A, 1of0:A, 4q89:A, 4q89:B, 4q8b:A, 4q8b:B, 1w6l:A, 1w6w:A, 1w8e:A, 2wsd:A, 2x87:A, 2x88:A, 7y8b:A, 7y8b:B, 7y8c:A, 7y8c:B, 4yvn:A, 4yvu:A, 3zdw:A, 5zlj:A, 5zlk:A, 5zll:A, 5zlm:A
16 2qt6:A 498 469 0.2756 0.2430 0.2580 1.34e-24 2qt6:B
17 5z1x:A 495 464 0.2847 0.2525 0.2694 1.92e-24 5z1x:B, 5z22:A
18 5ehf:A 497 458 0.2802 0.2475 0.2686 3.47e-22
19 3x1b:A 500 449 0.2665 0.2340 0.2606 1.38e-21 3x1b:B
20 1gyc:A 499 462 0.2825 0.2485 0.2684 2.28e-21
21 5mej:A 499 451 0.2665 0.2345 0.2594 7.26e-21 5e9n:A, 5mew:A, 5mhu:A, 5mhv:A, 5mhw:A, 5mhx:A, 5mhy:A, 5mhz:A, 5mi1:A, 5mi2:A, 5mia:A, 5mib:A, 5mic:A, 5mid:A, 5mie:A, 5mig:A, 6rgh:A, 6rgp:A, 6rhh:A, 6rhi:A, 6rho:A, 6rhp:A, 6rhr:A, 6rhu:A, 6rhx:A, 6ri0:A, 6ri2:A, 6ri4:A, 6ri6:A, 6ri8:A, 6rii:A, 6rik:A, 6ril:A
22 3kw7:A 502 463 0.2711 0.2371 0.2570 4.00e-20 3kw7:B
23 6iqy:A 536 432 0.2551 0.2090 0.2593 4.10e-20 3abg:A, 3abg:B, 6i3j:A, 6i3j:B, 6i3k:A, 6i3k:B, 6i3l:A, 6i3l:B, 6iqx:A, 6iqx:B, 6iqy:B, 6iqz:A, 2xll:A, 2xll:B, 2xll:C, 2xll:D
24 1v10:A 487 461 0.2756 0.2485 0.2625 4.32e-20
25 1a65:A 504 474 0.2825 0.2460 0.2616 1.03e-19 1hfu:A
26 3t6v:A 495 450 0.2506 0.2222 0.2444 2.42e-19 3t6v:B, 3t6v:C, 3t6w:A, 3t6w:B, 3t6w:C, 3t6x:A, 3t6x:B, 3t6x:C, 3t6z:A, 3t6z:B, 3t6z:C, 3t71:A, 3t71:B, 3t71:C
27 4a2e:A 496 449 0.2642 0.2339 0.2584 3.05e-19 4a2d:A, 4a2f:A, 4a2g:A, 4a2h:A, 5a7e:A, 5anh:A, 5anh:B, 5anh:C, 6h5y:A, 6h5y:B, 2hrg:A, 2hrh:A, 4jhu:A, 4jhv:A
28 3div:A 499 447 0.2574 0.2265 0.2528 1.34e-16 3fpx:A, 2h5u:A, 5ldu:A, 3pxl:A, 3v9c:A
29 3g5w:A 318 261 0.1481 0.2044 0.2490 6.36e-16 3g5w:B, 3g5w:C, 3g5w:D, 3g5w:E, 3g5w:F
30 3g5w:A 318 158 0.0866 0.1195 0.2405 1.1 3g5w:B, 3g5w:C, 3g5w:D, 3g5w:E, 3g5w:F
31 1kya:A 499 464 0.2711 0.2385 0.2565 6.45e-16 1kya:B, 1kya:C, 1kya:D
32 2hzh:A 499 478 0.2528 0.2224 0.2322 1.98e-15
33 5nq7:A 497 457 0.2597 0.2294 0.2495 3.56e-15 5nq8:A, 5nq9:A, 5nq9:C, 2xyb:A
34 3sqr:A 539 474 0.2551 0.2078 0.2363 1.19e-14 3v9e:A, 4x4k:A
35 1aoz:A 552 252 0.1595 0.1268 0.2778 3.74e-14 1aoz:B, 1aso:A, 1aso:B, 1asp:A, 1asp:B, 1asq:A, 1asq:B
36 1aoz:A 552 81 0.0592 0.0471 0.3210 0.24 1aoz:B, 1aso:A, 1aso:B, 1asp:A, 1asp:B, 1asq:A, 1asq:B
37 3gyr:A 587 532 0.2893 0.2164 0.2387 1.09e-13 3gyr:B, 3gyr:C, 3gyr:D, 3gyr:E, 3gyr:F, 3gyr:G, 3gyr:H, 3gyr:I, 3gyr:J, 3gyr:K, 3gyr:L
38 6klg:A 547 267 0.1526 0.1225 0.2509 1.14e-13 6kli:A, 6klj:A
39 4e9v:A 317 246 0.1367 0.1893 0.2439 1.23e-13 4e9v:C, 4e9v:B, 4e9w:A, 4e9w:B, 4e9w:C, 4e9x:A, 4e9x:C, 4e9x:B, 4e9y:A, 4e9y:C, 4e9y:B, 2zwn:A, 2zwn:B, 2zwn:C
40 4e9v:A 317 58 0.0387 0.0536 0.2931 0.87 4e9v:C, 4e9v:B, 4e9w:A, 4e9w:B, 4e9w:C, 4e9x:A, 4e9x:C, 4e9x:B, 4e9y:A, 4e9y:C, 4e9y:B, 2zwn:A, 2zwn:B, 2zwn:C
41 5lwx:A 554 278 0.1617 0.1282 0.2554 2.30e-13 5lm8:A, 5lww:A
42 1zpu:A 529 471 0.2392 0.1985 0.2229 6.46e-12 1zpu:B, 1zpu:C, 1zpu:D, 1zpu:E, 1zpu:F
43 3pps:A 564 469 0.2688 0.2092 0.2516 1.59e-11 3pps:B, 3pps:C, 3pps:D
44 3gdc:A 288 252 0.1458 0.2222 0.2540 2.28e-11 3gdc:B, 3gdc:C
45 6f5k:A 558 492 0.2551 0.2007 0.2276 1.53e-10
46 8r7i:A 628 266 0.1458 0.1019 0.2406 2.25e-09
47 8r7i:A 628 112 0.0661 0.0462 0.2589 0.076
48 7rab:A 299 211 0.1412 0.2074 0.2938 8.08e-09 7rab:B, 7rab:C, 7rab:D, 7rab:E, 7rab:F, 7rab:G, 7rab:H, 7rac:A, 7rac:B, 7rac:C, 7rac:D, 7rac:E, 7rac:F, 7rac:G, 7rac:H, 7rac:I, 7rac:J, 7rac:K, 7rac:L
49 3fu7:A 559 488 0.2665 0.2093 0.2398 1.08e-08 3dkh:A, 3dkh:B, 3fu7:B, 3fu8:A, 3fu8:B, 3fu9:A, 3fu9:B, 1gw0:A, 1gw0:B, 2ih8:A, 2ih8:B, 2ih9:A, 2ih9:B, 2q9o:A, 2q9o:B, 3qpk:A, 3qpk:B
50 7zn6:A 576 378 0.2096 0.1597 0.2434 2.00e-08
51 3wi9:A 303 175 0.1048 0.1518 0.2629 7.33e-08 6l46:A, 3wia:A, 3wia:B, 3wia:C, 3wia:D, 3wia:E, 3wia:F, 3wia:G, 3wia:H, 3wia:I, 3wkp:A, 3wkq:A, 3wni:A, 3wnj:A, 3x1e:A, 3x1f:A, 3x1g:A, 3x1n:A, 4ysa:A, 4ysd:A, 4yso:A, 4ysp:A, 4ysq:A, 4ysr:A, 4yss:A, 4yst:A, 4ysu:A, 5ytl:A, 5ytm:A, 5ytn:A, 4zk8:A
52 2bo0:A 336 133 0.0911 0.1190 0.3008 1.23e-06 5b1j:A, 5b1j:B, 5b1k:A, 2bp0:A, 2bp0:B, 2bp8:A, 2bp8:B, 1bq5:A, 4csp:A, 4csp:F, 4csz:A, 1gs6:X, 1gs7:A, 1gs8:A, 1hau:A, 1haw:A, 2jfc:A, 2jfc:B, 2jfc:C, 2jfc:D, 2jfc:E, 2jfc:F, 1ndt:A, 1oe1:A, 1oe2:A, 1oe3:A, 5onx:A, 5ony:A, 2vm3:A, 2vm4:A, 2vmj:A, 2vn3:A, 2vw4:A, 2vw4:B, 2vw6:A, 2vw6:B, 2vw7:A, 2vw7:B, 1wa0:X, 1wa1:X, 1wa2:X, 1wae:A, 2xwz:A, 2xwz:E, 2xwz:D, 2xwz:B, 2xwz:F, 2xwz:C, 2xx0:A, 2xx0:B, 2xx1:A, 2xx1:D, 2xx1:B, 2xx1:C, 2xx1:E, 2xx1:F, 2xxf:A, 2xxf:B, 2xxg:A, 2xxg:C, 2zon:A, 2zon:B, 2zon:C
53 8aip:A 275 143 0.0911 0.1455 0.2797 8.53e-06
54 8aip:A 275 82 0.0547 0.0873 0.2927 0.45
55 4kns:A 285 176 0.1071 0.1649 0.2670 9.64e-06 4kns:B, 4kns:C, 4kns:D, 4kns:E, 4kns:F, 4knt:A, 4knt:B, 4knt:C, 4knu:A, 4knu:B, 4knu:C, 4knu:D, 4knu:E, 4knu:F
56 4n8u:B 276 133 0.0843 0.1341 0.2782 1.23e-05 4n8u:A, 4n8u:C
57 4n8u:B 276 23 0.0228 0.0362 0.4348 7.7 4n8u:A, 4n8u:C
58 3tas:B 301 145 0.0934 0.1362 0.2828 1.25e-05 6fc7:A, 6fc7:B, 6fc7:C, 6fc7:D, 6fc7:E, 6fc7:F, 6fc7:G, 6fc7:H, 6fc7:I, 6fc7:J, 6fc7:L, 6fc7:K, 6fdj:A, 6fdj:B, 6fdj:C, 6fdj:D, 6fdj:F, 6fdj:E, 6fdj:G, 6fdj:I, 6fdj:H, 6fdj:J, 6fdj:K, 6fdj:L, 5lhl:A, 5lhl:B, 5lhl:C, 5lhl:D, 5lhl:F, 5lhl:E, 4m3h:A, 4m3h:B, 4m3h:C, 5mkm:A, 5mkm:B, 5mkm:C, 5mkm:D, 5mkm:E, 5mkm:F, 5o3k:A, 5o3k:C, 5o3k:B, 5o3k:D, 5o3k:E, 5o3k:F, 5o3k:G, 5o3k:H, 5o3k:I, 5o3k:J, 5o3k:K, 5o3k:L, 5o4i:A, 5o4i:B, 5o4i:C, 5o4i:D, 5o4i:E, 5o4i:F, 5o4i:G, 5o4i:H, 5o4i:I, 5o4i:J, 5o4i:K, 5o4i:L, 5o4q:A, 5o4q:B, 5o4q:C, 5o4q:D, 5o4q:E, 5o4q:F, 5o4q:G, 5o4q:H, 5o4q:I, 5o4q:J, 5o4q:K, 5o4q:L, 8p9u:A, 8p9u:C, 8p9u:B, 8p9u:D, 8p9u:F, 8p9u:E, 8p9v:A, 8p9v:B, 8p9v:C, 8p9v:D, 8p9v:E, 8p9v:F, 7pen:A, 7pen:B, 7pen:C, 7pen:D, 7pen:E, 7pen:F, 7pes:A, 7pes:B, 7pes:C, 7pes:D, 7pes:E, 7pes:F, 7pfr:A, 7pfr:B, 7pfr:C, 7pfr:D, 7pfr:E, 7pfr:F, 7ptm:A, 7ptm:C, 7ptm:B, 7ptm:D, 7ptm:F, 7ptm:E, 7pu0:A, 7pu0:B, 7pu0:C, 7pu0:D, 7pu0:E, 7pu0:F, 7puh:A, 7puh:C, 7puh:B, 7puh:D, 7puh:F, 7puh:E, 6rh9:A, 6rh9:B, 6rh9:C, 6rh9:D, 6rh9:E, 6rh9:F, 6rh9:G, 6rh9:H, 6rh9:I, 6rh9:J, 6rh9:K, 6rh9:L, 6rhq:A, 6rhq:B, 6rhq:C, 6rhq:D, 6rhq:E, 6rhq:F, 6s0o:A, 6s0o:B, 6s0o:C, 6s0o:D, 6s0o:E, 6s0o:F, 3tas:A, 3tas:C, 3tbb:A, 3tbb:B, 3tbb:C, 3tbc:A, 3tbc:B, 3tbc:C, 4uah:A, 4uah:B, 4uah:C, 4uan:A, 4uan:B, 4uan:C, 4w1t:A, 4w1t:B, 4w1t:C, 4wtq:A, 4wtq:B, 4wtq:C, 6y4a:AAA, 6y4a:BBB, 6y4a:CCC, 6yo5:AAA, 6yo5:BBB, 6yo5:CCC, 6yzd:AAA, 6yzd:BBB, 6yzd:CCC, 6yzf:CCC, 6yzf:AAA, 6yzf:BBB, 6yzy:AAA, 6yzy:BBB, 6yzy:CCC, 6zij:A, 6zij:C, 6zij:B, 6zij:D, 6zij:F, 6zij:E, 6zip:A, 6zip:B, 6zip:C, 6zip:D, 6zip:E, 6zip:F, 6zip:G, 6zip:H, 6zip:I, 6zip:J, 6zip:L, 6zip:K
59 3tas:B 301 79 0.0478 0.0698 0.2658 2.8 6fc7:A, 6fc7:B, 6fc7:C, 6fc7:D, 6fc7:E, 6fc7:F, 6fc7:G, 6fc7:H, 6fc7:I, 6fc7:J, 6fc7:L, 6fc7:K, 6fdj:A, 6fdj:B, 6fdj:C, 6fdj:D, 6fdj:F, 6fdj:E, 6fdj:G, 6fdj:I, 6fdj:H, 6fdj:J, 6fdj:K, 6fdj:L, 5lhl:A, 5lhl:B, 5lhl:C, 5lhl:D, 5lhl:F, 5lhl:E, 4m3h:A, 4m3h:B, 4m3h:C, 5mkm:A, 5mkm:B, 5mkm:C, 5mkm:D, 5mkm:E, 5mkm:F, 5o3k:A, 5o3k:C, 5o3k:B, 5o3k:D, 5o3k:E, 5o3k:F, 5o3k:G, 5o3k:H, 5o3k:I, 5o3k:J, 5o3k:K, 5o3k:L, 5o4i:A, 5o4i:B, 5o4i:C, 5o4i:D, 5o4i:E, 5o4i:F, 5o4i:G, 5o4i:H, 5o4i:I, 5o4i:J, 5o4i:K, 5o4i:L, 5o4q:A, 5o4q:B, 5o4q:C, 5o4q:D, 5o4q:E, 5o4q:F, 5o4q:G, 5o4q:H, 5o4q:I, 5o4q:J, 5o4q:K, 5o4q:L, 8p9u:A, 8p9u:C, 8p9u:B, 8p9u:D, 8p9u:F, 8p9u:E, 8p9v:A, 8p9v:B, 8p9v:C, 8p9v:D, 8p9v:E, 8p9v:F, 7pen:A, 7pen:B, 7pen:C, 7pen:D, 7pen:E, 7pen:F, 7pes:A, 7pes:B, 7pes:C, 7pes:D, 7pes:E, 7pes:F, 7pfr:A, 7pfr:B, 7pfr:C, 7pfr:D, 7pfr:E, 7pfr:F, 7ptm:A, 7ptm:C, 7ptm:B, 7ptm:D, 7ptm:F, 7ptm:E, 7pu0:A, 7pu0:B, 7pu0:C, 7pu0:D, 7pu0:E, 7pu0:F, 7puh:A, 7puh:C, 7puh:B, 7puh:D, 7puh:F, 7puh:E, 6rh9:A, 6rh9:B, 6rh9:C, 6rh9:D, 6rh9:E, 6rh9:F, 6rh9:G, 6rh9:H, 6rh9:I, 6rh9:J, 6rh9:K, 6rh9:L, 6rhq:A, 6rhq:B, 6rhq:C, 6rhq:D, 6rhq:E, 6rhq:F, 6s0o:A, 6s0o:B, 6s0o:C, 6s0o:D, 6s0o:E, 6s0o:F, 3tas:A, 3tas:C, 3tbb:A, 3tbb:B, 3tbb:C, 3tbc:A, 3tbc:B, 3tbc:C, 4uah:A, 4uah:B, 4uah:C, 4uan:A, 4uan:B, 4uan:C, 4w1t:A, 4w1t:B, 4w1t:C, 4wtq:A, 4wtq:B, 4wtq:C, 6y4a:AAA, 6y4a:BBB, 6y4a:CCC, 6yo5:AAA, 6yo5:BBB, 6yo5:CCC, 6yzd:AAA, 6yzd:BBB, 6yzd:CCC, 6yzf:CCC, 6yzf:AAA, 6yzf:BBB, 6yzy:AAA, 6yzy:BBB, 6yzy:CCC, 6zij:A, 6zij:C, 6zij:B, 6zij:D, 6zij:F, 6zij:E, 6zip:A, 6zip:B, 6zip:C, 6zip:D, 6zip:E, 6zip:F, 6zip:G, 6zip:H, 6zip:I, 6zip:J, 6zip:L, 6zip:K
60 1ndr:A 330 129 0.0911 0.1212 0.3101 2.23e-05 1ndr:B, 1ndr:C, 1nds:A, 1nds:B, 1nds:C
61 7b2k:A 282 137 0.0797 0.1241 0.2555 4.19e-05 7b2k:B, 7b4y:A, 7b4y:B, 7bdn:A, 7bdn:B, 7bfm:A, 7bfm:C, 3cg8:A, 3cg8:C, 3cg8:B, 4gxf:A, 4gxf:B, 4gxf:C, 4gy4:A, 4gy4:B, 4gy4:C, 4gyb:A, 3kw8:A, 4naj:A, 4nb7:A, 8u8p:A, 8u8p:C, 8u8p:B, 8u8q:A, 8u8q:B, 8u8q:C, 8u8r:A, 8u8r:B, 8u8r:C, 8u8s:A, 8u8s:B, 8u8s:C, 8u8t:A, 8u8t:C, 8u8t:B, 7w6v:A
62 7b2k:A 282 79 0.0456 0.0709 0.2532 3.4 7b2k:B, 7b4y:A, 7b4y:B, 7bdn:A, 7bdn:B, 7bfm:A, 7bfm:C, 3cg8:A, 3cg8:C, 3cg8:B, 4gxf:A, 4gxf:B, 4gxf:C, 4gy4:A, 4gy4:B, 4gy4:C, 4gyb:A, 3kw8:A, 4naj:A, 4nb7:A, 8u8p:A, 8u8p:C, 8u8p:B, 8u8q:A, 8u8q:B, 8u8q:C, 8u8r:A, 8u8r:B, 8u8r:C, 8u8s:A, 8u8s:B, 8u8s:C, 8u8t:A, 8u8t:C, 8u8t:B, 7w6v:A
63 5zl1:A 306 94 0.0729 0.1046 0.3404 1.60e-04 5zl1:B, 5zl1:C, 5zl1:D
64 3ta4:F 282 166 0.0934 0.1454 0.2470 5.27e-04 3t9w:A, 3ta4:E, 3ta4:D
65 3ta4:F 282 84 0.0592 0.0922 0.3095 0.075 3t9w:A, 3ta4:E, 3ta4:D
66 2zoo:A 438 290 0.1595 0.1598 0.2414 5.47e-04
67 7p2f:A 329 140 0.0911 0.1216 0.2857 0.002 7p2f:B, 7p2f:C
68 4ax3:D 457 131 0.0843 0.0810 0.2824 0.003 4ax3:A, 4ax3:B, 4ax3:C, 6f1q:A, 6fja:A, 5obo:A, 5ocb:A, 5ocf:A, 8qgf:A, 6qpt:A, 6qpt:B, 6qpt:C, 6qpt:D, 6qpt:E, 6qpt:F, 6qpu:A, 6qpu:B, 6qpu:C, 6qpu:D, 6qpu:E, 6qpu:F, 6qpv:A, 6qpv:I, 6qpx:A, 6qpx:I, 6qpz:A, 6qpz:I, 6qq0:A, 6qq1:A, 6qq2:A, 7qq2:A, 7r2u:A, 2yqb:A, 3zbm:A, 3ziy:A
69 6hbe:C 427 185 0.1253 0.1288 0.2973 0.004 6hbe:A, 6hbe:B
70 4bxs:V 1262 122 0.0683 0.0238 0.2459 0.008
71 4bxs:V 1262 119 0.0706 0.0246 0.2605 0.033
72 4bxs:V 1262 69 0.0433 0.0151 0.2754 9.0
73 7kwo:A 1200 154 0.0979 0.0358 0.2792 0.009
74 7kwo:A 1200 63 0.0456 0.0167 0.3175 3.3
75 7k66:A 1265 156 0.1025 0.0356 0.2885 0.012 1d7p:M, 3hnb:M, 7kbt:A, 6mf0:A, 6mf0:B, 4xzu:M
76 5d4h:B 341 131 0.0866 0.1114 0.2901 0.015 2afn:A, 2afn:B, 2afn:C, 1aq8:A, 1aq8:B, 1aq8:C, 1as6:A, 1as6:B, 1as6:C, 1as7:A, 1as7:B, 1as7:C, 1as8:A, 1as8:B, 1as8:C, 2b08:A, 2b08:B, 2b08:C, 5d4h:A, 5d4h:C, 5d4i:A, 5d4i:C, 5d4i:B, 5d4j:A, 5d4j:B, 5d4j:C, 2e86:A, 2e86:B, 2e86:C, 1et5:A, 1et7:A, 1et8:A, 5f7a:A, 5f7a:C, 5f7a:B, 5f7b:A, 5f7b:B, 5f7b:C, 2fjs:A, 2fjs:B, 2fjs:C, 3h4f:A, 3h4f:B, 3h4f:C, 3h4h:A, 3h4h:B, 3h4h:C, 3h56:A, 1j9q:A, 1j9q:B, 1j9q:C, 1j9r:A, 1j9r:B, 1j9r:C, 1j9s:A, 1j9s:B, 1j9s:C, 1j9t:A, 1j9t:B, 1j9t:C, 1l9o:A, 1l9o:B, 1l9o:C, 1l9p:A, 1l9p:B, 1l9p:C, 1l9q:A, 1l9q:C, 1l9q:B, 1l9r:A, 1l9r:B, 1l9r:C, 1l9s:A, 1l9s:B, 1l9s:C, 1l9t:A, 1l9t:C, 1l9t:B, 1npj:A, 1npj:B, 1npj:C, 1npn:A, 1npn:B, 1npn:C, 1ntd:A, 2p80:A, 2p80:B, 2p80:C, 2pp7:A, 2pp7:B, 2pp7:C, 2pp8:A, 2pp8:B, 2pp8:C, 2pp9:A, 2pp9:B, 2pp9:C, 2ppa:A, 2ppa:B, 2ppa:C, 2ppc:A, 2ppc:B, 2ppc:C, 2ppd:A, 2ppd:B, 2ppd:C, 2ppe:A, 2ppe:B, 2ppe:C, 2ppf:A, 2ppf:B, 2ppf:C, 1sjm:A, 1sjm:B, 1sjm:C, 1snr:A, 1snr:B, 1snr:C, 4ysc:A, 4ysc:B, 4ysc:C, 4yse:A, 4yse:B, 4yse:C, 1zdq:A, 1zdq:B, 1zdq:C, 1zds:A, 1zds:B, 1zds:C
77 4ejx:A 1034 95 0.0661 0.0280 0.3053 0.016 4enz:A, 2j5w:A, 1kcw:A
78 4ejx:A 1034 72 0.0547 0.0232 0.3333 0.019 4enz:A, 2j5w:A, 1kcw:A
79 4ejx:A 1034 130 0.0888 0.0377 0.3000 0.027 4enz:A, 2j5w:A, 1kcw:A
80 4ejx:A 1034 154 0.0934 0.0397 0.2662 1.7 4enz:A, 2j5w:A, 1kcw:A
81 3cdz:A 630 290 0.1481 0.1032 0.2241 0.017 3j2q:A
82 5akr:A 337 106 0.0752 0.0979 0.3113 0.017 2avf:A, 2avf:B, 2avf:C, 2avf:D, 2avf:E, 2avf:F, 2bw4:A, 2bw5:A, 2bwd:A, 2bwi:A, 6gb8:A, 6gbb:A, 6gby:A, 6gcg:A, 6gsq:A, 6gt0:A, 6gt2:A, 6gti:A, 6gtj:A, 6gtk:A, 6gtl:A, 6gtn:A, 5i6k:A, 5i6l:A, 5i6m:A, 5i6n:A, 5i6o:A, 5i6p:A, 1kcb:A, 6knf:A, 6knf:B, 6knf:C, 6kng:A, 6kng:B, 6kng:C, 5n8f:A, 5n8g:A, 5n8h:A, 5n8i:A, 1nia:A, 1nia:B, 1nia:C, 1nib:A, 1nib:B, 1nib:C, 1nic:A, 1nid:A, 1nie:A, 1nif:A, 2nrd:A, 5of5:A, 5of6:A, 5of7:A, 5of8:A, 5ofc:A, 5ofd:A, 5ofe:A, 5off:A, 5ofg:A, 5ofh:A, 5og2:A, 5og3:A, 5og4:A, 5og5:A, 5og6:A, 5ogf:A, 5ogg:A, 6qwg:A, 1rzp:A, 1rzp:B, 1rzp:C, 1rzq:A, 1rzq:B, 1rzq:C, 2y1a:A, 6zu6:A, 6zua:A, 6zub:A, 6zud:A, 6zut:A
83 6mf2:A 1222 108 0.0774 0.0278 0.3148 0.025 4bdv:A, 4bdv:B, 3cdz:B, 3j2q:B, 5k8d:A, 5k8d:B, 2r7e:B
84 2r7e:A 693 108 0.0774 0.0491 0.3148 0.026
85 1mzz:A 334 101 0.0706 0.0928 0.3069 0.028 2a3t:A, 2dws:A, 2dwt:A, 2dy2:A, 1mzy:A, 1mzz:B, 1mzz:C, 1n70:A, 1zv2:A
86 5n0k:A 1034 95 0.0661 0.0280 0.3053 0.038 5n4l:A, 5n4l:B
87 5n0k:A 1034 155 0.0957 0.0406 0.2710 0.14 5n4l:A, 5n4l:B
88 5n0k:A 1034 107 0.0547 0.0232 0.2243 0.19 5n4l:A, 5n4l:B
89 2dv6:A 422 274 0.1458 0.1517 0.2336 0.054 2dv6:B, 2dv6:C, 2dv6:D, 2dv6:E, 2dv6:F
90 5ue6:A 314 254 0.1276 0.1783 0.2205 0.17 1kbv:A, 1kbv:B, 1kbv:C, 1kbv:D, 1kbv:F, 1kbv:E, 1kbw:A, 1kbw:B, 1kbw:C, 1kbw:D, 1kbw:E, 1kbw:F, 5tb7:A, 5tb7:C, 5tb7:B, 5ue6:C, 5ue6:B, 5ue6:D, 5ue6:F, 5ue6:E, 5ue6:G, 5ue6:I, 5ue6:H
91 1sdd:A 268 73 0.0410 0.0672 0.2466 0.29
92 8rfv:A 345 123 0.0752 0.0957 0.2683 0.31 9evm:A, 7qxk:A, 7qy4:A, 7qyc:A, 8r8s:A, 8rfl:A, 8rfo:A, 8rfp:A, 8rfq:A, 8rfr:A, 8rfs:A, 8rft:A, 8rfu:A, 8rfw:A, 8rfx:A, 8rfy:A, 8rg8:A, 8rg9:A, 8rgb:A, 8rgc:A, 8rgd:A, 8ru9:A, 8rur:A, 8ryj:A, 8ryr:A, 8ryu:A, 8ryv:A, 8s0w:A, 8s2q:A, 8s5x:A, 8s5y:A, 8s63:A, 8s64:A, 8s68:A, 8s69:A, 6thf:A, 6zar:A, 6zas:A, 6zat:A, 6zau:A, 6zav:A, 6zaw:A, 6zax:A, 7zcn:A, 7zco:A, 7zcp:A, 7zcq:A, 7zcr:A, 7zcs:A
93 6tfo:C 424 28 0.0364 0.0377 0.5714 0.39 6tfd:A, 6tfd:C, 6tfd:B, 6tfo:A, 6tfo:B
94 6the:A 299 132 0.0979 0.1438 0.3258 0.43
95 7kmq:B 754 78 0.0524 0.0305 0.2949 2.2 7kmq:A
96 2ymv:A 327 48 0.0387 0.0520 0.3542 2.6
97 7poa:A 398 93 0.0615 0.0678 0.2903 6.4 7poa:B, 7pob:A, 7pob:D, 7pob:B, 7pob:C, 7poc:A, 7poc:D, 7poc:B, 7poc:C
98 1sdd:B 601 52 0.0342 0.0250 0.2885 8.2
99 4qiw:B 1069 78 0.0547 0.0225 0.3077 8.3 4qiw:J
100 5af7:B 391 69 0.0456 0.0512 0.2899 8.7 5af7:A, 5ahs:A, 5ahs:B, 5ahs:C, 5ahs:E, 5ahs:F, 5ahs:D
101 6kf3:B 1114 78 0.0547 0.0215 0.3077 8.9 9bct:B, 9bcu:B, 6kf4:B, 6kf9:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218